ИСПОЛЬЗОВАНИЕ МЕТОДА СЕКВЕНИРОВАНИЯ ДЛЯ HLA ТИПИРОВАНИЯ ПОТЕНЦИАЛЬНЫХ ДОНОРОВ ГЕМОПОЭТИЧЕСКИХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК В РЕГИСТРЕ ПСПБГМУ им. И.П. ПАВЛОВА

Кузьмич Е. В.; Макаренко О. А.; Алянский А. Л.; Ермолина В. В.; Мерзлякова С. В.; Иванова Н. Е.; Афанасьев Б. В.

«АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ ИММУНОГЕНЕТИКИ И ТКАНЕВОГО ТИПИРОВАНИЯ»

алгоритму комбинаций HLA-DPB1 аллелей (НЮ.53, р = 0.078).

Заключение. Т-клеточный эпитопный алгоритм, разработанный для оценки иммуноген-ности HLA-DPB1 аллелей, позволяет выделить неблагоприятные (ассоциированные с повышением риска развития осложнений, снижением

Санкт-Петербург 24-25 июня 2015 г.

общей выживаемости больных) комбинации аллелей пациента и потенциального донора ГСК. Исключение вариантов подбора с недопустимыми комбинациями HLA-DPB1 аллелей будет способствовать оптимизации процесса селекции донора, повышению эффективности аллогенной неродственной ТГСК.

Кузьмич Е. В., Макаренко О. А., Алянский А. Л., Ермолина В. В., Мерзлякова С. В., Иванова Н. Е., Афанасьев Б. В.

ГБОУ ВПО «Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И. П. Павлова» Министерства здравоохранения Российской Федерации, НИИ детской онкологии, гематологии и трансплантологии имени Р. М. Горбачевой

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ МЕТОДА СЕКВЕНИРОВАНИЯ ДЛЯ HLA ТИПИРОВАНИЯ ПОТЕНЦИАЛЬНЫХ ДОНОРОВ ГЕМОПОЭТИЧЕСКИХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК В РЕГИСТРЕ ПСПБГМУ им. И.П. ПАВЛОВА

Цель работы. Анализ распределения частот HLA аллелей, определенных с помощью метода секвенирования, в группе потенциальных доноров костного мозга Регистра ПСПбГМУ им. акад. И. П. Павлова.

Материалы и методы. Обследованы 200 потенциальных доноров гемопоэтических стволовых клеток Регистра ПСПбГМУ им. акад. И. П. Павлова. Высокоразрешающее типирова-ние ЫЬА-А, НЬА^, ЫЬА-С, НЬА^КВ1, ЫЬА-DQB1 аллелей осуществлено с помощью метода секвенирования по Сэнгеру. Использованы коммерческие наборы реагентов фирмы «Рго^аш» (Германия). Обработка результатов исследова-

ния осуществлена с помощью методов популя-ционной генетики с использованием программы Arlequin (версия 3.5.1.2).

Результаты. На основании результатов высокоразрешающего HLA типирования, выполненного с помощью метода секвенирования, исследовано распределение частот HLA аллелей в группе потенциальных доноров Регистра ПСПбГМУ им. акад. И. П. Павлова. Определены HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DRB1, HLA-DQB1 аллели, встречающиеся в обследованной группе с наибольшей частотой (таблица).

Распределение частот HLA аллелей.

Таблица.

HLA-A Частота, % HLA-B Частота, % HLA-C Частота, % HLA-DRB1 Частота, % HLA-DQB1 Частота, %

*02:01 25,3 *07:02 9,1 *07:02 12,3 *07:01 11,8 *03:01 17,1

*24:02 12,4 *13:02 7,1 *04:01 12,3 *15:01 8,2 *02:01 13,3

*03:01 12,1 *08:01 6,5 *06:02 12,3 *01:01 8,0 *05:01 10,2

*01:01 10,3 *15:01 5,2 *07:01 10,9 *03:01 6,2 *03:02 8,3

*11:01 5,7 *18:01 4,8 *12:03 9,1 *04:01 5,5 *06:02 7,5

*26:01 4,9 *51:01 4,5 *02:02 5,7 *16:01 5,4 *05:02 6,0

*32:01 4,3 *44:02 4,0 *03:04 4,0 *11:01 4,9 *06:03 4,9

*25:01 3,7 *35:01 3,4 *03:03 3,7 *13:01 3,8 *03:03 2,6

*33:01 1,7 *38:01 3,3 *17:01 3,7 *13:03 3,4 *04:02 2,0

*68:01 1,7 *41:02 3,2 *01:02 2,3 *11:04 3,4 *06:01 1,4

Выделены 5-локусные гаплотипы, представленные в группе обследованных потенциальных доноров с максимальной частотой: А*01:01 -B*08:01 - С*07:01 - DRB1*03:01 - DQB1*02:01 (2,9 %). А*03:01 - B*07:02 - С*07:02 -DRB1*15:01 - DQB1*06:02 (1,6 %).

Заключение. В настоящей работе обобщен первый опыт применения метода секвенирова-ния для типирования HLA аллелей потенциальных доноров костного мозга Регистра ПСПбГМУ им. акад. И. П. Павлова.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Кузьмич Е. В., Макаренко О. А., Алянский А. Л., Ермолина В. В., Мерзлякова С. В.