CC BY
43
Вестник Пермского университета. Серия Биология. 2023. Вып. 1. С. 58-64. Bulletin of Perm University. Biology. 2023. Iss. 1. P. 58-64.
МИКРОБИОЛОГИЯ
Обзорная статья УДК 579.61
doi: 10.17072/1994-9952-2023-1-58-64
Бактерии порядка Flavobacteriales: экологические особенности и клиническое значение в развитии патологии человека: обзор
Ксения Валерьевна Зубова
Саратовский национальный исследовательский государственный университет им. Н.Г. Чернышевского, Саратов, Россия, [email protected], https://orcid.org/0000-0002-9406-080X
Аннотация. Представлены характеристики отдельных представителей порядка Flavobacteriales, в частности, клинически значимых флавобактерий семейства Weeksellaceae. Описаны морфологические, культуральные, биохимические свойства значимых для медицины и биологии видов Chryseobacterium, Elizabethkingia и Empedobacter. Отмечен ряд их физиологических особенностей. Приведены некоторые данные о филогении этих организмов. Рассмотрены экологические характеристики, представлены сведения о некоторых видах, патогенных для человека и животных, приведены литературные данные о резистентности к современным антимикробным препаратам. Описаны клинические случаи инфицирования бактериями родов Chryseobacterium, Elizabethkingia и Empedobacter, особенности вызываемых ими заболеваний, а также приведены данные о частоте инфицирования этими микроорганизмами. Выявлено, что виды, относящиеся к порядку Flavobacteriales, могут представлять опасность для людей с ослабленным иммунитетом, с хроническими заболеваниями, такими как муковисцидоз и онкология, а также для младенцев и пожилых людей. Установлено, что представители порядка вызывают нозокомиальные инфекции. Установлено, что клинически значимые виды флавобактерий имеют природную устойчивость к широкому спектру антимикробных препаратов, что затрудняет подбор эффективной этиотропной терапии.
Ключевые слова: Flavobacteriales, морфология, биохимические свойства, условно-патогенные флаво-бактерии, нозокомиальные инфекции
Для цитирования: Зубова К. В. Бактерии порядка Flavobacteriales: экологические особенности и клиническое значение в развитии патологии человека: обзор // Вестник Пермского университета. Сер. Биология. 2023. Вып. 1. С. 58-64. http://dx.doi.org/10.17072/1994-9952-2023-1-58-64.
MICROBIOLOGY
Review article
The order Flavobacteriales: ecological features and clinical significance in the development of human pathology: review
Ksenia V. Zubova
Saratov National Research State University named after N.G. Chernyshevsky, Saratov, Russia, [email protected], https://orcid.org/0000-0002-9406-080X
Abstract. The article presents an overview of some representatives of the order Flavobacteriales, in particular clinically significant members of the family Weeksellaceae. Morphological, cultural, and biochemical properties of species important for medicine and biology, namely Chryseobacterium, Elizabethkingia, and Empedobacter, are described. Several physiological features are highlighted. Some data on the phylogeny of these organisms are given. Ecological characteristics are considered, and information about some pathogenic species for humans and animals is presented. Also, literature data on resistance to currently available antimicrobial drugs are given. Clinical cases of infections with bacteria of the genera Chryseobacterium, Elizabethkingia, and Empedobacter, features of the diseases caused, and data on the frequency of infections with these microorganisms are reported. Based on the analyzed data, it has been revealed that species belonging to the order Flavobacteriales may pose a risk to immunocompromised people, to patients with chronic diseases such as cystic fibrosis and oncology, and to infants and the elderly. It has been established that representatives of the order cause nosocomial infections. It has been also found that clinically significant species have intrinsic resistance to a wide range of antimicrobials, and therefore the selection of etiotropic therapy is difficult.
Keywords: Flavobacteriales, morphology, biochemical properties, conditionally pathogenic microorganisms, nosocomial infections
58_
© Зубова К. В., 2023
For citación: Zubova K. V. [The order Flavobacteriales: ecological features and clinical significance in the development of human pathology: review]. Bulletin of the Perm University. Biology. Iss. 1 (2023): рр. 58-64. (In Russ.). http://dx.doi.org/10.17072/1994-9952-2023-1-58-64.
Введение
Неферментирующие грамотрицательные бактерии (НФГОБ) играют важную роль в этиологической структуре инфекционных осложнений, особенно для пациентов на фоне иммуносупрессии различного генеза. Многие из видов группы НФГОБ являются представителями ризобиома ряда растений, почвенного и водного микробиома. Учитывая их широкую распространенность не только в условиях лечебно -профилактических учреждений (ЛПУ), но и в окружающей среде, возникает вопрос о необходимости оценки патогенетического потенциала и микробиологических рисков для пациентов в отношении не только бактерий с доказанным клиническим значением (Pseudomonas aeruginosa, Stenotrophomonas maltophilia, Acinetobacter baumanii), но и представителей порядка Flavobacteriales.
Стремительное развитие в последние годы микробиологии, возможность использования метода вре-мяпролетной MALDI-ToF масс-спектрометрии для рутинной идентификации, открыли перед бактериологами и биологами гетерогенную группу возбудителей с неустановленным клиническим значением. С целью понимания их роли в развитии патологии человека нами проведена работа по изучению и структурированию имеющихся в литературе научных данных.
В последние годы все чаще обнаруживаются сообщения об инфекциях, которые связаны с представителями порядка Flavobacteriales, а именно родов Chryseobacterium, Elizabethkingia и Empedobacter семейства Weeksellaceae. Бактерии этого порядка характеризуются высокой устойчивостью к факторам внешней среды и широким ареалом обитания [McBride, 2014]. Флавобактерии этих родов относятся к группе НФГОБ, обладающих множественной лекарственной устойчивостью к широкому спектру антибиотиков: пенициллинам, цефалоспоринам первого и второго поколений, цефтриаксону, азтреонаму, хлорамфени-колу, эритромицину, аминогликозидам, имипенему и меропенему, а также способностью к продукции карбапенемаз. Для флавобактерий семейства Weeksellaceae характерно отсутствие полных структурированных данных о их клиническом и эпидемиологическом значении [Carvalho, Marson, Levy, 2017]. Муль-тирезистентность бактерий родов Chryseobacterium, Elizabethkingia и Empedobacter вызывает сложности в подборе этиотропной терапии и усиливает риски неблагоприятного течения инфекции.
Особенности флавобактерий рода Chryseobacterium
Род Chryseobacterium представлен грамотрицательными, аэробными, неподвижными, каталазо- и оксидазоположительными бактериями. В окрашенных по Граму мазках возбудители имеют вид длинных, тонких и изогнутых палочек. Все штаммы Chryseobacterium spp. гидролизуют желатин и эскулин. Результаты некоторых биохимических тестов (например, тест на ДНКазу, уреазу, гидролиз крахмала) могут варьировать и зависят от выбора питательной среды, химических реактивов и длительности инкубации [Pickett, 1989]. Хризеобактерии дают положительную реакцию на индол, которая часто бывает слабовыраженной. В этом случае для ее проведения следует использовать наиболее чувствительный метод Эрлиха [Боронина и др., 2003]. Chryseobacterium spp. хорошо растут на простых питательных средах, кровяном и шоколадном агаре, образуя колонии в течение 24 ч. Оптимальная температура инкубации составляет 35-37°С. Значительно медленнее хризеобактерии растут на агаре МакКонки, в некоторых случаях рост может отсутствовать. Характеризуются способностью при росте на питательных средах продуцировать желтый или оранжевый пигмент различной интенсивности.
Чаще всего хризеобактерии являются возбудителями инфекций мочевыводящих путей и легких. В литературе описан клинический случай мочекаменной болезни, ассоциированной с Chryseobacterium gleum [Garg et al., 2015]. Есть данные о развитии пневмонии у грудного ребенка, поступившего с нефро-токсическим синдромом и подключенного к аппарату искусственной вентиляции легких. При этом показано, что пневмония вызвана присутствием представителей вида C. gleum, выделенных из трахеальной трубки аппарата.
По данным D.E. Izaguirre-Anariba и V. Sivapalan [2020], представители вида C. indologenes могут являться причиной возникновения бактериемии. Флавобактерии были выделены из гемокультуры пожилого мужчины с терминальной стадией почечной недостаточности. P.R. Hsueh et al. [1996] описали случаи бактериемии у 12 пациентов на юге Тайваня за период с 1992 по 1994 гг. Как отметили авторы, у шести пациентов была диагностирована пневмония, у двоих - первичная бактериемия, связанная с контаминацией множественных ожогов, четверо пациентов имели диагнозы: пионефроз, перитонит, инфекция жел-чевыводящих путей и хирургическая раневая инфекция. У пяти пациентов из списка обнаружены злокачественные новообразования [Hsueh et al., 1996].
Большое исследование на тему инфицирования пациентов с муковисцидозом флавобактериями
Chryseobacterium и Elizabethkingia провели в педиатрическом отделении университетской больницы Хаджеттепе (Анкара, Турция) в период с 2012 по 2016 гг. Авторы получили 18 изолятов, принадлежащих к роду Chryseobacterium (в частности, 6 штаммов C. indologenes и 2 штамма C. gleum) и 5 изолятов Elizabethkingia (3 штмма E. meningoseptic и 2 штамма E. anophelis), при этом H.C. Mirza et al. [2018] отметили, что из всех пациентов отделения у 81.8% был поставлен диагноз муковисцидоз.
A. Guiu et al. [2014] свидетельствуют о увеличении роли флавобактерий Chryseobacterium в патологии дыхательной системы у больных муковисцидозом. За три года наблюдений увеличилось число больных, инфицированных бактериями Chryseobacterium spp., от 9 пациентов было выделено 17 изолятов. Авторы указывают, что у троих пациентов наблюдалась хроническая колонизация Chryseobacterium spp., а у одного из пациентов значительно нарушилась функция легких. Следует учитывать, что хризеобактерии характеризуются как генетически детерминированной, так и приобретенной множественной лекарственной устойчивостью. В отсутствии рекомендаций по определению чувствительности для данной группы флавобактерий, подбор препаратов для терапии может представлять значительную сложность для клиницистов.
Особенности представителей рода Elizabethkingia
В 2005 г. вышла статья K.K. Kim et al., [2005] о реклассификации на основании анализа секвенирова-ния гена 16S рРНК флавобактерий, принадлежащих ранее к видам C. meningosepticum и C. miricola. Авторами предложен новый таксон Elizabethkingia gen. nov. Бактерии получили новые названия, такие как E. meningoseptica и E. miricola соответственно. Представители вновь предложенного таксона E. menin-goseptica, как и их близкородственные флавобактерии Chryseobacterium spp., являются новыми патогенами, которые могут вызывать серьезные проблемы у пациентов, госпитализированных в стационары, в частности, в палаты интенсивной терапии и реанимации. Опасность бактерий вида E. meningoseptica заключается в их множественной лекарственной устойчивости и способности адаптироваться к различным условиям среды обитания. Данные микроорганизмы способны вызывать бактериемию, менингиты, заболевания респираторного тракта, в частности пневмонии, бронхиты и заболевания носоглотки. Чаще всего этот инфекционный агент поражает людей с хроническими заболеваниями, с ослабленным иммунитетом, недоношенных детей, а также пациентов, находящихся на длительной внутривенной антибиотикотера-пии [Jean et al., 2014]. Для лечения инфекции, вызванной флавобактериями E. meningoseptica, используют ванкомицин, рифампицин, новые фторхинолоны, комбинацию пиперациллин-тазобактам, миноциклин и тигециклин.
G.H. Pereira et al. [2013] показали, что за двухгодичный период с августа 2010 и по апрель 2012 г. в больнице при институте Данте Паццанезе и в больнице Бригадейро (Сан-Пауло, Бразилия) было выявлено девять пациентов, инфицированных бактериями E. meningoseptica. Все инфекции были внутриболь-ничными и регистрировались в отделении кардиоторакальной хирургии, а также в трансплантологиче-ском и гематологическом отделениях. Чаще всего флавобактерии вызывали бактериемию, образуя биопленки в венозных катетерах. По данным Y.T. Lin et al. [2009], флавобактерии E. meningoseptica имели хромосомные гены GOB-18 и BlaB, ответственные за продукцию металло^-лактамаз, которые могут гидролизовать большинство бета-лактамных антибиотиков. Эти бактерии имели природную устойчивость к большинству ß-лактамов, включая карбапенемы. Однако они чувствительны к антибиотикам (ванкомицин, хинолоны, триметоприм-сульфаметоксазол, тигециклин и рифампицин), которые эффективны против грамположительных бактерий.
Флавобактерии, принадлежащие к виду E. anopheles, впервые были выделены из дыхательных путей человека во время вспышки пневмонии в начале января 2016 г. в штате Висконсин (США). В клинической картине у пациентов отмечались сильная лихорадка и затрудненное дыхание. Большинство заболевших оказались старше 65 лет. Вспышка привела к гибели не менее 20 человек из 65 заболевших. Ранее, в 2011 г., представители вида E. anopheles были выделены из кишечника комаров. Однако этот факт не позволил установить причину вспышки пневмонии среди населения штата Висконсин [Janda, Lopez-Denise, 2017].
От пациентов, больных муковисцидозом, также выделяют флавобактерии рода Elizabethkingia. В 2018 г. H.C. Mirza et al. [2018], при изучении респираторной микрофлоры больных муковисцидозом, выделили 5 изолятов Elizabethkingia spp., 3 из которых принадлежали к виду E. meningoseptica, 2 - к E. anopheles. E. Snesrud, P. McGann, E. Walsh [2019] описали случаи заражения бактериями E. anopheles в Нью-Йорке (США). В 2017 г. от 4 пациентов разного пола и возраста были получены изоляты E. anophelis, при этом у одного пациента диагностирован муковисцидоз. Эти бактерии обнаруживались в крови пациентов, у всех было тяжелое состояние при поступлении, связанное с обострением хронических заболеваний.
В исследованиях D.T.D. Kenna et al. [2018] показано, что в Великобритании у пациентов, больных муковисцидозом, преобладали флавобактерии вида E. miricola. У 38 пациентов выделили 43 изолята, относящихся к данному виду. У больных муковисцидозом был проведен анализ на определение чувствитель-
ности к антибиотикам. 12 изолятов от общего числа оказались устойчивы к бета-лактамам, за исключением комбинации пиперациллин-тазобактам. Выраженная степень чувствительности была обнаружена только к миноциклину и ко-тримоксазолу. С использованием гель-электрофореза в импульсном поле были выявлены 4 общих штамма среди 17 пациентов с муковисцидозом в одной педиатрической клинике, но эпидемиологические исследования не подтвердили передачу инфекции от пациента к пациенту.
Особенности представителей рода Empedobacter
Еще одними потенциальными возбудителями у пациентов с иммуносупрессией различной этиологии можно назвать представителей рода Empedobacter. По литературным данным, бактерии рода Empedobac-ter выделяются из клинических образцов крови, органов дыхания, ран, плевральной жидкости и мочевы-водящих путей. Как и другие представители семейства Weeksellaceae, они имеют природную устойчивость ко многим антибиотикам, включая карбапенемы, что является серьезной проблемой при подборе эффективной этиотропной терапии.
Представители вида Empedobacter falsenii могут вызывать инфекции урогенитального тракта, дыхательных путей, раневых поверхностей и неонатальный менингит. Голландские исследователи описали случай инфицирования бактериями E. falsenii мочевыводящих путей младенца. D. Sharma et al. [2016] описали случай бактериемии и менингита у новорожденной девочки, которая поступила в отделение интенсивной терапии спустя три часа после рождения. В крови и ликворе были обнаружены бактерии E. brevis. С использованием теста на чувствительность к антибактериальным препаратам показано, что изолированный штамм был чувствителен к тетрациклину, тигециклину и цефоперазону-сульбактаму и устойчив к ципрофлоксацину, колистину, амикацину, амоксиклав, ампициллину, цефазолину, цефепиму, цефотаксиму, цефтазидиму, цефиксиму, эртапенему, гентамицину, имипенему, левофлоксацин, меропе-нем, комбинации пиперациллин + тазобактам, пиперациллин и тобрамицин. Выздоровление пациентки наступило после проведения внутривенной антибиотикотерапии цефоперазон-сульбактам. В книге «Atypical Bacteria in the CF Airways: Diversity, Clinical Consequences, Emergence and Adaptation» описываются случаи инфицирования пациентов бактериями E. falsenii и E. brevis [Marchandin, Michon, Jumas-Bilak, 2012]. Имеются данные об инфицировании детей с муковисцидозом мультирезистентными бактериями E. falsenii [Tural et al., 2021]. Описана полирезистентность бактерий рода Empedobacter к таким антибиотикам, как ампициллин, ампициллин-сульбактам, меропенем, ко-тримаксазол, ципрофлоксацин, имипенем, пиперациклин-тазобактам и колистин [Matías et al., 2015; Zaman et al., 2017].
Заключение
Бактерии родов Chryseobacterium, Elizabethkingia и Empedobacter представляют интерес для медицинских микробиологов и клиницистов как потенциально опасные патогены, которые все чаще выявляются в медицинских учреждениях, а также у людей с хроническими заболеваниями. Отсутствие всестороннего изучения особенностей данных бактерий как возбудителей бактериальных осложнений является проблемой, которая сказывается на успехе лечения пациентов и идентификации бактерий, ставит под вопрос эпидемиологические особенности распространения и передачи. Подходы к терапии инфекций, ассоциированных с видами родов Chryseobacterium, Elizabethkingia и Empedobacter к настоящему времени не разработаны, нет единого стандартизированного протокола лечения и диагностики инфекций, вызванных данными бактериями. Отдельную проблему представляет сложность микробиологической диагностики родов семейства Weeksellaceae, ввиду возможности их некорректной идентификации как представителей других, близких к ним родов Cytophaga, Aeromonas spp. или Sphingobacterium spp. Высокий уровень резистентности к широкому спектру антибактериальных препаратов, устойчивость в окружающей среде, неясный механизм передачи инфекции, а также наличие генов вирулентности позволяют предположить возможность включения указанных возбудителей в список патогенов, имеющих значение в развитии нозокомиальных инфекций. Требуется накопление клинического опыта наблюдений за пациентами, колонизированными указанными возбудителями для лучшего понимания их роли в патологических состояниях, а также для оптимизации протоколов микробиологической диагностики и терапии.
Список источников
1. Боронина Л.Г. и др. Род Chryseobacterium (Flavobacterium): клиническое значение, идентификация, чувствительность к антибиотикам // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2003. Т. 5, № 3. С. 243-250. URL: https://cmac-journal.rU/publication/2003/3/cmac-2003-t05-n3-p243/
2. Зубова К.В. и др. Видовой состав представителей порядка Flavobacteriales, выделенных от пациентов с муковисцидозом в Российской Федерации за 2019-2021 гг. // Проблемы медицинской микологии. 2022. Т. 24, № 2. С. 74-75.
3. Abdalhamid B. et al. Chryseobacterium gleum pneumonia in an infant with nephritic syndrome // IDCases. 2016. Vol. 5. P. 34-36. DOI: 10.1016/j.idcr.2016.06.004
4. Garg S. et al. Pyonephrosis dueto Chryseobacterium gleum: a first case report // Indian Journal of Medical Microbiology. 2015. Vol. 2, № 33. P. 311-313. DOI: 10.4103/0255-0857.154894
5. Carvalho F.É.B., Marson A.L., Levy C.E. Challenges in the identification of Chryseobacterium indolo-genes and Elizabethkingia meningoseptica in cases of nosocomial infections and patients with cystic fibrosis // New Microbes and New Infections. 2017. Vol. 20. P. 27-33. DOI: 10.1016/j.nmni.2017.09.002
6. Guiu A. et al. Chryseobacterium spp., a new opportunistic pathogen associated with cystic fibrosis? // Enfermedades Infecciosas Microbiología Clinica. 2014. Vol. 32, № 8. P. 497-501. DOI: 10.1016/j.eimc.2013.08.003
7. Hsueh P.R. et al. Flavobacterium indologenes bacteremia: clinical and microbiological characteristics // Clinical Infectious Diseases. 1996. Vol. 23, № 3. P. 550-555. DOI: 10.1093/clinids/23.3.550
8. Izaguirre-Anariba D.E., Sivapalan V. Chryseobacterium indologenes, an emerging bacteria: A case report and review of literature // Cureus. 2020. Vol. 12, № 1. Article e6720. DOI: 10.7759/cureus.6720
9. Janda J.M., Lopez-Denise L. Mini review: New pathogen profiles: Elizabethkingia anopheles // Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. 2017. Vol. 88. P. 201-205. DOI: 10.1016/j.diagmicrobio.2017.03.007
10. Jean S.S. et al. Elizabethkingia meningoseptica: an important emerging pathogen causing healthcare-associated infections // Journal of Hospital Infection. 2014. Vol. 86, № 4. P. 244-249. DOI: 10.1016/j.jhin.2014.01.009
11. Kamran Z. et al. Empedobacter falsenii: a rare non-fermenter causing urinary tract infection in a child with bladder cancer // SOA: Clinical Medical Cases, Reports & Reviews. 2017. Vol. 1, № 1. P. 1-3. DOI: 10.12998/wjcc.v5.i5.187
12. Kenna D.T.D. et al. rpoB gene sequencing highlights the prevalence of an E. miricola cluster over other Elizabethkingia species among UK cystic fibrosis patients // Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. 2018. Vol. 90. P. 109-114. DOI: 10.1016/j.diagmicrobio.2017.10.014
13. Kim K.K. et al. Transfer of Chryseobacterium meningosepticum and Chryseobacterium miricola to Eliz-abethkingia gen. nov. as Elizabethkingia meningoseptica comb. nov. and Elizabethkingia miricola comb. nov. // International Journal of Systematic and Evolution Microbiology. 2005. Vol. 55. P. 1287-1293. DOI: 10.1099/ijs.0.63541-0
14. Lin Y.-T. et al. Tigecycline and colistin susceptibility of Chryseobacterium meningosepticum isolated from blood in Taiwan // International Journal of Antimicrobial Agents. 2009. Vol. 34, № 1. P. 100-101. DOI: 10.1016/j.ijantimicag.2009.01.011
15. Marchandin H., Michon A.L., Jumas-Bilak E. Atypical Bacteria in the CF Airways // Diversity, Clinical Consequences, Emergence and Adaptation. 2012. URL: https://www.researchgate.net/publication/224829099. DOI: 10.5772/30253
16. McBride M.J. The family Flavobacteriaceae // The Prokaryotes. 2014. P. 643-667. DOI: 10.1007/978-3-642-38954-2_130
17. Mirza H.C. et al. Clinical strains of Chryseobacterium and Elizabethkingia spp. isolated from pediatric patients in a university hospital: Performance of MALDI-TOF MS-based identification, antimicrobial susceptibilities, and baseline patient characteristics // Microbial Drug Resistance. 2018. Vol. 24, № 6. P. 816-821. DOI: 10.1089/mdr.2017.0206
18. Pereira G.H. et al. Nosocomial infections caused by Elizabethkingia meningoseptica: An emergent pathogen // The Brazilian Journal of Infectious Diseases. 2013. Vol. 17, № 5. P. 606-609. DOI: 10.1016/j.bjid.2013.02.011
19. Pickett M.J. Methods for identification of flavobacteria // Journal of Clinical Microbiology. 1989. Vol. 27. P. 2309-2315. DOI: 10.1128/jcm.27.10.2309-2315.1989.
20. Sharma D. et al. Empedobacter brevis meningitis in a neonate: A very rare case of neonatal meningitis and literature review // Case Reports in Pediatrics. 2016. Vol. 5. P. 1-4. DOI: 10.1155/2016/7609602
21. Snesrud E., McGann P., Walsh E. Clinical and genomic features of the first cases of Elizabethkingia anopheles infection in New York, including the first case in a healthy infant without previous nosocomial exposure // Journal of the Pediatric Infectious Diseases Society. 2019. Vol. 8, № 3. P. 269-271. DOI: 10.1093/jpids/piy071
22. Tural D.A. et al. Clinical characteristics of children with cystic fibrosis infected with unusual bacteria // Minerva Pediatr (Torino). 2021. Apr. 15. P. 111-114. DOI: 10.23736/S2724-5276.21.06189-2
23. Van der Velden et al. First report of a Wautersiella falsenii isolated from the urine of an infant with pyelonephritis // Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. 2012. Vol. 4, № 74. P. 404-405. DOI: 10.1016/j.diagmicrobio.2012.08.008
References
1. Boronina L.G., Kukushkina M.P., Krutova K.V., Blinova S.M. [The genus Chryseobacterium (Flavobac-terium): Clinical significance, identification, sensitivity to antibiotics]. Kliniceskaja mikrobiologija i antimikrobnaja chimioterapija. V .5, No. 3 (2003): pp. 243-250. (In Russ.). Available at: https://cmac-journal.ru/publication/2003/3/cmac-2003-t05-n3-p243/.
2. Zubova K.V., Kuzmina E.A., Kondratenko O.V., Glinskaya E.V. [Species composition of representatives of the order Flavobacteriales isolated from patients with cystic fibrosis in the Russian Federation for 2019-2021]. Problemy medicinskoj mikologii. V. 24, No. 2 (2022): pp. 74-75. (In Russ.).
3. Abdalhamid B., Elhadi N., Alsamman K., Aljindan R. Chryseobacterium gleum pneumonia in an infant with nephritic syndrome. IDCases. V. 5 (2016): pp. 34-36. DOI: 10.1016/j.idcr.2016.06.004.
4. Garg S., Appannanavar S.B., Mohan B., Taneja N. Pyonephrosis due to Chryseobacterium gleum: a first case report. Indian Journal of Medical Microbiology. V. 2, No. 33 (2015): pp. 311-313. DOI: 10.4103/02550857.154894
5. Carvalho F.É.B., Marson A.L., Levy C.E. Challenges in the identification of Chryseobacterium indolo-genes and Elizabethkingia meningoseptica in cases of nosocomial infections and patients with cystic fibrosis. New Microbes and New Infections. V. 20 (2017): pp. 27-33. DOI: 10.1016/j.nmni.2017.09.002.
6. Guiu A., Buendía B., Llorca L., Gómez Punter R.M., Girón R. Chryseobacterium spp., a new opportunistic pathogen associated with cystic fibrosis? Enfermedades Infecciosas Microbiologia Clinica. V. 32, No. 8 (2014): pp. 497-501. DOI: 10.1016/j.eimc.2013.08.003.
7. Hsueh P.R., Hsiue T.R., Wu J.J., Teng L.J., Ho S.W, Hsieh W.C., Luh K.T. Flavobacterium indologenes bacteremia: clinical and microbiological characteristics. Clinical Infectious Diseases. V. 23, No. 3 (1996): pp. 550-555. DOI: 10.1093/clinids/23.3.550.
8. Izaguirre-Anariba D.E., Sivapalan V. Chryseobacterium indologenes, an emerging bacteria: A case report and review of literature. Cureus. V. 12, No. 1 (2020): Article e6720. DOI: 10.7759/cureus.6720.
9. Janda J.M., Lopez-Denise L. Mini review: New pathogen profiles: Elizabethkingia anopheles. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. V. 88 (2017): pp. 201-205. DOI: 10.1016/j.diagmicrobio.2017.03.007.
10. Jean S.S., Lee W.S., Hen F.L., Ou T.Y., Hsueh P.R. Elizabethkingia meningoseptica: an important emerging pathogen causing healthcare-associated infections. Journal of Hospital Infection. V. 86, № 4 (2014): pp. 244-249. DOI: 10.1016/j.jhin.2014.01.009.
11. Kamran Z., Parakriti G., Varpeet K., Balvinder M., Neelam T. Empedobacter falsenii: a rare non-fermenter causing urinary tract infection in a child with bladder cancer. SOA: Clinical Medical Cases, Reports & Reviews. V. 1, No. 1 (2017): pp. 1-3. DOI: 10.12998/wjcc.v5.i5.187.
12. Kenna D.T.D., Fuller A., Martin K., Perry C., Pike R., Burns P.J., Narayan O., Wilkinson S., Hill R., Woodford N., Logan J.M.J., Turton J. rpoB gene sequencing highlights the prevalence of an E. miricola cluster over other Elizabethkingia species among UK cystic fibrosis patients. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. V. 90 (2018): pp. 109-114. DOI: 10.1016/j.diagmicrobio.2017.10.014.
13. Kim K.K., Kim M.K., Lim J.H., Park H.Y., Lee S.T. Transfer of Chryseobacterium meningosepticum and Chryseobacterium miricola to Elizabethkingia gen. nov. as Elizabethkingia meningoseptica comb. nov. and Elizabethkingia miricola comb. nov. International Journal of Systematic and Evolution Microbiology. V. 55 (2005): pp. 1287-1293. DOI: 10.1099/ijs.0.63541-0.
14. Lin Y.-T., Chan Y.-J., Chiu C.-H., Lin M.-L., Yu K.-W., Wang F.-D., Liu C.-Y. Tigecycline and colistin susceptibility of Chryseobacterium meningosepticum isolated from blood in Taiwan. International Journal of Antimicrobial Agents. V. 34, No. 1 (2009): pp. 100-101. DOI: 10.1016/j.ijantimicag.2009.01.011.
15. Marchandin H., Michon A. L., Jumas-Bilak E. Atypical Bacteria in the CF Airways. Diversity, Clinical Consequences, Emergence and Adaptation. Cystic Fibrosis - Renewed Hopes through Research. Croatia, 2012. P. 30. DOI: 10.5772/30253.
16. McBride M. J. The Family Flavobacteriaceae. The Prokaryotes. (2014): pp. 643-667. DOI: 10.1007/978-3-642-38954-2_130.
17. Mirza H. C., Tuncer O., Olmez S. et al. Clinical Strains of Chryseobacterium and Elizabethkingia spp. Isolated from Pediatric Patients in a University Hospital : Performance of MALDI-TOF MS-Based Identification, Antimicrobial Susceptibilities, and Baseline Patient Characteristics. Microbial Drug Resistance. V. 24, No. 6 (2018): pp. 816-821. DOI: 10.1089/mdr.2017.0206.
18. Pereira G.H., Garcia D.O, Abboud C.S., Barbosa V.L., Silva P.S. Nosocomial infections caused by Elizabethkingia meningoseptica : An emergent pathogen. The Brazilian Journal of Infectious Diseases. V. 17, No. 5 (2013): pp. 606-609. DOI: 10.1016/j.bjid.2013.02.011.
19. Pickett M. J. Methods for identification of flavobacteria. Journal of Clinical Microbiology. V. 27 (1989): pp. 2309-2315. DOI: 10.1128/jcm.27.10.2309-2315.1989.
20. Sharma D., Patel A., Soni P., Sharma P., Gupta B. Empedobacter brevis Meningitis in a Neonate: A Very Rare Case of Neonatal Meningitis and Literature Review. Case Reports in Pediatrics. V 5 (2016): pp. 1-4. DOI: 10.1155/2016/7609602.
21. Snesrud E., McGann P., Walsh E. Clinical and Genomic Features of the First Cases of Elizabethkingia anophelis Infection in New York, Including the First Case in a Healthy Infant Without Previous Nosocomial Exposure. Journal of the Pediatric Infectious Diseases Society. V. 8, No. 3 (2019): pp. 269-271. DOI: 10.1093/jpids/piy071.
22. Tural D.A., Ersöz D.D., Emiralioglu N., Ozsezen B., Hazirolan C., Valcin E., Örgelik U., Kiper N. Clinical characteristics of children with cystic fibrosis infected with unusual bacteria. Minerva Pediatr (Torino). Apr. 15 (2021): pp. 111-114. DOI: 10.23736/S2724-5276.21.06189-2.
23. Van der Velden L., Jong A.S., Jong H., de Gier R. et al. First report of a Wautersiella falsenii isolated from the urine of an infant with pyelonephritis. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. V. 4, No. 74 (2012): pp. 404-405. DOI: 10.1016/j.diagmicrobio.2012.08.008.
Статья поступила в редакцию 17.11.2022; одобрена после рецензирования 11.01.2023; принята к публикации 22.02.2023.
The article was submitted 17.11.2022; approved after reviewing 11.01.2023; accepted for publication 22.02.2023.
Информация об авторе
К. В. Зубова - аспирант кафедры микробиологии и физиологии растений. Information about the author
К. V. Zubova -postgraduate student of the Department of Microbiology and Plant Physiology.
