CC BY
325
Медицинская Иммунология ОбзО&Ы
2003, Т. 5, № 1-2, стр 11-28 -»
©2003, СПбРОРААКИ
СТРУКТУРНЫЕ ОСНОВЫ И ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ ЗНАЧИМОСТЬ АЛЛЕЛЬНОГО ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНОВ ЦИТОКИНОВ ЧЕЛОВЕКА И ИХ РЕЦЕПТОРОВ
Коненков В.И., Смольникова М.В.
ГУ Научно-исследовательский институт клинической иммунологии СО РАМН
Резюме. К настоящему времени определился новый уровень генетического контроля вариабельности функционирования иммунной системы, антигеннеспецифической регуляции иммунного ответа. Известно, что кроме генов HLA-системы важное место в формировании иммунного ответа занимают полиморфные гены цитокинов, гены их рецепторов и антагонистов. Показано, что уровень продукции цитокинов про- и противовоспалительной природы и их антагонистов, уровень экспрессии рецепторов к тому или иному ци-токину и тому подобные эффекты определяются наследуемым человеком набором аллельных вариантов генов цитокинов и генов их рецепторов. Целью настоящего обзора явилась попытка теоретического анализа влияния полиморфной структуры генов цитокинов и их рецепторов на возможный исход формирующегося на ряд антигенных детерминант различной природы иммунного ответа организма, кроме этого, в обзоре представлено наиболее полное описание известных к настоящему полиморфных регионов указанных генов с учетом хромосомной локализации гена каждого иммуномодулятора. По мнению авторов, подробное изучение полиморфной структуры цитокиновой сети, расшифровка механизмов регуляции функциональной активности клеток иммунной системы и генетического контроля иммунного ответа поможет исследователям в процессах разработки критериев предрасположенности и резистентности человека к развитию патологических состояний; приблизит нас к обоснованию возможности нового подхода к генотерапии заболеваний человека путем воздействия на установленные вариабельные участки генов с целью модификации реакции клеток-мишеней на активационные сигналы ключевых цитокинов.
Ключевые слова: полиморфизм генов, цитокины, рецепторы цитокинов, аллельный вариант, хромосомная локализация.
Konenkov V.I., Smolnikova М. V.
STRUCTURE AND FUNCTIONAL IMPORTANCE OF ALLELIC POLYMORPHISM
OF HUMAN CYTOKINE GENES AND THEIR RECEPTORS
Abstract. At present the new level of genetic control of variability of the immune system functions and antigen-non-specific regulation of the immune response has been defined. It is known, that besides the genes of HLA-system, the important role in the immune response play cytokine polymorphic genes, as well as genes of their receptors and antagonists. The levels of pro- and anti-inflammatory cytokines and their antagonists production, the levels of receptor expression to one or another cytokine and similar effects are determined by the inherited number of allelic variants of cytokine genes and genes of their receptors. The purpose of the present review was an attempt of theoretical analysis of influence of polymorphic structure of cytokine genes and their receptors on possible outcome of immune response to various antigenic determinants. Moreover, the review concerns thorough description of polymorphic regions of abovementioned genes, taking into consideration chromosomal localization of each immunomodulator’s gene. In our opinion, the detailed study of the cytokine network polymorphic structure, decoding of regulatory mechanisms of cell functional activity and of the genetic control of
— T” immune response will help the researchers to introduce the
Адрес для переписки: ,. r . . , . .
Смольникова Марина Викторовна cntena Ы ~ Predisposition and resistance to patholo-
ГУ НИИКИ СО РАМН gy. It will help us to substantiate a new approach to human
630099, г. Новосибирск, ул. Ядринцевская 14. diseases genotherapy by means of influence on indicated
Тел.: (3832) 28-50-84. variable sites of genes in order to modificate target-cell re-
Факс: (383-2) 22-70-28. sponses to the activation signals of cytokines.
E-mail: [email protected] (Med.Immunol., 2003, vol.5, N1-2,pp 11-28)
Открытие все большего числа продуцируемых клетками регуляторных факторов, их антагонистов и рецепторов приближает нас к пониманию всей сложности и многокомпонентности системы регуляции межклеточных взаимодействий в иммунной системе. Описание продукции цитокинов клетками, прямо не относящимися к иммунной системе, и даже многими бактериальными клетками свидетельствует о том, что иммунология с методологического выходит на новый уровень описания общебиологических закономерностей функционирования клеточного сообщества в рамках целостного организма, а также межорганизменных симбиозов.
Однако при этом каскаде открытий остается за кадром основной вопрос функционирования иммунной системы как строго специфической системы, в которой собственно системообразующим фактором является конкретный антиген, чье воздействие непосредственно и формирует иммунный ответ и вовлекает весь клеточный и молекулярный ансамбль в исполнение согласованной партии.
При этом в рамках иммунной системы одного индивида, обладающей способностью к полноценно-
му функционированию единой цитокиновой сети, все же формируются как низкие, так и высокие уровни иммунного ответа различного типа к различным антигенным детерминантам. Наряду с этим, на популяционном уровне мы имеем дело с формированием различного уровня иммунных ответов на однотипные антигенные воздействия. Этот вопрос, казалось бы, хорошо изученный в рамках концепции о генетическом контроле силы иммунного ответа и значимости в нем полиморфизма генов главного комплекса гистосовместимости, вновь возник при исследовании генов, кодирующих структуру цитокинов и их антагонистов, а также их рецептных молекул, ассоциированных с клеточной мембраной.
За последние десять лет в многочисленных исследованиях, продемонстрировавших новые механизмы формирования полиморфной структуры генов цитокинов, было установлено, что гены как самих цитокинов человека, так и их рецепторов характеризуются аллельным полиморфизмом. Эти гены представлены в различных регионах большинства хромосом человека. Хромосомная локализация генов цитокинов и их рецепторов показана на схемах 1 и 2, из ко-
-М-СЭР
Д-ПЛО
-ПЛа
-ПЛЬ
Г.-ЖА-ВДЖ
-ЮТа
|-ТШ>
-игь
т
§
«■
■
'т
І
-Ш7
-Ш2
-П-8
■
I
-пл
йм-сэр
4 -11,5
■ел з
•ЕЛ •Ш9
І.ІШа
Н-ПЭД
10 11 12
-О-СБР
13 14 15 16 17
-ЕЛ1
18 19
20 21 22
•а-сзрю
!-ютяь
1-ШЖд
іЮТЯа
■
т
ц
2-іиіи
Е'-ШКІ
І-ОЖа •ПЖЬ
И і
■ -ІЬ5К.а ' ! »
-ІЬ12р35 ■ ■ м-
а -ССНІ а и
1 ■ -ССЮ 1 N -ІЬ15 Ц ■
■ ■ ■ ■
я ■ ■ Р
■ ■ им ■
И і і ■ X *4
3 4 5
-гит
-ПЛЯа ■іивз -м-сят з -шнь
-ПЛВл
-ПЛОЯа
-Ш»К.а
-тш>
■
т
©о
17
ь м
А 4Х>
18 19
а-ом-сэгаь
-ПЛКЬ
22-П-3№
-ПЛЗЯаІ
-іияв « І -ЯЛЗіиЯ іом-с^Ю)
• іш*. ІІЖЬ
X У
Схема 1.
Схема 2.
торых видно, что большие кластеры генов цитокинов располагаются на 5 и 6 хромосомах человека; гены рецепторов цитокинов и их отдельных цепей распределены в основном на 1,2,5 и на X хромосоме.
Одними из первых исследований, посвященных изучению аллельных вариантов генов цитокинов человека, были работы о полиморфизме гена фактора некроза опухолей альфа [9]. Подобный интерес объясняется локализацией его гена в кластере генов МНС, аллельный полиморфизм которых подробно исследован [17]. Показано неравновесное сцепление между аллелями генов главного комплекса гистосовместимости и аллелями гена ГМчх. К одним из первых исследований из ряда полиморфных генов цитокинов можно отнести и работы о полиморфизме генов семейства интерферонов, который был показан при их секвенировании, начатом в 1982 году [49, 98]. В настоящее время обнаружено более ста полиморфизмов в различных участках генов цитокинов и их рецепторов, и эти данные вновь и вновь пополняются новыми найденными полиморфизмами.
Наиболее распространенные точечные мутации, результатом которых является аллельный полиморфизм, могут затрагивать как кодирующие, так и некодирующие районы генов цитокинов [10, 32, 44].
Гены цитокинов и их рецепторов являются высококонсервативными структурами, в связи с чем неконсервативные мутации внутри экзонов генов цитокинов редки и обусловливают отсутствие или изменение функций конечного экспрессируемого протеина. Примеры изменения аминокислотной последовательности обнаружены в рецепторах некоторых цитокинов у здоровых людей [8, 124]. Подобные мутации в экзонах, приводящие к замене аминокислот, выявлены для таких медиаторов как 1Ь-1(3, \L-1R1,1Ь-Ша, 1Ь-411, ТОТ-Иа, ТСБ-Р, СМ-СБРИР [8, 32, 50, 78, 108]. Наибольшее внимание в настоящее время уделяется мутации в пятом экзоне гена 1Ь2Ку, приводящей к замене триптофана на аргинин в позиции 224. Этот ген локализован на Х-хромосо-ме человека, и в результате указанной мутации формируется Х-сцепленный комбинированный иммунодефицит [90]. Консервативные же (молчащие) мутации не затрагивают аминокислотную последовательность, однако они могут влиять на экспрессию белка другими путями, изменяя сплайсинг или стабильность мРНК, влияя на уровень транскрипции исследуемого гена. Поиск аллельных вариантов генов цитокинов, в которых мутации затрагивали бы кодирующую часть и приводили бы к появлению новых функций или изменению старых, интенсивно продолжается, т.к. представляют интерес в их связи с возникающими при этом патологическими состояниями организма человека.
Наиболее часто встречающиеся аллельные варианты генов цитокинов образуются в результате мутаций интронных областей, напрямую не изменяющие аминокислотную последовательность. Такие мутации также могут влиять на продукцию и функциональную активность белков. Однако это влияние может быть опосредовано через изменение функциональных сайтов, контролирующих транскрипцию, созревание и транспортировку соответствующих мРНК. Например, полиморфизм внутри 5’- и 3’-фланкирующих регуляторных районов или внутри интронов может оказывать существенное влияние на уровень трансляции, стабильность РНК и механизмы сплайсинга про-мРНК.
Известно, что практически все гены цитокинов человека являются индуцибельными, часто их индукция определяется воздействием транскрипционных факторов на энхансерную последовательность промоторного участка гена. Промоторы генов цитокинов и их рецепторов тоже полиморфны по своей структуре, и их полиморфизм оказывает влияние на продукцию белкового продукта цитокиновых генов. Необходимо отметить, что наибольшее количество аллельных вариантов генов цитокинов установлено именно для их промоторов - участков, ответственных за связывание РНК-полимеразы с ДНК; наличие различных аллелей в промоторных регионах отличает их носителей друг от друга в основном интенсивностью экспрессии генов. Мутации в промоторах, влияя на уровень экспрессии контролируемого гена (или генов), тем не менее, не изменяют кодируемых генами продуктов. Влияние подобных полиморфизмов на транскрипцию осуществляется путем изменения структуры сайтов связывания транскрипционных факторов внутри промоторов генов (или структур энхансеров и сайленсеров внутри интронов). Наконец, подобный полиморфизм может изменять сайты присоединения пространственных факторов транскрипции в ядерном матриксе, что приводит к изменению структуры промоторов.
Нельзя оставить без внимания то, что ответ клеток иммунной системы на действие цитокинов возможен лишь при условии экспрессии на поверхности этих клеток соответствующих рецепторов. Полиморфизм в различных участках генов рецепторов цитокинов также способен оказывать влияние на продукцию соответствующего белка, что в свою очередь ведет к изменению действия цитокинов. В качестве примера такую цепочку можно проследить на генах семейства 1Ь-1 (см. ниже).
Множество аллельных вариантов генов практически всех цитокинов человека к настоящему времени выявлено и описано благодаря современным высокоспецифичным молекулярно-генетическим методам исследований. Многие из вариантов моли-
морфизма цитокиновых генов встречаются в пределах известных или предполагаемых регуляторных регионов и подробно описаны (табл.1).
Применение метода рестрикционного анализа (RLFP - Restriction Length FragmentPolymorphism), а также высокоинформативного метода анализа микросателлитного полиморфизма (STR - Short Tandem Repeats), наряду с развитием ПЦР-типи-рования и секвенирования, привело к быстрому прогрессу в области генетического картирования у человека [20, 115]. Резюмирующим итогом активной работы ученых многих стран была полная расшифровка генома человека в 2001 году и опубликование его структуры [102]. Относительно недавно были сформулированы представления о SNP (Single Nucleotide Polymorphism), или полиморфизме по одному нуклеотиду, который связан с точечными заменами или микроделециями и инсерция-ми в геноме [109]. Большой заслугой комплекса работ по расшифровке генома человека явилось выявление ошибочных и не подтвержденных SNP (примерно 5% от числа известных), которые были отнесены к артефактам. SNP индивидуально менее информативны, чем STR, но существенно более распространены в геноме (подтверждено наличие порядка 1,4 миллионов SNP в геноме человека), что обусловило большой интерес к ним как к средству локализации генов. На данный момент SNP являются наиболее широко изучаемыми полиморфизмами промоторных регионов генов цитокинов и их рецепторов, исследуемых при популяционных исследованиях и при исследованиях ассоциативных связей с заболеваниями человека.
К распространенным полиморфизмам генов также относят вариабельное число тандемных повторов (VNTR - Variable Number of Tandem Repeats), неравновесных по сцеплению с влияющими на транскрипционную активность участками [30,85]. Их аллельные варианты отличны по числу повторов длиной более пяти пар нуклеотидов. В эту же группу можно отнести вышеупомянутые STR - регионы, расположенные в некодирующих последовательностях ДНК, состоящие из вариабельного числа повторяющихся ди-, три- или тетрануклеотидов [111]. Методы идентификации такого полиморфизма заключаются в проведении полимеразной цепной реакции с варьирующей температурой отжига и последующего определения длины фрагментов в высокопроцентном полиакриламидном геле.
Из наиболее используемых в мировой практике технологий по выявлению однонуклеотидных различий фрагментов ДНК можно выделить:
- ферментативные методы
- физические методы
- химические методы гидролиза гетеродуплексов.
Табл.1. ПОЛИМОРФНЫЕ РЕГИОНЫ ГЕНОВ ЦИТОКИНОВ
И ИХ РЕЦЕПТО РОВ
Ген Полиморфизм
11-1а Intron 6: 46bp VNTR -889 Exon 5: +4345 Т-» G Dinucleotide repeat
IL-1P -511 G-> A (AvA) -35 T—> С (Aid) nt5810 A-> T (ЯяЯ) +3953 (nt5887) C-> T (Гаф
IL-1Ra +2016 Т-» С Intron 2: 86bp VNTR nt8006 T—> С (Ms/X) nt8061 C-> T (Mwd) nt9589 A—> T (SsfX) nt11100T-> C (A/S/A1I)
IL-1RI 2 Pst\ RFLPs Exon 1C: C52A, A140T
IL-2 -330 +166 Dinucleotide repeat
IL-2Rcc Taq/RFLP
IL-2R3 Dinucleotide repeat
IL-3 Bglll RFLP -211 C—> A -16 С-» T +5 C-»T +131 C-> T Enhancer nt232 Enhancer nt236
IL-3 Enhancer nt283
IL-4 -590 C-> T (BsmFl) -285 C-> T -81 A—» G Intron 3: (GT) repeat Intron 2: 70bp VNTR
IL-4R nt148 А-» G nt426 C-> T nt747 C-> G nt864 T-> С nt1124A-> С nt1167 G-> T nt1216 Т-» С nt1218 C-> T nt1224 T—> С nt1232 С-» T nt1902 G-> A (R576Q) nt2281 T-> С
IL-5 -703 C-> T
IL-5Ra Dinucleotide repeat -80 G-> A (Maelll)
Продолжение табл. 1 (Начало на стр. 14)
Ген Полиморфизм
IL-6 -174 G-> С (Nlalll) -598 A—> G -573 G-> С 3’ (AT)-rich minisatellite Mspl RFLP Bglll RFLP Xbal RFLP nt565 G-> A (Fokl) 5' (AT)-tract (5 alleles) (CA)n repeat
IL-6R (CA)n repeat
IL-8 Hindlll RFLP
IL-8Ra Codon 827
IL-8Rb Exon 3: +785, +1208
IL-9 Dinucleotide repeat
IL-10 -1082 G-> A -819 C-> T -652 -592 С-» A -127 -41 5’ proximal (CA) repeat (IL10.G)
IL-11 З’-IFTR: CA-repeat
IL-12Rb lntron2 Intron 4 З'-UTR: A1188C
IL-13 -1055 C-> T Intron 1: G+543C Intron 3: T+1922C Exon 4: A+2043G, A+2579C
IL-13R С 1050T
TNFa -1031 -862 (*-863) -856 (*-857) -851 С-» T -559 C-4 T -574 -376 G-> A -316 G-> A -308 G-> A (TNF1 =G; TNF2=A) -288 G-> A -244 G—» A -238 G-> A -163 G—» A -55C—>T -50 C-* G +25 G-> A +70 G-> A +489 G-> A +691 deIG TNFa, b, c, d, e microsatellites
Ген Полиморфизм
TNFp Intron 1, Ned RFLP (Thr26Asn) (TNFB*1=Asn26; TNFB*2=Thr26) AspHI RFLP
TNF-RI B(on 1: nt36 А-» G [Mspk\ I) Intron 6: +10 -609 -383 A-* С (Bgl\)
TNF-RII Exon 6: T696G Exon 10: З’-UTR: A1603G, T1668G, C1690T Codon 198: +422
IFNa Dinucleotide repeat
IFNaR Hindlll RFLP
IFNp 3’ Mspl RFLP
IFNy Intron 1, (CA) repeat
IFNyRI Taql RFLP
TGFa Taql RFLP
TGFP1 Exon 1: nt869 (LeulOPro), nt915 (Arg25Pro) nt72 unspecified -988 -800 -509 nt713-8delC nt788 C-> T
TGFJ32 4 RFLPs, SSCPs
M-CSFR EcoRI
G-CSF Stul
GM-
CSF-Ra nt199 C-> G nt824 C-4 T nt640 A-> G nt428 A-> G nt1148 G-> A
GM-
CSF-RP nt301 С-» T (Cys91) nt773 G-» С (Glu249Glu) nt962 G-> A (Asp312Asn) nt1306 C-¥ T (Ser426) nt1835 C-> A nt1968 G-> T nt1972 G—> A nt1982 G-> A nt2427 G-> A
Последние две категории относительно новы, их чаще используют для строго специфичных целей, которые не требуют многочисленных исследований [35]. Ферментативные же методы наиболее популярны в молекулярно-генетических исследованиях, прежде всего в связи с их экономичностью, чувствительностью и высокой специфичностью. К ним относится PCR-RLFP (рестрикционный анализ продуктов амплификации), первое описание которого привел Deng G.R. в 1988 году при изучении онкогена c-Ha-ras, а также Maeda М. с соавторами при изучении генов HLA-DQA1 [33, 77]. Этот метод считают относительно простым и быстрым для определения аллелей генов, не требующим использования радиоизотопов и специфических олигонуклеотид-ных зондов, проведения гибридизации.
Другой метод определения точечных мутаций -PCR-SSP (амплификация праймерами, имеющими аллельную специфичность) был впервые применен Shyamala V. в 1989 году в условиях, когда было недоступно полное секвенирование исследуемого гена [46, 106]. В дополнение к этому, некоторые авторы отказались от электрофоретической детекции продуктов реакции в геле, что упростило SSP метод, продукты амплификации в этой модификации определяют с помощью измерения флюоресценции [29]. Данный метод не требует использования эндонуклеаз рестрикции, чем доказывает свою экономичность.
По сравнению с первыми двумя, метод PCR-SSOP (гибридизация амплифицированных фрагментов ДНК, фиксированных на мембранах, с оли-гонуклеотидными зондами) достаточно трудоемок, что уменьшает его применение в ряде научных исследований [35, 81].
Благодаря наиболее часто используемым сейчас методам рестриктного анализа продуктов амплификации и амплификации с аллель-специфическими праймерами к настоящему моменту описано множество полиморфных участков генов цитокинов, локализованных на большинстве хромосом человека (табл. 2).
Так, на первой хромосоме человека в участке lq31-32 локализован ген IL-10, содержащий 4 экзо-на [129]. В результате секвенирования гена IL-10 были выявлены полиморфные участки промотора этого гена, в том числе IL-10.G и IL-10.R из 5’-флан-кирующего региона, различающиеся количеством СА-повторов [37, 38,39]. Благодаря использованию чувствительного метода денатурирующей высокоэффективной жидкостной хроматографии (DHPLC) недавно также установлены варианты точечных замен в 5’-фланкирующем регионе гена IL-10: А-3533Т, A-2769G, A-2739G, A-2013G, A-1349G, С-1255Т, А-815G, A-657G [31 ]. Указывается, что среди этих вось-
ми новых аллельных вариантов гена аллели -2769G и -1255Т очень редки, они показаны в одном испытании среди почти двухсот обследованных индивидов. В 1997 году описаны шесть полиморфизмов гена IL-10 в позициях -1082, -819, -652, -592, -127, -41 относительно транскрипционного сайта [119]. Показаны аллельные варианты в позиции Т-854С и С-627А, а также полное сцепление аллелей -854Т и -627А [40].
Изучение транскрипционного контроля гена интерлейкина 10 (IL-10), располагающегося на первой хромосоме, представляет особенный интерес в связи с тем, что этот цитокин играет основную роль в регуляции воспалительного и иммунного ответов, являясь продуктом Th2 клеток. IL-10 ингибирует синтез ряда цитокинов, продуцируемых ТЫ, таких как IFN-y, IL-2, TNF-$, а также IL-1, IL-6 и TNF-a [97].
При сопоставлении результаты продукции IL-10 с данными аллельных вариантов гена выявлено, что из трех точечных мутаций в промоторном регионе (G-1082A, С-819Т, С-592А) в позиции -1082 обнаруживается корреляция с продукцией белкового продукта гена IL10,- аллель G ассоциирован с высокой, а аллель А - с низкой продукцией этого интерлейкина in vitro [59, 83]. Позиция промотора -1082 лежит внутри ETS-подобного сайта узнавания, т.е. может действовать на этот транскрипционный фактор, который к тому же является негативным регулятором продукции IL-2 [119]. Установлено, что присутствие аллельного варианта -592А ассоциировано с уменьшением продукции IL-10 [105].
Выявленные полиморфные участки промотора IL10.G и IL10.R, различающиеся количеством СА-повторов, могут оказывать влияние на дисрегуляцию нормальных функций В-клеток. При изучении микросателлитов в гене IL10 показано, что аллель IL10.R3 достоверно ассоциирован с низкой продукцией IL-10. Позднее была предложена номенклатура четырех наиболее распространенных гаплотипов 1Ь10в голландской популяции, различающихся между собой различной секрецией IL-10: IL10.01 (IL10.R3/IL10.G/-1087G/-824C/-597C), IL10.02, IL10.03, IL10.04 [37, 38, 39].
Принимая во внимание свойство IL-10 ингибировать продукцию цитокинов, продуцируемых Thl клеток, можно предположить, что присутствие в гене аллеля -1082А или IL10.R3 приведет к повышенной продукции таких провоспалительных цитокинов, как IL-1, IL-2, IL-6, TNFa и IFNy.
Кроме гена IL10 на первой хромосоме расположен ген макрофагального колониестимулирующего фактора (M-CSF) в положении 1р13-р21. Ген M-CSFсодержит в себе 10 экзонов, и до сих пор не описано полиморфных вариантов в каком-либо участке этого гена.
Табл. 2. ХРОМОСОМНАЯ ЛОКАЛИЗАЦИЯ ГЕНОВ ЦИТОКИНОВ И ИХ РЕЦЕПТОРОВ
Ген Хромосомная локализация Название или функция белкового продукта
1. Гены цитокинов
И-10 ІЧ31-32 Интерлейкин-10 (И-10)
М-СБР 1р13-21 Макрофагальный колониестимулирующий фактор (М-СБР)
Т6РВ2 1р41 Трансформирующий ростовый фактор Р-2
II.-1а 2ф Субъединица 11.-1
11.-1 р 2ф-2] Субъединица И-1
ТЄРА 2рН-13 Трансформирующий ростовый фактор а
И-12А 3р12-13.2 И-12А
И-2 4д26-28 И-2
И-8 4д12-21 И-8
И-15 4ч25-35 11.-15
И-З 5я23-31 И-З
И-4 5423-31 11.-4
И-5 5я23-31 11.-5
И-9 5я31-32 И.-9
И-12В 5д31-33 И-12В
И-13 5я31.1 II.-13
СМ-СБР 5я22-31 Гранулоцитарно-макрофагальный СЭР (СМ-СБР)
Т^а 6р23-дІ2 Фактор некроза опухолей а (TNF-а)
TNFp 6р23-дІ2 т^-р
И-6 7р21-р14 И-6
И-7 8д12-13 И-7
ІРМа 9р22 Интерферон-а (1РМ-а)
ігор 9р22 Интерферон-0 (^N-(3)
1РЫу 12д24.1 Интерферон-у(1Р1^-у)
ТСРВЗ 14ч24 Трансформирующий ростовый фактор Р-3
17д11.2-12 Гранулоцитарный СБР (С-СЭР)
II.-11 19д13.1-13.4 И-11
ТЄРВІ 19д13 Трансформирующий ростовый фактор р-1
II. Гены рецепторов цитокинов
И.-6Яа 1д21 а-цепь рецептора И-6
Т^ЯЬ 1р36.3-36.2 Рецептор 2 ТМР
й-СБРЭЯ 1р35-34.3 Рецептор к Є-СБР
И-1ЯМ 2дІЗ Антагонист рецептора И-1
И-1В1 2ц\2 Рецептор И-1 типа 1
И-1Я2 2дІ2 Рецептор И-1 типа 2
И-8ЯА 2д35 Рецептор И-8
И-8ЯВ 2д35 Рецептор И-8
И-5ЯА Зр26-24 а-цепъ рецептора И-5
И-12р35 3 Рецептор И-12
И-7ЯА 5рІЗ Рецептор И-7
1Ь7ЯС 5рІЗ Рецептор И-7
м-сэт 5чЗЗ Рецептор М-СБР
ІЖдЯ 6р23-24 Рецептор 1 ІРІМ-у
И.-11Я 9 Рецептор 11.-11
И-2ЯА 10р14-15 а-цепь рецептора И-2
И.-10ЯА Нд23 а-цепь рецептора И-10
TNFRA 12д13.2 Рецептор 1 ТМР
И.-4ЯА 16р12.1 -11.2 а-цепь рецептооа И-4
И-6ЯВ 17 Рецептор И-6
^дЯ2 21я22.1 Рецептор 2 ІРМ-у
И.-2ЯВ 22дп.2-12 Р-цепь рецептора ІІ-2
И-ЗЯВ 22 Рецептор ІІ.-3
СМ-СБРЯВ 22^2.2-13.1 Р-цепь рецептора йМ-СЭР
И-13ЯА2 Хд13.1-28 а2-цепь рецептора И-13
И-13ЯА1 X а1-цепь рецептора И-13
игяй ХдІЗ у-цепь рецептора И-2
ЄМ-С^ЯА Хр22.32,Ур11.3 а-цепь рецептора ЄМ-СБР
И.-9Я Хд28,УдІ2 Рецептор И-9
В участке І44І расположен ген одной из трех изоформ трансформирующего ростового фактора (3 (ТСРР2), содержащий семь экзонов. В 1993 году показано наличие четырех полиморфизмов по длине рестрикционных фрагментов (ИРЬР) в некодирующей части гена этого цитокина [87].
На первой хромосоме расположен ген а-цепи рецептора ІЬбЛА (регион 1 я21), для которого описан полиморфизм по количеству СА-повторов [118]. В регионе 1р36.3-36.2 локализован ген второго рецептора ТКРРВ (ТЫР-Р-П), состоящий из 10 экзонов и
9 интронов. Изучены биаллельные полиморфизмы во 2 (молчащая мутация), 6 (Т—Ю в позиции 696) и
10 экзонах (в З’-ШИ регионе 1663А—Ю, 1668 Т->С и 1690С—>Т [2, 12, 78, 94, 117]. Показан также полиморфизм в позиции +422 кодона 198 этого гена, а в японской популяции были исследованы новые полиморфизмы п(;168Т—>С, пі543С—>Т, п1587Т—»С, п1б94С—>А [3,116]. На этой хромосоме расположен также консервативный ген рецептора Є-СБЕЗЯ (1р35-34.3).
1Ь-1а и ІЬ-ір кодируются двумя различными генами, содержащими по семь экзонов и расположен-
ными на второй хромосоме в участках 2413 и 2413-421 соответственно. Каждый из генов локуса интерлейкина 1 на второй хромосоме полиморфен (см. также гены Д,ШЫ, 1ЬШ1 и Я,Ш2). В некодирующей части гена, в шестом интроне П-1 а показан полиморфизм вариабельного числа тандемных повторов [10]. Описаны также динуклеотидные повторы в гене 1Ыа [36, 116]. В промоторном регионе изучены аллельные варианты гена в участке -889, показано неравновесие по сцеплению между этим полиморфизмом и заменой Т+4345С в пятом экзоне [65, 72, 79]. В промоторном регионе гена 1Ь1$ показаны точечные замены Т-35С, С-511 А, а в кодирующей части гена описан полиморфизм в пятом экзоне (С+3953Т)
- аллель Т которого ассоциирован с повышенной экспрессией указанного гена [28, 50].
На второй хромосоме в районе 2р11-2р13 локализован ген ТС Ра, он содержит шесть экзонов. Выявлен полиморфизм по длине рестрикционных фрагментов, связанный с наличием/отсутствием сайта рестрикции для Taql [53].
Вторая хромосома содержит гены рецепторов 1Ь-1 и 1Ь-8. Здесь располагается целый кластер ге-
Табл. 3. ВЛИЯНИЕ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНОВ РЯДА ЦИТОКИНОВ НА УРОВЕНЬ ЭКСПРЕССИИ
Ген Аллельный вариант Экспрессия
IL-1Ra intron 2 86bp VNTR (allele 2) і
IL-1Ra Intron 2 86bp VNTR, (ailele2) T
IL-1P +3953 (nt5887) T t
IL-4 -590 T T
IL-6 -174 G t
З’-UTR allele 5
3’(AT)rich minisatellite 790 792, 808 and 820bp alleles) т
-597A, -572G, -373А,Д.., -174G haplotype -597G, -572G, -373АД,, -174G haplotype і
т
IL-10 -1082 G т
-592 A 1
-1082 A, -819 C, -592 С і
-1082 A, -819 T, -592 A і
-1082 G, -819 C, -592 С т
-1082A, -819Г, -592A і
-1082G, -819C, -592C т
R 2, G14 т
R 3 і
R 3, G1 і
IL-13 -1055 T т
LTa (TNFp) Intron 1, Ned RFLP: TNFB*1 (Asn26) т
Intron 1, Ned RFLP: TNFB*2 (Thr26) і
TGFpi nt915 (Arg25) т
nt896 (Leu 10) т
TNFa -238 A т
-308 (TNF2) т
-863 A і
a13 і
a2 and a9 т
& і
cS т
IFNy (CA)n intron 1 (allele 2) т
нов из группы 1Ь-1, в том числе ген антагониста рецептора интерлейкина 1 Д.У.ИУ ^13), для которого показан полиморфизм во втором экзоне (+2016 Т—>С), несколько однонуклеотидных замен (см. таблицу 1) и «пента-аллельное» вариабельное число тандемных повторов 86 Ьр (У>1Т11) во втором нитроне [50]. Существует двоякое мнение о влиянии аллеля 2 полиморфизма по количеству повторов на уровень экспресии гена (см. таблицу 3). Изучение полиморфизма гена ПШЫважно в связи с его способностью ингибировать стимулирующие эффекты 1Ь-1 [И, 18]. Здесь же локализованы гены двух типов рецептора 1ЫШ и 1ЬШ2 (2ц12), первый из которых полиморфен в позициях 52 и 140 экзона 1С (С-4А и А—>Т, соответственно), также показана мутация в 52 позиции интрона 1В (А-»С, сайт рестрикции для МэрТ) [108]. В гене рецептора 1Ь811А ^35) описан один БКТР полиморфизм в 827 кодоне, а в гене 11811В, локализованного там же, показано три БЫР
- одна молчащая мутация и две в 3 экзоне (позиции +785, +1208).
1Ь-12 - гетеродимерная структура, состоящая из двух субъединиц, ген одной из которых (р35, называемой также 1Ы2А) локализован в регионе Зр12-ql3.2, для него пока не показан полиморфизм.
На третьей хромосоме расположен ген а-цепи Д.5&4 (Зр26-24) с заменой А-80С в промоторной области и динуклеотидными повторами в некодирующей части [71]. Здесь же локализован консервативный ген рецептора к 1Ь-12 (П12р35).
Ген 1Ь2 расположен в регионе 4q26-28 и содержит 4 экзона. Полиморфизм гена этого интерлейкина определен двумя точечными мутациями в положениях -330 и +166 относительно стартовой точки транскрипции и динуклеотидными повторами в 3’-фланкирующем регионе [36,63]. БЫР в регионе+166 локализована в лидерном пептиде и не влияет на аминокислотную последовательность (молчащая мутация), тогда как существует мнение, что замена Т-330С в промоторном регионе может влиять на уровень продукции 1Ь-2 [62].
Интерлейкин 2 (1Ь-2), как продукт ТЫ, индуцирует клеточный иммунитет, являясь фактором роста для всех субпопуляций Т-лимфоцитов, его действие приводит к развитию плейотропного ответа с участием нескольких субпопуляций клеток иммунной системы. 1Ь-2 в присутствии 1Ь-4 участвует в усилении пролиферации активированных В-клеток.
Ассоциаций точечной мутации Т-ЗЗОС в промоторном регионе гена Н2 с продукцией этого интерлейкина пока не показано, однако аллельные варианты в этом участке предположительно могут оказывать влияние на уровень продукции 1Ь-2. Ген 1Ь2 является кандидатным маркером для поиска ассоциаций с аутоиммунными заболеваниями, что связано
с возникающими при его недостатке аутоиммунными расстройствами.
На четвертой хромосоме картирован также ген IL8 в положении 4ql2-21, он содержит в себе 4 экзона. Fey M.F. et al описывают полиморфизм по длине рестрикционных фрагментов, связанный с наличием/отсутствием сайта рестрикции для Hindlll [43].
Ген IL-15 локализован в регионе 4q25-35, он к настоящему времени недостаточно изучен и полиморфизм не показан ни в одном из его регионов.
На пятой хромосоме человека локализован целый кластер генов цитокинов, многие из которых имеют полиморфную структуру в различных участках. Здесь расположены гены IL3 (в позиции 5q23-31), IL4 (5q23-31), IL5 (5q23-31), IL9 (5q31-32), IL12B (5q31-33), IL13 (5q31.1) и GM-CSF (5q22-31).
Одним из самых полиморфных является ген IL3, содержащий пять экзонов. В этом гене аллельные варианты показаны как для промоторного региона (в позициях G-211A и С-16Т), так и для кодирующей части (С+5Т, С+131Т), а также полиморфизм по длине рестрикционных фрагментов, связанный с наличием/отсутствием сайта рестрикции для рест-риктазы BgtlI [60, 61].
Ген IL4 имеет протяженность около 10 кб и содержит 4 экзона [6]. Его кодирующая последовательность высоко консервативна - до сих пор не обнаружено ни одной мутации в экзонах IL4. В то же время выявлено несколько точечных полиморфизмов в промоторной области гена (С-590Т, С-285Т, A-81G) и микросателлиты во втором и третьем интронах [19,
84, 100, 110, 112].
Интерлейкин 4 (IL-4), цитокин Th2, является главным фактором регуляции пролиферативного ответа В-лимфоцитов и регулирует переключение изотипов иммуноглобулинов в них, индуцируя экспрессию IgG и IgE, его часто называют критическим цитокином воспаления. IL-4 выступает, наряду с IL-2, так же как фактор роста Т-лимфоцитов и тучных клеток и является ключевым сигналом диф-ференцировки CD4+ Т-клеток в хелперы типа 2 [128].
Точечная замена С-590Т обусловливает повышенную по сравнению с аллельным вариантом -590С активность промотора, и, как результат этого, увеличенную экспрессию IL-4 и продукцию интерлейкина [6,19, 67]. Исключительная роль IL-4 как стимулятора продукции IgE подтверждается тем, что, например, у больных астмой и атопическим дерматитом наличие аллеля -590Т ассоциировано с высоким уровнем общего IgE [68,100].
Ген IL5 картирован и секвенирован двумя независимыми группами [26, 113]. В настоящее время известна только одна его мутация - транзиция С-703Т в промоторной области [99].
Ген IL9 длиной около 4 кб локализован ближе к теломерному концу хромосомы по отношению к кластеру других интерлейкинов и состоит из 5 экзонов [37]. Полиморфизм гена IL9 представлен динуклео-тидными повторами в некодируемой части [34]. В другом исследовании найден вариант IL9, связанный с заменой С на Т в позиции 338 экзона 5 [74].
Ген второй субъединицы IL12 (р40, IL12B) содержит восемь экзонов. В гене IL12В показаны полиморфизмы во втором и четвертом интронах, не влияющие на аминокислотную последовательность белкового продукта, а также замена А—>С для TaqI в 3’-нетранслируемом регионе (3’UTR) в позиции 1188 [56].
Структура гена ЛУЗ подобна генам IL3, IL5, IL4 и GM-CSF, в нем содержится четыре экзона. Первые аллельные варианты этого гена были показаны в про-моторном участке С-1055Т, наличие которых, однако, некоторыми авторами отрицается [5]. Позднее открыты новые полиморфизмы - два в интронах (G+543C в первом интроне и Т+1922С в третьем) и два в кодирующей части гена (A+2043G и А+2579С в транслируемом и З’-нетранслируемом регионе, соответственно, четвертого экзона) [93,122].
Найдена ассоциация генотипа Т/Т в промотор-ном участке -1055 гена IL13 и увеличенной продукцией этого цитокина, функции которого во многом пересекаются с IL-4 [93].
Ген GM-CSFсодержит четыре экзона, о его полиморфизме данных в литературе пока нет.
Пятая хромосома содержит и гены ряда рецепторов цитокинов, для которых в данном случае менее характерен полиморфизм. Так, здесь локализованы высококонсервативные гены рецепторов IL7RA и IL7RG (5р13). В гене рецептора М-CSFR (CSFIR), локализованного в локусе 5q33, показан полиморфизм сайта рестрикции для EcoRI [21,41].
Ген TNF лежит внутри кластера генов III класса МНС между HLA-B и HLA-DR генами, в позиции 6p23-ql2 [27]. Различают гены TNFA и TNFB (или лимфотоксин-альфа, LTa), которые лежат на расстоянии примерно 1,2 кб друг от друга и оба характеризуются полиморфизмом [13]. Описаны полиморфные замены (практически все - замена G->A) в участках промотора гена TNFA: -1031, -862, -856, -574, -376, -308, -238, -163 [24, 55, 120, 125]. Кроме этого описаны а, Ь, с, d микросателлиты в некодирующей части гена [55, 80, 86, 120]. Также показаны точечные мутации G+70A, A+489G. В гене LTa показан RFLP для AspHI, а в первом интроне - для Ncol -здесь указывается на то, что аллель, обозначенная авторами как TNFB1, ассоциирована с повышенной экспрессией гена TNFB [42, 80].
Некоторые из полиморфизмов оказывают влияние на уровень продукции TNF in vitro, например,
полиморфизм в промоторном локусе -308. Многие исследования показали ассоциацию некоторых полиморфизмов гена TNFA с различными воспалительными и инфекционными состояниями человека. Однако до сих пор остается дискуссионным, является ли этот феномен опосредованным прямым влиянием SNPs или является «функционально молчащим» и проявляется только благодаря неравновесию по сцеплению с аллелями генов HLA системы. Перечисляя некоторые из установленных, укажем на неравновесие по сцеплению между рядом точечных мутаций гена фактора некроза опухолей и аллелями главного комплекса гистосовместимости: между редким аллелем -238А гена TNFAc HLA-A1, В17 и DR7, а также с гаплотипом DQB1 *0303-DRB 1 *0701; между -238G TNFA и HLA-B27; между редким аллелем -308А гена TNFA и HLA DR3, HLA-DRB1*0301, HLA-В21, гаплотипом HLA A1-B8-DR3; между -857Т аллелем TNFA и DRB 1*0405; между аллелем 2 полиморфизма сайта рестриктазы Ncol в интроне 2 гена TNFB и HLA-B21, HLA-B8; между микросателлитами TNFA all и DRB1*1501; а2, ЬЗ, d2 и DR3; аЗ-el и HLA-DR4; а13 и HLA-DRB1*1502 [3, 15, 48, 51, 66, 104,107,127 и др.].
Небольшое число исследований посвящено комплексному изучению возможного сцепления между генами I, II и III классов HLA, включая гены HSP70, Bat, Тар и др. И в этом случае указывается на то, что ассоциации аллельных вариантов иммунорегулятор-ных генов отражают их сцепление с генами HLA. Несмотря на это, знание характера ассоциаций, наличие неравновесного сцепления между аллелями TNF и HLA может быть полезно для объективного изучения определения роли генов этого локуса в возможном генетическом происхождении большого числа заболеваний человека [57].
TNFa обладает широчайшим спектром биологической активности, стимулирует иммунную систему во многих ее звеньях, является медиатором эндо-токсического шока, изменяет экспрессию многих цитокинов и ростовых факторов, обладает множеством других функций.
Несмотря на множество описанных полиморфизмов гена TNFA лишь замена в позиции G-308А влияет на изменение транскрипции и продукции TNFa [22, 126]. При измерении LPS-стимулированной продукции TNFa параллельно с определением генотипа этого цитокина показано, что у индивидов с гетерозиготным вариантом А/G в позиции -308 про-моторного региона продукция моноцитами этого цитокина выше, чем при G/G гомозиготном варианте [95]. Показана ассоциация аллельного варианта -308А с повышенной активностью промотора гена TNFA in vitro, с высоким конститутивным и индуцированным уровнем TNFa [7, 24].
Ген первого рецептора к ШЫ-у располагается на шестой хромосоме в локусе 6р23-24, описан ЛРЬР для рестриктазы Тас/1 [52].
На седьмой хромосоме в регионе 7р21 -р 14 расположен ген И6, содержащий пять экзонов. Кроме установленного в 1998 году полиморфизма С-174С промотора этого гена, ^Г(1ашс1е5 N. с соавторами в 2000 году описали А-598С и С-573С аллельные варианты [64, 89, 91]. Кроме этого, показан полиморфизм микросателлитов в 3’- фланкирующем регионе гена И6, а также несколько 11РЬР для разных ре-стриктаз [16, 23, 76].
Показана ассоциация аллеля -174С с низкой активностью промотора и более низким содержанием 1Ь-6 в плазме [64,91]. В дополнение к этому, аллель А5 из микросателлитного полиморфного З’-фланки-рующего региона гена П6 также ассоциирована с низкопродуктивным фенотипом 1Ь-6 [121].
Восьмая хромосома содержит ген 1Ь7 в участке 8ql2-qlЗ, который не характеризуется полиморфно-стью, в отличие от генов интерферонов, два из которых (7/Л'га и ШУР) по соседству друг от друга локализованы на девятой хромосоме в участке 9р22. Для гена НЫа описан полиморфизм динуклеотидных повторов в некодирующей части, а для НЩ3 - КРЬР для Мхр1 в З’-нетранслируемой части гена [19,47,73, 98].
На 9-12 хромосомах расположено по одному гену рецепторов: на девятой консервативный ген рецептора 1Ь-11; на десятой в регионе 10р14-15 локализован ген а-цепи рецептора 1Ь-2, для которого показан КРЬР Тад1; на 11 -й хромосоме лежит ген а-цепи рецептора 1Ь-10 (1Ц23), в нем не обнаружено полиморфизмов. На двенадцатой хромосоме в участке 12ql3.2 локализован ген первого рецептора ТЫРЯА, в его промоторном регионе описаны в регионе -609 и замена А-383С, а также полиморфные участки обнаружены в участках +36 (экзон 1) и +10 в нитроне 6 [3, 78, 103].
Ген ТГЛ'у локализован на двенадцатой хромосоме в участке 12q24.1 и содержит пять экзонов. Показан полиморфизм по количеству СА-повторов в первом интроне гена /Жу - это пока единственный описанный полиморфизм для этого интерферона, играющего столь важную роль в формировании иммунитета [49,59,96, 101].
^N7, в отличие от 1Ь-4, регулирует в основном Т-клеточные иммунные реакции. Он обладает антивирусной активностью, которая, в основном, опосредуется им через индукцию синтеза в моноцитах интерферонов-а и -Р, усиливает цитотоксичность TNFa и увеличивает клеточную цитотоксичность макрофагов и NK-клeтoк, индуцирует экспрессию антигенов I и II класса главного комплекса гистосовместимости, а также ингибирует 1Ь-4 -индуцирован-
ное переключение изотипов иммуноглобулинов в В-лимфоцитах.
В указанном полиморфизме первого интрона INFy выявлено четыре аллеля, из которых присутствие аллеля 2 (12 СА-повторов) достоверно коррелирует с повышенной продукцией INF-ym vitro [96]. Отмечено, что каждый аллель непосредственно имеет регуляторные функции или же существуют связи между С A-повторами и функциональными полиморфизмами в первом интроне, которые объясняют различия в продукции INFy.
На четырнадцатой хромосоме в районе 14q24 локализован ген третьей изоформы TGFQ3, который, в отличие от первых двух изоформ, высококонсервативен.
Шестнадцатая хромосома содержит в себе ген a-цепи рецептора IL4RA (16р12.1-11.2). В настоящее время известно 7 миссенс-мутаций IL4RA, включая Ile50Val, Gln551 Arg и Ser478Pro [32,54,82,88]. Была установлена патогенетическая значимость некоторых из них в отношении астмы и атопии в выборках европеоидов, афро- и латино-американцев [88]. Найдена достоверная ассоциация между некоторыми аллелями IL4RA, а также их сочетаниями (гаплоти-пами, по терминологии авторов) с астмой и атопией во всех популяциях. Эта взаимосвязь оказалась специфична именно для IL4RA, а не для расположенных рядом генов. Однако заключается, что наблюдаемая ассоциация исследуемых аллелей и гаплоти-пов обусловлена не их собственной функциональной значимостью, а неравновесием по сцеплению с еще неизвестными вариантами в некодирующих частях гена.
На семнадцатой хромосоме расположен консервативный ген b-цепи рецептора IL-6, а также ген G-CSF (17qll.2-12),cпoлимopфизмoм для5£гД [114].
На девятнадцатой хромосоме локализованы гены IL11 (19ql3.1-13.4) и одна из изоформ TGF$1 (19ql3). Для гена ЯЛ 7 характерен полиморфизм СА-динуклеотидных повторов в 5’-некодирующей последовательности [14, 92]. Ген TGFQ1 имеет несколько полиморфных участков в нетранслируемой области и в промоторном регионе (-988, -800, -509), а также описаны замены в 869, 915, 72, 713, 788 нуклеотидах гена, считая от первого AG кодона. Отмечают, что полиморфизм в позиции +915 сигнальной последовательности, который приводит к замене аргинина на пролин в 25 кодоне, ассоциирован с индивидуальным уровнем продукции TGF-P [8, 25, 75]. Присутствие в гене TGFf>1 аминокислот Leu в кодоне 10 и Arg в кодоне 25 первого экзона ассоциируется с повышенной продукцией этого цитокина [58].
Двадцать первая хромосома человека включает в себя консервативный ген второго рецептора IFN-y (IFNyR2), расположенный в локусе 21q22.1.
На 22-й хромосоме локализованы гены Ь-цепей таких цитокинов как 1Ь-2 (1Ь211В, 22д12.2-13.1), полиморфного по СА-повторам [70]; гены 11.-3 (ПЗЯВ) и СМ-СББ (СМ-С5^АВ, 22д11.2-12), в последнем из которых описан ряд БОТ (см. табл. 1).
И, наконец, интересно, что на половых хромосомах также локализованы гены рецепторов цитокинов человека. На X хромосоме расположен ген а-цепи рецептора 1Ь-13 в регионе Хд13.1-28, для которого показан полиморфизм в позиции 1050 АТС стартового кодона (С—»Т). Здесь локализован представляющий особый интерес ген §-цепи (регион
XqlЗ), в котором описано девять точечных мутаций, в том числе транзиция С—>Т в экзоне 5, приводящая к патологической замене триптофана на аргинин в 224 положении [45, 90]. На этой хромосоме расположен и ген а-цепи рецептора СМ-СБР (СМ-СБРЯА, Хр22.32), в котором показан ряд точечных мутаций в некодирующих регионах гена.
На У хромосоме расположены гены рецепторов 1Ь-3 и 1Ь-9. Последний локализован в псевдоауто-сомном регионе Xq28/Yql2, состоит из 11 экзонов и занимает около 17 кб [123]. П9Я экспрессируется с У-хромосомы и избегает Х-инактивации. Найдены псевдогены Н9Я в районах 9я34, 10р15, 16р13.3 и 18р11.3 [69].
Таким образом, в настоящее время высокоспецифичные молекулярно-генетические методы исследований позволяют выявлять и подробно описывать множество аллельных вариантов генов практически всех цитокинов и их рецепторов человека. Аллельный полиморфизм характерен как для кодирующей части, так и для интронных и промоторных участков генов, что часто ведет за собой изменение уровня продуцируемого белка.
Установлено существование значительных индивидуальных различий в продукции цитокинов клетками организма человека. Причем различия между максимальным и минимальным уровнями продукции некоторых цитокинов часто достигают десятикратных величин, и эти показатели остаются постоянными в течение длительного периода времени.
Резюмируя все вышесказанное, можно заключить, что к настоящему времени вырисовывается новый уровень генетического контроля над деятельностью иммунной системы. Этот уровень не связан непосредственно с определением силы иммунного ответа на антигенный стимул с помощью формирования межмолекулярного комплекса из процессиро-ванного антигена, молекул гистосовместимости, Т-клеточного рецептора, костимуляторных и адгезивных молекул, скорее, в данном случае происходит модулирование иммунного ответа человека путем заданного уровня продукции различных цитокинов. Уровень же продукции цитокинов про- и противо-
воспалительной природы и их антагонистов, в том числе интерлейкинов, регулирующих активность отдельных звеньев иммунной системы, уровень экспрессии рецепторов к тому или иному цитокину и тому подобные эффекты, определяются наследуемым человеком набором аллельных вариантов генов цитокинов и генов их рецепторов.
Таким образом, иммунная система находится под контролем двух основных уровней генетической регуляции, один из которых определяет интенсивность иммунного ответа к антигенным детерминантам и связан с набором аллельных вариантов генов гистосовместимости, а другой - задает общий уровень активности различных эффекторных реакций на антигены и связан с набором аллельных вариантов генов цитокинов.
Вероятно, общий набор аллельных вариантов этих двух больших и высоко полиморфных генетических систем и определяет в конечном итоге интенсивность иммунного ответа к эндо- и экзогенным антигенным детерминантам, а также предрасположенность и резистентность индивида к различным заболеваниям. Подтверждением этого являются пока не сведенные в общедоступную информацию хорошо известные данные об ассоциированности болезней человека с аллелями HLA-генов и новые данные об ассоциированности болезней человека с аллельными вариантами генов цитокинов [1].
Благодарности
Работа выполнена при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований (грант 02-04-48145).
Список литературы
1. Смольникова М.В., Коненков В.И. Клиническая иммуногенетика заболеваний человека. // Медицинская Иммунология. - 2001,- №3. - С.379-389.
2. Al-Ansari AS, Oilier WE, Villarreal J, Ordi J, Teh LS, Hajeer AH. Tumor necrosis factor receptor
II (TNFRII) exon 6 polymorphism in systemic lu-puserythematosus. // Tissue Antigens.- 2000. - Vol.
55. - P. 97-99.
3. Allen RA, Lee EM, Roberts DH, Park BK, Pirmo-hamed M. Polymorphisms in the TNF-alpha and TNF-receptor genes in patients with coronary artery disease. // Eur J Clin Invest.- 2001. - Vol.31. - P. 843-851.
4. Allen RD. Polymorphism of the human TNF-alpha promoter-random variation or functional diversity?// Mol Immunol.- 1999. - Vol.36. - P. 1017-1027.
5. Anderson KL, Mathieson PW, Gillespie KM. Polymorphisms not found in the IL-13 gene promoter // Science.- 1999. -V. 284,- P. 1431a.
6. Arai N., Nomura D., Villaret D. Complete nucleotide sequence of the chromosomal gene for human IL-4 and its expression //J Immunol.- 1989,- V. 142,-P.274-282.
7. Arias A.I., Giles B., Eiermann T.H., Sterry W, Pan-dey JP. TNF-a gene polymorphism in psoriasis // Exp Clin Immunogenetic.-1997.- V.14.- P.118-122.
8. Awad MR, El Gamel A, Hasleton P, Turner DM, Sinnott PJ, Hutchinson IV.. Polymorphism in transforming growth factor-beta 1 gene and its correlation to TGF-beta 1 production, allograft fibrosis and fibrot-ic lung diseases.//EurJ Immunogenet.- 1998. - Vol.25.-P.70.
9. Badenhoop K, Schwarz G, Bingley P TrowsdaleJ, Usadel KH, Gale EA, Bottazzo GF. TNF-alpha gene polymorphisms: association with type 1 (insulin-dependent) diabetes mellitus.// T Immunogenet.- 1989,- Vol. 16,- P. 455-460.
10. Bailly S, di Giovine FS, Duff GW. Polymorphic tandem repeat region in interleukin-1 alpha intron 6. // Hum Genet.- 1993.-Vol. 91.-P. 85-86.
11. Bajnok E, Takacs I, Vargha P, Speer G, Nagy Z, Lakatos P. Lack of association between interleukin-1 receptor antagonist protein genepolymorphism and bone mineral density in Hungarian postmenopausal women. // Bone.- 2000.-Vol. 27. - P. 559-562.
12. Barton A, John S, Oilier WE, Silman A, Worthington J. Association between rheumatoid arthritis and polymorphism of tumor necrosisfactor receptor II, but not tumor necrosis factor receptor I, in Caucasians. //Arthritis Rheum.- 2001.- Vol. 44. - P. 61-65.
13. Bayley JP, de Rooij H, van den Elsen PJ, Huizinga TW, Verweij CL. Functional analysis of linker-scan mutants spanning the -376, -308, -244 and -238 polymorphic sites of the TNF-a promoter.// Cytokine.-2001,-Vol. 14,- P. 316-323.
14. Bellingham J, Gregory-Evans K, Gregory-Evans CY. A poly-morphic dinucleotide repeat in the 5’-flank-ing region of the human interleukin 11 (IL11) gene. // Immunogenet.- 1998. - Vol. 47,- P. 499-500.
15. Bittencourt PL, Palacios SA, Cancado EL, Porta G, Drigo S, Carrilho FJ, LaudannaAA, Kalil J, Goldberg AC. Autoimmune hepatitis in Brazilian patients is not linked to tumor necrosis factor alpha polymorphisms at position -308. //J Hepatol.- 2001.- Vol.35.- P. 24-28.
16. Blankenstein T, Volk HD, Techert-Jendrusch C, Qin ZH, Richter G, Diamantstein T. Lack of correlation between Bgl II RFLP in the human IL-6 gene and rheumatoid arthritis. // Nucleic Acids Res.- 1989. -Vol.17.- P. 8902.
17. Bodmer J.G., Marsh S.G.E., Albert E.D. Bodmer WF, Dupont B, Erlich HA, Mach B, Mayr WR, Parham P, Sasazuki T, et al. Nomenclature for factors of the HLA-system, - 1994.// Tissue Antigens.- 1994,- N
44,- P.l-18.
18. Boiardi L, Salvarani C, Timms JM, Silvestri T, Macchioni PL, di Giovine FS. Interleukin-1 cluster and tumor necrosis factor-alpha gene polymorphisms inpolymyalgia rheumatica. //Clin Exp Rheumatol.- 2000,-Vol.18.- P. 675-681.
19. Borish L., Mascali J. J., Klinnert M. Leppert M, Rosenwasser LJ. SSC polymorphisms in interleukin genes // Hum. Mol. Genet. - 1994. - Vol. 3 - P. 1710.
20. Botstein D., White R. L, Skolnick M., Davis R. W. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms // Am. J. Hum. Genet. - 1980. - Vol. 32. - P. 314-331.
21. Boultwood J, Rack K, Kelly S, Madden J, Sak-aguchi AY, Wang LM, Oscier DG, Buckle VJ, Wainscoat JS. Loss of both CSF1R (FMS) alleles in patients with myelodysplasia and achromosome 5 deletion. // Proc Natl Acad Sci U S A.- 1991,- Vol. 15. - P. 6176-6180.
22. Bouma G, Crusius JB, Oudkerk Pool M, Kolk-man JJ, von Blomberg BM, Kostense PJ, Giphart MJ, Schreuder GM, Meuwissen SG, Pena AS. Secretion of tumour necrosis factor alpha and lymphotoxin alpha in relation topolymorphisms in the TNF genes and HLA-DR alleles. Relevance for inflammatorybowel disease. // Scand J Immunol. -1996. -Vol. 43. - P. 456-463.
23. Bowcock AM, Ray A, Erlich H, Sehgal PB. Rapid detection and sequencing of alleles in the 39 flanking region of the interleukin-6 gene. // Nucleic Acids Res.-1989. - Vol. 17,- P. 6855-6864.
24. Brinkman BM, Huizinga TW, Kurban SS van der Velde EA, Schreuder GM, Hazes JM, Breedveld FC, Verweij CL. Tumour necrosis factor alpha gene polymorphisms in rheumatoid arthritis: association with susceptibility to, or severity of, disease? // Br J Rheumatol.- 1997. - Vol. 36.-P. 516-521.
25. Cambien F, Ricard S, Troesch A, Mallet C, Ge-nerenaz L, Evans A, Arveiler D, Luc G, Ruidavets JB, Poirier O. Polymorphisms of the transforming growth factor-beta 1 gene in relation to myocardial infarction and blood pressure. The Etude Cas-Temoin de Plnfarctus du Myocarde (ECTIM) Study.// Hypertension.- 1996. - Vol. 28,- P. 881-887.
26. Campbell H. D„ Tucker W. Q. J., Hort Y. Martinson ME, Mayo G, Clutterbuck EJ, Sanderson CJ, Young IG. Molecular cloning, nucleotide sequence, and expression of the gene encoding human eosinophil differentiation factor (interleukin 5) // Proc. Natl. Acad. Sci. - 1987. - Vol. 84. - P. 6629-6633.
27. Campbell RD, TrowsdaleJ, Raqoussis J. Map of the human major histocompatibility complex. // Immunol Today.- 1993. - Vol. 14,- P.349-352.
28. Cantagrel A., Navaux F„ Loubet-Lessonlie P., Nourhashemi F, Enault G, Abbal M, Constantin A, Laroche M, Mazieres B. IL-lbeta, IL-1 receptor antagonist, IL-4, and IL-10 gene polymorphisms. // Arthr Rheum. - 1999.-Vol.42,- P. 1093-1100.
29. Chia D, Terasaki P, Chan H, Acalinovich A, Maruya E, Saji H, Ware K.. A new simplified method of gene typing. //Tissue Antigens.- 1994. - Vol.44. -P.300-305.
30. Clay FE, Tarlow JK, Cork MJ, Cox A, Nicklin MJ, Duff GW. Novel interleukin-1 receptor antagonist exon polymorphisms and their use in allele-specific mRNA assessment. // Hum Genet.- 1996. - Vol.97. -P.723-726.
31. D’Alfonso S., Rampi M., Rolando V., Giordano M, Momigliano-Richiardi P. New polymorphism in the IL-10 promoter region. // Genes Immun.-2000. - Vol.l.
- P. 231-233.
32. Deichmann K, Bardutzky J, Forster J, Heinzmann
A, Kuehr J. Common polymorphisms in the coding part of the IL4-receptor gene. // Biochem Biophys Res Com-mun.- 1997. - Vol. 231. - P. 696-697.
33. Deng GR. A sensitive non-radioactive PCR-RFLP analysis for detecting point mutations at 12th codon of oncogene c-Ha-ras in DNAs of gastric cancer. //Nucleic Acids Res.- 1988. - Vol.16. - P.6231.
34. Doull I. J., Lawrence S., Watson M. Begishvili T, Beasley RW, Lampe F, Holgate T, Morton NE. Allelic association of gene markers on chromosomes 5q and 1 lq with atopy and bronchial hyperresponsiveness // Am. J. Respir. Crit. Care Med. - 1996. - Vol. 153. - P. 1280-1284.
35. Dyer PA, Jawaheer D, Oilier B, Poulton K, Sin-nott P, Thomson W. HLA allele detection using molecular techniques. // Dis Markers.- 1993. - Vol. 11.-P.145-60.
36. Epplen C, Frank G, Gomolka M, Albert E, Nurn-berg P, Epplen JT. Dinucleotide repeat polymorphism in the human ILIA gene. // Hum Mol Genet.- 1994. -Vol. 3.-P. 1710.
37. Eskdale J, Gallagher G. A polymorphic dinucleotide repeat in the human IL-10 promoter. // Immuno-genetics.- 1995.-V. 42.-P. 444-445.
38. Eskdale J, Kube D, Gallagher G. A second polymorphic dinucleotide repeat in the 59 flanking region of the human IL 10 gene. //Immunogenetics 1996; 45: 82-83.
39. Eskdale J., Kube D., Tesch H., Gallagher G. Mapping of the human IL10 gene and characterization of the 5’ flanking sequence.// Immunogenetics.-1997,-V.46.-P. 120-128.
40. Eskdale J., McNicholl J., Wordsworth P., Jonas
B, Huizinga T, Field M, Gallagher G. IL-10 microsatellite polymorphisms and IL-10 locus alleles in RA susceptibility. // Lancet.-1998. - Vol.352. - P.12-82.
41. Feigner J, Kreipe H, Jaquet K, Heidorn K, Zs-chunke F, Heuss R, Radzun HJ,Parwaresch MR. A frequent EcoRI RFLP demonstrated within the human M-CSF receptor gene (CSFIR). // Nucleic Acids Res.-
1991,- Vol.19.- P. 5096.
42. Ferencik S, Lindemann M, Horsthemke B, Grosse-Wilde H. A new restriction fragment length polymorphism of the human TNF-B gene detected by AspHI digest.// Eur J Immunogenet.- 1992,-Vol. 19. -P. 425-430.
43. Fey MF, Tobler A. An interleukin-8 (IL-8) cDNA clone identifies a frequent Hindlll polymorphism. // Hum Genet.- 1993. - Vol. 91. - P. 298.
44. Freeburn RW, Gale RE, Wagner HM, Linch DC. The beta sub-unit common to the GM-CSF, IL-3 and IL-5 receptors is highly polymorphic but pathogenic point mutations in patients with acute myeloid leukaemia (AML) are rare.// Leukemia.- 1996.-Vol.10. -P. 123-129.
45. Fugmann SD, Muller S, Friedrich W, Bartram CR, Schwarz K.Mutations in the gene for the common gamma chain (gammac) in X-linked severe combined immunodeficiency.// Hum Genet.- 1998. - Vol.103. -P.730-731.
46. Garritsen HS, Szuflad P, Sibrowski W, Dzik WH. A sequence-specific polymerase chain reaction assay for mitochondrial DNA polymorphisms in human platelets and white cells.//Transfusion.- 1997.-Vol.37. - P.1012-1019.
47. Golovleva I, Kandefer-Szerszen M, Beckman L, Lundgren E. Polymorphism in the interferon-alpha gene family. // Am J Hum Genet.- 1996. - Vol. 59,- P. 570-578.
48. Grabczynska SA, Carey BS, McGregor JM, Hawk JL, Vaughan RW. Tumour necrosis factor alpha promoter polymorphism at position -308 is not associated with actinic prurigo. // Clin Exp Dermatol.- 2001.-Vol.26. - P.700-704.
49. Gray PW, Goeddel DV. Human immune interferon (IFN-gamma) gene sequence and structure. // Basic Life Sciences.- 1983. - Vol. 25. - P. 35-61.
50. Guasch JF, Bertina RM, Reitsma PH. Five novel intragenic dimorphisms in the human interleukin-1 genes combine to high informativity. // Cytokine.-1996. -Vol. 8.-P. 598-602.
51. Hajeer AH, Hutchinson IV. Influence of TNFal-pha gene polymorphisms on TNF-alpha production and disease. // Hum Immunol.- 2001.-Vol.62. -P.1191-1199.
52. Hauptschein R, Dalla-Favera R, Gaidano G.TaqI RFLP in the interferon gamma receptor 1 gene (IFN-GR1) on human chromosome 6q. //Nucleic Acids Res.-
1992.-Vol.20. - P.1158.
53. Hayward NK, Nancarrow DJ, Bell GI. A Taq I polymorphism for the human transforming growth factor alpha gene (TGFA). // Nucleic Acids Res.- 1987. -Vol. 15,- P. 5503.
54. Hershey G. K., Friedrich M. F., Esswein L. Thomas ML, Chatila TA. The association of atopy with a gain-of-function mutation in the a subunit of the interleukin-4
receptor // New Eng. J. Med. - 1997. - Vol. 337. - P. 1720-1725.
55. Higuchi T, Seki N, Kamizono S Y amada A, Kimu-ra A, Kato H, Itoh K. Polymorphism of the 5’-flanking region of the human tumor necrosis factor (TNF)-al-pha gene in Japanese.// Tissue Antigens.- 1998. - Vol.
51.- P. 605-612.
56. Huang D., Cancilla M.R., Morahan G. Complete primary structure, chromosomal localisation, and definition of polymorphisms of the gene encoding the human interleukin-12 p40 subunit.// Genes Immun.-2000.-Vol.l.- P. 515-520.
57. Hunt PJ, Marshall SE, Weetman AP, Bunce M, Bell JI, Wass JA, Welsh KI. Histocompatibility leucocyte antigens and closely linked immunomodulatory genes in autoimmune thyroid disease. // Clin Endocrinol (0x0-- 2001,- Vol.55.- P.491-499.
58. Hutchinson I.V., Pravica V., Hajeer A., Sinnott P.J. Identification of high and low responders to allografts. // Rev Immunogenetics. -1999.- Vol.l.- P.323-333.
59. Hutchinson I.V., Pravica V., Perrey C., Sinnott P. Cytokine gene polymorphisms and relevance to forms of rejection.//Transplant Proc.- 1999.-Vol.31,- P. 734-736.
60. Jaquet K, Kreipe H, Feigner J, Radzun HJ, Par-waresch MR. A Bglll RFLP demonstrated for the IL-3 gene in normal human blood cells and leukemias. // Nucleic Acids Res.- 1989,- Vol. 17,- P. 3620.
61. Jeong MC, Navani A, Oksenberg JR. Limited allelic polymorphism in the human interleukin-3 gene. // Molec Cell Probes.- 1998.- Vol.12.- P. 49-53.
62. John S, Myerscough A, Marlow A Hajeer A, Sil-man A, Oilier W, Worthington J. Linkage of cytokine genes to RA. Evidence of the heterogeneity.// Annals of Rheumatic Disease.- 1998.- Vol. 57,- P. 361.
63. John S., Turner D., Donn R., Sinnott P, Worthington J, Oilier WE, Hutchinson IV, Hajeer AH. Two novel biallelic polymorphisms in the IL-2 gene.// Eur J Immunigenetics. -1998.- Vol.25.- P. 419-420.
64. Jordanides N., Eskdale J., Stuart R„ Gallagher
G. Allele associations reveal four prominent haplotypes at the human interleukin-6 (IL-6) locus.// Gen Immun.-
2000,-Vol.l.- P.451-455.
65. Jouvenne P., Chaudhary A., Buchs N., Giovine FS, Duff GW, Miossec P. Possible genetic association between IL-la gene polymorphism and the severity of chronic polyarthritis.// Eur Cytokine Netw.-1999.-Vol.10.-P. 33-36.
66. Kaijzel EL, Brinkman BM, van Krugten MV, Smith L, Huizinga TW, Verjans GM, Breedveld FC, Verweij CL. Polymorphism within the tumor necrosis factor alpha (TNF) promoter region in patients with ankylosing spondylitis. // Hum Immunol.- 1999.-Vol.60. - P. 140-144.
67. Kanemitsu S., Takabayashi A., Sasaki Y., Kuro-maru R, Ihara K, Kaku Y, Sakai K, Hara T. Association of IL-4 receptor and IL-4 promoter gene polymorphisms with SLE. // Arthritis and Rheumatism. -1999.- Vol.42.-P.1298-1300.
68. Kawashima T., Noguchi E., Arinami T„ Yamaka-wa-Kobayashi K, Nakagawa H, Otsuka F, Hamaguchi H. Linkage and association of an IL-4 gene polymorphism with atopic dermatitis in Japanese families.//J Med Genet.- 1998,- Vol.35.- P. 502-504.
69. Kermouni A., Van Roost E., Arden K. C. Ver-meesch JR, Weiss S, Godelaine D, Flint J, Lurquin C, Szikora JP, Higgs DR, et al. The IL-9 receptor gene (IL9R): genomic structure, chromosomal localization in the pseudoautosomal region of the long arm of the sex chromosomes, and identification of IL9R pseudogenes at 9qter, lOpter, 16pter, and 18pter // Genomics - 1995.
- Vol. 29. - P. 371-382.
70. Khani-Hanjani A, Hoar D, Horsman D, Lacaille D, Chalmers A, Keown P. Identification of four novel dinucleotide repeat polymorphisms in the IL-2 andlL-2beta receptor genes.// Hum Immunol.- 2001.- Vol.62.
- P. 368-370.
71. Kollintza A, Worthington J, John S, Oilier WE, Hajeer AH. A new polymorphism in the promoter of the interleukin 5 receptor alpha subunit (IL-5RA) gene.// Immunogenetics.- 1998.- Vol. 48,- P. 65-66.
72. Kornman KS, di Giovine FS. Genetic variations in cytokine expression: a risk factor for severity of adult periodontitis. // Ann Periodontol.- 1998.- Vol. 3,- P. 327-338.
73. Kwiatkowski DJ, Diaz MO. Dinucleotide repeat polymorphism at the IFNA locus (9p22). // Hum Mol Genet.- 1992,- Vol.l.- P. 658.
74. Laitinen T., Kauppi P., Ignatius J. Ruotsalainen T, Daly MJ, Kaariainen H, Kruglyak L, Laitinen H, de la Chapelle A, Lander ES, Laitinen LA, Kere J. Genetic control of serum IgE levels and asthma: linkage and linkage disequlibrium studies in an isolated population // Hum. Mol. Genet. - 1997. - Vol. 6. - P. 2069-2076.
75. Langdahl BL, KnudsenJY, Jensen HK, Gregers-en N, Eriksen EF. A sequence variation: 713-8delC in the transforming growth factor-beta 1 gene has higher prevalence in osteoporotic women than in normal women and is associated with very low bone mass in osteoporotic women and increased bone turnover in both osteoporotic and normal women. // Bone.-1997.- Vol.
20,- P. 289-294.
76. Linker- Israeli M., Wallace D.J., Prehn J., Michael D, Honda M, Taylor KD, Paul-Labrador M, Fischel-Ghodsian N, Fraser PA, Klinenberg JR. Association of IL-6 gene alleles with SLE and with elevated IL-6 expression.// Gen Immun.- 1999.- Vol.l.- P. 45-52.
77. Maeda M, Murayama N, Ishii H, Uryu N, Ota M, Tsuji K, Inoko H. A simple and rapid method for
HLA-DQA1 genotyping by digestion of PCR-amplified DNA with allele specific restriction endonucleares.// Tissue Antigens.- 1989,- Vol.34.- P.290-298.
78. Mascheretti S, HampeJ, KuhbacherT, Herfarth
H, Krawczak M, Folsch UR,Schreiber S. Pharmacoge-netic investigation of the TNF/TNF-receptor system in patients with chronic active Crohn’s disease treated with infliximab.// Pharmacogenomics J.- 2002. Vol.2. -P.127-136.
79. McDowell T.L., Symons J.A., Ploski R., Forre O., Duff G.W. A genetic association between juvenile rheumatoid arthritis and novel IL-1 alpha polymorphism. / /Arthritisand Rheumatism.-1995.- Vol.38(2).- P. 221-228.
80. Messer G, Spangler U, Jung MC. Polymorphic structure of the tumor necrosis factor (TNF) locus: an Ncol polymorphism in the first intron of the human TNF-beta gene correlates with a variant amino acid in position 26 and a reduced level of TNF-beta production. //J Exp Med.- 1991.-Vol. 173,- P. 209-219.
81. Middleton D, Williams F, Cullen C, Mallon E. Modification of an HLA-B PCR-SSOP typing system leading to improved allele determination. // Tissue Antigens.- 1995,- Vol.45.- P.232-236.
82. Mitsuyasu H., Izuhara K., Mao X.-Q. Gao PS, Arino-bu Y, Enomoto T, Kawai M, Sasaki S, Dake Y, Hamasaki N, Shirakawa T, Hopkin JM. Ile50Val variants or I14Ra upreg-ulates IgE synthesis and associates with atopic asthma // Nature Genet. - 1998. - Vol. 19. - P. 119-120.
83. Mok C.C., Lanchbury J.S., Chan D.W., Lau C.S. IL-10 promoter polymorphism in Southern Chinese patients with SLE. // Arthrit Rheumatism. -1998.-Vol.41.- P.1090-1095.
84. Mout R, Willemze R, Landegent JE. Repeat polymorphisms in the interleukin-4 gene (IL4). // Nucleic Acids Res.- 1991.- Vol. 19,- P. 3763.
85. Nakamura Y, Leppert M, O’Connell P, Wolff R, Holm T, Culver M, Martin C, Fujimoto E, Hoff M, Kumlin E, et al. Variable number of tandem repeat (VNTR) markers for human gene mapping. // Science.-1987.-Vol.235(4796).- P.1616-1622.
86. Nedospasov SA, Udalova IA, Kuprash DV, Turetskaya RL. DNA sequence polymorphism at the human tumor necrosis factor (TNF) locus. Numerous TNF/lymphotoxin alleles tagged by two closely linked microsatellites in the upstream region of the lympho-toxin (TNF-beta) gene. //J Immunol.-1991,- Vol.147.-P.1053-1059.
87. Nishimura DY, Purchio AF, Murray JC. Linkage localization of TGFB2 and the human homeobox gene HLX1 to chromosome lq. // Genomics.- 1993,-Vol. 15,- P. 357-364.
88. OberC., Leavitt S. A., Tsalenko A. Howard TD, Hoki DM, Daniel R, Newman DL, Wu X, Parry R, Lester LA, Solway J, Blumenthal M, King RA, Xu J, Meyers DA,
Bleecker ER, Cox NJ. Variation in the interleukin 4-receptor a gene confers susceptibility to asthma and atopy in ethnically diverse population // Am. J. Hum. Genet. - 2000. -Vol. 66.-P. 517-526.
89. Olomolaiye OO, Wood NAP, Bidwell JL. Identification of a novel polymorphism in the human IL-6 promoter region. // Immunology.- 1997,- Vol. 92 (Sup-pl 1).- P. 66.
90.0’Marcaigh AS, Puck JM, Pepper AE, De Santes K, Cowan MJ.Maternal mosaicism for a novel interleu-kin-2 receptor gamma-chain mutation causing X-linked severe combined immunodeficiency in a Navajo kindred. //J Clin Immunol.- 1997,- Vol. 17. - P. 29-33.
91. Osiri M., McNicholl J., Moreland L.W., Bridges
S.L. Jr. A novel single nucleotide polymorphism and five probable haplotypes in the 5’- flanking region of the IL-6 gene in African-Americans.// Gen Immun.-1999.-Vol.l.- P.166-167.
92. OtaN.,NakajimaT., Takeuchi T., Shirai Y, Emi M. A highly polymorphic CA repeat marker at the in-terleukin-11 locus.// Gen Immun.-1999.- Vol.l.-P.159-160.
93. Pantelidis P, Jones MG, Welsh KI, Taylor AN, du Bois RM. Identification of four novel interleukin-13 gene polymorphisms.// Gen Immun.-2000.- Vol.l.- P. 341-345.
94. Pantelidis P, Lympany PA, Foley PJ, Fanning GC, Welsh KI, du Bois. Polymorphic analysis of the high-affinity tumor necrosis factor receptor 2. // Tissue Antigens.- 1999,- Vol.54. - P. 585-591.
95. Pociot F., Wilson A.G., Nerup J., Duff G.W. No independent association between a TNF-a promoter region polymorphism and insulin-dependent diabetes mel-litus. // Eur J Immunol .-1993. -Vol.23.- P. 3043-3049.
96. Pravica V., Asderakis A., Perrey C., Hajeer A, Sinnott PJ, Hutchinson IV. In vitro production of IFN-Y correlates with CA repeat polymorphism in the human IFN-y gene. // Eur J Immunogenetics. -1999.-Vol.26.- P.l-3.
97. Rabbi M.F., Finnegan A., Al-Harthi L., Song S, Roebuck KA. IL-10 enhances TNF-alpha activation of HIV-1 transcription in latently infected T cells.//J Acquir Immune Defic Syndr Hum Retrovirol.-1998.-Vol.19.- P.321-331.
98. Riggin CH, Jr., Pitha PM. Methylation and a polymorphic restriction site adjacent to human beta-interferon gene. // DNA.-1982.- Vol.l.- P. 267-271.
99. Rioux J. D„ Stone V. A., Daly M. Cargill M, Green T, Nguyen H, Nutman T, Zimmerman PA, Tucker MA, Hudson T, Goldstein AM, Lander E, Lin AY. Familial eosinophilia maps to the cytokine gene cluster on human chromosomal region 5q31 -q33 // Am. J. Hum. Genet. - 1998. - Vol. 63. - P. 1086-1094.
100. Rosenwasser L.J., Klemm D.J., Dresback J.K. Inamura H, Mascali JJ, KlinnertM, BorishL. Promoter
polymorphisms in the chromosome 5 gene cluster in asthma and atopy // Clin. Exp. Allergy. - 1995. - Vol. 25 Suppl. - P. 74-78.
101. Ruiz-Linares A. Dinucleotide repeat polymorphism in the interferon-gamma (IFNG) gene. // Hum Mol Genet.- 1993,- Vol. 2,- P. 1508.
102. Sachidanandam R, Weissman D, Schmidt SC, Kakol JM, Stein LD, Marth G, Sherry S, Mullikin JC, Mortimore BJ, Willey DL, Hunt SE, Cole CG, Coggill PC, Rice CM, Ning Z, Rogers J, Bentley DR, Kwok PY, Mardis ER, Yeh RT, Schultz B, Cook L, Davenport R, Dante M, Fulton L, Hillier L, Waterston RH, McPherson JD, Gilman B, Schaffner S, Van Etten WJ, Reich D, Higgins J, Daly MJ, Blumenstiel B, Baldwin J, Stange-Thomann N, Zody MC, Linton L, Lander ES, Altshuler D; The International SNP Map Working Group. A map of human genome sequence variation containing 1.42 million single nucleotide polymorphisms. // Nature.-
2001,- Vol.409(6822).- P.928-933.
103. Sashio H, Tamura K, Ito R, Yamamoto Y, Bam-ba H, Kosaka T, Fukui S, Sawada K, Fukuda Y, Tamura K, Satomi M, Shimoyama T, Furuyama J.Polymorphisms of the TNF gene and the TNF receptor superfamily member IB gene are associated with susceptibility to ulcerative colitis and Crohn’s disease, respectively.// Immunogenetics.- 2002,- Vol.53.-P.1020-1027.
104. Seki N, Kamizono S, Yamada A, Higuchi T, Matsumoto H, Niiya F, Kimura A,Tsuchiya K, Suzuki R, Date Y, TomitaT, Itoh K, Ochi T. Polymorphisms in the 5'-flanking region of tumor necrosis factor-alpha gene in patients with rheumatoid arthritis. // Tissue Antigens.- 1999.- Vol.54,- P.194-197.
105. Shin HD, Winkler C, Stephens JC, Bream J, Young H, Goedert JJ, O’Brien TR, Vlahov D, Buch-binder S, Giorgi J, Rinaldo C, Donfield S, Willoughby A, O’Brien SJ, Smith MW. Genetic restriction of HIV-1 pathogenesis to AIDS by promoter alleles of IL10. // PNAS.-2000.-Vol.97,- P. 14467-14472.
106. Shyamala V, Ames GF. Genome walking by sin-gle-specific-primer polymerase chain reaction: SSP-PCR. // Gene.- 1989,- Vol.84.- P.l-8.
107. Singal DP, Li J, Zhu Y. HLA class III region and susceptibility to rheumatoid arthritis. // Clin Exp Rheumatol.- 2000,- Vol.18.- P.485-491.
108. Sitara D, Olomolaiye O, Wood N, Keen L, Morse H, Elson C, Westacott C, BidwellJ. Identification of novel single nucleotide polymorphisms in intron IB and exon 1 Cof the human interleukin-1 receptor type I (IL-1RI) gene. // Genes Immun.- 1999,- Vol.l.- P.161-163.
109. SNP attack on complex traits. Editorial // Nature Genet. - 1998. - Vol. 20. - P. 217-218.
110. Song Z., Casolaro V., Chen R. Georas SN, Monos D, Ono SJ. Polymorphic nucleotides within the human IL-4 promoter that mediate overexpres-
sion of the gene //J. Immunol. - 1996. - Vol. 156. -P.424-429.
111. Strayer D, Heintz N, Roeder R, Gillespie D.Three organizations of human DNA // Proc Natl Acad Sci U S A.- 1983,- Vol.80.- P.4770-4774.
112. Suzuki I., Yamaguchi E„ Hizawa N., Itoh A, Kawakami Y. A new polymorphism in the 5’-flanking region of the human IL-4 gene. // Immunogenetics.-
1999,- Vol.49.- P. 738-739.
113. Tanabe T., Konishi M., Mizuta T„ Noma T, Honjo T. Molecular cloning and structure of the human interleukin-5 gene //J. Biol. Chem. - 1987. - Vol. 262.
- P. 16580-16584.
114. Tani K, Asano S, Ozawa K, Takaku F. A StuI polymorphism in the human granulocyte colony-stimulating factor gene. //Nucleic Acids Res.-1989.- Vol. 17.
- P.7544.
115. Thompson G., Esposito M. S. The genetics of complex diseases // Trends Cell Biol., Trends Bio-chem Sci., Trends Genet. - 1999. - Millennium Issue
- M17-20.
116. Todd S, Naylor SL. Dinucleotide repeat polymorphism in the human interleukin 1, alpha gene (ILIA).// Nucleic Acids Res.- 1991,- Vol. 19.- P. 3756.
117. Tsuchiya N, Komata T, Matsushita M, Ohashi J, Tokunaga K. New single nucleotide polymorphisms in the coding region of human TNFR2:association with systemic lupus erythematosus. // Genes Immun.- 2000,-Vol.l. - P.501-503.
118. Tsukamoto K, Ohta N, Shirai Y, Emi M. A highly polymorphic CA repeat marker at the human interleukin 6 receptor (IL6R)locus. //J Hum Genet.-1998,-Vol.43. - P. 289-290.
119. Turner D.M., Williams D.M., Sankaran D., Lazarus M, Sinnott PJ, Hutchinson IV. An investigation of polymorphism in the IL-10 gene promoter.// Eur J Im-munogenet.- 1997,- Vol. 24,- P. 1-8.
120. Uglialoro AM, Turbay D, Pesavento PA, Delgado JC, McKenzie FE, Gribben JG, Hartl D, Yunis EJ, Goldfeld AE. Identification of three new single nucleotide polymorphisms in the human tumor necrosis fac-tor-alphagene promoter. //Tissue Antigens.-1998,- Vol.
52,- P. 359-367.
121. Vandenbroeck K., Fiten P., Ronsse I., Goris A, Porru I, Melis C, Rolesu M, Billiau A, Marrosu MG, Opdenakker G. High-resolution analysis of IL-6 minisatellite polymorphism in Sardinian multiple sclerosis: effect on course and onset of disease.// Gen Immun.-
2000,- Vol.l.- P. 460-463.
122. Van der Pouw Kraan TC, van Veen A, Boeije LC, van Tuyl SA, de Groot ER, Stapel SO, Bakker A, Verweij CL, Aarden LA, van der Zee JS. An IL-13 promoter polymorphism associated with increased risk of allergic asthma.// Gen Immun.-1999.- Vol.l.- P. 61-65.
123. Vermeesch J.R., Petit P., Kermouni A. Renauld JC, Van Den Berghe H, Marynen P. The IL-9 receptor gene, located in the Xq/Yq pseudoautosomal region, has an autosomal origin, escapes X inactivation and is expressed from the Y // Hum. Mol. Genet. - 1997. - Vol. 6. - P. 1-8.
124. Wengler GS, Giliano S, Fiorini M. Mutation analysis by a non-radioactive single-strand conformation polymorphism assay in nine families with X-linked severe combined immuno-deficiency (SCIDX1).// Br J Haematol.- 1998,- Vol. 101.- P. 586-591.
125. Wilson AG, de Vries N, Pociot F, di Giovine FS, van der Putte LB, Duff GW. An allelic polymorphism within the human tumor necrosis factor alpha promoter region is strongly associated with HLA Al, B8, and DR3 alleles. //J Exp Med.- 1993,- Vol. 177,- P. 557-560.
126. Wilson A.G., Symons J.A., McDowell T.L., McDevitt HO, Duff GW. Effect of a Polymorphism in
the Tumor Necrosis Factor-Alpha promoter on transcriptional activation. // PNAS.-1997.- Vol. 94,- P. 3195-3199.
127. Yen JH, Chen CJ, Tsai WC, Lin CH, Ou TT, Lin SC, Dai ZK, Liu HW. Tumor necrosis factor microsatellite alleles in patients with rheumatoid arthritis in Taiwan.// Immunol Lett.- 2002,- Vol.81. - P. 177-182.
128. Yokota Т., Otsuka Т., Mosmann T„ Banchere-au J, DeFrance T, Blanchard D, De Vries JE, Lee F, Arai K. Isolation and characterization of a human interleukin cDNA clone, homologous to mouse В-cell stimulatory factor 1, that expresses В-cell- and T-cell-stimu-lating activities // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1986 -Vol. 83 - P. 5894-5898.
129. Zlotnik A, Moore KW. Interleukin 10. // Cytokine.- 1991.- Vol.3.-P.366-371.
поступила в редакцию 07.10.2002 принята к печати 09.12.2002
