CC BY
0
Видовое разнообразие грибов, выделенных у пациентов с муковисцидозом
Козлов А.В.1, Лямин А.В.1, Шафигуллина Л.Р.1, Кондратенко О.В.1, Ерещенко А.А.1, Бородулина Е.А.1,
2
1
1 Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Самарский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации, 443099, г. Самара, Российская Федерация
1 Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова», 115522, г. Москва, Российская Федерация
Кондратьева Е.И.2, Измалков Н.С.1
Резюме
Муковисцидоз (МВ) - генетическое аутосомно-рецессивное заболевание, вызываемое мутацией гена Ключевые слова: регулятора трансмембранной проводимости при МВ (CFTR) и проявляющееся повреждением экзокринных муковисцидоз; желез, главным образом дыхательной и пищеварительной систем. Основной причиной летальности паци- грибы; микозы; ентов с МВ остается хроническая инфекция нижних дыхательных путей. По-прежнему существуют труд- Candida spp.; ности в диагностике и лечении инфекционных осложнений, вызванных грибами у больных МВ. Aspergillus spp.
Цель исследования - изучение видового спектра грибов, выделенных из биологического материала больных МВ.
Материал и методы. Клинический материал, собранный у пациентов с МВ, культивировали на агаре Сабуро с хлорамфениколом. Полученные культуры грибов идентифицировали с помощью MALDI-ToF MS и методом микроскопии. Статистическая обработка данных проведена с использованием пакета программ Microsoft Office Excel 2013 и StatTech (version 3.1.6, разработчик ООО «Статтех», Россия). Сравнение двух групп по количественному показателю, распределение которого отличалось от нормального, выполняли с помощью У-критерия Манна-Уитни. Различия считали статистически значимыми при р<0,05.
Результаты и обсуждение. С 2018 по 2022 г. был исследован 9701 образец клинического материала от пациентов с МВ. Грибы были обнаружены в 3535 (36,44%) образцах. Идентифицировано 3248 (91,9%) штаммов дрожжевых и 287 (8,1%) штаммов мицелиальных грибов. В структуре дрожжевых грибов доминирующим родом был Candida, выделено 3205 (98,68%) штаммов. Среди мицелиальных грибов наиболее часто выделяли представителей Aspergillus spp., количество которых составило 222 (77,35%) штамма. В единичном случае был идентифицирован штамм Candida auris, являющийся этиологически значимым патогеном.
Заключение. Установлено, что грибы представляют значительную часть микробиоты респираторного тракта пациентов с МВ. В связи с этим сохраняется актуальность мониторинга структуры микробиоты дыхательных путей у пациентов с МВ и совершенствования диагностических методов для выделения грибов.
Финансирование. Исследование не имело спонсорской поддержки. Конфликт интересов. Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
Вклад авторов. Идея и концепция - Козлов А.В., Лямин А.В., Кондратенко О.В.; сбор и обработка материала - Кондратенко О.В., Шафигуллина Л.Р., Ерещенко А.А.; формальный анализ - Кондратьева Е.И., Измалков Н.С.; написание текста -Шафигуллина Л.Р., Козлов А.В.; редактирование и утверждение окончательного варианта статьи - Бородулина Е.А., Лямин А.В.
Для цитирования: Козлов А.В., Лямин А.В., Шафигуллина Л.Р., Кондратенко О.В., Ерещенко А.А., Бородулина Е.А., Кондратьева Е.И., Измалков Н.С. Видовое разнообразие грибов, выделенных у пациентов с муковисцидозом // Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение. 2024. Т. 13, № 3. С. 50-56. DOI: https://doi.org/10.33029/2305-3496-2024-13-3-50-56 Статья поступила в редакцию 15.01.2024. Принята в печать 05.07.2024.
Species diversity of fungi isolated from patients with cystic fidosis
KozlovA.V.1, Lyamin A.V.1, 1 Samara State Medical University, Ministry of Health of the
Shafigullina L.R.1, Kondratenko O.V.1, Russian Federation, 443099, Samara, Russian Federation
Ereshchenko A.A.1, Borodulina E.A.1, 2 Research Centre for Medical Genetics named after academician
Kondratyeva E.I.2, Izmalkov N.S.1 N.P. Bochkov, 115522, Moscow, Russian Federation
Abstract
Cystic fibrosis (CF) is a genetic autosomal recessive disease caused by a mutation in the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) gene and manifests itself as damage to the exocrine glands, mainly the respiratory and digestive systems. Chronic lower respiratory tract infection remains the main cause of mortality in patients with CF. There are still difficulties in diagnosing and treating infectious complications caused by fungi in CF patients.
The aim of the study is to study the species spectrum of fungi isolated from the biological material of patients with cystic fibrosis.
Material and methods. Clinical material collected from CF patients was cultured on Sabouraud chloramphenicol agar. The resulting fungal cultures were identified using MALDI-ToF MS and microscopy. Statistical data processing was carried out using the Microsoft Office Excel 2013 and Stattech software package (version 3.1.6, developed by Stattech LLC, Russia). Comparison of two groups for quantitative indicators whose distribution differed from normal was performed using the Mann-Whitney U-test. Differences were considered statistically significant at p<0.05.
Results. Between 2018 and 2022 9701 samples of clinical material from patients with CF were examined. Fungi were detected in 3535 (36.44%) samples. 3248 (91.9%) strains of yeast and 287 (8.1%) strains of filamentous fungi were identified. In the structure of yeast fungi, the dominant genus was Candida, 3205 (98.68%) strains were isolated. Among filamentous fungi, representatives of Aspergillus spp. were most often isolated, the number of which was 222 (77.35%) strains. In a single case, a Candida auris strain was identified as an etiologically significant pathogen.
Conclusion. It has been established that fungi represent a significant part of the microbiota of the respiratory tract of patients with CF. In this regard, it remains relevant to monitor the structure of the microbiota of the respiratory tract of patients with CF and improve diagnostic methods for isolating fungi.
Keywords:
cystic fibrosis; mushrooms; mycoses; Candida spp.; Aspergillus spp.
Funding. The authors received no financial support for the research Conflict of interest. The authors declare no conflict of interest.
Contribution. Idea and concept - Kozlov A.V., Lyamin A.V., Kondratenko O.V.; collection and processing of material - Kondratenko O.V., Shafigullina L.R., Ereshchenko A.A.; formal analysis - Kondratyeva E.I., Izmalkov N.S.; writing of the text - Shafigullina L.R., Kozlov A.V.; editing and approval the final version of the article - Borodulina E.A., Lyamin A.V.
For citation: Kozlov A.V., Lyamin A.V., Shafigullina L.R., Kondratenko O.V., Ereshchenko A.A., Borodulina E.A., Kondratyeva E.I., Izmalkov N.S. Species diversity of fungi isolated from patients with cystic fidosis. Infektsionnye bolezni: novosti, mneniya, obuchenie [Infectious Diseases: News, Opinions, Training]. 2024; 13 (3): 50-6. DOI: https://doi.org/10.33029/2305-3496-2024-13-3-50-56 (in Russian) Received 15.01.2024. Accepted 05.07.2024.
Муковисцидоз (МВ) является наиболее распространенным наследственным заболеванием среди представителей европейской расы с частотой встречаемости 1:3200 человек [1]. МВ - это генетическое заболевание, связанное с наследованием 2 рецессивных генов Cystic Fibrosis Transmembrane conductance Regulator (CFTR). У больных МВ поражаются экзокринные железы, преимущественно расположенные в дыхательной и пищеварительной системах, в результате чего в просвет органов
выделяется густой секрет, обусловленный дефектной регуляцией ионных каналов с нарушением их нормального функционирования. Мутация гена CFTR приводит к нарушению функции специфического белка-переносчика Cystic Fibrosis Transmembrane conductance Regulator, что вызывает накопление ионов хлора и натрия внутри клетки, вследствие чего по закону осмоса происходит перемещение воды в клетки с их поверхности и межклеточного пространства. Сгущению секрета способствуют и нуклеиновые кислоты, высвобожда-
емые в ходе разрушения нейтрофилов, количество которых увеличивается за счет бактериальной контаминации [2]. Вследствие этого секрет становится вязким, густым и труд-ноотделяемым, что создает благоприятные условия для колонизации патогенными микроорганизмами, в том числе представителями царства Грибы.
При изучении состава микрофлоры секрета дыхательных путей больных МВ чаще всего выделяют представителей таких родов оппортунистических грибов, как Aspergillus, Penicillium, Candida, Mucor, Fusarium, Exophiala, Scopulariopsis [3]. Микроорганизмы, включая представителей рода Candida, попадая экзогенно из внешней среды или в результате аутоинфекции, поражают висцеральные органы и глубокие ткани. Специфика патогенеза МВ определяет значительную продолжительность инфекционных осложнений у пациентов.
Помимо этого, на продолжительность инфицирования респираторного тракта у пациентов с МВ влияет длительная антибиотикотерапия, в результате чего повышается вероятность развития резистентности патогенов к противоми-кробным препаратам. Повышение устойчивости обусловлено также изменчивостью возбудителей хронических инфекций благодаря трем факторам: гетерогенности популяций микроорганизмов, изменению генотипа и микроэволюции [4]. Примером микроэволюции является ранее не обладавший выраженными патогенными свойствами гриб Mucor spp., который приобрел клиническую значимость во время пандемии COVID-19 [5]. До 2020 г. случаи мукормикоза выявляли значительно реже, чем после начала пандемии. Mucor spp. инспираторно попадает в организм человека, вызывая риноорбитально-церебральный мукормикоз, часто приводящий к летальному исходу.
Факторами риска развития микотической инфекции являются диабет, иммуносупрессия, прием глюкокортико-идов, злокачественные новообразования и трансплантация. Эти же факторы риска характерны для группы пациентов с МВ. Микроорганизмы с измененными биологическими свойствами приобретают клиническую значимость и могут вызывать новые осложнения у больных МВ. В этой ситуации решающую роль для жизни пациентов приобретают быстрое верное понимание этиологии заболевания и разработка методов диагностики и лечения.
Определенной проблемой является сложность диагностики микотических инфекций. Это связано с методологическими различиями преаналитического этапа в лабораторных центрах: сбор анализов, обработка, выбор питательной среды [6]. Установлено, что от вида исследуемого материала зависит обнаружение патогена. В частности, представителей рода Aspergillus чаще определяли в образцах бронхоальвео-лярного лаважа (БАЛ) - «золотого стандарта» для выявления возбудителя при МВ в сравнении с исследованием образцов мокроты и материала орофарингеальных мазков [7]. Однако в большинстве случаев не представляется возможным использовать БАЛ для исследования. На искажение результатов бактериологического анализа могут оказывать влияние условия транспортировки образцов, так как необходимо доставить материал не позднее 24 ч после взятия, а ввиду централизованного расположения микробиологических лабораторий это не всегда возможно.
При МВ частой патологией, вызванной Aspergillus spp., является аллергический бронхолегочный аспергиллез (АБЛА). Согласно регистру пациентов с муковисцидозом, в Российской Федерации в 2020 г. осложнение АБЛА выявлено у 2,5% больных. Сравнение данных регистров 2015 и 2020 гг. показывает, что частота развития АБЛА выросла в 3-4 раза. Это может быть связано со снижением функции легких на фоне хронических бактериальных инфекций и длительной анти-биотикотерапии, в результате чего Aspergillus spp. коинфици-рует респираторный тракт и вызывает аллергический процесс
[8]. АБЛА является аллергической реакцией на грибковые токсины и характеризуется астмой, бронхоэктазами и слизистыми пробками. Следует принять во внимание, что люди старше 18 лет находятся в зоне риска, так как вероятность развития инфекций, вызванных грибами, у них на 51% выше
[9]. Это связано с переходом инфекционно-воспалитель-ного процесса в хронический статус вследствие длительного применения антибиотиков, снижением функции легких и «обладанием особой восприимчивостью к заражению нитевидными грибами» [10]. Учитывая все вышеизложенное, больным МВ рекомендуется проводить микробиологические обследования ежеквартально [7].
Цель исследования - изучение видового спектра грибов, выделенных из биологического материала больных МВ.
Материал и методы
Исследование проведено на базе клиник ФГБОУ ВО СамГМУ Минздрава России в 2018-2022 гг. Сбор образцов мокроты и орофарингеальных мазков осуществляли в стерильные контейнеры и транспортные пробирки со средой Эймса, которые доставляли в лабораторию в течение 48 ч. Посев клинического материала проводили на набор питательных сред, включающий агар Сабуро с хлорамфениколом, методом в «три точки». Посевы культивировали в течение 28 дней в термостате при температуре 32 °С с ежедневным фиксированием роста и его интенсивности.
Выросшие культуры идентифицировали по микроморфологическим (методом микроскопии «раздавленной капли») и макроморфологическим признакам, обращая внимание на скорость роста и внешние признаки. Для видовой идентификации микроорганизмов использовали метод MALDI-ToF-MS. При применении масс-спектрометрии использовали метод прямого нанесения: нанесение культуры на точку мишени с покрытием свежеприготовленного раствора матрицы a-Cyano-4-hydroxy cinnamic Acid (HCCA).
Статистическую обработку данных проводили с использованием пакета программ Microsoft Office Excel 2013 и StatTech (version 3.1.6, разработчик ООО «Статтех», Россия). Сравнение двух групп по количественному показателю, распределение которого отличалось от нормального, выполняли с помощью У-критерия Манна-Уитни. Различия считали статистически значимыми при р<0,05.
Результаты и обсуждение
Всего с 2018 по 2022 г. был исследован 9701 образец биологического материала от пациентов с МВ. В 3535
(36,44%) образцах обнаружены грибы. При этом доля мице-лиальных грибов составляла 8,1% (287 штаммов), дрожжевых - 91,9% (3248 штаммов). Родовая структура выделенных из биологического материала больных МВ грибов представлена на рис. 1.
При анализе структуры мицелиальных грибов отмечено преобладание Aspergillus spp., их количество составило 222 штамма, что соответствует 77,35% всех мицелиальных грибов. Вторым по встречаемости был Alternaria spp. -27 (9,41%) штаммов, третьим - Mucor spp. - 17 (5,92%) штаммов. В единичных случаях обнаружены Fusarium spp., Scopulariopsis spp. и Penicillium spp., численность которых в совокупности составила 21 (7,32%) штамм.
В структуре рода Aspergillus доминировал вид A.fumigatus, его доля составила 53,6% общей численности Aspergillus spp. Также среди наиболее распространенных аспергилл были выявлены A. flavus (19%), A. niger (14%), A. terreus (7,2%). В 7 (3%) случаях удалось определить только родовую принадлежность гриба. Видовая структура представителей рода Aspergillus spp. показана на рис. 2.
В структуре дрожжевых грибов доминировали Candida spp., на долю которых пришлось 3205 штаммов, что соответствует 98,68% всех дрожжевых грибов. Второе ранговое место принадлежит Rhodotorula spp., выделен 21 (0,65%) штамм, на третьем - Exophiala spp. - 11 (0,34%) штаммов. В единичных случаях были выделены Saccharomyces spp., Trichosporon spp., общее количество которых составило 11 (0,34%) штаммов. Родовая структура дрожжевых грибов, выделенных из клинического материала больных МВ, представлена в таблице.
Согласно данным научной литературы, отмечена тенденция к увеличению частоты выделения грибов из биологического материала больных МВ. Хотя клиническая значимость многих представителей дрожжевых и мицелиальных грибов до конца не изучена, обсуждается их нарастающий патогенный потенциал [11]. Они могут вызывать аллергические реакции, инфицировать пациентов
Рис. 1. Таксономическая характеристика грибов, выделенных из биологического материала больных муковисцидозом
Роды дрожжевых грибов, выделенных из клинического материала больных муковисцидозом
Род Количество штаммов
Candida spp. 3205
Rhodotorula spp. 21
Exophiala spp. 11
Trichosporon spp. 10
Saccharomyces spp. 1
с иммунодефицитами, приводить к развитию инвазивных микозов с переходом в хронические формы. Однако существует сложность в интерпретации полученных из лаборатории результатов. В некоторых образцах биологического материала пациентов с МВ могут быть обнаружены грибы, которые являются сапрофитной микрофлорой окружающей среды и попадают в материал при его взятии, как, например, Penicillium spp., не являющийся инфекционным агентом [12]. В связи с этим необходимо назначать повторное обследование пациентов с прицельным поиском грибов.
В ходе проведенного исследования ожидаемо было выявлено, что дрожжевые грибы (3248 штаммов) превалируют над мицелиальными (287 штаммов). Численный перевес создается за счет частого обнаружения рода Candida spp. в образцах больных МВ. По нормативным документам РФ, представители Candida spp. не имеют клинического значения для больных МВ [7]. Однако известно о случаях снижения дыхательной функции, увеличения частоты обострений хронического инфекционного воспалительного процесса в легких на фоне колонизации дыхательных путей Candida albicans [6]. Кроме того, C. albicans может формировать биопленки, которые играют роль защитного механизма и способствуют появлению резистентности к классическим противогрибковым препаратам [13]. Возможно образование смешанных биопленок C. albicans и Staphylococcus aureus, в результате чего микроорганизмы приобретают устойчивость к ранее эффективному противомикробному препарату.
Рис. 2. Частота выделения представителей рода Aspergillus spp. из биологического материала больных муковисцидозом
Патогенное влияние Candida albicans и способность вызывать инфекционные осложнения у пациентов с МВ остаются предметом дискуссий [6].
В единичном случае в 2022 г. на базе лаборатории в биологическом материале больного МВ был идентифицирован штамм Candida auris, считающийся новым патогеном с уровнем летальности от 30 до 70% при развитии инфекционного процесса [15]. О первом выделении данного гриба у пациента с МВ сообщалось в Греции в 2019 г. [16]. Candida auris представляет серьезную проблему для медицинского сообщества и пациентов, так как затруднено его диагностирование и лечение, ввиду того что микроорганизм резистентен ко многим антимикотическим препаратам, используемым для лечения кандидозов [15].
Среди дрожжевых грибов был выявлен Exophiala derma-titidis, доля которого составила 11% всех дрожжевых грибов, что коррелирует с данными других авторов [17]. Этиологическая значимость этого гриба в полном объеме не выяснена. Ведутся дискуссии, является ли E. dermatitidis возбудителем инфекционной болезни или он бессимптомно колонизирует дыхательные пути.
В ходе проведенного исследования установлено, что наиболее часто встречаемым среди мицелиальных грибов был род Aspergillus spp. (77,35%). Патогены Aspergillus spp. вызывают АБЛА, инвазивный аспергиллез и хронический аспергиллез легких [18]. Споры Aspergillus spp. респираторным путем попадают в дыхательные пути, где либо поглощаются макрофагами и нейтрофилами, либо выводятся в составе слизи. У больных МВ ввиду реологических свойств мокроты споры задерживаются в дыхательных путях и инфицируют ткани легкого, вызывая инвазивный аспергиллез. В ряде случаев аспергиллы выделяют токсины и метаболиты, на которые развивается аллергическая реакция (АБЛА) [19]. При анализе полученных результатов было определено, что в дыхательных путях больных МВ доминирующим видом оказался A. fumigatus, на долю которого пришлось 53% рода Aspergillus spp., что коррелирует с данными исследователей, которые считают его одним из наиболее клинически значимых для пациентов с МВ [17].
СВЕДЕНИЯ ОБ АВТОРАХ
Наиболее частое проявление патогенности A. fumigatus -развитие АБЛА, которой подвержены 1-15% пациентов с МВ [19]. Нередко наблюдают коинфекцию с Pseudomonas aeruginosa. Сообщаются противоречивые данные о том, что грамотрицательная бактерия P. aeruginosa и плесневый гриб A. fumigatus оказывают друг на друга как подавляющий, так и синергический эффекты [19]. Синегнойная палочка подавляет A. fumigatus за счет выделения феназинов, образующих активные формы кислорода, повреждающие митохондрии аспергилл, а также за счет синтеза сидерофора пиовердина, хелатирующего ионы железа, которые необходимы для образования микотической биопленки. A. fumigatus, в свою очередь, оказывает подавляющее действие на P. aeruginosa благодаря выработке сидерофоров, выделению глиотоксина, оказывающего бактерицидный эффект. Синергизм проявляется в усилении выработки цитотоксичной эластазы синегнойной палочкой в присутствии A. fumigatus, приводящей к большему повреждению эпителия. В свою очередь, P. aeruginosa с помощью диметилсульфида создает благоприятную среду для персистенции A. fumigatus [19]. Таким образом, возможна суперинфекция, усложняющая протекание МВ.
Одним из примеров клинически важных взаимодействий являются отношения между A. fumigatus и S. maltophilia. При совместном культивировании изменяется их чувствительность к противомикробным препаратам: A. fumigatus становится более восприимчив к амфотерицину B, а S. maltophilia - резистентным к левофлоксацину [20].
Заключение
В результате проведенного исследования установлено, что грибы представляют значительную часть микробиоты респираторного тракта пациентов с МВ. Остается диску-табельным вопрос о клиническом значении большинства грибов, регулярно выделяемых при микробиологическом обследовании больных МВ, однако появляется все больше информации о возможном участии грибов в развитии инфекционных осложнений у пациентов данной группы. В связи с этим сохраняется актуальность мониторинга структуры микробиоты дыхательных путей пациентов с МВ и совершенствования диагностических методов для выделения грибов.
Козлов Андрей Владимирович (Andrey V. Kozlov) - кандидат медицинских наук, заведующий лабораторией молекулярной патологии НОПЦ ГЛТ ФГБОУ ВО СамГМУ Минздрава России, Самара, Российская Федерация E-mail: [email protected] https://orcid.org/0000-0001-9384-6854
Лямин Артем Викторович (Artem V. Lyamin) - доктор медицинских наук, доцент, директор НОПЦ ГЛТ ФГБОУ ВО СамГМУ Минздрава России, Самара, Российская Федерация E-mail: [email protected] https://orcid.org/0000-0002-5905-1895
Шафигуллина Лилия Ринатовна (Liliya R. Shafigullina) - специалист лаборатории молекулярной патологии НОПЦ ГЛТ ФГБОУ ВО СамГМУ Минздрава России, Самара, Российская Федерация E-mail: [email protected] https://orcid.org/0009-0009-2363-3701
Кондратенко Ольга Владимировна (Olga V. Kondratenko) - доктор медицинских наук, доцент, заведующий лабораторией образовательных технологий в генетике, микробиологии и лабораторной диагностики НОПЦ ГЛТ ФГБОУ ВО СамГМУ Минздрава России, Самара, Российская Федерация E-mail: [email protected] https://orcid.org/0000-0002-7750-9468
Ерещенко Алена Анатольевна (Alena A. Ereshchenko) - кандидат медицинских наук, заведующий лабораторией иммунологических методов исследований НОПЦ ГЛТ ФГБОУ ВО СамГМУ Минздрава России, Самара, Российская Федерация E-mail: [email protected] https://orcid.org/0000-0002-4221-4440
Бородулина Елена Александровна (Elena A. Borodulina)* - доктор медицинских наук, профессор, заведующий кафедрой фтизиатрии и пульмонологии ФГБОУ ВО СамГМУ Минздрава России, Самара, Российская Федерация E-mail: [email protected] https://orcid.org/0000-0002-3063-1538
Кондратьева Елена Ивановна (Elena I. Kondrateva) - доктор медицинских наук, профессор, руководитель научно-консультативного отдела муковисцидоза ФГБНУ «МГНЦ», Москва, Российская Федерация E-mail: [email protected] https://orcid.org/0000-0001-6395-0407
Измалков Николай Сергеевич (Nikolai S. Izmalkov) - кандидат медицинских наук, доцент, главный врач клиник ФГБОУ ВО СамГМУ Минздрава России, Самара, Российская Федерация E-mail: [email protected] https://orcid.org/0000-0002-0773-9524
ЛИТЕРАТУРА
1. Dickinson K., CollacoJ. Cystic fibrosis // Pediatr. Rev. 2021. Vol. 42, N 2. P. 5567. DOI: https://doi/10.1542/pir.2019-0212
2. Chernick W.S., Barbero G.J. Composition of tracheobronchial secretions in cystic fibrosis of the pancreas and bronchiectasis // Pediatrics. 1959. Vol. 24. P. 739745. DOI: https://doi.org/10.1542/peds.24.5739
3. Fiscarelli E.V., Ricciotti G., Rossitto M. et al. As a cystic fibrosis child with lung function decline // J. Cyst. Fibros. 2019. Vol. 18, N 6. P. 62-64. DOI: https://doi. org/10.1016/j.jcf.2019.06.015
4. Hauser A.R., Jain M., Bar-Meir M., McColley S.A. Clinical significance of microbial infection and adaptation in cystic fibrosis // Clin. Microbiol. Rev. 2011. Vol. 24, N 1. P. 29-70. DOI: https://doi.org/10.1128/CMR.00036-10
5. Dilek A., Ozaras R., Ozkaya S. et al. COVID-19-associated mucormycosis: case report and systematic review // Travel. Med. Infect. Dis. 2021. Vol. 44. Article ID 102148. DOI: https://doi.org/10.1016/j.tmaid.2021.102148
6. Magee L.C., Louis M., Khan V. et al. Managing fungal infections in cystic fibrosis patients: challenges in clinical practice // Infect. Drug Resist. 2021. Vol. 14. P. 1141-1153. DOI: https://doi.org/10.2147/IDR.S267219
7. Поликарпова С.В., Жилина С.В., Кондратенко О.В. и др. Руководство по микробиологической диагностике инфекций дыхательных путей у пациентов с муковисцидозом. Тверь, 2019. 128 с.
8. Parkins M.D., Somayaji R., Waters V.J. Epidemiology, biology, and impact of clonal pseudomonas aeruginosa infections in cystic fibrosis // Clin. Microbiol. Rev. 2018. Vol. 31, N 4. Article ID 00019-18. DOI: https://doi.org/10.1128/ CMR.00019-18
9. Sudfeld C.R., Dasenbrook E.C., Merz W.G. et al. Prevalence and risk factors for recovery of filamentous fungi in individuals with cystic fibrosis // J. Cyst. Fibros. 2010. Vol. 9, N 2. P. 110-116. DOI: https://doi.org/10.1016/jjcf.2009.11.010
10. Duesberg U., Wosniok J., Naehrlich L. et al. Risk factors for respiratory Aspergillus fumigatus in German Cystic Fibrosis patients and impact on lung function // Sci. Rep. 2020. Vol. 10, N 1. Article ID 18999. DOI: https://doi.org/10.1038/ s41598-020-75886-w
REFERENCES
11. Bercusson A., Jarvis G., Shah A. CF fungal disease in the age of CFTR modulators // Mycopathologia. 2021. Vol. 186, N 5. P. 655-664. DOI: https:// doi.org/10.1007/s11046-021-00541-5
12. Engel T.G.P., Slabbers L., de Jong C. et al.; Dutch Cystic Fibrosis Fungal Collection Consortium. Prevalence and diversity of filamentous fungi in the airways of cystic fibrosis patients - a Dutch, multicentre study // J. Cyst. Fibros. 2019. Vol. 18, N 2. P. 221-226. DOI: https://doi.org/10.1016/jjcf.2018.11.012
13. Ponde N.O., Lortal L., Ramage G. et al. Candida albicans biofilms and polymicrobial interactions // Crit. Rev. Microbiol. 2021. Vol. 47, N 1. P. 91-111. DOI: https://doi.org/10.1080/1040841X.2020.1843400
14. Ayadi R., Sitterle E., d'Enfert C. et al. Candida albicans and Candida dubliniensis show different trailing effect patterns when exposed to echinocandins and azoles // Front. Microbiol. 2020. Vol. 11. P. 1286. DOI: https://doi.org/10.3389/ fmicb.2020.01286
15. Sikora A., Hashmi M.F., Zahra F. Candida auris // StatPearls. Treasure Island, FL : StatPearls, 2023. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK563297
16. Stathi A., Loukou I., Kirikou H. et al. Isolation of Candida auris from cystic fibrosis patient, Greece, April 2019 // Euro Surveill. 2019. Vol. 24, N 29. Article ID 1900400. DOI: https://doi.org/10.2807/1560-7917. ES.2019.24.29.1900400
17. Lv Q., Elders B.B.L.J., Warris A. et al. Aspergillus-related lung disease in people with cystic fibrosis: can imaging help us to diagnose disease? // Eur. Respir. Rev. 2021. Vol. 30, N 162. Article ID 210103. DOI: https://doi. org/10.1183/16000617.0103-2021
18. Kirchhoff L., Olsowski M., Rath P.M., Steinmann J. Exophiala dermatitidis: key issues of an opportunistic fungal pathogen // Virulence. 2019. Vol. 10, N 1. P. 984-998. DOI: https://doi.org/10.1080/21505594.2019.1596504
19. Poore T.S., Zemanick E.T. Infection, allergy, and inflammation: the role of Aspergillus fumigatus in cystic fibrosis // Microorganisms. 2023. Vol. 11, N 8. P. 2013. DOI: https://doi.org/10.3390/microorganisms11082013
20. Curran A.K., Hava D.L. Allergic diseases caused by Aspergillus species in patients with cystic fibrosis // Antibiotics (Basel). 2021. Vol. 10, N 4. P. 357. DOI: https:// doi.org/10.3390/antibiotics10040357
1. Dickinson K., Collaco J. Cystic fibrosis. Pediatr Rev. 2021; 42 (2) 55-67. DOI: https://doi/10.1542/pir.2019-0212
2. Chernick W.S., Barbero G.J. Composition of tracheobronchial secretions in cystic fibrosis of the pancreas and bronchiectasis. Pediatrics. 1959; 24: 739-45. DOI: https://doi.org/10.1542/peds.24.5739
3. Fiscarelli E.V., Ricciotti G., Rossitto M., et al. As a cystic fibrosis child with lung function decline. J Cyst Fibros. 2019; 18 (6): 62-4. DOI: https://doi. org/10.1016/j.jcf.2019.06.015
4. Hauser A.R., Jain M., Bar-Meir M., McColley S.A. Clinical significance of microbial infection and adaptation in cystic fibrosis. Clin Microbiol Rev. 2011; 24 (1): 2970. DOI: https://doi.org/10.1128/CMR.00036-10
5. Dilek A., Ozaras R., Ozkaya S., et al. COVID-19-associated mucormycosis: case report and systematic review. Travel Med Infect Dis. 2021; 44: 102148. DOI: https://doi.org/10.1016/j.tmaid.2021.102148
6. Magee L.C., Louis M., Khan V., et al. Managing fungal infections in cystic fibrosis patients: challenges in clinical practice. Infect Drug Resist. 2021; 14: 1141-53. DOI: https://doi.org/10.2147/IDR.S267219
7. Polikarpova S.V., Zhilina S.V., Kondratenko O.V., et al. Guidelines for the microbiological diagnosis of respiratory tract infections in patients with cystic fibrosis. Tver', 2019: 128 p. (in Russian)
8. Parkins M.D., Somayaji R., Waters V.J. Epidemiology, biology, and impact of clonal pseudomonas aeruginosa infections in cystic fibrosis. Clin Microbiol Rev. 2018; 31 (4): 00019-18. DOI: https://doi.org/10.1128/CMR.00019-18
* Автор для корреспонденции.
9. Sudfeld C.R., Dasenbrook E.C., Merz W.G., et al. Prevalence and risk factors for recovery of filamentous fungi in individuals with cystic fibrosis. J Cyst Fibros. 2010; 9 (2): 110-6. DOI: https://doi.org/10.1016/jjcf.2009.11.010
10. Düesberg U., Wosniok J., Naehrlich L., et al. Risk factors for respiratory Aspergillus fumigatus in German Cystic Fibrosis patients and impact on lung function. Sci Rep. 2020; 10 (1): 18999. DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-020-75886-w
11. Bercusson A., Jarvis G., Shah A. CF fungal disease in the age of CFTR modulators. Mycopathologia. 2021; 186 (5): 655-64. DOI: https://doi.org/10.1007/s11046-021-00541-5
12. Engel T.G.P., Slabbers L., de Jong C., et al.; Dutch Cystic Fibrosis Fungal Collection Consortium. Prevalence and diversity of filamentous fungi in the airways of cystic fibrosis patients - a Dutch, multicentre study. J Cyst Fibros. 2019; 18 (2): 221-6. DOI: https://doi.org/10.1016/jjcf.2018.11.012
13. Ponde N.O., Lortal L., Ramage G., et al. Candida albicans biofilms and polymicrobial interactions. Crit Rev Microbiol. 2021; 47 (1): 91-111. DOI: https:// doi.org/10.1080/1040841X.2020.1843400
14. Ayadi R., Sitterlé E., d'Enfert C., et al. Candida albicans and Candida dubliniensis show different trailing effect patterns when exposed to echinocandins and
azoles. Front Microbiol. 2020; 11: 1286. DOI: https://dol.org/10.3389/ fmlcb.2020.01286
15. Slkora A., Hashml M.F., Zahra F. Candida auris. In: StatPearls. Treasure Island, FL: StatPearls, 2023. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK563297
16. Stathi A., Loukou I., Kirikou H., et al. Isolation of Candida auris from cystic fibrosis patient, Greece, April 2019. Euro Surveill. 2019; 24 (29): 1900400. DOI: https:// doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2019.24.29.1900400
17. Lv Q., Elders B.B.L.J., Warris A., et al. Aspergillus-related lung disease in people with cystic fibrosis: can imaging help us to diagnose disease? Eur Respir Rev. 2021; 30 (162): 210103. DOI: https://doi.org/10.1183/16000617.0103-2021
18. Kirchhoff L., Olsowski M., Rath P.M., Steinmann J. Exophiala dermatitidis: key issues of an opportunistic fungal pathogen. Virulence. 2019; 10 (1): 984-98. DOI: https://doi.org/10.1080/21505594.2019.1596504
19. Poore T.S., Zemanick E.T. Infection, allergy, and inflammation: the role of Aspergillus fumigatus in cystic fibrosis. Microorganisms. 2023; 11 (8): 2013. DOI: https://doi.org/10.3390/microorganisms11082013
20. Curran A.K., Hava D.L. Allergic diseases caused by Aspergillus species in patients with cystic fibrosis. Antibiotics (Basel). 2021; 10 (4): 357. DOI: https://doi. org/10.3390/antibiotics10040357
