Анализ встречаемости транслокаций NTRK1, NTRK2, NTRK3 в MSI-позитивных опухолях толстой кишки при помощи ПЦР
Авторы
Романько Александр Андреевич, [email protected], ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
Преображенская Елена Васильевна, [email protected], ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
Митюшкина Наталья Владимировна, [email protected], ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
Тюрин Владислав Ильич, [email protected], ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
Мулкиджан Римма Сергеевна, [email protected], ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
Кривошеева Елена Александровна, [email protected], ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
Имянитов Евгений Наумович, [email protected], ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
Ключевые слова:
рак толстой кишки, MSI, транслокация, NTRK, ПЦР диагностика, мутация
Актуальность
Опухоли, несущие транслокации с участием генов NTRK-1, -2, -3, чувствительны к терапии ингибиторами тирозинкиназ. Частота транслокаций NTRK среди всех типов опухолей невысока и составляет примерно 0,35% [1]. В недавних исследованиях было обнаружено, что процент перестроек NTRK повышен в MSI-позитивных опухолях толстой кишки [2]. На сегодняшний день золотым стандартом диагностики таких перестроек является метод секвенирования нового поколения, однако высокая стоимость и трудоемкость ограничивают возможность его применения в рутинных диагностических процедурах. Нами был разработан быстрый и экономически эффективный скрининговый подход для выявления NTRK-транслокаций, основанный на определении несбалансированной экспрессии 5' и 3' участков гена тирозинкиназы и серии вариант-специфических ПЦР.
Цель
Определить частоту и спектр транслокаций NTRK в MSI-позитивных опухолях толстой кишки у российских пациентов.
Материалы и методы
Исследование включило 45 образцов РНК от пациентов с MSI-позитивным раком толстой кишки (РТК), не имеющих мутаций в генах KRAS, NRAS, BRAF. Образцы были получены от больных, проходивших молекулярно-генетическое тестирование в НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова в 2020-2022 гг. Для всех образцов был выполнен анализ уров-
ня несбалансированной экспрессии 5' и 3' концевых фрагментов генов NTRK1, NTRK2 и NTRK3, а также проведена серия вариант-специфических ПЦР на 41 наиболее частый вариант слияний.
Результаты
Было обнаружено 5 образцов, демонстрирующих несбалансированную экспрессию с участием одного из генов NTRK. Из них 3 случая приходилось на ген NTRK1 и по 1 — на NTRK2 и NTRK3. С помощью серии вариант-специфических ПЦР в 4 из 5 образцов был выявлен конкретный вариант перестройки, а именно 3 слияния NTRK1 (TPM3ex8/NTRK1ex10) и 1 транслокация EML4ex2/NTRK3ex14. Дополнительно был обнаружен 1 случай перестройки с участием гена NTRK3, в котором феномен несбалансированной экспрессии был выражен слабо (EML4ex2/ NTRK3ex14). В образце с несбалансированной экспрессией NTRK2 методом высокопроизводительного секвенирования был обнаружен редкий вариант перестройки (ETV6ex5/NTRK2ex15). Таким образом, общая частота транслокаций NTRK в MSI РТК без мутаций KRAS, NRAS, BRAF достигла 13,3% (6/45).
Выводы
Исследование представляет собой новый подход для выявления перестроек с участием генов NTRK-1, -2, -3. В группе MSI РТК без мутаций KRAS, NRAS, BRAF данные аберрации обнаруживаются с заметной частотой (6/45, 13,3%), что создает новые перспективы для таргетной терапии таких опухолей. Исследование выполнено при финансовой поддержке РФФИ (грант № 20-315-90097).
Список литературы
1. Okamura R . , Boichard A ., Kato S . et al . Analysis of NTRK Alterations in Pan-Cancer Adult and Pediatric Malignancies: Implications for NTRK-Targeted Therapeutics // JCO Precis Oncol . 2018 . (2) . Р. 1-20 .
2 . Guo Y, Guo X. , Wang S . et al . Genomic Alterations of NTRK, POLE, ERBB2, and Microsatellite Instability Status in Chinese Patients with Colorectal Cancer // The Oncologist . 2020 . Nov 1. Vol . 25 (11) . Р e1671-e1680 .
Оценка гепатотоксического действия гибридного оловоорганического соединения и его аналога более простой
структуры
Авторы
Алхусейн-Кулягинова Маргарита Стефановна, [email protected], ФГБОУ ВО «Ростовский государственный медицинский университет» Минздрава России, Ростов-на-Дону
Додохова Маргарита Авдеевна, [email protected], ФГБОУ ВО «Ростовский государственный медицинский университет» Минздрава России, Ростов-на-Дону
Котиева Инга Мовлиевна, [email protected], ФГБОУ ВО «Ростовский государственный медицинский университет» Минздрава России, Ростов-на-Дону
Сафроненко Андрей Владимирович, [email protected], ФГБОУ ВО «Ростовский государственный медицинский университет» Минздрава России, Ростов-на-Дону
Котиева Елизавета Михайловна, [email protected], ФГБОУ ВО «Ростовский государственный медицинский университет» Минздрава России, Ростов-на-Дону
Котиева Виолетта Михайловна, [email protected], ФГБОУ ВО «Ростовский государственный медицинский университет» Минздрава России, Ростов-на-Дону
Никитин Евгений Александрович, [email protected], ФГБОУ ВО «Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова», Химический факультет, Москва
Шпаковский Дмитрий Борисович, [email protected], ФГБОУ ВО «Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова», Химический факультет, Москва
Милаева Елена Рудольфовна, [email protected], ФГБОУ ВО «Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова», Химический факультет, Москва
Ключевые слова:
оловоорганические соединения, гепатотоксичность, противоопухолевые средства, исследования in vivo
Актуальность
Приемы медицинской химии успешно применяются при конструировании фармакологически активных субстанций, в том числе и новых противоопухолевых препаратов [1]. Фундаментальные исследования по поиску универсальных лигандов и оценке их влияния на снижение общей и органотоксичности соединений являются одной из основных задач для междисциплинарных экспериментальных исследований в области онкологии. В отдельную группу органоспецифи-ческих неблагоприятных реакций при лекарственной терапии злокачественных новообразований выделены лекарственно индуцированные поражения печени [2].
Цель
Целью данного исследования является оценка гепатотоксического действия (3,5-ди-трет-бутил-4-гидроксифенилтиолат)триметилолова (Ме-4) по сравнению с аналогом более простой структуры — триметилоловохлоридом (ТМОХ) при введении в максимально переносимых дозах (МПД) на пике проявлений интоксикации (7 суток).
Материалы и методы
Исследование проведено на крысах Wistar (самки) массой тела 190-210 г. Соединения вводили однократно внутрижелудочно (контрольная группа-носи-
тель 1% водный раствор желатина) в МПД 35 мг/кг (Ме-4) и 5 мг/кг (ТМОХ). Соединения различались наличием или отсутствием фрагмента 2,6-ди-трет-бутилфенола при атоме олова.
Результаты
В эксперименте показано, что на 7-е сутки развития интоксикации морфологическое состояние печени охарактеризовано как средняя (Ме-4) и тяжелая (ТМОХ) дистрофия гепатоцитов. При анализе биохимических маркеров токсического поражения печени в обеих опытных группах выявлено статистически значимое по сравнению с таковыми в контрольной группе (р <0,05) угнетение мочевинообразователь-ной (снижение уровня мочевины на 52 и 34% для ТМОХ и Ме-4 соответственно), белоксинтетической (снижение уровня альбумина на 61 и 48% для ТМОХ и Ме-4 соответственно) функций. Отмечалось также увеличение общего билирубина в крови (на 37,2 и 21,4% для ТМОХ и Ме-4 соответственно) с нарушением процесса конъюгирования. Все зафиксированные изменения были более значительно выражены при введении ТМОХ.
Выводы
На основании полученных результатов можно сделать вывод о существенных отличиях выраженно-