Научная статья на тему 'Распределение значений минимальных подавляющих концентраций антибактериальных препаратов в отношении представителей порядка Flavobacteriales, выделенных из респираторных образцов от пациентов с муковисцидозом в Российской Федерации'

Распределение значений минимальных подавляющих концентраций антибактериальных препаратов в отношении представителей порядка Flavobacteriales, выделенных из респираторных образцов от пациентов с муковисцидозом в Российской Федерации Текст научной статьи по специальности «Клиническая медицина»

CC BY
0
0
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
муковисцидоз / Flavobacteriales / антибиотикорезистентность / cystic fibrosis / Flavobacteriales / antibiotic resistance

Аннотация научной статьи по клинической медицине, автор научной работы — Кондратенко О. В., Зубова К. В.

Цель. Анализ распределения значений минимальных подавляющих концентраций (МПК) антибактериальных препаратов в отношении представителей порядка Flavobacteriales, выделенных из респираторных образцов от пациентов с муковисцидозом в Российской Федерации, методом двойных серийных разведений. Материалы и методы. Проведена оценка распределения значений МПК ряда антибактериальных препаратов в отношении 100 штаммов бактерий, представителей порядка Flavobacteriales, выделенных из респираторных образцов от пациентов с муковисцидозом из 60 регионов Российской Федерации в рамках рутинного микробиологического обследования. Из них 75 представителей Сhryseobacterium spp., среди которых С. arthrospherae – 28, C. formosense – 1, С. gambrini – 3, C. gleum – 10, C. indologenes – 20, C. joostei – 1, C. oraniemense – 10, C. shandongense – 2 штамма, 4 штамма Elizabethkingia spp., среди которых 2 – E. miricola, и по одному штамму E. meningoseptica и E. anopheles соответственно, а также 21 штамм Empedobacter falsenii. Идентификация всех выделенных культур проводилась с помощью MALDI-ToF масс-спектрометрии (Bruker, Германия). Было проведено определение значений МПК в отношении 17 антимикробных препаратов: амикацин, амоксициллин/клавуланат, азтреонам, цефотаксим, цефтазидим, цефтазидим/авибактам, цефтолозан/ тазобактам, ципрофлоксацин, колистин, эртапенем, гентамицин, имипенем, меропенем, пиперациллин/ тазобактам, тигециклин, тобрамицин и триметоприм/сульфаметоксазол с помощью наборов Sensititre DKMGN. Результаты. Значение МПК колистина, цефотаксима и тобрамицина более 8 мкг/мл, а также более 2 мкг/мл для эртапенема продемонстрировано для 100% изолятов. В отношении большинства штаммов показатели МПК имипенема и меропенема составляли более 4 мкг/мл. МПК цефтазидима в отношении 20% штаммов Chryseobacterium spp. находилось в диапазоне до 2 мкг/мл. Значения МПК амикацина в отношении штаммов Elizabethkingia spp. составили 32 мкг/ мл и более. В отношении же 38% штаммов Chryseobacterium spp. и E. falsenii это значение не превышало 8 мкг/мл. Как и в случае с амикацином, все штаммы Elizabethkingia spp. демонстрировали высокие показатели МПК гентамицина – 8 мкг/мл (25% штаммов) и более (75% штаммов). В отношении 20% всех тестированных штаммов значение МПК находились в диапазоне ≤ 2 мкг/мл. В отношении половины тестируемых изолятов показатели МПК цефтазидима/авибактама, а также цефтолозана/тазобактама находились на уровне до 2/4 мкг/мл включительно. Более трети штаммов имели значения МПК ципрофлоксацина до 0,25 мкг/мл включительно. Для 25% штаммов значения МПК тигециклина составили до 0,5 мкг/мл включительно. Наименьшие показатели МПК в отношении тестрируемой группы штаммов продемонстрированы для триметоприма/сульфаметоксазола: для 88% штаммов значение МПК составило ≤ 1/19 мкг/мл, еще для 9% штаммов этот показатель составил 2/38 мкг/мл. Выводы. Представители порядка Flavobacteriales представляют собой группу микроорганизмов, характеризующихся множественной антибиотикорезистентностью. Большинство штаммов, выделенных от пациентов с муковисцидозом в Российской Федерации, сохраняют низкие значения МПК триметоприма/сульфаметоксазола.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по клинической медицине , автор научной работы — Кондратенко О. В., Зубова К. В.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Distribution of MIC values of antibacterial drugs for Flavobacteriales isolated from respiratory samples in Russian patients with cystic fibrosis

Objective. Analysis of the distribution of the values of the minimum inhibitory concentrations (MIC) of a number of antibacterial drugs in relation to representatives of the order Flavobacteriales isolated from respiratory samples from patients with cystic fibrosis of the Russian Federation by the method of double serial dilutions. Materials and methods. The distribution of the values of MIC of a number of antibacterial drugs was evaluated in relation to 100 strains of bacteria, representatives of the order Flavobacteriales, isolated from respiratory samples from patients with cystic fibrosis from 60 regions of the Russian Federation as part of a routine microbiological examination. Of these, 75 representatives of Chryseobacterium spp., among which C. arthrospherae – 28, C. formosense – 1, C. gambrini – 3, C. gleum – 10, C. indologenes – 20, C. joostei – 1, C. oraniemense – 10, C. shandongense – 2 strains, 4 strains of Elizabethkingia spp., among which 2 – E. miricola, and one strain of E. meningoseptica and E. anopheles, respectively, as well as 21 strains of E. falsenii. Identification of all isolated cultures was carried out using MALDI-ToF mass spectrometry (Bruker, Germany). The MIC values were determined for 17 antimicrobial drugs: amikacin, amoxicillin/clavulanate, aztreonam, cefotaxime, ceftazidime, ceftazidime/avibactam, ceftolozane/ tazobactam, ciprofloxacin, colistin, ertapenem, gentamicin, imipenem, meropenem, piperacillin/ tazobactam, tigecycline, tobramycin and trimethoprim/sulfamethoxazole using Sensititre kits DKMGN. Results. The MIC values of colistin, cefotaxime and tobramycin more than 8 μg/ml, as well as more than 2 μg/ml with respect to ertapenem was demonstrated for 100% of isolates. For most strains, the MIC values of imipenem and meropenem were more than 4 μg/ml. MIC of ceftazidime against 20% of Chryseobacterium spp. strains was up to 2 μg/ml. Indicators of MIC of amikacin in relation to Elizabethkingia spp. strains were 32 μg/ml or more. For 38% of the strains of Chryseobacterium spp. and E.falsenii, this value did not exceed 8 μg/ml. As in the case of amikacin, all Elizabethkingia spp. strains demonstrated high levels of gentamicin MIC – 8 μg/ml (25% of strains) and more (75% of strains). For 20% of all tested strains, the MIC value was in the range of ≤ 2 μg/ml. In relation to half of the tested isolates, the MIC values for ceftazidime/avibactam, as well as ceftolozane/tazobactam were at the level of up to 2/4 μg/ml inclusive. More than a third of the strains had a level of MIC ciprofloxacin up to 0.25 μg/ml inclusive. For 25% of strains, the level of MIC of tigecycline was up to 0.5 μg/ml, inclusive, the lowest MIC indicators for the tested group of strains were demonstrated for trimethoprim/sulfamethoxazole: for 88% of strains, the MIC value was ≤ 1/19 μg/ml, for another 9% of strains, this indicator was 2/38 μg/ml. Conclusions. Representatives of the order Flavobacteriales are a group of microorganisms characterized by multiple antibiotic resistance. Most strains isolated from patients with cystic fibrosis in the Russian Federation retain low MIC values for trimethoprim/sulfamethoxazole.

Текст научной работы на тему «Распределение значений минимальных подавляющих концентраций антибактериальных препаратов в отношении представителей порядка Flavobacteriales, выделенных из респираторных образцов от пациентов с муковисцидозом в Российской Федерации»

RM'AX

https://cmac-journal.ru

КЛИНИЧЕСКАЯ МИКРОБИОЛОГИЯ И АНТИМИКРОБНАЯ ХИМИОТЕРАПИЯ

2023

DOI: 10.36488/cmac.2023.2.211-216

Оригинальная статья

Распределение значений минимальных подавляющих концентраций антибактериальных препаратов в отношении представителей порядка FlavobacteNales, выделенных из респираторных образцов от пациентов с муковисцидозом в Российской Федерации

Кондратенко О.В.1, Зубова К.В.2

1 ФГБОУ ВО «Самарский государственный медицинский университет» Минздрава России, Самара, Россия

2 ФГБОУ ВО «Саратовский национальный исследовательский государственный университет им. Н.Г. Чернышевского», Саратов, Россия

Контактный адрес:

Ольга Владимировна Кондратенко

Эл. почта: [email protected]

Ключевые слова: муковисцидоз, Р^оЬайепаЫ, антибиотикорези-стентность.

Конфликт интересов: авторы заявляют об отсутствии конфликтов интересов.

Внешнее финансирование: исследование проведено без внешнего финансирования.

Цель. Анализ распределения значений минимальных подавляющих концентраций (МПК) антибактериальных препаратов в отношении представителей порядка Flavobacteriales, выделенных из респираторных образцов от пациентов с муковисцидозом в Российской Федерации, методом двойных серийных разведений.

Материалы и методы. Проведена оценка распределения значений МПК ряда антибактериальных препаратов в отношении 100 штаммов бактерий, представителей порядка Flavobacteriales, выделенных из респираторных образцов от пациентов с муковисцидозом из 60 регионов Российской Федерации в рамках рутинного микробиологического обследования. Из них 75 представителей Chryseobacterium spp., среди которых С. arthrospherae - 28, C. formosense - 1, С. gambrini - 3, C. gleum - 10, C. indoiogenes - 20, C. joostei - 1, C. oraniemense - 10, C. shandongense - 2 штамма, 4 штамма Elizabethkingia spp., среди которых 2 - E. miricola, и по одному штамму E. meningoseptica и E. anopheles соответственно, а также 21 штамм Empedobacter falsenii. Идентификация всех выделенных культур проводилась с помощью MALDI-ToF масс-спектрометрии (Bruker, Германия). Было проведено определение значений МПК в отношении 17 антимикробных препаратов: амикацин, амоксициллин/клавуланат, азтреонам, цефотаксим, цефтазидим, цефтазидим/авибактам, цефтоло-зан/тазобактам, ципрофлоксацин, колистин, эртапенем, гентамицин, имипенем, меропенем, пипе-рациллин/тазобактам, тигециклин, тобрамицин и триметоприм/сульфаметоксазол с помощью наборов Sensititre DKMGN.

Результаты. Значение МПК колистина, цефотаксима и тобрамицина более 8 мкг/мл, а также более 2 мкг/мл для эртапенема продемонстрировано для 100% изолятов. В отношении большинства штаммов показатели МПК имипенема и меропенема составляли более 4 мкг/мл. МПК цефтазидима в отношении 20% штаммов Chryseobacterium spp. находилось в диапазоне до 2 мкг/мл. Значения МПК амикацина в отношении штаммов Elizabethkingia spp. составили 32 мкг/мл и более. В отношении же 38% штаммов Chryseobacterium spp. и E. falsenii это значение не превышало 8 мкг/мл. Как и в случае с амикацином, все штаммы Elizabethkingia spp. демонстрировали высокие показатели МПК гентамицина - 8 мкг/мл (25% штаммов) и более (75% штаммов). В отношении 20% всех тестированных штаммов значение МПК находились в диапазоне < 2 мкг/мл. В отношении половины тестируемых изолятов показатели МПК цефтазидима/авибактама, а также цефтолозана/тазобактама находились на уровне до 2/4 мкг/мл включительно. Более трети штаммов имели значения МПК ци-профлоксацина до 0,25 мкг/мл включительно. Для 25% штаммов значения МПК тигециклина составили до 0,5 мкг/мл включительно. Наименьшие показатели МПК в отношении тестрируемой группы штаммов продемонстрированы для триметоприма/сульфаметоксазола: для 88% штаммов значение МПК составило < 1/19 мкг/мл, еще для 9% штаммов этот показатель составил 2/38 мкг/мл. Выводы. Представители порядка Flavobacteriales представляют собой группу микроорганизмов, характеризующихся множественной антибиотикорезистентностью. Большинство штаммов, выделенных от пациентов с муковисцидозом в Российской Федерации, сохраняют низкие значения МПК триметоприма/сульфаметоксазола.

Original Article

Distribution of MIC values of antibacterial drugs for Flavobacteriales isolated from respiratory samples in Russian patients with cystic fibrosis

Kondratenko O.V.1, Zubova K.V.2

1 Samara State Medical University, Samara, Russia

2 Saratov State University, Saratov, Russia

Кондратенко О.В., Зубова К.В.

Contacts:

Olga V. Kondratenko

E-mail: [email protected]

Key words: cystic fibrosis, Flavobacteriales, antibiotic resistance.

Conflicts of interest: all authors report no conflicts of interest relevant to this article.

External funding source: no external funding received.

Objective. Analysis of the distribution of the values of the minimum inhibitory concentrations (MIC) of a number of antibacterial drugs in relation to representatives of the order Flavobacteriales isolated from respiratory samples from patients with cystic fibrosis of the Russian Federation by the method of double serial dilutions.

Materials and methods. The distribution of the values of MIC of a number of antibacterial drugs was evaluated in relation to 100 strains of bacteria, representatives of the order Flavobacteriales, isolated from respiratory samples from patients with cystic fibrosis from 60 regions of the Russian Federation as part of a routine microbiological examination. Of these, 75 representatives of Chryseobacterium spp., among which C. arthrospherae - 28, C. formosense - 1, C. gambrini - 3, C. gleum - 10, C. indologenes -20, C. joostei - 1, C. oraniemense - 10, C. shandongense - 2 strains, 4 strains of Elizabethkingia spp., among which 2 - E. miricola, and one strain of E. meningoseptica and E. anopheles, respectively, as well as 21 strains of E. falsenii. Identification of all isolated cultures was carried out using MALDI-ToF mass spectrometry (Bruker, Germany). The MIC values were determined for 17 antimicrobial drugs: amikacin, amoxicillin/clavulanate, aztreonam, cefotaxime, ceftazidime, ceftazidime/avibactam, ceftolozane/ tazobactam, ciprofloxacin, colistin, ertapenem, gentamicin, imipenem, meropenem, piperacillin/ tazobactam, tigecycline, tobramycin and trimethoprim/sulfamethoxazole using Sensititre kits DKMGN. Results. The MIC values of colistin, cefotaxime and tobramycin more than 8 yg/ml, as well as more than 2 yg/ml with respect to ertapenem was demonstrated for 100% of isolates. For most strains, the MIC values of imipenem and meropenem were more than 4 yg/ml. MIC of ceftazidime against 20% of Chryseobacterium spp. strains was up to 2 yg/ml. Indicators of MIC of amikacin in relation to Elizabethkingia spp. strains were 32 yg/ml or more. For 38% of the strains of Chryseobacterium spp. and E.falsenii, this value did not exceed 8 yg/ml. As in the case of amikacin, all Elizabethkingia spp. strains demonstrated high levels of gentamicin MIC - 8 yg/ml (25% of strains) and more (75% of strains). For 20% of all tested strains, the MIC value was in the range of < 2 yg/ml. In relation to half of the tested isolates, the MIC values for ceftazidime/avibactam, as well as ceftolozane/tazobactam were at the level of up to 2/4 yg/ml inclusive. More than a third of the strains had a level of MIC ciprofloxacin up to 0.25 fjg/ml inclusive. For 25% of strains, the level of MIC of tigecycline was up to 0.5 fjg/ml, inclusive, the lowest MIC indicators for the tested group of strains were demonstrated for trimethoprim/sulfamethoxazole: for 88% of strains, the MIC value was < 1/19 yg/ml, for another 9% of strains, this indicator was 2/38 yg/ml.

Conclusions. Representatives of the order Flavobacteriales are a group of microorganisms characterized by multiple antibiotic resistance. Most strains isolated from patients with cystic fibrosis in the Russian Federation retain low MIC values for trimethoprim/sulfamethoxazole.

Введение

Респираторный микробиом пациентов с муковисци-дозом представляет собой уникальную биологическую модель, изучению которой к настоящему времени было посвящено значительное количество исследований. Клиническая и патогенетическая роль многих преимущественно грамотрицательных бактериальных патогенов, таких как Pseudomonas aeruginosa, Achromobacter xylosoxidans/ruhlandii, Burkholderia cepacia complex в развитии респираторных осложнений данного заболевания убедительно доказана достаточной выборкой исследований [1, 2]. В то же время, широкое внедрение современных методов микробиологической диагностики в практическую работу микробиологических лабораторий различного уровня, включая идентификацию с использованием MALDI-ToF масс-спектрометрии, не только раскрывает перед бактериологами и клиницистами уникальный видовой спектр респираторных патогенов, но и ставит вопрос о потенциальном клиническом значении «новых» возбудителей и, как следствие, их антибио-тикорезистентности. Многие из таких представителей для удобства их интерпретации были классификационно отнесены к группе бактерий с неустановленным клиническим значением при муковисцидозе [3]. К одной из таких групп микроорганизмов относятся представители порядка Flavobacteriales. Доминирующими

по частоте выделения из респираторных образцов среди членов указанной группы являются представители рода Chryseobacterium, реже представители родов Empedobacter и Elizabethkingia.

В литературе все чаще появляются публикации, описывающие случаи выделения этих грамотрицатель-ных бактерий из респираторных образцов от пациентов с муковисцидозом. Так, в частности Lambíase A. и соавт. приводят описание выделения 35 штаммов Chryseobacterium spp. от 22 пациентов из 300, наблюдающихся в итальянском центре муковисцидоза. При этом авторами отмечается высокий уровень резистентности выделенных культур к антибактериальным препаратам [4]. В то же время, рядом испанских исследователей также приводятся случаи наблюдения за пациентами с муковисцидозом, колонизированными Chryseobacterium spp., при этом отмечаются в том числе и случаи хронического инфицирования, сопровождающиеся снижением легочной функции. Кроме того, авторы также отмечают высокий профиль ан-тибиотикорезистентности выделенных культур [5]. Коллективом исследователей из Франции приводятся описание результатов полногеномного секвенирова-ния штамма Chryseobacterium oraniemense, выделенного от пациента с муковисцидозом, демонстрирующее

Кондратенко О.В., Зубова К.В.

множественную лекарственную устойчивость, ассоциированную с различными механизмами, как и в случае описания резистома Chryseobacterium indologenes, также изолированного из мокроты французского пациента [6, 7]. Многочисленные случаи выделения представителей порядка Flavobacteriales из респираторных образцов от пациентов с муковисцидозом и профили их множественной лекарственной устойчивости в настоящее время описаны многими зарубежными авторами. Однако в отношении штаммов, выделенных от пациентов Российской Федерации, подобных исследований, к настоящему времени, не было представлено.

Цель

Проанализировать распределение значений минимальной подавляющей концентрации (МПК) антибактериальных препаратов в отношении представителей порядка Flavobacteriales, выделенных из респираторных образцов от пациентов с муковисцидозом в Российской Федерации, методом двойных серийных разведений.

Материалы и методы

Исследование проведено на базе Микробиологического отдела КДЛ Клиник ФГБОУ ВО СамГМУ Минздрава России. За период 2021-2022 гг. проведен отбор 100 штаммов бактерий, представителей порядка Flavobacteriales, выделенных из респираторных образцов от пациентов с муковисцидозом из 60 регионов России в рамках рутинного микробиологического обследования. Из них 75 представителей Chryseobacterium spp., среди которых С. arthrospherae - 28, C. formosense - 1, С. gambrini- 3, C. gleum - 10, C. indologenes - 20, C. joostei - 1, C. oraniemense - 10, C. shan-dongense - 2 штамма. Кроме этого в исследование включены 4 штамма Elizabethkingia spp., среди которых 2 - E. miricola, и по одному штамму E. meningoseptica и E. anopheles соответственно, а также 21 штамм Empe-dobacter falsenii. Идентификация всех выделенных культур проводилась с помощью MALDI-ToF масс-спектроме-трии (Bruker, Германия). Было проведено определение значений МПК в отношении 17 антимикробных препаратов: амикацин, амоксициллин/клавуланат, азтрео-нам, цефотаксим, цефтазидим, цефтазидим/авибактам, цефтолозан/тазобактам, ципрофлоксацин, колистин, эртапенем, гентамицин, имипенем, меропенем, пипе-рациллин/тазобактам, тигециклин, тобрамицин и три-метоприм/сульфаметоксазол с помощью наборов системы Sensititre DKMGN (TREK diagnostic system, Великобритания). Подготовка культур, инокуляция планшетов, культивирование и оценка результатов исследования проводилась в соответствии с рекомендациями производителя тест-системы. Поскольку в отношении указанной группы бактерий пограничные значения МПК в отношении исследуемых препаратов не установлены, разделение изолятов на категории по чувствительности/резистентности не проводилось, однако был выполнен анализ распределения значений МПК.

Кондратенко О.В., Зубова К.В.

Результаты

Распределение значений МПК колистина

Значение МПК колистина в отношении всех 100 протестированных изолятов составило более 8 мкг/мл. Данные результаты являются закономерными, т.к. исследуемые микроорганизмы относятся к группе колисти-норезистентных бактерий.

Распределение значений МПК карбапенемов и азтре-онама

Значения МПК эртапенема в отношении всех исследуемых культур составили > 2 мкг/мл. На Рисунке 1 представлены результаты определения чувствительности исследуемых штаммов к карбапенемам и азтреонаму. В результате проведенного исследования установлено, что в отношении 53,3% штаммов Chryseobacterium spp. значение МПК меропенема составило более 16 мкг/мл, для 24% было равно 16 мкг/мл, для 14,7% составило 8 мкг/мл. По 2,7% штаммов имели значение МПК меропенема 2 мкг/мл и 4 мкг/мл соответственно, и еще по 1,3% - 0,5 и 1 мкг/мл соответственно. В отношении 3 из 4 изолятов Elizabethkingia spp. и 38,1% изолятов Е. falsenii показатель МПК меропенема составил более 16 мкг/мл, среди остальных изолятов указанных бактерий ни один не имел уровень МПК менее 4 мкг/мл. Значение МПК имипенема в отношении большинства изолятов также находилось в диапазоне более 4 мкг/мл. Лишь 1,3% изолятов Chryseobacterium spp. и 4,8% - Е. falsenii демонстрировали уровень МПК равный 2 мкг/мл. В то же время 58,6% изолятов Chryseobacterium spp., 3 из 4 изолятов Elizabethkingia spp. и 9,5% - Е. falsenii показали значение МПК более 16 мкг/мл. Для 22,7% изолятов Chryseobacterium spp., 1 из 4 изолятов - Elizabethkingia spp. и 23,8% -Е. falsenii этот показатель был равен 16 мкг/мл. Кроме того, 6,7% и 10,7% изолятов Chryseobacterium spp., а также 38,1% и 23,8% - Е. falsenii демонстрировали значения МПК 4 мкг/мл и 8 мкг/мл соответственно. В отношении всех 4 штаммов Elizabethkingia spp., а также 98,7% штаммов Chryseobacterium spp. МПК азтрео-нама составила более 32 мкг/мл. Однако, среди представителей Е. falsenii 19,1% показали значения МПК азтреонама менее 0,5 мкг/мл, по 4,8% - 1 мкг/мл и 16 мкг/мл соответственно, по 14,3% - 4 мкг/мл и 8 мкг/мл соответственно. Значение МПК азтреонама более 32 мкг/мл установлено в отношении 42,7% изолятов Е. falsenii.

Распределение значений МПК цефалоспоринов

В отношении 100% исследуемых изолятов значение МПК цефотаксима составило более 8 мкг/мл. МПК цеф-тазидима в отношении 20% изолятов Chryseobacterium spp. не превышала 2 мкг/мл, при этом для 13,3% составила 2 мкг/мл, для 5,4% - 1 мкг/мл, и лишь в отношении 1,3% изолятов оказалась менее 0,5 мкг/ мл (Рисунок 2). Еще для 34,7% изолятов представителей данного вида это значение составило 4 мкг/мл. По 16% соответственно имели значения МПК 8 мкг/мл и

1%) 60

| 50

|5 40 Э

а зо

I 20

I 10

О

|%)

70 . 60

1 50

3 40 | 30

I 20 * 10

О

МП К меропенема

чо

0,00.00,0 0,00,00,0 '-01.3 00 1,01,30,0 2.02'7о,р У

КЗ I ¡14/ " Тл,

->.....ТГ:: ::::11

(%)

120 5 100 I 80

о 60

0 40

X

1 20

о

<0,5

1 2 4

Значение МПК, мкг/мл

0,12 0,25 0,5

Суммарно СНгувеоЬа(Летт зрр. II ЕтреёоЬас1ег $рр.

МПК имипенема

0,00,00,0

_

23,8 23,022,723,8

13'°10,;

11

I

16

2 4 8

Значение МПК, мкг/мл

III Суммарно Н СЬгу:воЬас1вп'ит !рр. ЕтревоЬа<Лвг 5рр.

МПК азтреонама

87 0

42,7

19 1

4'°0,0 1'°0,04'3 0,00,00,0 3,0 0(0 3,00(0 1,00,04'8 1,01,30,0

1 2 4 8 16 32

Значение МПК, мкг/мл III Суммарно Оцу5еоЬас(елшл $рр. 11 Етре<4оЬас1ег 5рр.

|%)

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

60 | 50 | 40

г зо | 20 I 10

о

1%) 45 ,40 ! 35 I 30 1 25 ! 20 I 15 ; ю

I 5

' о

1%) 45

0 40

1 35 | 30 э 25 | 20 | 15

; 10

МПК цефтазидима

28.6

1 2,013,3 I н 1

1.01,3 0,0 }Г\о ________ 0,

<0,5

I

16

2 4 8

Значение МПК, мкг/мл Суммарно С/»у5еоЬас4ег/|ш зрр. Етрес1оЬа&ег 5рр

МПК амикацина

28,6

ш 24,0 23.8 У |

_____-8.С________ 20 0 18 7

| _____________1

1_____________1 _____________1 пятоТ"

«______________ 4,8

8 16 32

Значение МПК, мкг/мл Суммарно II С/ну*еоЬас(ег/1Ш 5рр. ЕтресЬЬасЛег ¡рр.

МПК гентамицина

| 5,0 5,3 4,8 6,0

11......

_

<0,5 1 2 4 8

Значение МПК, мкг/мл Суммарно 0)гузеоЬас?ег/1Ж15рр. Етрес1оЬас1ег 5рр.

Рисунок 1. Значения МПК карбапенемов и азтреонама

Рисунок 2. Значения МПК цефтазидима и аминогликозидов

более 16 мкг/мл, и 13,3% - 16 мкг/мл. Все изоляты Elizabethkingia spp. демонстрировали уровень МПК более 16 мкг/мл. Для E. falsenii показатели МПК находились в диапазоне от 2 до 16 мкг/мл, при этом крайние значения отмечены для 9,5% изолятов, соответственно, в отношении большинства штаммов (52,4%) - этот показатель составил 4 мкг/мл, еще в отношении 28,6% изолятов - 8 мкг/мл.

Распределение значений МПК аминогликозидов

Интересные результаты были получены при определении МПК амикацина, которые также представлены на Рисунке 2. Все изоляты Elizabethkingia spp. демонстрировали высокие показатели МПК амикацина -32 мкг/мл (п = 1) и более (п = 3). Однако, при тестировании Chryseobacterium spp. и E. falsenii в отношениии 13,3% и 38,1% штаммов, соответственно, значение МПК было менее 4 мкг/мл. Для 38% штаммов значение МПК не превышало 8 мкг/мл. Как и в случае с ами-кацином, все изоляты Elizabethkingia spp. демонстрировали высокие показатели МПК гентамицина - 8 мкг/мл (п = 1) и более (п = 3). У 20% тестированных изолятов значения МПК находились в диапазоне < 2 мкг/мл. В отношении тобрамицина - одного из основных препаратов, применяющихся для терапии респираторных осло-

жений при муковисцидозе МПК для всех исследуемых изолятов составила > 8 мкг/мл.

Распределение значений МПК ингибиторозащищен-ных бета-лактамов

При определении МПК амоксициллина/клавуланата было показано, что в отношении Elizabethkingia spp. значения составили более 64/2 мкг/мл. Среди E. fal-senii этот показатель варьировал от менее 4/2 мкг/мл (для 9,5% изолятов), до более 64/2 мкг/мл (для 4,8% изолятов), находясь для большинства изолятов в диапазоне от 16/2 до 64/2 мкг/мл. Для подавляющего большинства изолятов Chryseobacterium spp. этот показатель находился в диапазоне значений от 64/2 мкг/мл (20%), и более 64/2 мкг/мл (60%) -Рисунок 3. На Рисунке 3 также представлены результаты определения значений МПК пиперациллина/тазо-бактама. Для 29% штаммов этот показатель находился в диапазоне до 4/4 мкг/мл и еще для 43% штаммов в границах от 8/4 до 16/4 мкг/мл. Три из четырех изолятов Elizabethkingia spp. имели значение МПК более 32/4 мгл/мл. Наименьшие значения МПК отмечены для E. falsenii, для 33,3% изолятов они составили менее 1/4 мкг/мл, для 28,5% - 8/4 мкг/мл, для 14,3% и 19,1 % - 16/4 и 32/4 мкг/мл соответственно.

Кондратенко О.В., Зубова К.В.

. 1%] МПК амоксициллина/клавуланата

| во .............................................................................................................

I 60 .............................................................................................................

8 40 ..........................................

8 20 ....„, ____

I °

,„ ■________________

_

<4/2 в/2 16/2 32/2 64/2

Значение МПК, мкг/мл

Суммарно СЬгужоЬасШ'шт зрр. Етрес1оЬа(Лег 8рр.

МПК пиперациллина/тазобактама

< 1/4

[%]

Я 35 I 30 г 25

I 20

" 15

В 10

2/4 4/4 8/4 16/4 32/4

Значение МПК, мкг/мл Суммарно СЬгуьеоЬасЗепигп :рр. Етрес1оЬа(Лег 5рр.

МПК цефтазидима/авибактама

23.8.....2ЗД

8 К

>64/2

>32/4

4,0 _

-«¡О-в,

........-•-

<0,5/4 1/4 00 2/4 4/4 8/4 16/4

Значение МПК, мкг/мл Суммарно ОнреоЬасХепит зрр. ЕтревоЬасЛег зрр.

МПК цефтолозана/тазобактама

...............................................зз.з........................................................................

23.8

! •г.с'Ь^.з

8-о9'\8......ад..........

• III э.о "• 1 1

<0,5/4 1/4 2/4 4/4 в/4 16/4 32/4 Значение МПК, мкг/мл Суммарно Ону5еоЬас4ег|ит 5рр. Етрес1оЬас1ег 5рр.

>16/4

6.05.3

II

>32/4

(%)

60 . 50 |40 о 30 | 20 | Ю 0

М 60

■ 50

| 40

1 30

| 20

| 10

МПК ципрофлоксацина

28,0

24,0 2,0 7,3 15 ,1

....... ....... | | 12, С 13,3 . А? ______9,0 I

Ь? Ь.3 0,0 II | 4" \\ II тт

<0,06

0,12

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

I

0,25 0,5

Значение МПК, мкг/мл Суммарно ■ С^гу5еоЬас(егшт 5рр. I I ЕтревоЬас1ег 5рр.

МПК тигециклина

3,0 2,7 'я 0 -

и.7 21,3 _.Ш!.....................

Ш!.....

II

1*1 100

60 40 20 0

< 0,25 0,5 1 2 4

Значение МПК, мкг/мл

I I Суммарно | СЬгуаеоЬас1епит $рр. II Етре(1оЬас1ег зрр. МПК триметоприма/сульфаметоксазола

9 0 та,г............................7....................................................-...... ] 0,0 2,0 1,3 4,8 0,0 0,0 0,0 1,0 0,0 4'8

< 1/19 2/38 4/76 8/152

Значение МПК, мкг/мл III Суммарно 11 С/1гу5еоЬас1еч'ит 5рр. ЕтреЬоЬасЛег 5рр.

>8/152

Рисунок 3. Значения МПК ингибиторозащищенных бета-лактамов

Среди Chryseobacterium spp. по 9,3% изолятов имели показатели МПК менее 1/4 мкг/мл, 2/4 мкг/мл, 4/4 мкг/мл, а также 32/4 мкг/мл; по 18,7% изолятов демонстрировали значение 16/4 мкг/мл, более 32/4 мкг/мл, и для 25,4% тестрируемых образцов он составил 8/4 мкг/мл.

Появление в последние годы «новых» ингибиторо-защищенных бета-лактамов, таких как цефтазидим/ авибактам и цефтолозан/тазобактам, в том числе и применительно к терапии респираторных осложнений у пациентов с муковисцидозом, актуализирует вопрос об их возможной эффективности и в отношении представителей порядка Flavobacteriales. На Рисунке 3 представлены результаты определения значений МПК цефтазидима/авибактама. Показано, что практически половина тестируемых изолятов сохраняла чувствительность к указанному препарату со значениями МПК до 2/4 мкг/мл включительно. Для 2 изолятов Elizabethkin-д'а spp. значения МПК цефтазидима/авибактама составили 8/4 мкг/мл, и более 16/4 мкг/мл - также для 2 изолятов. Значения МПК цефтолозана/тазобактама находились в диапазоне до 2/4 мкг/мл включительно для 59% изолятов. Для Elizabethkingia spp. значения МПК цефтолозана/тазобактама находились в диапазоне от 16/4 мкг/мл до более 32/4 мкг/мл.

Кондратенко О.В., Зубова К.В.

Рисунок 4. Значения МПК ципрофлоксацина, тигециклина и триметоприма/сульфаметоксазола

Распределение значений МПК ципрофлоксацина

Более 30% всех протестированных изолятов демонстрировали значение МПК ципрофлоксацина до 0,25 мкг/мл включительно (Рисунок 4). При этом для Elizabethkingia spp. значения МПК находились в диапазоне 0,25-0,5 мкг/мл. Большинство изолятов Е. falsenii, напротив, имели более высокие значения МПК - от 1 мкг/мл и более для 80% тестируемых культур.

Распределение значений МПК тигециклина

При оценке результатов определения чувствительности к тигециклину было установлено, что 25% штаммов имели МПК до 0,5 мкг/мл включительно (Рисунок 4). При этом для штаммов Elizabethkingia spp. значения МПК находились в диапазоне 0,5-1 мкг/мл.

Распределение значений МПК триметоприма/сульфаметоксазола

Наименьшие значения МПК в отношении тестируемой группы штаммов были показаны для триметоприма/ сульфаметоксазола. Полученные значения для исследуемых штаммов представлены на Рисунке 4. Установлено, что для 88% штаммов значение МПК составило < 1/19 мкг/мл, еще для 9% штаммов этот показатель составил 2/38 мкг/мл.

Заключение

Порядок Flavobacteriales представляет собой группу микроорганизмов, характеризующихся множественной антибиотикорезистентностью, как первичной, так и приобретенной. Длительное время указанные микроорганизмы не расценивались как клинически значимые. В последние годы их патогенетический потенциал продемонстрирован серией случаев наблюдения за пациентами по всему миру. Учитывая возрастающую роль этих микроорганизмов в структуре представителей респира-

торного микробиома российских пациентов с муковис-цидозом, изучение их антибиотикорезистентности может быть полезным как для микробиологов, так и для специалистов клинического профиля.

В результате проведенного исследования показано, что большинство изолятов представителей порядка Flavobacteriales, выделенных от пациентов с муковис-цидозом в Российской Федерации, имеют высокие значения МПК для широкого перечня антибактериальных препаратов, при этом сохраняют низкие значения МПК триметоприма/сульфаметоксазола.

Литература

1. Shaginyan I.A., Avetisyan L.R., Chernukha M.Yu., Siya-nova E.A., Burmistrov E.M., Voronkova A.Y., et al. Epidemiological significance of genome variations in Pseudomonas aeruginosa causing chronic lung infection in patients with cystic fibrosis. Kliniceskaa mikrobiologia i antimikrobnaa himioterapia. 2019;21(4):340-351. Russian. (Шагинян И.А., Аветисян Л.Р., Чернуха М.Ю., Сиянова Е.А., Бурмистров Е.В., Воронкова А.Ю. и со-авт. Эпидемиологическая значимость молекулярной изменчивости генома изолятов Pseudomonas aeruginosa, вызывающих хроническую инфекцию легких у больных муковисцидозом. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2019;21(4):340-351.) DOI: 10.36488/cmac.2019.4.340-351

2. Polikarpova S.V., Kondratyeva E.I., Shabalova L.A., Piv-kina N.V., Zhilina S.V., Voronkova A.Y., et al. Microflora of the respiratory tract in patients with cystic fibrosis and sensitivity to antibiotics based on a 15-year follow-up (20002015 years). Medicinskij sovet. 2016;15:84-89. Russian. (Поликарпова С.В., Кондратьева Е.А., Шабалова Л.А., Пивкина Н.В., Жилина С.В., Воронкова А.Ю. и соавт. Микрофлора дыхательных путей у больных муковис-цидозом и чувствительность к антибиотикам в 15-летнем наблюдении (2000-2015 гг.). Медицинский совет. 2016;15:84-89.) DOI: 10.21518/2079-701X-2016-15-84-89

3. Polikarpova S.V., Zhilina S.V., Kondratenko O.V., Lja-min A.V., Borzova Ju.V., Zhestkov A.V. Guidelines for the

microbiological diagnosis of respiratory tract infections in patients with cystic fibrosis. Tver', 2019. 128 р. Russian. (Поликарпова С.В., Жилина С.В., Кондратенко О.В., Лямин А.В., Борзова Ю.В., Жестков А.В. Руководство по микробиологической диагностике инфекций дыхательных путей у пациентов с муковисцидозом. Тверь, 2019. 128 с.)

Lambiase A., Del Pezzo M., Raia V., Sepe A., Ferri P., Rossano F. Chryseobacterium respiratory tract infections in patients with cystic fibrosis. J Infect. 2007;55(6):518-523. DOI: 10.1016/j.jinf.2007.08.002 Guiu A., Buendía B., Llorca L., Gómez Punter R.M., Girón R. Chryseobacterium spp., ¿nuevo patógeno oportunista asociado a fibrosis quística? [Chryseobacterium spp., a new opportunistic pathogen associated with cystic fibrosis?]. Enferm Infecc Microbiol Clin. 2014;32(8):497-501. Spanish. DOI: 10.1016/j.eimc.2013.08.003 Sharma P., Gupta S.K., Diene S.M., Rolain J.M. Whole-genome sequence of Chryseobacterium oranimense, a colistin-resistant bacterium isolated from a cystic fibrosis patient in France. Antimicrob Agents Chemother. 2015;59(3):1696-1706. DOI: 10.1128/AAC.02417-14 Cimmino T., Rolain J.M. Whole genome sequencing for deciphering the resistome of Chryseobacterium indologenes, an emerging multidrug-resistant bacterium isolated from a cystic fibrosis patient in Marseille, France. New Microbes New Infect. 2016;12:35-42. DOI: 10.1016/j.nmni.2016.03.006

Кондратенко О.В., Зубова К.В.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.