CC BY
21мой амплификации зондов. Оценка ответа на терапию проводилась согласно критериям RECIST 1.1 для определения выживаемости без прогрессирования (ВБП).
Результаты
Амплификация гена HER2 обнаружена в 7,3% (3/41) случаев РЖ. При проведении периоперационной химиотерапии в режиме FLOT у больных РЖ с амплификацией HER2 ВБП была достоверно ниже, чем у больных с отсутствием амплификации HER2: медиана составила 121 и 317 дней соответственно [отношение рисков (ОР): 0,38; 95% ДИ 0,11-1,31; p = 0,005]. Распространенность МСН составила 4,9% (2/41), а ам-
Список литературы
плификации KRAS — 13,3% (2/15). ВБП у больных РЖ с амплификацией KRAS была достоверно ниже, чем у больных с отсутствием амплификации KRAS: медиана составила 88 и 317 дней соответственно (ОР: 0,27; 95% ДИ 0,05-1,33; p = 0,004). Для МСН и других исследованных маркеров не выявлено связи с ВБП при проведении периоперационной химиотерапии.
Выводы
Наличие амплификации HER2 и KRAS могут служить предиктивными маркерами неэффективности периоперационной химиотерапии в режиме FLOT у пациентов с местнораспространенным РЖ.
1. Gervaso, Lorenzo et al . Biomarker evaluation in radically resectable locally advanced gastric cancer treated with neoadjuvant chemotherapy: an evidence reappraisal . Therapeutic advances in medical oncology. 2021. Vol . 13 . 17588359211029559 . Sep . 1. D0l:10 .1177/17588359211029559 .
Анализ ALK-транслокаций в серии 4991 EGFR/MET-негативных опухолей немелкоклеточного рака легкого
Авторы
Преображенская Елена Васильевна, [email protected], ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минзрава России, Санкт-Петербург
Романько Александр Андреевич, [email protected], ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минзрава России, Санкт-Петербург
Мартьянов Александр Сергеевич, [email protected], ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минзрава России, Санкт-Петербург
Митюшкина Наталья Владимировна, [email protected], ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минзрава России, Санкт-Петербург
Тюрин Владислав Ильич, [email protected], ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минзрава России, Санкт-Петербург
Бизин Илья Валерьевич, [email protected], ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минзрава России, Санкт-Петербург
Ключевые слова:
рак легкого, ALK, транслокации, таргетная терапия, NGS
Актуальность
Применение таргетной терапии основано на обнаружении молекулярной мишени для препарата в опухоли. Генетическое тестирование перестроек гена ALK вошло в рутинную диагностику больных немелкоклеточным раком легкого (НМРЛ), но, как правило, ограничивается поиском частых вариантов. Исследования ALK на основе иммуногистохимического исследования и FISH не идентифицируют варианты слияния ALK, NGS-анализ недоступен в массовой медицине из-за дороговизны. Транслокации ALK приводят к усилению транскрипции киназного домена гена, поэтому ПЦР-анализ несбалансированной экспрессии 5'/3'-концов гена является экономически эффективным инструментом для комплексного обнаружения всех вариантов перестроек ALK.
Цель
Апробация скринингового метода обнаружения перестроек ALK, поиск редких вариантов транслокаций.
Материалы и методы
Исследование проводилось на коллекции образцов РНК опухолевого материала от 4991 больного НМРЛ негативных в отношении мутаций EGFR/MET, поступившего на диагностическое исследование в НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова (Санкт-Петербург) с апреля 2018 г. по октябрь 2020 г. Анализ проводили методом ОТ-ПЦР с Taqman-зондами.
Результаты
744/4991 (14,9%) НМРЛ продемонстрировали несбалансированную экспрессию 5'/3'-концов ALK, при этом только в 427 из них обнаружился дисбаланс между границей частых перестроек (экзон 19) и З'-участком гена ALK. Вариант-специфический ПЦР-анализ, разработанный для обнаружения 20 наиболее распространенных слияний ALK, позволил определить ген-партнер транслокации в 291/4991 (5,9%) НМРЛ. Среди опухолей с идентифицирован-
ными ALK-перестройками 266/291 (91,4%) и 278/291 (95,5%) демонстрировали несбалансированную экспрессию 5'/3' и ex19/3' соответственно. Далее мы исследовали 62 образца, которые оказались наиболее перспективными по тесту на несбалансированную экспрессию гена ALK, но не обнаруживали известных вариантов перестроек и не несли мутации в гене KRAS. NGS-анализ выявил 20 случаев транслокаций ALK: 5 новых вариантов (UBCex1-ALKex18, EML4ex13-ALKex3-ALKex20, EML4ex6-ins18bp-ALKex20 и EML4ex5del10-del44ALKex20, EML4ex2-del150ALKex20); 13 опухолей с известными редкими вариантами транслокаций ALK, в том числе 5 случаев с перестройкой на 17/18/19 экзоны гена ALK;
2 распространенных варианта присутствующих в низком проценте клеток опухоли. Кроме того, мы подвергли NGS-анализу QIAseq RNAscan 32 образца от молодых пациентов НМРЛ, которые были негативными в ПЦР-тестах на транслокации ALK/ROS1/ RET, перестроек гена ALK выявлено не было, однако в 1 случае обнаружилась не описанная ранее перестройка ACTB-ROS1.
Выводы
Это исследование обеспечивает основу для недорогого и эффективного обнаружения транслокаций с участием гена ALK. Исследование проводилось при поддержке гранта РНФ 17-75-30027.
Список литературы
1. lyevleva A . G . , Raskin G A. , Tiurin V I . et al . Novel ALK fusion partners in lung cancer // Cancer Lett . 2015 . 362 (1) . Р 116-121. 2 . Wang R . , Pan Y, Li C . et al . The use of quantitative real-time reverse transcriptase PCR for 5' and 3' portions of ALK transcripts to detect ALK rearrangements in lung cancers // Clin Cancer Res 2012 . 18 (17) . Р 4725-4732 .
Внеклеточные микроРНК мочи как диагностический маркер кастрационно-резистентного рака предстательной железы
Авторы
Сайткулова Милена Максимовна, [email protected], ФГБУН Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, ФГАОУ ВО «Новосибирский национальный исследовательский государственный университет», Новосибирск
Брызгунова Ольга Евгеньевна, [email protected], ФГБУН Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, ФГБУ «НМИЦ им. академика Е.Н. Мешалкина», Новосибирск
Лактионов Павел Петрович, [email protected], ФГБУН Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, ФГБУ «НМИЦ им. академика Е.Н. Мешалкина», Новосибирск
Остальцев Илья Александрович, [email protected], ФГБУ «НМИЦ им. академика Е.Н. Мешалкина», Новосибирск
Красильников Сергей Эдуардович, [email protected], ФГБУ «НМИЦ им. академика Е.Н. Ме-шалкина», Новосибирск
Коношенко Мария Юрьевна, [email protected], ФГБУН Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, ФГБУ «НМИЦ им. академика Е.Н. Мешалкина», Новосибирск
Ключевые слова:
микроРНК, рак предстательной железы, диагностика, кастрационно-резистентный рак предстательной железы
Актуальность
Рак предстательной железы (РПЖ) во всем мире занимает лидирующие позиции в структуре онкозабо-леваемости и смертности от злокачественных новообразований среди мужчин. Медиана выживаемости больных кастрационно-резистентным раком предстательной железы (КРРПЖ), плохо поддающейся лечению формой заболевания, составляет 9-36 месяцев. Современная диагностика КРРПЖ заключается в исследовании уровня тестостерона и ПСА в крови пациента. До сих пор не разработано высокоспецифичных маркеров для ранней диагностики и терапии, способной предотвратить развитие КРРПЖ [1]. МикроРНК вовлечены во все ключевые этапы развития РПЖ, андрогенной независимости и обладают значительным потенциалом в качестве диагностических маркеров РПЖ [2].
Цель
Формирование диагностической панели для КРРПЖ на основе оценки уровня экспрессии 9 микроРНК (miR-19b, -30е, -31, -92а, -125Ь, -200Ь, -205а, -375, -660) в составе внеклеточных везикул (ВВ) и бесклеточной фракции (БкФ) мочи больных гор-мончувствительным раком предстательной железы (ГЧРПЖ) и КРРПЖ.
Материалы и методы
Образцы мочи пациентов с КРРПЖ и ГЧРПЖ были получены из НМИЦ им. академика Е.Н. Мешалкина. ВВ мочи были получены методом агрегации-преципитации с использованием полиэти-лентгликоля и декстрана. МикроРНК внеклеточных везикул и бесклеточной фракции мочи были выделе-
