CC BY
0
I ГЕМАТОЛОГИЯ ИТРАНСФУЗИОЛОГИЯ | RUSSIAN JOURNAL OF HEMATOLOGY AND TRANSFUSIOLOGY (GEMATOLOGIYA I TRANSFUSIOLOGIYA) | 2024; TOM69; №2 |
проводитсяу небольшого количества пациентов иувеличивается к 12 месяцам терапии. Обращает на себя внимание низкий процент выполненных ЦГИ на протяжении всего первого года терапии. Ведение
регистра пациентов с ХМЛ и увеличение доступности диагностических тестов в республике позволяет проводить своевременный мониторинг и обеспечивает своевременную смену терапии.
Буг Д. С., Кузнецов Ю. Н., Арзамазова В. И., Кудяшева О. В., Пирогова О. В., Абдулхаликова 3. К., Измайлова Е. А., Бархатов И. М.,
Моисеев И. С., Кулагин А.Д.
РЕЗУЛЬТАТЫ ПОЛНОЭКЗОМНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ У ПАЦИЕНТОВ С ПЕРВИЧНО-МНОЖЕСТВЕННЫМИ ОПУХОЛЯМИ
КРОВЕТВОРНОЙ СИСТЕМЫ
НИИ детской онкологии, гематологии и трансплантологии им. P.M. Горбачевой, ПСПбГМУ им. акад. И.П. Павлова
Введение. Первично множественная опухоль (ПМО) — это наличие у пациента двух и более независимых злокачественных новообразований разных или одной систем. ПМО часто рассматривают в контексте потенциальной наследственной предрасположенности к онкологическим заболеваниям, однако в литературе генетическая характеристика таких пациентов представлена фрагментарно
[т^огЛ Л. е1.а1, 2015].
Цель работы. Провести исследование мутационного статуса пациентов с ПЖО кроветворной системы.
Материалы и методы. В исследование включено 5 пациентов с ПМО. Медиана возраста больных — 60 лет (58—68 лет), соотношение мужчин к женщинам 2:3. Пациент — диагноз: — острый лейкоз со смешанным фенотипом (ОЛСФ) и множественная миело-ма (ММ); ММ и системный мастоцитоз (СМ); ММ
и острый миелоидный лейкоз (ОМЛ) СВ; №4 — ММ, эссенциаль-ная тромбоцитемия (ЭТ) с исходом в миелофиброз и меланома; № 5; бластная плазмоцитоидная дендритоклеточная неоплазия (БПДКН) и хронический миеломоноцитарный лейкоз (ХММЛ). Синхронное течение ПМО наблюдалось у трёх пациентов (пациенты № 2, 3 и 5). Для генетического исследования отбирались неселектированные-/У=4 и селектированные клетки костного мозга (СОЗ+; СОЗЗ+; С0138+)^=1. Библиотека для полноэкзомного секвенирования (ПЭС) приготовлена согласно инструкции производителя (КАРА НурегЕхоте, ЯосЬе, Швейцария). Для биоинформатической обработки использовался пайплайн ОАТК, программы ОеерУапа^ для поиска терминальных вариантов и для соматических. Варианты с аллельной нагруз-
кой 30—70% относились к гетерозиготным, 90—100% — к гомозиготным
Таблица. Результаты ПЭС у пациентов с ПМО
[Slavin Т.Р. et al., 2019]. Для определения клинической значимости вариантов использовались критерии ACMG.
Результаты и обсуждение. По данным ПЭСу всех пациентов обнаружены мутации в генах, ассоциированных с онкологическими заболеваниями (таб.1), из них гетерозиготные варианты с патогенным и вероятно патогенным значениями выявлены у трёх: № 1 (FANCA), № 2 (BRCA1, ADA2 и СНЕК2) и № 5 (ТЕТ2). Такжеу пациента № 1 выявлена вторая мутация в гене FANCA соматического характера (класс III). У четырёх пациентов обнаружены варианты неустановленного значения: № 2 (СНЕК2 и РТСН1), № 3 (ADA2), № 4 (UBR5), № 5 (POLE и ТЕТ2). Таким образом, у пациентов № 3 и 5 имелись по два варианта мутаций в генах ADA2 и ТЕТ2 соответственно с разной клинической значимостью. Также у пациента № 5 выявлен соматический вариант мутации, ассоциированный с фенотипом в гене MPL1 (класс I). При секвенировании селектированных образцов у пациента № 4 в пробах CD38+ и CD138+ обнаружен неслучайный соматический вариант мутации в гене JAK2 (класс I). Изолированно в CD138+ клетках имелись еще 2 соматических варианта мутаций в онкогенах ASXL1 и EZH2 (класс III). Дополнительно во всех пробах обнаружена патогенная гетерозиготная мутация в гене AIRE, не имеющая отношения к фенотипу.
Заключение. Данные результаты продемонстрировали высокую генетическую гетерогенность среди пациентов с ПМО. Для достоверного определения влияния выявленных мутаций необходимо продолжить накопление генетических баз данных по пациентам с ПМО. Данное исследование может быть стать вспомогательным для дальнейших работ.
№ Возраст Пол Диагноз Ген Вариант Содержание в аллеле Клиническая значимость Ассоциация гена с онкологическим заболеванием
1 65 лет Ж ММ FANCA C.G4199A 46,38% ВП Да
ОЛСФ NFI C.G26A 10,70% Класс III Да
FANCA c.A914C 10,00% Класс III Да
2 58 лет M мм СНЕК2 C.T470C 52,08% ВНЗ Да
см PTCHJ c.2059_2060delinsTT 40,90% ВНЗ Да
3 60 лет M мм BRCAÏ c.5125dupC 53,00% П Да
омл CHEK2 C.A968C 55,00% ВП Да
ADA2 C.G142T 47,00% ВНЗ Да
ADA2 c,144delG 45,00% П Да
4 68 лет Ж мм Проба CD3+
эт Меланома UBR5 C.T5954C 55,00% ВНЗ Да
AISE C.C769T 45,98% П Нет
Проба CD33+
AIRE C.C769T 52,94% П Нет
UBR5 C.T5954C 51,89% ВНЗ Да
1AK2 C.G1849T 23,10% Класс 1 Да
Проба CD138+
AISE C.C769T 63,00% П Нет
UBR5 C.T5954C 55,26% ВНЗ Да
JAK2 C.G1849T 50,72% Класс 1 Да
ASXLI C.C1894T 35,94% Класс III Да
EZH2 c.268delG 36,30% Класс III Да
5 58 лет Ж БПДКН POLE C.G1883C 53,00% ВНЗ Да
ХММЛ TET2 C.C3869T 50,00% ВНЗ Да
MPI! C.G1544T 38,00% Класс 1 Да
TET2 C.G1882T 32,00% ВП Да
ATRX c.3509_3510 insCAGA 16,00% Класс III Да
ВНЗ — вариант неустановленного значения, ВП — вероятно патогенный вариант, П — патогенный вариант.
