CC BY
4Актуальность
Добыча угля остается крупной отраслью, в которой работают миллионы людей по всему миру. У подвергшихся воздействию пыли угольных шахт рабочих могут развиться различные легочные заболевания, в том числе такие, как злокачественные новообразования легких (Taeger, 2015). Варианты генов, осуществляющих контроль биотрансформации ксенобиотиков, репарации ДНК, контроля клеточного цикла и апоптоза, системы антиоксидантной защиты, трансмембранного рецептора семейства рецепторных тирозинкиназ ЕгЬВС нередко ассоциируют не только с формированием рака легкого (РЛ) , но и с эффектом воздействия производственной среды на организм человека (Ada, 2013; Liu, 2017).
Цель
Анализ вариантов генов репарации ДНК (APEX1 rs1130409, hOGGl rs1052133, NBS1 rs1805794, XPD rs13181) , системы антиоксидантной защиты (MnSOD rs4880, GPxl rs1050450, CAT rs1001179), контроля клеточного цикл и апоптоза (TP53 rs1042522), ферментов биотрансформации ксенобиотиков (CYP1A2 rs762551, GSTP1 rs1695, EPHX1 rs1051740), трансмембранного рецептора семейства рецепторных тирозинкиназ ЕгЬВ (EGFR rs2227984) в связи с риском формирования рака легкого у рабочих угольных шахт Кузбасса.
Материалы и методы
Обследованы 214 больных РЛ рабочих угольных шахт Кузбасса и 300 здоровых рабочих угольных шахт Кузбасса, которые составили группу сравнения. Испытуемые были подобраны с учетом пола, возраста и статуса курения, и у каждого было взято согласие на исследование. Варианты генов hOGGl (rs1052133), APEX1 (rs1130409), XPD (rs13181), NBS1 (rs1805794), CAT (rs1001179), EPHX1 (rs1051740), EGFR (rs2227984) изучали методом аллель-специфической ПЦР (НПФ «Литех», Москва), а варианты генов CYP1A2(rs762551), TP53(rs1042522), GSTP1 (rs1695), MnSOD(rs4880), GPx1(rs1050450) — Real-time PCR (ООО «СибДНК», Нoвосибирск). Статистическая обработка материала проводилась с помощью SNPstats (http://bioinfo.iconcolo-gia.net/SNPstats), «Statistica 10.0» (StatSoft, Inc., USA).
Результаты
Выявлены ассоциации риска развития РЛ c генотипом АА гена EGFR (OR= 1,85; 95% CI=1,28-2,68; p=0,001 для сверхдоминантной модели), с генотипом ТС+СС гена EPHX1 (OR=0,45; 95% CI=0,32-0,64; p=0,0001 для доминантной модели), с генотипом GG гена XPD (OR=2,60; 95% CI=1,57-4,31; p=0,0004 для кодоминантной модели), с генотипом GG гена APEX1 (OR=1,64; 95% CI=1,07-2,52; p=0,02 для рецессивной модели). В обследованных группах частоты генотипов и аллелей исследованных генов соответствовали равновесию Харди-Вайнберга.
Выводы
Полученные данные указывают на возможную роль вариантов генов EPHX1 rs 1051740, EGFR rs2227984, APEX1 rs1130409, XPD rs13181 в формировании риска РЛ у шахтеров Кузбасса.
Исследование выполнено при поддержке гранта в форме субсидий на создание научных лабораторий под руководством молодых ученых (постановление Правительства от 19.09.22 № 632).
Список литературы
1. Taeger, D . Lung cancer among coal miners, ore miners and quarrymen: smoking-adjusted risk estimates from the synergy pooled analysis of case-control studies I D .Taeger, B . Pesch, B . Kendzia, et al . II Scand J Work Environ Health . 2015;41(5):467-477. D0l:10 . 5271Isjweh . 3513 .
2 Ada, A O Cytogenetic damage in Turkish coke oven workers exposed to polycyclic aromatic hydrocarbons: Association with CYP1A1, CYP1B1, EPHX1, GSTM1, GSTT1, and GSTP1 gene polymorphisms I Ada, A. O . C . Demiroglu, M . Yilmazer, et al . II Arh Hig Rada Toksikol . 2013;64(3):359-369. D0l:10. 2478I10004-1254-64-2013-2328 .
3 Liu, C Genetic polymorphisms and lung cancer risk: Evidence from metaanalyses and genome-wide association studies I C . Liu, H . Cui, D . Gu et al . II Lung Cancer. 2017 . V. 113 . P. 18-29 .
Спектр генетических перестроек в расширенной выборке воспалительных миофибробластических опухолей у детей
Авторы:
(1) Венина Айгуль Рифовна, [email protected], ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
(2) Преображенская Елена Васильевна, [email protected], ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
(3) Сулейманова Амина Магометовна, [email protected], ФГБУ «НМИЦ онкологии им.
H.Н. Блохина» Минздрава России, Москва
(4) Бизин Илья Валерьевич, [email protected], ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
(5) Загребин Федор Альбертович, [email protected], ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
(6) Саитова Евгения Станиславовна, [email protected], ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
(7) Мулкиджан Римма Сергеевна, [email protected], ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
(8) Имянитов Евгений Наумович, [email protected], ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
Ключевые слова
Воспалительные миофибробластические опухоли, транслокации, несбалансированная экспрессия
Актуальность
Воспалительные миофибробластические опухоли (ВМО) — исключительно редкая категория новообразований у детей, однако часто они содержат генные перестройки с участием рецепторных тирозинкиназ, являющихся мишенями для таргетной терапии.
Цель
Описать спектр генетических перестроек при ВМО у детей, определить клинико-генетические тенденции.
Материалы и методы
82 последовательных случая ВМО были проанализированы на наличие транслокаций тирозинкиназ с помощью каскада последовательных молекулярных тестов: ПЦР-теста на несбалансированную экспрессию 5'/3'-концов генов ALK, ROS1, RET, NTRK1, NTRK2 и NTRK3, вариант-специфичной ПЦР для 47 описанных транслокаций ALK, ROS1 и NTRK3 и таргетного секвенирования нового поколения (NGS).
Результаты
Тест на несбалансированную экспрессию 5'/3'-концов генов ALK, ROS1, RET, NTRK1, NTRK2 и NTRK3 предсказал присутствие транслокации в 62 опухолях. Идентифицировать перестройки с помощью вариант-специфичной ПЦР удалось в 54/62 (87%) случаях. Транслокации в оставшихся 8 опухолях, с несбалансированной экспрессией 5'/3'-концов гена ALK, были верифицированы методом NGS. В 8/20 случаях, негативных по тесту на несбалансированную экспрессию, методом ПЦР была обнаружена перестройка TFG::ROS1. 12 оставшихся ВМО были подвергнуты NGS-тестированию, которое выявило 1 случай с перестройкой SRF::PDGFRb. Таким образом, в 71/82 (87%) проанализированных ВМО, выявлены перестройки с участием рецепторных тирозинкиназ (ALK: n=47; ROS1: n=20; NTRK3: n=3; PDGFRb: n=1). 10 из 11 опухолей, встречающихся у детей в возрасте до 1 года, были ALK-позитивными, в то время как спектр перестроек генов был более равномерным, а частота транслокаций ALK была ниже в более старших возрастных группах (перестройки ALK: <1 год: 10/11 (91%); >1 год: 37/71 (52%); р=0,039). Характер перестроек варьировался в зависимости от анатомического расположения опухолей. Слияния ALK с участием генов RANBP2 и CLTC чаще встречались при ВМО брюшной полости, чем при опухолях других органов (р=0,037 и р=0,008 соответственно). Перестройки TFG::ROS1 были более характерны для новообразований легких, чем для других опухолей [14/35 (40%) vs 6/47 (13%), р=0,007]. Перестройки NTRK3 и PDGFRb были обнаружены только в ВМО, локализованных в грудной полости. Среди 11 ВМО, у которых не были обнаружены перестройки с участием генов киназ, 1 опухоль продемонстрировала активацию ALK посредством амплификации и гиперэкспрессии гена, еще в одном случае была выявлена транслокация COL 1A1:: USP6.
Выводы
Каскад тестов на основе ПЦР обеспечивает высокоэффективную и недорогую молекулярную диагностику ВМО. В 87% ВМО определены маркеры чувствительности к таргетной терапии.
Работа выполнена при поддержке гранта РНФ № 17-75-30027.
Список литературы
I. Lovly CM, Gupta A, Lipson D et al . Inflammatory myofibroblasts tumors harbor multiple potentially actionable kinase fusions
// Cancer Discov. 2014:4:889-895 . DOI: 10 .1158/2159-8290 . CD-14-0377 .
2 . Lee CJ, Schöffski P, Modave E et al . Comprehensive Molecular Analysis of Inflammatory Myofibroblastic Tumors Reveals
Diverse Genomic Landscape and Potential Predictive Markers for Response to Crizotinib . Clin Cancer Res . 2021:27:67376748 . DOI: 10 .1158/1078-0432 . CCR-21-1165 .
3 . Preobrazhenskaya EV, lyevleva AG, Suleymanova AM et al . Gene rearrangements in consecutive series of pediatric inflam-
matory myofibroblastic tumors . Pediatr Blood Cancer. 2020:67:e28220 . DOI: 10 ,1002/pbc . 28220
Нарушение светового режима как фактор риска спонтанных опухолей кроветворной системы
Авторы:
(1) Виноградова И.А., [email protected], ФГБОУ ВО «Петрозаводский государственный университет», Петрозаводск
(2) Букалев А.В., [email protected], ГБУЗ РК «Республиканская больница им. В.А. Баранова», Петрозаводск Ключевые слова
крысы, спонтанные опухоли, гемобластозы, световое загрязнение, десинхроноз Актуальность
В многочисленных исследованиях показано влияние светового излучения, его продолжительности и интенсивности на различные биологические объекты. Известно, что избыточное освещение приводит к подавлению, а режим световой депривации, напротив, — к активации эпифиза. Нарушения в работе эпифиза сказываются на цикличности продукции мелатонина, способствуют преждевременному старению и развитию новообразований (Анисимов В.Н., 2008; Жукова О.В., Виноградова И.А., 2021; Vinogradova I.A. et al., 2022).
Цель
Сравнительное изучение длительного влияния нарушенного светового режима на развитие новообразований гематопоэтической системы у самцов и самок крыс.
Материалы и методы
Эксперименты проведены на 280 самцах и самках крыс. Работа выполнена с соблюдением международных принципов Хельсинской декларации о гуманном отношении к животным. Исследование проводили до естественной гибели животных. В 25-дневном возрасте крыс рандомизированно разделили на группы. Первая группа (экспериментальная) находилась в условиях светового загрязнения («белые ночи» и постоянный свет). Вторая группа животных (контрольная) — в стандартном чередующемся режиме освещения. Павших по ходу опыта животных вскрывали. Использовали гистологическую классификацию опухолей, предложенную МАИР.
Результаты
Нарушение светового режима оказывало статистически значимое модифицирующее влияние на развитие спонтанных опухолей кроветворной системы как у самцов, так и у самок крыс. Так, в экспериментальной группе крыс достоверно увеличивалась частота развития гемобластозов по сравнению с особями в контрольной группе. При лейкозах и лимфомах наблюдали выраженные гепато- и спленомегалии. Микроскопически выявляли диффузную и очаговую инфильтрацию атипичными клетками с многочисленными митозами. Опухолевые инфильтраты были расположены по ходу сосудов, в строме паренхиматозных органов и под капсулой. Следует отметить, что в экспериментальной группе было выявлено по 8 случаев лейкоза и злокачественных лимфом, тогда как в контрольной группе только 2.
Выводы
Таким образом, новообразования гематопоэтической системы в нарушенном световом режиме встречались гораздо чаще, чем в режиме нормального чередования света и темноты.
Список литературы
1. Анисимов В . Н . Молекулярные и физиологические механизмы старения . В 2 т. Издательство: СПб: Наука, 2008 . 915 с .
2 . Жукова О . В . , Виноградова И .А. Мелатонинергическая система, репродуктивная функция и водно-солевой обмен .
Петрозаводск: Издательство ПетрГУ, 2022 . 68 с .
3 . Vinogradova I . A ., Matveeva Yu . P, Zhukova O .V., Yunash V. D . , Anisimov V N . Melatonin prevents the development of age-
related pathology in male rats during accelerated aging caused by impaired photoperiodism . Advances in Gerontology. 2021; 11 (1):77-82 .
