ПРОФИЛИ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ У БОЛЬНЫХ МНОЖЕСТВЕННОЙ МИЕЛОМОЙ В ДЕБЮТЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

При л о ж ен и е 1

CAR" Т-клетки истощались; популяция PD1+TIM3+CAR+kлеток достигала 60—90% на 10—14-й день культивирования для здоровых доноров и пациентов. Добавление в среду HSA не оказало значимого влияния на фенотип и истощение CAR-T-клеток.

Заключение. Мы показали, что иммунофенотип CAR-T-клeтoк пациентоспецифичен, а истощение клеток доноров и пациентов происходит с разной динамикой вне зависимости от соотношения Е:Т и присутствия НЭА.

Сергеева А. М.1, Грибкова А. К.2, Суримова В. А.1, Сунцова М. В.3, Менделеева Л. П.1, Буздин А. А.3, Шайтан А. К.2 ПРОФИЛИ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ У БОЛЬНЫХ МНОЖЕСТВЕННОЙ МИЕЛОМОЙ В ДЕБЮТЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ

1ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России, 2Биологический факультет, МГУ им. М.В. Ломоносова, 3Первый Московский государственный медицинский университет

имени И. М. Сеченова

Введение. Множественная миелома (ММ) — неизлечимое злокачественное лимфопролиферативное заболевание, характеризующееся высокой степенью гетерогенности. Диагностика основывается на клинических, иммунохимических, иммунофенотипических и цитогенетических методах исследования опухоли, однако моле-кулярно-генетические признаки, такие как профили экспрессии генов, в настоящее время не учитываются. Технология секвенирования РНК позволяет идентифицировать и проанализировать большое количество генов, вовлеченных в формирование профиля экспрессии генов, специфичного для ММ как заболевания и увидеть маркеры экспрессии, характерные для каждого больного.

Цель работы. Провести функциональный анализ дифференциально экспрессирующихся генов в опухолевых клетках у больных ММ на моментустановления диагноза.

Материалы и методы. Образцы костного мозга (КМ) были получены от 58 пациентов с впервые установленным диагнозом ММ (29—78 лет, 33 м и 25 ж). В качестве контроля использовались образцы КМ от 11 здоровых доноров (24— 41 год, 5ми6 ж). Мононуклеары КМ, обогащенные CD138+ клетками, использовали для выделения РНК в соответствии с методикой, описанной ранее (Sergeeva et al. 2019). Подготовку библиотек и секвенирование транскриптома выделенных клеток проводили по опубликованному протоколу (Borisov et al. 2021). Полученные последовательности в файлах FASTO обрабатывались с применением биоинформатических алгоритмов пакетов Salmon и DESeq2 для выявления статистически значимо (^<0,05 с поправкой Бенджамини-Хохберга) дифференциально экспрессирующихся генов (ДЭГ). К ДЭГ относили гены, экспрессия которых

изменилась более чем в четыре раза (llog2FCl>2). Мы использовали два онлайн ресурса, Gene Ontology и DAVID для функциональной классификации и анализа обогащения ДЭГ, соответственно. Анализ обогащения по их молекулярным функциям, биологическим процессам и клеточным компонентам проводился в DAVID путем кластеризации терминов, в которых не менее 5 генов из полученного списка ДЭГ, и^<0,05 с поправкой Бенджамини-Хохберга).

Результаты и обсуждение. В результате анализа транскриптома клеток ММ пациентов и плазматических клеток здоровых доноров было выявлено 464 ДЭГ, экспрессия которых увеличивается, и 626 ДЭГ, экспрессия которых снижается (без учета генов иммуноглобулинов). По нашим данным, наиболее значительно была повышена экспрессия у генов: NOL4, ММР16, KCNS3, GRIA3, USH2A, CTNNA3, GALNT13, NBPF4, GPR37, CFAP47; понижена: PPP1R14C, KRT2, CACNA1H, GRK1, OR6N1, BEGAIN, НМНВ1, ТМЕМ179, PLP1, DEFA3.

Анализ функционального обогащения ДЭГ выявил статистически значимые кластеры генов: высокая экспрессия обнаружена у генов, связанных с активностью ионных каналов, внеклеточными взаимодействиями и активностью рецепторных комплексов. Наблюдалась пониженная экспрессия генов, участвующих в организации хроматина, врожденной и адаптивной иммунных системах, транспорте кислорода.

Заключение. В результате проведенного исследования мы выявили гены, экспрессия которых значительно изменена вследствие малигнизации плазматической клетки. С помощью анализа функционального обогащения генов выявлены основные функциональные группы генов,участвующих в патогенезе ММ.

Синяев А. А., Попова М. О., Рогачева Ю. А., Власова Ю. Ю., Смирнова А. Г., Бондаренко С. Н., Моисеев И. С., Кулагин А. Д.

КОЛОНИЗАЦИЯ ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫМИ БАКТЕРИЯМИ С МНОЖЕСТВЕННОЙ ЛЕКАРСТВЕННОЙ УСТОЙЧИВОСТЬЮ ПРИ ХРОНИЧЕСКОЙ РЕАКЦИИ «ТРАНСПЛАНТАТ ПРОТИВ ХОЗЯИНА«

НИИ ДОГиТ им. Р. М. Горбачевой

Введение. РТПХ увеличивает риск и тяжесть инфекционных осложнений (ПО). Колонизация грамотрицательными (ГО) бактериями с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ) коррелирует с более высокой частотой ПО.

Цель работы. Изучить колонизацию ГО бактериями с МЛУу пациентов с хронической РТПХ: эпидемиологию, влияние на частоту ПО, а также влияние на исходы.

Материалы и методы. В нашем центре мы провели анализ ИО у пациентов с РТПХ. Ретроспективное исследование включало 128 взрослых пациентов с хронической РТПХ (табл.) после алло-ТГСК со медианой наблюдения 1160 дней (176—2854). Анализ проводился в соответствии с статистическими рекомендациями ЕВМГ.

Результаты и обсуждение. Кумулятивная частота (КЧ) бактериальных инфекций (БИ) в группе с хронической РТПХ составила 22,8% (95%ДИ 15,8—30,6). В многофакторном анализе поражение ЖКТ при хронической РТПХ увеличивает риск БИ: ОР 2,9 (95%ДИ 1,3— 6,3), ^<0,01 соответственно. Частота колонизации ESBL-продуцирующими ГО бактериями составила 65,6% (я=84), СРЕ — 26,5% (я=34). Преимущественно представлена К. pneumonías (я=34, 63%) и Е. cotí (я=14, 17%). КЧ ГО бактериальных инфекций 16,9% (95%ДИ 10,9—24,1), основные возбудители К. pneumonías (я=9, 39%), Pdeudomonad spp. (n=5, 22%) и Е. cotí (n=5, 22%). Колонизация ESBL значимо увеличивает КЧ ГО бактериальных инфекций:

22,2% (95%ДИ 13,9 - 31,8) против 6,8% (95%ДИ 1,8-16,7),^=0,0373.

Однако колонизация СРЕ не оказало значимого влияния,^=0,19. КЧ ГО инфекций кровотока — 4,7% (95%ДИ 1,9—9,5). Колонизация СРЕ значимо увеличивает КЧ ИК: 14,8% (95%ДИ 5,4-28,7) против 1,0%

Таблица. Характеристика пациентов

Хроническая РТПХ (п=128)

N %

Возраст, медиана 37(18-67]

Мужчины Женщины 67 61 52,3 47,7

Стандарт Терапия «спасения» 102 26 79,7 20,3

Донор Haplo MRD MUD MMUD 8 32 59 29 6,2 25 45,9 22,9

Источник СК PBSC вм 70 58 54,7 45,3

Режим кондиционирования RIC MAC 104 24 81,2 18,8

СтепеньРТПХ 1 II III 25 55 48 19,5 43 37,5

Follow-up, медиана 1160 дней (176-2854)