CC BY
46
УДК 613.64: 616.717 - 057
РАЗРАБОТКА МЕТОДИЧЕСКИХ ПОДХОДОВ К ИДЕНТИФИКАЦИИ ОСОБЕННОСТЕЙ ГЕНЕТИЧЕСКОГО ПОЛИМОРФИЗМА И ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ У ДЕТЕЙ В УСЛОВИЯХ ВОЗДЕЙСТВИЯ ХИМИЧЕСКИХ СРЕДОВЫХ ФАКТОРОВ НА ПРИМЕРЕ СТРОНЦИЯ
О.В. Долгих1'2'3, Н.В. Зайцева1'2'3, А.В. Кривцов1, К.Г. Старкова1,
1 13 1 13
Д.Г. Дианова , О.А. Бубнова ' , Е.А. Отавина , Н.В. Безрученко '
ХФБУН «Федеральный научный центр медико-профилактических технологий управления рисками здоровью населения», 614045, г. Пермь, ул. Монастырская, 82
2ФГБОУ ВПО «Пермский национальный исследовательский политехнический университет», Россия, 614990, г. Пермь, Комсомольский просп., 29
3ФГБОУ ВПО «Пермский государственный национальный исследовательский университет», Россия, 614990, Пермь, Букирева, 15
Разработаны методические подходы к оценке особенностей генетического полиморфизма, ассоциированного с воздействием факторов химической этиологии, для идентификации генетических маркеров чувствительности. Предложены технологии, методические аспекты использования полимеразной цепной реакции, секвенирования фрагментов ДНК, исследований спонтанной и индуцированной стронцием экспрессии кандидатных генов, позволяющие выявить изменения генома и транскриптома в целях идентифиции ранних нарушений адаптационных процессов в условиях хронической средовой нагрузки для доказательства вреда здоровью и оценки индивидуального риска экспозиции химических факторов.
Ключевые слова: маркеры чувствительности, генетический полиморфизм, экспрессия генов, секвенирование, стронций.
Актуальной проблемой является разработка методических подходов к выявлению связанной с полиморфизмом генов адаптивности отдельного человека и популяции к действию химических мутагенов. Восприимчивость организма к воздействию техногенных химических факторов в значительной мере зависит от особенностей генетических ассоциаций, опреде-
ляющих: активность ферментов системы деток-сикации ксенобиотиков; специфику патогенеза техногенных нарушений в органах-мишенях; состояние белков предрасположенности к онко-пролиферативным состояниям и факторов иммунного ответа. При этом особый интерес вызывают вопросы функциональной организации генома и особенностей генетического полимор-
© Долгих О.В., Зайцева Н.В., Кривцов А.В., Старкова К.Г., Дианова Д.Г., Бубнова О.А., Отавина Е.А., Безрученко Н.В., 2015
Долгих Олег Владимирович - доктор медицинских наук, заведующий отделом иммунобиологических методов диагностики, профессор кафедры окружающей среды, профессор кафедры экологии человека и безопасности жизнедеятельности (e-mail: [email protected]; тел.: 8 (342) 236-39-30).
Зайцева Нина Владимировна - доктор медицинских наук, академик РАН, профессор, директор (e-mail: [email protected]; тел.: 8 (342) 237-25-34).
Кривцов Александр Владимирович - кандидат медицинских наук, заведующий лабораторией иммуногенети-ки (e-mail: [email protected]; тел.: 8 (342) 236-39-30).
Старкова Ксения Геннадьевна - кандидат медицинских наук, заведующий лабораторией иммунологии и аллергологии (e-mail: [email protected]; тел.: 8 (342) 236-39-30).
Дианова Дина Гумеровна - кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории клеточных методов диагностики (e-mail: dianovadina@rambler.кu; тел.: 8 (342) 236-39-30).
Бубнова Ольга Алексеевна - младший научный сотрудник отдела иммунобиологических методов диагностики (e-mail: [email protected]; тел.: 8 (342) 236-39-30).
Отавина Елена Алексеевна - младший научный сотрудник отдела иммунобиологических методов диагностики (e-mail: [email protected]; тел.: 8 (342) 236-39-30).
Безрученко Надежда Владимировна - иммунолог отдела иммунобиологических методов диагностики, студентка магистратуры биологического факультета (e-mail: [email protected]; тел.: 8 (342) 236-39-30).
физма. Генетический полиморфизм — долговременное существование в популяции двух генотипов и более, частоты которых достоверно превышают вероятность возникновения соответствующих повторных мутаций. По данным научной литературы, распространенность минорного алле-ля в популяции занимает в среднем 10 % по большинству значимых полиморфизмов. Идентификация однонуклеотидных полиморфизмов (8№), то есть замены одного нуклеотида другим, решает вопрос оценки качественного полиморфизма. Выявление структуры и особенностей экспрессии генов, кодирующих все белковые молекулы человека, а также внедрение в рутинную лабораторную практику новых диагностических технологий тестирования различных генных полиморфизмов (варианты одного и того же гена в популяции) позволяет предсказывать риски развития определенных заболеваний у конкретного индивидуума. В частности, генетическое тестирование дает возможность выяснить, есть ли наследственная предрасположенность к нарушениям детоксикации лекарственных и других ксеногенных соединений, появлению рака, различным сердечно-сосудистым заболеваниям, развитию многочисленных осложнений течения беременности. Для решения задач ранней диагностики и повышения эффективности профилактики развития процессов дезадаптации у детей в условиях техногенной экспозиции актуальным является установление особенностей идентификации нарушений генетических показателей [1-23].
Развитие исследований и методической базы в этом направлении необходимо для обеспечения путей защиты и стабилизации генома человека в условиях воздействия негативных факторов среды обитания.
Целью настоящих исследований являлась разработка методических подходов к идентификации особенностей генетического полиморфизма как маркера ранних нарушений адаптационных процессов (иммунных, обменных, соматических, пролиферативных) у детей в условиях хронической экспозиции химических средовых факторов на примере стронция.
Материалы и методы. Дизайн исследования включал в себя сравнительный анализ контингента риска (экспонированное население) и контингента контроля (неэкспонированное население); индивидуальный и популяционный анализ, проводимый на различных стратификационных биологических уровнях (клеточном, молекулярном).
Методический алгоритм идентификации SNP базировался на основных положениях методических рекомендаций «Перечень маркеров генного полиморфизма, отвечающих за особенности мутагенной активности техногенных химических факторов» МР 4.2.0075-13 от 20.08.2013 г.
Проводилось персонифицированное гено-типирование, в основе которого лежал индивидуальный подбор панели генов, отражающих профессиональные, внешнесредовые, социальные (вредные привычки) условия и наличие хронической патологии.
Верификация генетического полиморфизма (маркеры чувствительности) включала в себя оценку групп генов, отражающих особенности обменных, топических (органных), иммунных и детоксикационных процессов:
♦ идентификация мутаций генов ферментов 1-й и 2-й фазы детоксикации;
♦ полиморфизм генов белков, участвующих в патогенезе техногенных нарушений в органах-мишенях (ген эластазы, ген эндотелиаль-ного фактора роста) и обменных процессах;
♦ генотипирование предрасположенности к онкопролиферативным состояниям;
♦ определение иммуногенетических маркеров.
Для диагностики генного полиморфизма на уровне ДНК в условиях факторной нагрузки на основании изучения специализированной литературы нами подобраны гены и их участки в качестве маркеров чувствительности вероятных рисков возникновения индуцированных средой нарушений здоровья: цитохрома Р-450 CYP1A1 (rs4646421 и rs1048943), копропорфи-риногеноксидазы CPOX (rs1131857), метилен-тетрагидрофолатредуктазы (rs1801133) MTHFR, эндотелиальной NO-синтазы eNOS (rs1799983), белка аполипопротеина Е ApoE (rs429358), матриксных протеиназ MMP9 и MMP12 (rs17576 и rs652438), сульфотрансферазы SULT1A1 (rs9282861), онкогенов BRCA1, BRCA2 и TP53 (rs3950989, 1801439, 1042522), гена рецептора эстрогена ESR1 (rs2228480) и промоторной области гена TNFA (rs1800629) фактора некроза опухолей, GSTA4 (глутатион-трансфераза), SOD2, ZMPSTE24 (цинк-металлопептидаза), TERT, DRD2, SIRT1, TLR4 (толл-рецептор 4), PPAR, FAS, FOXP3, VEGF, APO-E, NO-син-таза, ACE.
Для определения генотипа человека использовали метод аллельной дискриминации,
когда различия между гетерозиготами, гомозиготами дикого и минорного вариантов устанавливали по различиям в протекании реакций амплификации соответствующих праймеров.
Алгоритм ДНК-детекции: забор образцов ДНК со слизистой оболочки щеки; выделение геномной ДНК с помощью фенол-хлороформной экстракции; исследование полиморфных вариантов изучаемых генов методикой ПЦР в режиме реального времени; амплификация и детекция вариантных аллелей на базе тер-моциклера СБХ96 с использованиеми структуры праймеров и параметров температурных циклов, описанных в литературе; обработка полученных результатов методом аллельной дискриминации с идентификацией различий гомозиготной замены от гетерозиготы и нормальной гомозиготы.
Технология и алгоритм идентификации индуцированной мутагенами генетической экспрессии включали в себя оценку состояния транс-криптома клеток-мишеней изучаемого фактора у экспонированного населения по критерию уровня спонтанной и индуцированной экспрессии тестируемого гена. В качестве материала сравнения служат контрольные биопробы с допустимым уровнем контаминации мутагеном.
Алгоритм оценки индуцированной экспрессии генов:
1) взятие материала и его транспортировка в лабораторию;
2) определение содержания мутагена в крови;
3) сепарация клеток крови и их идентификация;
4) подготовка образцов и выделение общей РНК;
5) обратная транскрипция мРНК в кДНК;
6) амлификация кДНК с подготовленными праймерами и зондами;
7) расчет относительной экспрессии маркерного гена;
8) статистический анализ.
Результаты конкретного анализа экспрессии генов позволили нам за счет выделения специфических клеточных фенотипов СБ4+, СБ8+, СБ16+, экспрессирующих ген дефензина-альфа, обеспечить прогнозирование иммунных нарушений, ассоциированных с воздействием стронция.
Протокол исследования экспрессии канди-датного гена, приведенной внутренним контролем (ген ОЛРБЫ), включал в себя:
1) относительное количество белка (РНК) дефензина-альфа (спонтанный уровень экспрессии CD8+;
2) индуцированный стронцием уровень экспрессии белка (РНК) дефензина-альфа (индуцированный уровень экспрессии CD8+).
Анализ результатов производится по соотношению индуцированного стронцием и спонтанного уровней экспрессии дефензина-альфа.
Состояние специфической индуцибельно-сти нами оценивалось по величине и направлению изменчивости экспрессии, вызванной экспозицией стронцием ex vivo, по сравнению со спонтанной экспрессией с учетом базовой экспозиции (содержание стронция в крови).
Статистическая обработка данных генетического обследования осуществлялась по накопленным массивам данных отдельно по каждому гену для двух групп — опытной и контрольной. Использовались статистические методы для описания равновесия частот генотипов и аллелей генов по равновесию Харди-Вайнберга. Различия в двух популяциях рассчитывались по отношению шансов (OR) для различных моделей наследования: аддитивной, общей, мультипликативной, доминантной и рецессивной и считались достоверными при р < 0,05.
Результаты и их обсуждение. В табл. 1 приведены результаты оценки числа полиморфных вариантов кандидатных генов различных функциональных систем у экспонированных стронцием пациентов.
В структуре мутаций максимальной поли-морфностью обладают гены детоксикации — 37,5 % из всей выборки генов, второй ранг занимают гены обмена (27,5 %) и гены иммунорегуляции, замены в соматических генах выражены в меньшей степени. Это связано с высокой лабильностью поли-морфности функциональных белков и медиаторов обмена веществ, обеспечивающих адаптивность к изменяющимся характеристикам среды и высокой чувствительностью транскриптомно-геном-ных взаимосвязей для иммунорегуляторных генов.
Состояние специфической индуцибельно-сти нами оценивалось по величине и направлению изменчивости экспрессии, вызванной экспозицией стронцием ex vivo, по сравнению со спонтанной экспрессией с учетом базовой экспозиции (содержание стронция в крови).
Данные, полученные в ходе испытаний, приведены в табл. 2.
Таблица 1
Результаты секвенирования кандидатных генов
Хромосома Ген Количество полиморфизмов в сравнении с референсной последовательностью
1 п 2 п 3 п 4 п 5 п 6 п
1 2 3 4 5 6
1 MTHFR 13 13 13 14 23 23
1 CLCN6 0 1 0 0 1 1
1 ZMPSTE24 4 3 3 4 1 4
3 CPOX 1 8 7 8 8 10
5 TERT 9 5 14 3 6 5
5 IL17B 0 2 0 2 1 1
6 PPARD 4 6 4 5 5 1
6 VEGFA 2 4 3 2 8 5
6 IL17F 0 0 0 0 0 1
6 GSTA4 11 12 9 15 11 15
6 SOD 4 0 6 2 0 6
6 HLADRB1 45 19 6 0 15 10
7 NOS3 19 14 12 14 12 14
9 TLR4 0 1 1 1 2 2
10 ACTA2 1 1 1 2 0 0
10 FAS 0 4 8 5 7 9
11 SIRT3 9 12 8 12 8 1
11 TH 17 16 15 8 16 18
11 DRD2 19 12 16 14 19 20
13 IL17D 3 1 2 1 1 1
15 CYP1A2 5 3 3 4 3 4
16 SULT1A1 41 33 37 10 39 37
16 IL17C 3 3 2 3 4 2
17 TP53 7 7 6 6 7 6
17 ACE 4 28 24 22 21 25
19 APOE 3 3 3 2 2 5
Х FOXP3 3 3 4 0 2 2
14 хромосом 27 генов 227 214 207 159 222 228
Таблица 2
Характеристика индекса экспрессии гена дефензина-альфа у пациентов с различным уровнем содержания стронция в крови
№ п/п Экспрессия Содержание CD8+, % Концентрация стронция в крови, мкг/мл
спонтанная индуцированная стронцием индекс экспрессии
1 0,007 0,01718 2,26 24 0,0181
2 0,011 0,0121 1,05 26 0,012
3 0,062 0,2349 3,8 35 0,123
4 0,010 0,007 0,67 17 0,090
5 0,603 0,359 0,60 14 0,0862
6 0,128 0,085 0,66 21 0,0553
7 0,051 0,1429 2,8 28 0,0216
8 0,072 0,19541 2,71 29 0,0347
9 0,024 0,0394 1,63 32 0,032
10 0,033 0,05215 1,58 28 0,0201
Норма - 0,7-3,0 28,0 ± 4, 7 0,024 ± 0,007
Приведенные значения спонтанной и индуцированной экспрессии и предлагаемого индекса у экспонированных стронцием пациентов достоверно отличались от аналогичных данных пациентов, у которых содержание стронция в крови было ниже референтного уровня (0,077 мг/дм3) (р < 0,05). Для обоснования поро-
говости индекса экспрессии, который бы характеризовал иммунные нарушения у пациента, исходили из следующего принципа. Принцип пороговости предполагает разрыв между пороговыми (минимально действующими) уровнями фактора и недействующими с коэффициентом 3 и выше. Ряд авторов (например, Е.А. Трифо-
нова и др.) считают значимым изменение уровня экспрессии гена более чем в 1,5 раза, хотя они же идентифицируют повышение ее интенсивности у женщин с преэклампсией в 6—8 раз. Поэтому нами рекомендуется в качестве диагностически значимого критерия измененной экспрессии снижение ее в 1,5 раза как критический уровень угнетения экспрессии гена и индекс 3,0 как порог допустимого увеличения экспрессии гена, что будет выражаться диапазоном коэффициентов оптимума экспрессии (индекс экспрессии) от 0,7 до 3,0. Разница между коэффициентами, ограничивающими увеличение и снижение экспрессии генов, объясняется особенностями и интенсивностью этих процессов у эукариотов. Режим сохранения генетического материала при супрессии и инициация синтеза при стимуляции (достигается путем многократной инициации синтеза ДНК) приводит в последнем случае к значительному увеличению генетического материала. При анализе клеточных фенотипов, отвечающих за иммунорезистентность, выявлен их дефицит, что в ассоциации с высокой контаминацией биосред стронцием и угнетением экспрессии дефензина-альфа указывает на наличие иммунодефицитного состояния, обусловленного действием стронция.
Анализ индуцированной экспрессии генов рекомендуется использовать для определения выраженности индивидуальных и популяцион-ных эпигенетических изменений в континген-тах, подвергающихся хронической гаптенной интоксикации в алгоритмической последовательности, следующей за сиквенсом и ПЦР-иден-тификацией кандидатных генов.
Таким образом, предложена методология генотипирования нуклеотидных замен, заключающаяся в алгоритмической последовательности проведения сиквенса, ПЦР-типирования и экспрессии кандидатных генов. Результаты анализа полиморфизма генов в условиях повышенной экспозиции стронцием указывают на избыточную вариабельность генов CYP1A2, TERT, FAS, FOXP3, TP53, HLADRB1, MTHFR, GSTA, SULT1A1, NOS, SIRT, ACE, отвечающих за особенности иммунорегуляции и деток-сикации. Изложенные подходы и принципы идентификации генов иммунной дезадаптации позволяют подобрать для определенных условий (среда, территория, нозология) сочетание
генетических маркеров для идентификации нарушений здоровья.
Выводы. Идентификация маркеров чувствительности с использованием современных генетических методологий должна включать в себя последовательность тестирования биопроб методами полимеразной цепной реакции, секвенирования и оценки экспрессии кандидат-ных генов.
Генетические маркеры позволяют дать оценку особенностям влияния факторов среды обитания на состояние здоровья, обеспечить службу современными тестами ранней диагностики вреда здоровью при воздействии химических факторов
Разработанные на примере стронция методические подходы к идентификации особенностей генетического полиморфизма у детей, ассоциированного с факторной нагрузкой, включают в себя соблюдение следующих условий и особенностей их реализации:
♦ достаточность выборки, ее популяци-онная однородность, отсутствие врожденных аномалий, адекватность подбора контрольного контингента, проживающего вне ареала влияния виновного фактора;
♦ комплексный подход к анализу полиморфных вариантов кандидатных генов с использованием возможностей ПЦР-анализа в режиме реального времени, их сиквенса с подсчетом тан-демных повторов и транзиций и трансверсий генов с проведением оценки спонтанной и митоген-индуцированной экспрессии генов;
♦ анализ ключевых однонуклеотидных полиморфизмов и вариантных аллелей канди-датных генов («иммунные», обменные, соматические, онкопролиферативные и детоксикаци-онные гены), отвечающих за особенности метаболизма действующего фактора или за состояние эффекторных органов и систем (тканей-мишеней);
♦ анализ состояния транскриптома по величине относительной экспрессии матричной РНК кандидатных генов сепарированных клеток-мишеней изучаемого фактора;
♦ анализ ассоциаций «ген - рецептор - ли-ганд» с изучением состояния не только гена, но и экспрессируемого им белка, имеющего разные формы: внутриклеточную (транскрипционные факторы), мембранную (рецептор), внеклеточную (лиганд).
Список литературы
1. Венгеровский А.И., Хлусов И.А., Нечаев К.А. Молекулярные механизмы действия бисфосфонатов и стронция ранелата // Экспер. и клин. фармак. - 2014. - Т. 77 (9). - С. 43-46.
2. Иммунологические и генетические маркеры внешнесредовой экспозиции стронцием / К.Г. Горшкова, О. А. Бубнова, Е. Д. Маерова, О .В. Долгих // Санитарный врач. - 2014. - № 3. - С. 72-74.
3. Иммунологические и генетические маркеры воздействия ароматических углеводородов на работающих / О.В. Долгих, А.В. Кривцов, А.М. Гугович, Р.А. Харахорина, Д.В. Ланин, Т.С. Лыхина, М.А. Сафонова // Медицина труда и промышленная экология. - 2012. - № 12. - С. 30-33.
4. Иммунные маркеры и полиморфизм генов у детей в условиях экспозиции тяжелыми металлами / О.В. Долгих, К.Г. Старкова, А.В. Кривцов, О.А. Бубнова, Н.А. Вдовина, Е.А. Пирогова // Вестник Пермского университета. Серия «Биология». - 2015. - № 3. - С. 240-244.
5. Куценко С.А. Основы токсикологии. - СПб.: Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова, 2002. - 395 с.
6. Методические подходы к расчету вероятности негативных ответов для оценки индивидуальных рисков здоровью человека / Н.В. Зайцева, П.З. Шур, Д.А. Кирьянов, В.М. Чигвинцев, О.В. Долгих, К.П. Лужецкий // Профилактическая и клиническая медицина. - 2015. - № 3 (56). - С. 5-11.
7. Полиморфизм генов белков ангиогенеза в условиях шумовой и химической техногенной экспозиции / Р.А. Предеина, О.В. Долгих, О.О. Синицына, А.В. Кривцов, О.А. Бубнова, Е.Д. Данилова, Д.Г. Дианова, Т.С. Лыхина // Здоровье населения и среда обитания. - 2013. - № 11 (248). - С. 42-44.
8. Спонтанная и индуцированная стронцием экспрессия гена дефензина / О.В. Долгих, Н.В. Зайцева, А.В. Кривцов, О.А. Бубнова // Здоровье населения и среда обитания. - 2016. - № 1 (274). - С. 31-33.
9. Рахманин Ю.А., Новиков С.М., Иванов С.И. Современные научные проблемы совершенствования методологии оценки риска здоровью населения // Гигиена и санитария. - 2005. - № 2. - С. 3-8.
10. Assessment of immunotoxic in humans / J. Descotes [et. al.] // Clin. Chem. - 1995. - Vol. 41, № 12. - P. 1870-1873.
11. Caverzasio J., Thouverey C. Activation of FGF receptors is a new mechanism by which strontium ranelate induces osteoblastic cell growth // Cell. Physiol. Biochem. - 2011. - Vol. 27 (3-4). - P. 243-250.
12. Descotes J., Vial Th. Immunotoxic effects of xenobiotics in humans: A review of current evidence // Toxicology in Vitro. - 1994. - Vol. 8, № 5. - Р. 963-966.
13. Molecular markers of apoptosis in industrial workers / O. Dolgikh, N. Zaitseva, D. Dianova, A. Krivtsov // In vivo: international Journal of Experimental and Clinical Pathophysiology and Drub Research. - 2011. - Vol. 25, № 3. - P. 523-524.
14. Fromigue О., Hay Е., Barbara А. Calcium sensing receptor-dependent and receptor-independent activation of osteoblast replication and survival by strontium ranelate // JCMM. - 2009. - Vol. 13 (8B). - P. 2189-2199.
15. Xenobiotic-metabolizing enzymes in human respiratory nasal mucosa / P.G. Gervasi, V. Longo, F. Naldi, G. Panattoni, F. Ursino // Biochem. Pharmacol. - 1991. - Vol. 41. - P. 177-184.
16. The calcium-sensing receptor is involved in strontium ranelate-induced osteoclast apoptosis. New insights into the associated signaling pathways / A.S. Hurtel-Lemaire, R. Mentaverri, A. Caudrillier, F. Cournarie, A. Wat-tel, S. Kamel, E.F. Terwilliger, E.M. Brown, M. Brazier // JBC. - 2009. - Vol. 284. - P. 575-584.
17. Approaches to the evaluation of chemical-induced immunotoxicity / K. Krzystyniak [et. al.] // Environ. Health Perspect. - 1995. - Vol. 103, suppl 9. - P. 17-22.
18. Switching Akt: From survival signaling to deadly response / M. Los, S. Maddika, B. Erb, K. Schul-zeOsthoff // BioEssays. - 2009. - Vol. 31 (5). - P. 492-495.
19. Mulder G.J. Metabolic Activation of Industrial Chemicals and Implications for Toxicity // Toxicology of industrial compounds. Taylor & Francis Ltd. UK. - 1995. - P. 37-44.
20. Van Bladeren P.J., van Ommen B. Metabolism of Reactive Chemicals // Toxicology of industrial compounds. Taylor & Francis Ltd. - 1995. - P. 61-72.
21. Strontium enhances osteogenic differentiation of mesenchymal stem cells and in vivo bone formation by activating Wnt/catenin signaling / F. Yang, D. Yang, J. Tu, Q. Zheng, L. Cai, L. Wang // Stem cells. - 2011. -Vol. 29. - P. 981-999. doi: 10.1002/stem.646.
22. Yurchenko M., Shlapatska L.M., Sidorenko S.P. The multilevel regulation of CD95 signaling outcome // Exp. oncol. - 2012. - Vol. 34 (3). - P. 200-2011.
23. Zaitseva N.V., Dianova D.G., Dolgykh O.V. Effects of cellular immunity in conditions of surplus supply of strontium with consumed water // European journal of natural history. - 2014. - № 1. - P. 7-8.
Разработка методических подходов к идентификации особенностей генетического полиморфизма и экспрессии генов у детей в условиях воздействия химических средовых факторов на примере стронция / О.В. Долгих, Н.В. Зайцева, А.В. Кривцов, К.Г. Старкова, Д.Г. Дианова, ОА. Бубнова, Е.А. Отавина, Н.В. Безрученко //Анализ риска здоровью. - 2016. - № 1 (13). - С. 34-41.
DEVELOPMENT OF METHODICAL APPROACH TO THE IDENTIFICATION OF THE FEATURES OF THE GENETIC POLYMORPHISMS AND GENE EXPRESSION IN CHILDREN UNDER INFLUENCE OF CHEMICAL ENVIRONMENTAL FACTORS ON THE EXAMPLE OF STRONTIUM
O.V. Dolgikh1'2'3, N.V. Zaitseva1,2,3, A.V. Krivtsov1, K.G. Starkova1, D.G. Dianova1, O.A. Bubnova1,3, E.A. Otavina1, N.V. Bezruchenko1,3
1 FBSI "Federal Scientific Center for Medical and Preventive Health Risk Management Technologies", 82 Monastyrskaya St., Perm, 614045, Russian Federation
2 FBSEI HPE "Perm National Research Polytechnic University", 29 Komsomolsky Av., Perm, 614990, Russian Federation
3 FBSEI HPE "Perm State National Research University", 15 Bukireva St., Perm, 614990, Russian Federation
Methodological approaches evaluating the features of genetic polymorphism associated with exposure to chemical etiology factors for the identification of genetic susceptibility markers were developed. The technologies, methodological aspects of the use of polymerase chain reaction, DNA sequencing fragments, studies of spontaneous and induced strontium expression of candidate genes that help identify changes in the genome and transcriptome in order to identify early disorders of adaptation processes in chronic environmental burden to prove the injury and assessment of individual exposure risk chemical factors were suggested.
Key words: sensitivity markers, genetic polymorphisms, gene expression, sequencing, strontium.
References
1. Vengerovskiy A.I., Hlusov I.A., Nechaev K.A. Molekuljarnye mehanizmy dejstvija bisfosfonatov i stron-cija ranelata [Molecular mechanisms of bisphosphonate and strontium ran elate action]. Jekcpep. i klin. Fapmak, 2014, vol. 77 (9), pp. 43-46. (in Russian).
2. Gorshkova K.G., Bubnova O.A., Maerova E.D., Dolgih O.V. Immunologicheskie i geneticheskie markery vneshnesredovoj jekspozicii stronciem [Immunological and genetic markers of environmental exposure strontium]. Sanitarnyj vrach, 2014, no. 3, pp. 72-74. (in Russian).
3. Dolgikh O.V., Krivtsov A.V., Gugovitch A.M., Kharakhorina R.A., Lanin D.V., Lykhina T.S., Sa-fonova M.A. Immunologicheskie i geneticheskie markery vozdejstvija aromaticheskih uglevodorodov na rabota-jushhih [Immunologic and genetic markers of exposure to aromatic hydrocarbons in workers]. Medicina truda i promyshlennaja jekologija, 2012, no. 12, pp. 30-33. (in Russian).
4. Dolgikh O.V., Starkova K.G., Krivtsov A.V., Bubnova O.A., Vdovina N.A., Pirogova E.A. Immunnye markery i polimorfizm genov u detej v uslovijah jekspozicii tjazhelymi metallami [Immune markers and gene polymorphism in children exposed to heavy metals]. Vestnik Permskogo Universiteta. Serija Biologija, 2015, no. 3, pp. 240-244 (in Russian).
© Dolgikh O.V., Zaitseva N.V., Krivtsov A.V., Starkova K.G., Dianova D.G., Bubnov O.A., Otavina E.A., Bezruchenko N.V., 2016
Dolgikh Oleg Vladimirovich - Doctor of Medicine, Head of Department of immunobiological diagnostic methods, professor of environmental, Professor of Human Ecology and Life Safety (e-mail: [email protected]; tel.: + 7 (342) 236-39-30).
Zaitseva Nina Vladimirovna - Doctor of Medicine, academician of the Russian Academy of Sciences, Professor, Director (e-mail: [email protected]; tel.: + 7 (342) 237-25-34).
Krivtsov Alexander Vladimirovich - Ph.D., Head of the Laboratory of Immunogenetics (e-mail: [email protected]; tel.: + 7 (342) 236-39-30).
Starkova Kseniya Gennadievna - Ph.D., Head of the Laboratory of Immunology and Allergology (e-mail: [email protected]; tel.: + 7 (342) 236-39-30).
Dianova Dina Gumerovna - Ph.D., senior researcher, Laboratory of cell diagnostic methods (e-mail: diano-vadina@rambler.кu; tel.+ 7 (342) 236-39-30.).
Bubnova Olga Alekseevna - Junior Researcher at the Department of immunobiological diagnostic methods (e-mail: [email protected]; tel.: + 7 (342) 236-39-30).
Otavina Elena Alekseevna - Junior Researcher at the Department of immunobiological diagnostic methods (e-mail: [email protected]; tel.: + 7 (342) 236-39-30).
Bezruchenko Nadezhda Vladimirovna - immunolog of the department of immunobiological diagnostic methods, the student of the Magistracy of biological faculty (e-mail: [email protected]; tel.: +7 (342) 236-39-30).
5. Kucenko, S. A. Osnovy toksikologii [Bases of toxicology]. St. Petersburg: Voenno-medicinskaja akademija im. S.M. Kirova, 2002, 395 p. (in Russian).
6. Zaitseva N.V., Shur P.Z., Kir'janov D.A., Chigvincev V.M., Dolgih O.V., Luzhetsij K.P. Metodicheskie podhody k raschetu verojatnosti negativnyh otvetov dlja ocenki individual'nyh riskov zdorov'ju cheloveka [Methodological approaches to the calculation of the probability of negative responses to assessment of the individual risks to human health]. Profilakticheskaja i klinicheskaja medicina, 2015, no. 3 (56), pp. 5-11. (in Russian).
7. Predeina R.A., Dolgikh Oleg, Krivtsov A.V., Bubnova O.A., Danilova E.D., Sinitsyna O.O., Dianova D.G., Lykhina T.S. Polimorfizm genov belkov angiogeneza v uslovijah shumovoj i himicheskoj tehnogennoj jekspozicii [Polymorphism of genes of proteins angiogenesis noise and conditions of chemical exposure technogenic]. Zdorov'e naselenija i sreda obitanija, 2013, no. 11 (248), pp. 42-44. (in Russian).
8. Rakhmanin Yu.A., Novikov S.M., Ivanov S.I. Sovremennye nauchnye problemy sovershenstvovanija me-todologii ocenki riska zdorov'ju naselenija. [Current scientific problems in the improvement of methodology for assessing a human health risk]. Gigiena i sanitarija, 2005, no. 2, pp. 3-8. (in Russian).
9. Dolgikh O.V., Zaitseva N.V., Kir'janov D.A., Bubnova O.A. Spontannaja i inducirovannaja stronciem jek-spressija gena defenzina [Spontaneous and induced by strontium expression of the defensin gene]. Zdorov'e naselenija i sreda obitanija, 2016, no. 1 (274), pp. 31-33 (in Russian).
10. Descotes J. [et. al.] Assessment of immunotoxic еffects in humans. Clin. Chem, 1995, vol. 41, no. 12, pp. 1870-1873.
11. Descotes J. [et. al.] Assessment of immunotoxic еffects in humans. Clin. Chem, 1995, vol. 41, no. 12, pp. 1870-1873.
12. Descotes J., Vial Th. Immunotoxic effects of xenobiotics in humans: A review of current evidence. Toxicology in Vitro, 1994, vol. 8, no. 5, pp. 963-966.
13. Dolgikh O., Zaitseva N., Dianova D., Krivtsov A. Molecular markers of apoptosis in industrial workers.
In vivo: international Journal of Experimental and Clinical Pathophysiology and Drub Research, 2011, vol. 25, no. 3, pp. 523-524.
14. Fromigué О., Hay Е., Barbara А. Calcium sensing receptor-dependent and receptor-independent activation of osteoblast replication and survival by strontium ranelate. JCMM, 2009, vol. 13 (8B), pp. 2189-2199.
15. Gervasi P.G., Longo V., Naldi F., Panattoni G., Ursino F. Xenobiotic-metabolizing enzymes in human respiratory nasal mucosa. Biochem Pharmacol, 1991, vol. 41, pp. 177-184.
16. Hurtel-Lemaire A.S., Mentaverri R., Caudrillier A., Cournarie F., Wattel A., Kamel S., Terwilliger E.F., Brown E.M., Brazier M. The calcium-sensing receptor is involved in strontium ranelate-induced osteoclast apop-tosis. New insights into the associated signaling pathways. JBC, 2009, vol. 284, pp. 575-584.
17. Krzystyniak K. [et. al.]. Approaches to the evaluation of chemical-induced immunotoxicity. Environ Health Perspect, 1995, vol. 103, suppl 9, pp. 17-22.
18. Los M., Maddika S., Erb B., SchulzeOsthoff K. Switching Akt: From survival signaling to deadly response. BioEssays, 2009, vol. 31 (5), pp. 492-495.
19. Mulder G.J. Metabolic Activation of Industrial Chemicals and Implications for Toxicity. Toxicology of industrial compounds. Taylor & Francis Ltd. UK, 1995, pp. 37-44.
20. Van Bladeren P.J., van Ommen B. Metabolism of Reactive Chemicals. Toxicology of industrial compounds. Taylor & Francis Ltd, 1995, p. 61-72.
21. Yang F., Yang D., Tu J., Zheng Q., Cai L., Wang L. Strontium enhances osteogenic differentiation of mesenchymal stem cells and in vivo bone formation by activating Wnt/catenin signaling. Stem cells, 2011, vol. 29, pp. 981-99. DOI: 10.1002/stem.646.
22. Yurchenko M., Shlapatska L.M., Sidorenko S.P. The multilevel regulation of CD95 signaling outcome. Exp. Oncol, 2012, vol. 34 (3), pp. 200-2011.
23. Zaitseva N.V., Dianova D.G., Dolgikh O.V. Effects of cellular immunity in conditions of surplus supply of strontium with consumed water. European journal of natural history, 2014, no. 1, pp. 7-8.
Dolgikh O.V., Zaitseva N.V., Krivtsov A.V., Starkova K.G., Dianova D.G., Bubnov O.A., Otavina E.A., Bez-ruchenko N.V. Development of methodical approach to the identification of the features of the genetic polymorphisms and gene expression in children under influence of chemical environmental factors on the example of strontium // Health Risk Analysis. - 2016. - № 1 (13). - P. 34-41. (in Russian).
