Научная статья на тему 'Возможности алгоритма сверток с производными для оценки параметров масс-спектров, содержащих наложившиеся пики'

Возможности алгоритма сверток с производными для оценки параметров масс-спектров, содержащих наложившиеся пики Текст научной статьи по специальности «Физика»

CC BY
117
30
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Научное приборостроение
ВАК
RSCI
Область наук
Ключевые слова
МЕТОДЫ ОБРАБОТКИ СИГНАЛОВ / МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЯ / ОЦЕНКА ПАРАМЕТРОВ ПИКОВ В МУЛЬТИПЛЕТАХ / АНАЛИЗ ПОГРЕШНОСТЕЙ АЛГОРИТМОВ ОБРАБОТКИ ДАННЫХ / METHODS FOR SIGNAL PROCESSING / MASS-SPECTROMETRY / PEAK PARAMETER ESTIMATION IN MULTIPLETS / ANALYSIS OF ALGORITHM PROCESSING DATA ERRORS

Аннотация научной статьи по физике, автор научной работы — Манойлов В. В., Заруцкий И. В.

Рассматриваются результаты исследования возможностей алгоритма сверток исходного сигнала со второй и четвертой производными функций, описывающих форму спектральных линий. Приводятся погрешности оценок амплитуд, положений и ширин спектральных пиков после проведения процедуры разделения наложившихся пиков для сигналов с разными значениями дисперсии шума, разными значениями амплитуд в наложившихся пиках и разными расстояниями по шкале масс отдельных пиков в мультиплетах. Исследование проведено с помощью вычислительного эксперимента с использованием компьютерных моделей масс-спектрометрических сигналов, искаженных шумами для мультиплетов с различными амплитудами отдельных пиков и различными расстояниями между ними.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по физике , автор научной работы — Манойлов В. В., Заруцкий И. В.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

CAPABILITY OF THE ALGORITHM ON THE BASE CONVOLUTION PROCESSING SIGNALS WITH DERIVATIONS OF PEAK SIGNALS FORM FOR THE ESTIMATION OF MASS-SPECTRA PEAK PARAMETERS IN MULTIPLETS

The results of investigation of algorithm on the base of convolution processing signals with derivations of peak signals form for estimation parameters mass-spectra peak in multiplets are discussed. The investigation is realized with the help of computational experiment on the base models of mass-spectral peaks with different amplitudes and different distance between single peaks in multiplets.

Текст научной работы на тему «Возможности алгоритма сверток с производными для оценки параметров масс-спектров, содержащих наложившиеся пики»

ISSN 0868-5886 НАУЧНОЕ ПРИБОРОСТРОЕНИЕ, 2009, том 19, № 4, c. 103-108

= ОБРАБОТКА И АНАЛИЗ СИГНАЛОВ =

УДК 621.391.26

© В. В. Манойлов, И. В. Заруцкий

ВОЗМОЖНОСТИ АЛГОРИТМА СВЕРТОК С ПРОИЗВОДНЫМИ ДЛЯ ОЦЕНКИ ПАРАМЕТРОВ МАСС-СПЕКТРОВ, СОДЕРЖАЩИХ НАЛОЖИВШИЕСЯ ПИКИ

Рассматриваются результаты исследования возможностей алгоритма сверток исходного сигнала со второй и четвертой производными функций, описывающих форму спектральных линий. Приводятся погрешности оценок амплитуд, положений и ширин спектральных пиков после проведения процедуры разделения нало-жившихся пиков для сигналов с разными значениями дисперсии шума, разными значениями амплитуд в наложившихся пиках и разными расстояниями по шкале масс отдельных пиков в мультиплетах. Исследование проведено с помощью вычислительного эксперимента с использованием компьютерных моделей масс-спектрометрических сигналов, искаженных шумами для мультиплетов с различными амплитудами отдельных пиков и различными расстояниями между ними.

Кл. сл.: методы обработки сигналов, масс-спектрометрия, оценка параметров пиков в мультиплетах, анализ погрешностей алгоритмов обработки данных

ПОСТАНОВКА ЗАДАЧИ

Большинство масс-спектрометрических пиков можно описать гауссовой функцией. Как известно, пик гауссовой формы описывается формулой

S (t) = A • exp

( (t - tmax Г 2ц2

(1)

(

Y(t) = Х As • exp

(t -1 )

V max s /

2

S2(t) =

-1

V ^

f

exp

/

t

\

S4(t) =

(t4 6t2 _ ---+ 3

V ц ц

V 2ц у

Л f exp

j

2

v

2ц2

(3)

(4)

'o У

где А — амплитуда пика; /--полуширина пика; t — независимая переменная; — положение вершины на оси независимой переменной.

Как отмечалось в работах [1-4], масс-спектр можно рассматривать как сумму суперпозиции пиков гауссовой формы. Предположим, что независимая переменная t меняется непрерывно на вещественной оси (- да, да). Таким образом, полезная составляющая спектра равна

В формулах (3) и (4) через /и0 обозначена полуширина пика в функции, описывающей форму пика. Эти функции "подобны" пику в том смысле, что имеют экстремумы при t = 0.

Теперь рассмотрим свертки -S2(t) и S4(t) с отдельно взятым пиком:

У2Г) = - A j

-да да

У,(г) = - A j

( 12 ^

exp

2ц2

S2(t -t)dt,

exp

2

2ц2

S4(t -t)dt.

(5)

(6)

(2)

где 5 — номер пика в спектре; А5 — амплитуда 5-го пика спектра; / — полуширина 5-го пика; tmax 5 — положение вершины 5-го пика спектра.

Рассмотрим подробнее алгоритм оценки параметров масс-спектрометрических пиков, основанный на вычислении сверток с производными четных порядков гауссовых пиков. Выпишем формулы производных гауссианы второго и четвертого порядков:

В формулах (5) и (6) / — полуширина пика в исходном сигнале, А — амплитуда пика в исходном сигнале. Взяв интегралы, получим:

У2(т) = Ацл1'2 1 + (ц/ц )

32

X [(1 - г2/(ц2 + ц2)) • exp (-Т2/(ц2 + ц2))], (7)

У4 (г) = Ацл

2-|5/2

+ (ццо) J :

x (3 - 6г2/(ц2 + ц2)) +

2

х

'/(я2 + Я02)2 • ехр(-т2/(я2 + Я)).

(8)

Из формул (7) и (8) следует:

• при т = 0 >2(т) и >ч(т) имеют абсолютный максимум;

• У2(0) / У4(0) = [1 + (я / Яо)2] / 3;

• если у обеих сверток в одной и той же точке имеются максимумы, то это значит, что на экспериментальной кривой в этом месте расположен пик, а в данной точке — его вершина.

Таким образом, производится обнаружение пика в спектре. Можно доказать, что система функций на основе производных четных порядков {5П(0} является ортогональной. В базисе этой системы может быть представлен сигнал исследуемого масс-спектра. Выполнение операций свертки при п = 2 и п = 4 дает возможность выделить пик в заданной точке оси масс, если он там существует. В дальнейшем по значению сверток в максимуме, используя формулы (7) и (8), можно вычислить полуширину я и амплитуду А обнаруженного пика.

Обозначим значение свертки У2(т) в максимуме как С2, а значение свертки У4(т) в максимуме как С4, тогда

Я - Я0 •

1

зс^ - ^2

V С4

(9)

/

с

А -

1 +

Я

з

Я0

2пя

(10)

Для дискретных отсчетов (7) и (8) имеют вид:

+N

ш) = £ 82(^ )у & - и), (11)

I--N +N

ш) = £ S4(tí) ж - ^).

(12)

I=-N

Здесь оказалось возможным перейти от интегрирования по бесконечному интервалу к конечным суммам, т. к. гауссова функция и ее производные быстро убывающие — уже на расстоянии в несколько Я0 уменьшаются до машинного нуля (т. е. становятся по модулю меньше минимального положительного вещественного компьютерного числа).

/V

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

у» /V 1

Рис. 1. Сигнал с наложившимися гауссовыми пиками со степенью наложения 0.375 без добавления шума, отношение амплитуд 2 : 1. Сплошная линия — суммарный пик, штриховая линия и линия с точками — отдельные пики в дуплете

Рис. 2. Сигнал с наложившимися пиками, полученными из экспериментальных данных, со степенью наложения 0.395 без добавления шума, отношение амплитуд 4 : 1.

Сплошная линия — суммарный пик, штриховая линия и линия с точками — отдельные пики в дуплете

МОДЕЛИРОВАНИЕ СИГНАЛА,

СОДЕРЖАЩЕГО НАЛОЖИВШИЕСЯ ПИКИ, ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ И ОЦЕНКИ ПАРАМЕТРОВ АЛГОРИТМА СВЕРТОК С ПРОИЗВОДНЫМИ

Для исследования возможностей указанного выше метода оценки параметров сигналов, содержащих наложившиеся пики, использовались модели двух типов:

1) масс-спектр представляет собой совокупность пиков, форму которых можно описать гауссовыми функциями с различными амплитудами и ширинами;

2) описание формы пиков масс-спектра основано на реальных экспериментальных данных, полученных на масс-спектрометре с квадрупольным анализатором.

Модели каждого из двух типов имеют наложившиеся пики и аддитивный шум. Степень наложения определяется параметром N = / / L, где / — полуширина пика в соответствии с формулой (1), L — расстояние между центрами нало-жившихся пиков. Шум, добавляемый к моделям пиков двух типов, генерировался с помощью датчика случайных чисел, имеющих плотность рас-

пределения, соответствующую нормальному закону с задаваемой программно дисперсией и нулевым математическим ожиданием.

На рис. 1 представлена модель двух наложив-шихся пиков гауссовой формы со степенью наложения N = 0.375. Для данной модели L = 4, / = 1.5. Соотношение амплитуд 2 : 1 (амплитуда большого пика 1500, малого пика 750).

На рис. 2 представлена модель двух наложив-шихся пиков, форма которых соответствует экспериментальным данным, полученным на масс-спектрометре с квадрупольным анализатором. Наложившиеся пики получены путем сближения одиночных пиков реального масс-спектра.

На рис. 3 и 4 представлены те же модели сигналов соответственно, что и на рис. 1, 2, но нало-жившиеся пики сдвинуты относительно друг друга до степени наложения N = 1.

На рис. 5 и 6 представлены те же модели сигналов, что и на рис. 3, 4, но с добавлением шума. Отношение сигнал/шум (К) определяется как отношение амплитуды минимального пика к среднему квадратичному отклонению дисперсии шума. Для представленных моделей отношение сигнал/шум К = 10.

2500

Рис. 3. Сигнал с наложившимися гауссовыми пиками со степенью наложения 1 без добавления шума, отношение амплитуд 2 : 1.

Сплошная линия — суммарный пик, штриховая линия и линия с точками — отдельные пики в дуплете

гл

/

т 1 £ ч \ • \

у % \ V V

Рис. 4. Сигнал с наложившимися пиками, полученными из экспериментальных данных, со степенью наложения 1 без добавления шума, отношение амплитуд 4 : 1.

Сплошная линия — суммарный пик, штриховая линия и линия с точками — отдельные пики в дуплете

Рис. 5. Сигнал с наложившимися гауссовыми пиками со степенью наложения 1 с добавлением шума, отношение амплитуд 2 : 1. Отношение сигнал/шум R = 10

Рис. 6. Сигнал с наложившимися пиками, полученными из экспериментальных данных со степенью наложения 1 с добавлением шума, отношение амплитуд 4 : 1.

Отношение сигнал/шум R = 10

Табл. 1. СКО оценок параметров отдельных сигналов в дублетах (М = 0.85) с соотношением амплитуд 5 : 1 при различных отношениях сигнала к шуму

Сигнал/ шум СКО оценки, %

Амплитуда Ширина

гаусс квадр гаусс квадр

10 3 3 0.1 0.1

50 0.5 0.8 0.05 0.05

100 0.1 0.3 0.05 0.05

РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ НА МОДЕЛЯХ СИГНАЛОВ АЛГОРИТМА СВЕРТОК С ПРОИЗВОДНЫМИ ДЛЯ ОЦЕНКИ ПАРАМЕТРОВ МАСС-СПЕКТРОВ, СОДЕРЖАЩИХ НАЛОЖИВШИЕСЯ ПИКИ

Для определения возможностей указанного алгоритма с помощью вычислительного эксперимента определялись средние квадратичные отклонения (СКО) оценок отдельных параметров сигналов в дублетах при различных реализациях налагаемого шума. СКО оценок параметров отдельных сигналов в дублетах с соотношением амплитуд (5 : 1) по результатам проверки алгоритма "свертка с производными ..." при различных отношениях сигнала к шуму и степени наложения N = 0.85 для пиков гауссовой формы (гаусс) и эксперимен-

тальных данных квадрупольного масс-спектрометра (квадр) представлены в табл. 1.

СКО оценок параметров дублетов для отдельных сигналов с соотношением амплитуд 5 : 1 по результатам проверки алгоритма "свертка с производными ..." при различной степени наложения N и отношении сигнал/шум 50 для пиков гауссовой формы (гаусс) и экспериментальных данных квадрупольного масс-спектрометра (квадр) представлены в табл. 2.

Погрешность положения центра пика для всех случаев не превышала шага дискретизации по оси масс.

СКО оценок параметров дублетов для отдельных сигналов с различным соотношением амплитуд по результатам проверки алгоритма "свертка с производными..." при степени наложения N = 0.85

Табл. 2. СКО оценок параметров отдельных сигналов в дублетах с соотношением амплитуд 5 : 1 при различной степени наложения (Я = 50)

Степень наложения N СКО оценки, %

Амплитуда Ширина

гаусс квадр гаусс квадр

0.75 0.5 0.6 0.05 0.05

0.85 0.5 0.8 0.05 0.05

1.00 1.0 1.0 0.1 0.1

Табл. 3. СКО оценок параметров отдельных сигналов в дублетах (Ы = 0.85) с различным соотношением амплитуд при R = 50

Отношение амплитуд СКО оценки, %

Амплитуда Ширина

гаусс квадр гаусс квадр

5 : 1 0.5 1.5 0.05 0.05

10 : 1 0.5 1.7 0.05 0.05

20 : 1 1.6 1.9 0.1 0.1

пики, дают информацию о пригодности такого алгоритма для использования в практической работе при обработке данных со степенью наложения пиков в мультиплетах, не превышающей единицы, и с соотношением амплитуд, не превышающим двадцати. Достоинством алгоритма является низкая погрешность определения положения центров пиков при различных отношениях амплитуд одиночных пиков в мультиплетах.

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Разников В.В., Разникова М.О. Информационно-аналитическая масс-спектрометрия. М.: Наука, 1991. 248 с.

2. Гуревич А.Л., Могильницкий А.М., Русинов Л.А. и др. Автоматизация обработки масс-спектро-метрической информации. М.: Энергия, 1978. 182 с.

3. Сирвидас С.И., Заруцкий И.В., Ларионов А.М., Манойлов В.В. Использование метода сверток с производными базовых функций для обна-

и отношении сигнал/шум Я = 60 для пиков гауссовой формы (гаусс) и экспериментальных данных квадрупольного масс-спектрометра (квадр) представлены в табл. 3. При получении данных в табл. 3 по программе, реализующей рассматриваемый алгоритм, после обнаружения в мульти-плете пика с максимальной амплитудой из исходных данных вычитался пик с амплитудой, вычисленной по формуле (10), и формой, соответствующей экспериментальным данным одиночного пика квадрупольного масс-спектрометра (квадр). При увеличении отношения амплитуд до 40 : 1 положения центров пиков оставались практически неизменными, а СКО оценки амплитуды малого пика составляло от 2.5 до 16 % в зависимости от реализации шумового сигнала.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Рассмотренные возможности алгоритма на основе сверток с производными для оценки параметров масс-спектров, содержащих наложившиеся

ружения и разделения пиков в экспериментальных данных // Dspa'99. Доклады. Т. 1. С.105.

4. Сирвидас С.И., Заруцкий И.В., Ларионов А.М., Манойлов В.В. Обнаружение, разделение и оценка параметров масс-спектрометрических пиков методом свертки экспериментальных данных с производными гауссовых функций // Научное приборостроение. 1999. Т. 9, № 4. С. 84.

Институт аналитического приборостроения РАН, Санкт-Петербург

Материал поступил в редакцию 3.06.2009.

CAPABILITY OF THE ALGORITHM ON THE BASE CONVOLUTION PROCESSING SIGNALS WITH DERIVATIONS OF PEAK SIGNALS FORM FOR THE ESTIMATION OF MASS-SPECTRA PEAK PARAMETERS IN MULTIPLETS

V. V. Manoylov, I. V. Zarutsky

Institute for Analytical Instrumentation RAS, Saint-Petersburg

The results of investigation of algorithm on the base of convolution processing signals with derivations of peak signals form for estimation parameters mass-spectra peak in multiplets are discussed. The investigation is realized with the help of computational experiment on the base models of mass-spectral peaks with different amplitudes and different distance between single peaks in multiplets.

Keywords: methods for signal processing, mass-spectrometry, peak parameter estimation in multiplets, analysis of algorithm processing data errors

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.