CC BY
1
https://doi.org/10.31631/2073-3046-2024-23-6-83-103
Распространенность и факторы риска колонизации карбапенемрезистентными микроорганизмами у пациентов, поступающих в многопрофильный стационар
О. Г. Ни*1, Б. З. Белоцерковский12, А. Н. Круглов1, М. И. Матяш1, А. О. Быков12, С. В. Яковлев34, Е. М. Шифман25, Д. Н. Проценко12
1 ГБУЗ г. Москвы «Московский многопрофильный клинический центр «Коммунарка» Департамента здравоохранения города Москвы», Москва
2 ФГАОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н. И. Пирогова» Минздрава России, Москва
3 ФГАОУ ВО «Первый МГМУ им. И. М. Сеченова» Минздрава России (Сеченовский Университет), Москва
4 ГБУЗ г. Москвы «Городская клиническая больница имени С. С. Юдина Департамента здравоохранения города Москвы», Москва
5 ГБУЗ МО МОНИКИ им. М. Ф. Владимирского, Москва
Резюме
Актуальность. В последнее десятилетие возрастает распространенность антибиотикорезистентных микроорганизмов во внебольничной среде. Колонизация и бессимптомное носительство продуцентов бета-лактамаз расширенного спектра и карбапенемаз могут быть предпосылкой к развитию инфекционного процесса и существенным фактором патогенеза инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи. Понимание факторов риска внебольничной колонизации анти-биотикорезистентными микроорганизмами необходимо для проведения целенаправленного скрининга и своевременного принятия мер по предотвращению распространения резистентности в стационаре. Цель. Определить значимые факторы риска колонизации антибиотикорезистентными грамотрицательными микроорганизмами и носительства генов устойчивости к карбапенемам у пациентов, поступающих в многопрофильный стационар. Материалы и методы. Проспективное одно-центровое исследование методом поперечных срезов проводилось в Московском многопрофильном клиническом центре «Коммунарка» с 15.09.2022 г. по 15.08.2023 г. Включены 733 пациента в возрасте от 18 до 94 лет. Образцы биоматериала брались из прямой кишки, верхних и нижних дыхательных путей. Полученный биоматериал исследовали методом полимераз-ной цепной реакции с гибридизационно-флуоресцентной детекцией продуктов амплификации (ПЦР в реальном времени) для выявления генов карбапенемаз и культуральным методом для определения колонизации карбапенемрезистентными бактериями. Идентификацию выделенных микроорганизмов проводили с помощью метода времяпролетной масс-спектрометрии с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией (MALDI-TOF MS), чувствительность к антибактериальным препаратам определяли методом диск-диффузии в агар на среде Мюллер-Хинтон по Кирби-Бауэру. Результаты определения чувствительности выделенных возбудителей интерпретировали на основании критериев EUCAST v12.0, v13.0, v13.1. Результаты и обсуждение. Носительство генов карбапенемаз выявлено у 12,6% пациентов, поступивших в стационар, колонизация карбапенемрезистентными бактериями - у 2,7%. У большинства пациентов (66,7%) единственным локусом носительства генов была прямая кишка. При этом лишь у 18,1% из них была выявлена колонизация прямой кишки бактериями, устойчивыми к карбапенемам. Указанное несовпадение, вероятно, обусловлено большей чувствительностью молекулярно-генетических методов по сравнению с культуральными, а с позиций клинической медицины определение нуклеиновых кислот методом ПЦР может служить эквивалентом обнаружения возбудителя в биоматериале. Многофакторный анализ выявил 5 независимых предикторов колонизации: прием цитостатиков, перевод из другого стационара, потребность в вазопрессорной поддержке, прием антибиотиков в предшествующие 3 месяца и мужской пол. Выводы. Выявленные факторы риска позволяют выделить когорту пациентов высокого риска для целенаправленного скрининга с целью своевременного назначения адекватной антибактериальной терапии и принятия мер по профилактике распространения карбапенемрезистентности в стационаре. Ключевые слова: карбапенемрезистентность, колонизация, эпидемиология, карбапенемазы, антибиотикорезистентность, факторы риска
Конфликт интересов не заявлен.
* Для переписки: Ни Оксана Геннадьевна, заведующая отделением клинической фармакологии - врач-клинический фармаколог, ГБУЗ города Москвы «Московский многопрофильный клинический центр «Коммунарка» Департамента здравоохранения города Москвы», 108814, Москва, ул. Сосенский Стан, д.8/3. +7 (918) 182 20 27, [email protected]. ©Ни О. Г. и др.
Для цитирования: Ни О. Г., Белоцерковский Б. З., Круглов А. Н. и др. Распространенность и факторы риска колонизации карба-пенемрезистентными микроорганизмами у пациентов, поступающих в многопрофильный стационар. Эпидемиология и Вакцино-профилактика. 2024;23(6):83-103. https://doi:10.31631/2073-3046-2024-23-6-83-103_
Prevalence and Risk Factors for Colonization with Carbapenem-Resistant Microorganisms in Patients Admitted to a Multidisciplinary Hospital
OG Ni*1, BZ Belotserkovskiy12, AN Kruglov1, MI Matyash1, AO Bykov12, SV Yakovlev34, EM Shifman25, DN Protsenko12
1 Moscow City Multi-field Clinical Center «Kommunarka», Russia
2 Pirogov National Research Medical University, Russia
3 Sechenov University, Russia
4 City clinical hospital named after S. S. Yudin, Russia
5 Moscow Regional Research Clinical Institute, Russia Abstract
Relevance. In the last decade, there has been an increase in the isolation of antibiotic-resistant microorganisms in community settings. Colonization and asymptomatic carriage of extended-spectrum beta-lactamase and carbapenemase producers can be a precursor to the development of an infectious process and a significant factor in the pathogenesis of healthcare-associated infections. Understanding the risk factors for community-acquired colonization with antibiotic-resistant microorganisms is necessary for targeted screening and timely implementation of measures to prevent the spread of resistance in hospitals. The aim. To determine significant risk factors for colonization with antibiotic-resistant gram-negative microorganisms and carriage of carbapenem resistance genes in patients admitted to a multidisciplinary hospital. Materials & Methods. A prospective single-center cross-sectional study was conducted at the Moscow Multidisciplinary Clinical Center «Kommunarka» from 15.09.2022 to 15.08.2023. The study included 733 patients aged 18 to 94 years. Biological samples were taken from the rectum, upper and lower respiratory tract. The obtained samples were examined by real-time polymerase chain reaction (PCR) with hybridization-fluorescent detection of amplification products to identify carbapenemase genes and by culture method to determine colonization with carbapenem-resistant bacteria. Identification of isolated microorganisms was performed using matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS), and antibiotic susceptibility was determined by the Kirby-Bauer disk diffusion method on Mueller-Hinton agar. The results of susceptibility testing were interpreted based on EUCAST v12.0, v13.0, and v13.1 criteria. Results. Carriage of carbapenemase genes was detected in 12.6% of patients admitted to the hospital, while colonization with carbapenem-resistant bacteria was found in 2.7%. In the majority of patients (66.7%), the rectum was the only site of gene carriage. However, only 18.1% of these patients showed rectal colonization with carbapenem-resistant bacteria. This discrepancy is likely due to the higher sensitivity of molecular genetic methods compared to culture-based techniques. From a clinical perspective, the detection of nucleic acids by PCR can serve as an equivalent to pathogen detection in biological material. Multivariate analysis identified 5 independent predictors of colonization: cytostatic therapy, transfer from another hospital, need for vasopressor support, antibiotic use in the previous 3 months, and male gender. Conclusion. The identified risk factors allow for the identification of a high-risk patient cohort for targeted screening, enabling timely administration of appropriate antibiotic therapy and implementation of measures to prevent the spread of carbapenem resistance in the hospital.
Keywords: carbapenem-resistance, oolonization, epidemiology, carbapenemases, antimicrobial resistance, risk factors No conflict of interest to declare.
For citation: Ni OG, Belotserkovskiy BZ, Kruglov AN, et al. Prevalence and risk factors for colonization with carbapenem-resistant microorganisms in patients admitted to a multidisciplinary hospital. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2024;23(6):83-103 (In Russ.). https://doi:10.31631/2073-3046-2024-23-6-83-103_
Введение стью и большей продолжительностью лечения па-
Одним из наиболее серьезных вызовов, с ко- циентов с ИСМП, вызванными резистентными ми-
торыми сталкивается система здравоохранения, кроорганизмами [4,5]. Указанные обстоятельства
является проблема инфекций, связанных с ока- подчеркивают важность эффективных комплексов
занием медицинской помощи (ИСМП). Распро- профилактики различных видов ИСМП с учетом по-
страненность ИСМП остается достаточно высокой, нимания факторов риска, источников и путей нозо-
а результаты лечения не всегда успешны, что во комиального инфицирования.
многом связано с возрастающей устойчивостью В последнее десятилетие все чаще отмечают
возбудителей к антимикробным препаратам [1,2]. выделение антибиотикорезистентных микроорга-
Атрибутивная летальность при инфекциях, связан- низмов во внебольничной среде [6]. Известно, что
ная с антибиотикорезистентностью возбудителей, колонизация и бессимптомное носительство про-
составляет, по данным различных авторов, от 26% дуцентов бета-лактамаз расширенного спектра
до 44% [3]. Социально-экономическая значимость (БЛРС) и карбапенемаз может быть предпосылкой
проблемы определяется также высокой стоимо- к развитию инфекционного процесса, вызванного
* For correspondence: Ni Oksana G., Head of the Department of Clinical Pharmacology - Clinical Pharmacologist, Moscow City Multi-field Clinical Center «Kommunarka», 8/3 Sosenskii Stan street, 108814, Moscow, Russian Federation. +7 (918) 182 20 27, [email protected]. ©Ni OG, et al.
этими микроорганизмами [7-11], а занос микроорганизмов с повышенной резистентностью из внебольничной среды с последующим перекрестным инфицированием госпитализированных пациентов - существенным моментом патогенеза ИСМП. Знание факторов риска колонизации анти-биотикорезистентными микроорганизмами позволило бы проводить целенаправленный скрининг, своевременно принять меры по предотвращению кросс-контаминации внутри стационара и предотвратить распространение антибиотикорезистент-ности за его пределы, повысить эффективность антимикробной терапии в случае развития инфекционного процесса.
Цель исследования - определить значимые факторы риска колонизации антибиотико-резистентными грамотрицательными микроорганизмами и носительства генов устойчивости к карбапенемам у пациентов, поступающих в многопрофильный стационар.
Материалы и методы
Проспективное одноцентровое исследование методом поперечных срезов проводилось на базе Московского многопрофильного клинического центра «Коммунарка» Департамента здравоохранения города Москвы (далее - ММКЦ «Коммунарка») с 15.09.2022 г. по 15.08.2023 г. Исследование одобрено локальным этическим комитетом ММКЦ «Коммунарка» ДЗМ, протокол № 4 от 12.04.2022 г. Критерии включения пациентов в исследование:
• возраст >18 лет;
• длительность госпитализации на момент взятия образцов < 24 часов;
• согласие пациента на взятие дополнительных образцов биоматериала.
Критерии исключения:
• наличие симптомов манифестной инфекции в локусах взятия биоматериала (кишечник, верхние дыхательные пути, нижние дыхательные пути);
• ситуации, когда невозможно взять образец биоматериала из прямой кишки или взятие образца сопряжено с повышенным риском трав-матизации и/или выраженными болевыми ощущениями (новообразования заднего прохода и анального канала, анальные трещины и др.).
С 15.09.2022 г. по 31.12.2022 г. у всех пациентов, поступавших в стационар, получали образцы биоматериала из прямой кишки методом ректального мазка. Дополнительно у поступавших в отделения реанимации и интенсивной терапии брали биоматериал из верхних дыхательных путей (ВДП) методом орофарингеального мазка. Кроме того, у пациентов, которым на момент включения в исследование проводилась искусственная вентиляция легких (ИВЛ), брали образцы биоматериала из нижних дыхательных путей (НДП): эндотрахеаль-ный аспират или бронхоальвеолярный лаваж. Все
образцы получали в двойном экземпляре: в стерильные пробирки с тупферами для исследования методом полимеразной цепной реакции и в стерильные пробирки с тупферами, погруженными в транспортную среду Amyes, для культурального исследования.
Предварительный анализ первых полученных данных показал частоту догоспитального носитель-ства генов устойчивости среди пациентов выше ожидаемой. В связи с этим было принято решение расширить перечень оцениваемых локусов и исследовать распространенность носительства устойчивых к карбапенемам грамотрицательных бактерий и генов-детерминант резистентности в верхних дыхательных путях не только среди пациентов, госпитализированных в ОРИТ, но и среди пациентов, госпитализированных в отделения другого профиля. В результате с 01.01.2023 г. дизайн исследования был изменен, и парные образцы из ВДП с этого момента и до конца исследования брали у всех пациентов при поступлении в стационар вне зависимости от профиля отделения, куда осуществлялась госпитализация. Правила взятия образцов из других локусов не изменились.
С целью выявления генов, детерминирующих продукцию карбапенемаз, образцы биоматериала исследовали методом полимеразной цепной реакции с гибридизационно-флуоресцентной детекцией продуктов амплификации (ПЦР в реальном времени) на термоциклере CFX96 Touch (Biorad, США). Для тестирования применяли наборы реагентов АмплиСенс (ФБУН «ЦНИИ Эпидемиологии» Роспо-требнадзора):
1. АмплиСенс MDR A.b.-OXA-FL (для выявления OXA (Oxacillin-hydrolyzing class D ß-lactamase) карбапенемаз групп OXA-23-подобных, OXA-58-подобных и OXA-40-подобных (характерных для ацинетобак-теров) и генов-маркеров Acinetobacter baumannii (генов OXA-51-подобных карбапенемаз);
2. АмплиСенс MDR MBL-FL (для выявления генов приобретенных карбапенемаз класса металло-ß-лактамаз (МБЛ) групп VIM (Verona integron-encoded metallo-ß-lactamase), IMP (Imipenemase) и NDM (New-Delhi metallo-ß-lactamase);
3. АмплиСенс MDR KPC/OXA-48-FL (для выявления генов приобретенных карбапенемаз групп KPC (Klebsiella pneumoniae carbapenemase) и OXA-48-подобных.
Образец биоматериала, в котором был обнаружен один или более из исследуемых генов, расценивался как положительный.
Пациент считался носителем генов продукции карбапенемаз (далее - носитель генов, пациент с носительством генов), если один или более образец взятого у него биоматериала являлся положительным.
Параллельно с выявлением генов, детерминирующих продукцию карбапенемаз, проводили куль-туральное исследование - посев биоматериала на плотные питательные среды с последующим выде-
лением чистой культуры, идентификацией видовой принадлежности выделенных микроорганизмов и определением их чувствительности к антимикробным препаратам. Идентификацию выделенных микроорганизмов осуществляли с помощью метода времяпролетной масс-спектрометрии с ма-трично-активированной лазерной десорбцией/ ионизацией (MALDI-TOF MS) на аппарате MALDI Biotyper Microflex LT/SH (Bruker, Германия). Чувствительность к антибактериальным препаратам устанавливали только для грамотрицательных микроорганизмов. Определение чувствительности проводилось методом диск-диффузии в агар на среде Мюллер-Хинтон по Кирби-Бауэру. При дальнейшем анализе принимали во внимание только наличие или отсутствие чувствительности к карба-пенемам.
Интерпретация результатов определения чувствительности к антибиотикам проводилась в соответствии с актуальными на момент исследования критериями Европейского комитета по определению чувствительности к антимикробным препаратам (European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing, EUCAST) версии v12.0, v13.0, v13.1 [12]. Обновления версий EUCAST не касались критериев определения чувствительности к карбапе-немам и не могли повлиять на ход или результаты исследования.
Устойчивыми к карбапенемам считались изо-ляты, демонстрировавшие устойчивость к >1 антибиотику из группы [13].
Выделение в одном или более из исследуемых локусов изолятов грамотрицательных бактерий, устойчивых к карбапенемам, расценивали как колонизацию карбапенемрезистентными бактериями по результатам культурального исследования (далее - колонизация КР бактериями), соответственно пациент считался колонизованным карбапенемрезистентными бактериями.
Помимо чувствительности к антибактериальным препаратам определялась также продукция бета-лактамаз расширенного спектра (БЛРС) методом двойных дисков. Использовали диски, содержащие цефтазидим и цефотаксим, а также диски с клавулановой кислотой [14]. Сведения о продукции БЛРС фиксировали только для изолятов, у которых не было выявлено устойчивости к карбапе-немам.
Полученные сведения о носительстве генов карбапенемаз, колонизации КР или БЛРС никак не влияли на маршрутизацию или выбор дальнейшей тактики лечения пациентов.
На основании опубликованных результатов ранее проведенных исследований [15-22] и собственных данных мы предположили, что ряд факторов окружающей среды, некоторые сопутствующие заболевания и состояния, наличие инвазивных устройств до госпитализации, прием антибиотиков в течение последних 3 месяцев и потребность в интенсивной терапии на момент госпитализации
могут потенциально влиять на вероятность носи-тельства генов и/или колонизации карбапенемрезистентными бактериями (факторы риска). Выявление факторов риска проводили путем опроса пациента и/или родственников, а также анализа доступной медицинской документации. Кроме того, оценивали связь носительства и/или колонизации КР с возрастом и полом пациентов.
Статистический анализ проводили с использованием программы StatTech V. 4.1.5 (разработчик - ООО «Статтех», Россия). Количественные показатели оценивали на предмет соответствия нормальному распределению с помощью критерия Колмогорова-Смирнова. Категориальные данные описывались с указанием абсолютных значений (п) и процентных долей. Сравнение процентных долей при анализе многопольных таблиц сопряженности выполнялось с помощью критерия хи-квадрат Пирсона. В качестве количественной меры эффекта для сравнения относительных показателей использовали отношение шансов с 95% доверительным интервалом (ОШ; 95% ДИ). Для многофакторного анализа применяли метод логистической регрессии с использованием минимального критерия Акаике в качестве критерия отбора. Различия считали статистически значимыми при р < 0,05.
Результаты
В исследование были включены 733 пациента в возрасте от 18 до 94 лет (медиана 64 года). Женщин было больше, чем мужчин: 59,9% и 40,1% соответственно. Большинство пациентов, включенных в исследование, были госпитализированы в отделения онкохирургии, хирургии, реанимации и интенсивной терапии (ОРИТ), химиотерапии (табл. 1). Обращает на себя внимание преобладание пациентов, страдающих онкологическими заболеваниями, что обусловлено специализацией ММКЦ «Коммунарка» на оказании медицинской помощи пациентам со злокачественными новообразованиями различных локализаций.
Всего за период исследования было получено 1016 парных образцов биоматериала: 733 пары ректальных мазков, 253 пары образцов из ВДП и 30 пар образцов из НДП.
Носительство генов минимум в одном локусе было выявлено у 92 пациентов из 733 (12,6%). При этом у большинства носителей (71,0%) обнаруживался только один тип генов, однако у 15 пациентов (16,1%) были гены, детерминирующие два разных типа карбапенемаз, а у 12 пациентов (12,9%) были найдены от 3 до 6 разновидностей генов.
Колонизация грамотрицательными бактериями, устойчивыми к карбапенемам, была выявлена у 20 из 733 пациентов (2,7%), среди которых у трех -гены карбапенемаз обнаружены не были (рис. 1).
У большинства пациентов единственным локу-сом носительства генов была прямая кишка, однако были выявлены случаи носительства в ВДП, НДП, а также мультилокусное носительство (рис. 2).
Таблица 1. Общая характеристика пациентов. Table 1. General characteristics of patients
Показатели Indicators Категории Categories n %*
Пол Женский Female 439 59,9
Gender Мужской Male 294 40,1
ОРИТ ICU 114 15,6
Хирургия Surgery 170 23,1
Профиль отделения Онкохирургия Oncosurgery 269 36,7
Department profile Гематология Hematology 33 4,5
Терапия Therapy 57 7,6
Химиотерапия Chemotherapy 94 12,6
Примечания: * процент рассчитан от общего числа включенных пациентов. ОРИТ - отделение реанимации и интенсивной терапии. Notes: * Percentage calculated from the total number of included patients. ICU - Intensive Care Unit.
Обращает на себя внимание факт, что из шести случаев выявления генов более чем в одном локу-се лишь в двух обнаружилось полное совпадение: у одного пациента в ректальном и орофарингеаль-ном мазках был обнаружен ген ЫаКРС, у другого -Ь1аОХА48. У троих пациентов в ректальном и оро-фарингеальном мазках были идентифицированы разные типы генов, характерных для Аапе^Ьа^ег
ЬаитаппИ [23], то есть выявлено совпадение видовой принадлежности. У одного пациента было полное несовпадение: в ректальном мазке - ген Ь^1М, а в образце из ВДП - Ь1аОХА58.
Носительство генов в прямой кишке выявлено у 72 пациентов, при этом лишь у 13 из них (18,1%) была выявлена колонизация прямой кишки бактериями, устойчивыми к карбапенемам. Из 72 пациентов с носительством генов карбапенемаз в прямой кишке у 42 (58,3%) были идентифицированы гены, характерные для представителей порядка ЕтеюЬасгега^: ЫаКРС, Ь1аОХА48 и blaNDM. Однако устойчивые к карбапенемам энтеробакте-рии были обнаружены только у 11 из них (26,2%). Гены Ь1аОХА23 Ь1аОХА58 Ь1а0ХА40 и Ь1аОХА51, характерные для Аапе^Ьа^ег ЬаитаппИ, были выделены из ректальных мазков в 27 случаях, в то время как культуральным методом АстейЬайег ЬаитаппП в этом локусе был обнаружен лишь в 6 случаях, и только один из них был устойчив к карбапенемам.
Аналогичная ситуация обнаружилась при анализе соответствия носительства генов карбапене-маз и колонизации устойчивыми к карбапенемам грамотрицательными организмами в верхних дыхательных путях. Гены карбапенемаз были обнаружены в 30 образцах из ВДП, в то время как резистентные грамотрицательные бактерии были идентифицированы только в 11 образцах, и лишь в 6 случаях была выявлена устойчивость к кар-бапенемам. Энтеробактерии были выделены из биоматериала от 6 из 11 пациентов с носитель-ством генов резистентности, характерных для Enterobacterales, при этом у 5 из них выявлена устойчивость к карбапенемам. Интересно, что
Рисунок 1. Соотношение носительства генов устойчивости к карбапенемам и колонизации карбапенемрезистентными бактериями
Figure 1. The ratio of carriage of carbapenem resistance genes to colonization by carbapenem-resistant bacteria
Рисунок 2. Локусы выделения генов карбапенемаз Figure 2. Loci of carbapenemase gene detection
лишь у одного пациента в образце биоматериала из ВДП был идентифицирован Acinetobacter baumannii, в то время как гены, характерные для этого вида микроорганизмов [23], были обнаружены в 21 образце.
В НДП гены карбапенемаз были обнаружены у 7 пациентов, из них у троих были выявлены карбапенемрезистентные микроорганизмы: в двух образцах Klebsiella pneumoniae и в одном -Pseudomonas aeruginosa.
В таблицах 2, 3 и 4 представлены сводные данные о выявленных генах, а также о выделенных грамотрицательных микроорганизмах в ректальных, орофарингеальных мазках и образцах биоматериала из НДП пациентов, у которых зафиксированы носительство генов карбапенемаз и/или колонизация КР.
Как минимум один из оцениваемых факторов риска выявили у 87,6% пациентов, однако у 5 из 95 (5,3%) пациентов с выявленным носительством генов и/или колонизацией КР не обнаружилось ни одного фактора риска (табл. 5).
В дальнейшем из анализа были исключены те факторы риска, которые встречались менее чем у 1% пациентов: пребывание в учреждениях длительного ухода, зарубежные поездки, программный диализ, прием глюкокортикоидов и генно-инженерных биологических препаратов по поводу COVID-19, а также предшествующая терапия эрта-пенемом, ингибитор-защищенными цефалоспори-
нами, аминогликозидами, тигециклином, колисти-ном и полимиксином В.
Мы оценивали связь между наличием факторов риска и носительством генов и/или колонизацией КР. По итогам анализа был выявлен ряд факторов риска носительства и колонизации карбапенем-резистентными грамотрицательными бактериями. Однако после проведения дополнительного анализа методом логистической регрессии с использованием минимального критерия Акаике в качестве критерия отбора статистическая значимость скорректированных отношений шансов сохранилась лишь для пяти предикторов (табл. 6).
Обсуждение
Антибиотики группы карбапенемов до настоящего времени широко применяются в стационарах для лечения тяжелых инфекций, вызванных грамотрицательными бактериями. В последние 10-15 лет обоснованное беспокойство вызывает чрезвычайный рост устойчивости нозокомиаль-ных возбудителей к карбапенемам и выход анти-биотикорезистентности за пределы стационаров. Литературные данные о распространенности внегоспитальной колонизации карбапенемрези-стентными микроорганизмами противоречивы, а внебольничное носительство генов, кодирующих продукцию карбапенемаз, рассматривается лишь в единичных работах [24]. Частота обнаружения устойчивых микроорганизмов во внебольничной
Practical Aspects of Epidemiology and Vaccine Prevention
Таблица 2. Гены карбапенемаз и грамотрицательные микроорганизмы, обнаруженные в ректальных мазках пациентов
Table 2. Carbapenemase genes and gram-negative microorganisms detected in rectal swabs of patients
Пациент Patient Возраст Age Пол Gender Профиль Profile Число локусов носительства Number of carrier loci KPC IMP OXA-48 NDM VIM OXA-23-like OXA-58-like e ik -l о - XA- O OXA-51-like A. baumannii K. pneumoniae P. aeruginosa E. coli P. mirabilis M. morgannii P. stuartii др. Enterobacterales
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
ANN 73 муж М онкохирургия oncosurgery 1 - - - - - - + - - - - - + - - - -
ASM 56 муж М ОРИТ ICU 1 - - + - - - - - - - - - - - - - -
ASM 74 муж М ОРИТ ICU 3 + - + + КР CR - + БЛРС ESBL - - -
BGA 30 муж М ОРИТ ICU 1 - - - - - - + - - - - - - - - - -
BVA 55 муж М онкохирургия oncosurgery 1 - - + - - - - - - - + - БЛРС ESBL - - - +
BVSh 65 муж М ОРИТ ICU 2 + - - - - - - + - КР CR - - БЛРС ESBL - - - -
BYuA 35 жен F ОРИТ ICU 1 - - - + - - - - - - КР CR - + - - КР CR -
BZN 57 жен F терапия therapy 1 + - + + - + - - + - КР CR - КР CR КР CR - - -
ChNV 42 жен F ОРИТ ICU 1 - - - - + - - - - - - - + - - - -
DLK 87 жен F онкохирургия oncosurgery 2 - - - - + - - - - - - - + - - - -
DLN 69 жен F онкохирургия oncosurgery 1 - - + - - - - - - - - - + - + - -
DMK 45 жен F онкохирургия oncosurgery 1 - - - - + - - - - - - - + - - - -
DSV 49 жен F хирургия surgery 1 - - - + - - - - - - - - + - - - -
DTV 63 жен F терапия therapy 1 - - + - - - - - - - + - + - - - -
FEA 61 жен F ОРИТ ICU 1 + - + + - - - - - - - - + - - - -
FEV 48 жен F терапия therapy 1 - - - - - - - - + - - - + - - - -
FLI 85 муж М ОРИТ ICU 2 - - - - - - + - - - - - + - - - +
FVA 69 муж М гематология hematology 1 - - - - - - - - - - + - КР CR - - - -
GMK 61 жен F онкохирургия oncosurgery 1 - - - - - - - - - - КР CR - + - - - -
GOL 48 муж М ОРИТ ICU 1 - - + - - - - - - - - - + - - - -
Practical Aspects of Epidemiology and Vaccine Prevention
Таблица 2. Продолжение Table 2. Continuation
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
GSI 57 муж М ОРИТ ICU 2 - - + - - - - - - - - КР CR - - - - -
GTA 67 жен F хирургия surgery 1 - - + + - - - - - - - - + - - - -
GVA 62 муж М онкохирургия oncosurgery 1 - - - + - - - - - - - - + - - - -
KAA 59 муж М гематология hematology 1 - - + - - - - - - - + - - - - - +
KAM 58 жен F ОРИТ ICU 2 - - - + - + - + + - КР CR - БЛРС ESBL - - КР CR -
KAYu 64 жен F ОРИТ ICU 1 - - - - - - - - + - + - + - - - -
KMM 61 жен F терапия therapy 1 - - - - - - + - - - - - + - - - -
KNA 60 муж М онкохирургия oncosurgery 1 - - - + - - - - + - - - БЛРС ESBL - - - -
KOV 64 муж М химиотерапия chemotherapy 1 + - + + - - - - - - БЛРС ESBL - + - - - -
KSM 69 муж М ОРИТ ICU 1 - - + + + БЛРС ESBL - - -
LLR 81 жен F онкохирургия oncosurgery 1 - - - - - - + - - - + - БЛРС ESBL - - - БЛРС ESBL
LNA 23 жен F ОРИТ ICU 2 + КР CR
LSA 56 муж М онкохирургия oncosurgery 1 - - - - - - + - - - - - + - - - -
LSI 75 муж М химиотерапия chemotherapy 1 + - + - - - - - - - - - + - - - БЛРС ESBL
LSYu 57 муж М ОРИТ ICU 1 - - - - - - - + - - - - БЛРС ESBL - - - -
LVI 67 муж М онкохирургия oncosurgery 1 - - - - - - + - - - - - - - - - -
MAN 46 муж М ОРИТ ICU 2 - - - - - - - - + - - - + - - - -
MGD 22 жен F ОРИТ ICU 1 - - - + - - - - - - - - - - - - -
MIYu 53 жен F ОРИТ ICU 1 - - + - - - - - - - - - + + - - +
MSA 59 муж М ОРИТ ICU 1 - - - - - - - + - - - - + - - - -
MSV 62 муж М химиотерапия chemotherapy 1 + - - - - - - - - - + - + - - - -
NAG 71 муж М ОРИТ ICU 1 - - - + - - - - + - - - - - - - -
OAM 74 жен F онкохирургия oncosurgery 1 - - - + - - - - - - - - + - - - -
OPA 54 муж М химиотерапия chemotherapy 1 - - + - - - - - - - + - + - - - -
OVA 68 муж М хирургия surgery 1 - - - - + - - - - - - - + - - - -
OVP 63 жен F ОРИТ ICU 1 - - + + КР CR КР CR
Practical Aspects of Epidemiology and Vaccine Prevention
Таблица 2. Продолжение Table 2. Continuation
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
PAI 54 жен F онкохирургия oncosurgery 1 - - - - + - - - - - - - + - - - -
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
PDA 47 муж М ОРИТ ICU 1 - - - + - - - - - - - - - - - - -
PNP 74 жен F онкохирургия oncosurgery 1 - - - - - - + - - - - - + - - - -
PPA 70 муж М химиотерапия chemotherapy 1 - - + - - - - - - - - - + - - - -
PSV 64 муж М онкохирургия oncosurgery 1 - - + + - - - - - - - - + - - - -
RVA 67 муж М хирургия surgery 1 - - - - - - - + - - + - + - - - -
ShAN 61 муж М онкохирургия oncosurgery 1 - - + - + - - - - - + - + + - - -
ShBG 69 муж М онкохирургия oncosurgery 1 - - - - + - - - - - - + - - - - -
SIA 60 жен F хирургия surgery 1 - - - - + - - - - - - - + - - - -
SIV 47 жен F терапия therapy 1 - - - - - - - + - - + - + - - - -
SIYu 47 муж М ОРИТ ICU 2 + КР CR
SMI 81 муж М онкохирургия oncosurgery 1 - - - - - - - - + - - - + - - - -
SNA 63 муж М химиотерапия chemotherapy 1 - - - - + - - - - - - - + - - - -
SNV 85 жен F ОРИТ ICU 2 - - + + БЛРС ESBL
STK 81 жен F терапия therapy 1 - - - - - + - - - - - - - - - - -
SVF 72 муж М ОРИТ ICU 1 + - - - - - - - - - БЛРС ESBL - КР CR - - - -
SVV 72 муж М ОРИТ ICU 2 - - + - - - - - - - - - - - - - БЛРС ESBL
SZV 65 жен F ОРИТ ICU 2 + - - - - - - - - - - - + - + - -
TsAN 65 муж М ОРИТ ICU 2 + - + + КР CR
TVA 65 муж М терапия therapy 1 - - - - - - + - - - - - БЛРС ESBL - - - -
VDS 37 муж М ОРИТ ICU 3 + - + КР CR
VEM 74 жен F онкохирургия oncosurgery 2 - - - - - + - - - - - - + - - - -
VLV 73 жен F химиотерапия chemotherapy 1 - - + + - - - - - - + - БЛРС ESBL - - - -
VLV 73 жен F химиотерапия chemotherapy 1 - - + + - - - - - - - - + - - - -
ZhSV 35 муж М ОРИТ ICU 1 - - - - - - + - - - - - + - - - -
Таблица 2. Продолжение Table 2. Continuation
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
ZhSV 64 муж М онкохирургия oncosurgery 1 - - - - - + - - - - - - + - - - +
ZIA 67 жен F хирургия surgery 1 - - + - - - - - - - + - КР CR - - - -
ZTN 70 жен F онкохирургия oncosurgery 1 - - - - - - + - - - - - БЛРС ESBL - - - -
FVA 69 муж М гематология hematology 1 - - - - - - - - - - + - КР CR - - - -
Примечание: муж. - мужской, жен. - женский; ОРИТ - отделение реанимации и интенсивной терапии; «-» - указанный ген или микроорганизм не обнаружен; «+» - указанный ген или микроорганизм обнаружен; БЛРС - указанный микроорганизм обнаружен и выявлена продукция бета-лактамаз расширенного спектра; КР - указанный микроорганизм обнаружен, и обладает устойчивостью к >1 из протестированных карбапенемов.
Note: M - Male; F - Female, ICU - Intensive Care Unit; «-« - the specified gene or microorganism was not detected; «+» - the specified gene or microorganism was detected; ESBL - the specified microorganism was detected and extended-spectrum beta-lactamase production was identified; CR - the specified microorganism was detected and is resistant to >1 of the tested carbapenems.
Таблица 3. Гены карбапенемаз и грамотрицательные микроорганизмы, обнаруженные в орофарингеальных мазках пациентов.
Table 3. Carbapenemase genes and gram-negative microorganisms detected in oropharyngeal swabs of patients.
Пациент Patient Возраст Age Пол Gender Профиль Profile Число локусов Number of loci KPC IMP OXA-48 NDM VIM OXA-23-like OXA-58-like J 1 о 4 1 § OXA-51-like A. baumannii K. pneumoniae P. aeruginosa E. coli P. mirabilis M. morgannii P. stuartii др. Enterobacterales
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
ASM 56 муж М ОРИТ ICU 2 - - - - - - - - - - КР CR - + - - - -
ASM 74 муж М ОРИТ ICU 3 + + + + + - - + - - КР CR - - - - - -
BVF 79 муж М ОРИТ ICU 1 - - - - - - + - - - - - БЛРС ESBL - - - -
BVSh 65 муж М ОРИТ ICU 2 + КР CR +
DAV 32 муж М ОРИТ ICU 1 + - + - - + - - - - КР CR - - - - - -
DLK 87 жен F онкохирургия oncosurgery 2 - - - - - - + - - - - - - - - - -
DVV 51 муж М онкохирургия oncosurgery 1 - - - + - - - - - - - - - - - - -
ESA 66 муж М ОРИТ ICU 1 - - - - - - - - + - - - - - - - -
EVYa 70 муж М онкохирургия oncosurgery 1 - - + - - - - - - - - - - - - - -
FLI 85 муж М ОРИТ ICU 2 + + +
GEV 56 жен F терапия therapy 1 - - - - - - - - + - - - - - - - -
GSI 57 муж М ОРИТ ICU 2 КР CR
KAM 58 жен F ОРИТ ICU 2 - - - - - + - - + КР CR - - + - - - -
Practical Aspects of Epidemiology and Vaccine Prevention
Таблица 3. Продолжение Table 3. Continuation
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
KBI
88
муж М
онкохирургия oncosurgery
KIN
55
жен F
терапия therapy
БЛРС ESBL
LNA
23
жен F
ОРИТ ICU
КР CR
LNV
36
жен F
ОРИТ ICU
БЛРС ESBL
LNV
70
жен F
онкохирургия oncosurgery
LSA
56
муж М
онкохирургия oncosurgery
LVV
59
муж М
онкохирургия oncosurgery
MAD
70
муж М
ОРИТ ICU
КР
CR
MAN
46
муж М
ОРИТ ICU
MIYu
53
жен F
ОРИТ ICU
КР
CR
MLS
83
жен F
ОРИТ ICU
SAD
41
муж М
ОРИТ ICU
БЛРС ESBL
ShchAF
72
муж М
терапия therapy
SNP
69
муж М
ОРИТ ICU
SNV
85
жен F
ОРИТ ICU
КР CR
SVF
72
муж М
ОРИТ ICU
КР CR
SVV
72
муж М
ОРИТ ICU
БЛРС ESBL
SZV
65
жен F
ОРИТ ICU
TsAM
33
муж М
ОРИТ ICU
TsAN
65
муж М
ОРИТ ICU
VDS
37
муж М
ОРИТ ICU
КР CR
VEM
74
жен F
онкохирургия oncosurgery
VYuV
63
муж М
онкохирургия oncosurgery
Примечание: муж. - мужской, жен. - женский; ОРИТ - отделение реанимации и интенсивной терапии; «-» - указанный ген или микроорганизм не обнаружен; «+» - указанный ген или микроорганизм обнаружен; БЛРС - указанный микроорганизм обнаружен и выявлена продукция бета-лактамаз расширенного спектра; КР - указанный микроорганизм обнаружен, и обладает устойчивостью к >1 из протестированных карбапенемов.
Note: M - Male; F - Female, ICU - Intensive Care Unit; «-« - the specified gene or microorganism was not detected; «+» - the specified gene or microorganism was detected; ESBL - the specified microorganism was detected and extended-spectrum beta-lactamase production was identified; CR - the specified microorganism was detected and is resistant to >1 of the tested carbapenems.
1
2
3
4
5
6
7
8
9
+
+
+
3
+
+
+
+
2
+
2
+
+
+
+
2
+
+
+
2
2
+
2
+
+
+
2
+
3
+
+
+
2
+
+
Таблица 4. Гены карбапенемаз и грамотрицательные микроорганизмы, обнаруженные в образцах из нижних дыхательных путей пациентов
Table 4. Carbapenemase genes and gram-negative microorganisms detected in lower respiratory tract samples of patients
Пациент Patient Возраст Age Пол Gender Профиль Profile Число локусов Number of loci KPC IMP OXA-48 NDM VIM OXA-23-like OXA-58-like J 1 о 4 - XA- O OXA-51-like A. baumannii K. pneumoniae P. aeruginosa E. coli P. mirabilis M. morgannii P. stuartii др. Enterobacterales
ADA 51 муж M ОРИТ 1 - - - - - - + - - - - - - - - - -
ASM 74 муж M ОРИТ 3 + КР CR
GSI 57 муж M ОРИТ 2 - - + - - - - - - - - КР CR - - - - -
LNA 23 жен F ОРИТ 3 - - - - - - - + - - - - - - - - -
PVYu 28 муж M ОРИТ 1 +
SIYu 47 муж M ОРИТ 2 - - + - - + - + +
VDS 37 муж M ОРИТ 3 + - + - - - - + - - КР CR - - - - - -
Примечание: муж. - мужской, жен. - женский; ОРИТ - отделение реанимации и интенсивной терапии; «-» - указанный ген или микроорганизм не обнаружен; «+» - указанный ген или микроорганизм обнаружен; БЛРС - указанный микроорганизм обнаружен и выявлена продукция бета-лактамаз расширенного спектра; КР - указанный микроорганизм обнаружен и обладает устойчивостью к >1 из протестированных карбапенемов.
Note: M - Male; F - Female, ICU - Intensive Care Unit; «-» - the specified gene or microorganism was not detected; «+» - the specified gene or microorganism was detected; ESBL - the specified microorganism was detected and extended-spectrum beta-lactamase production was identified; CR - the specified microorganism was detected and is resistant to >1 of the tested carbapenems.
Таблица 5. Частота выявления факторов риска Table 5. Frequency of risk factor detection
Число пациентов Number of patients 95% ДИ 95% CI
n %
Факторы окружающей среды Environmental factors
Профиль отделения госпитализации Hospitalization department profile линейные отделения linear departments 619 84,4 81,6-87,0
ОРИТ ICU 114 15,6 13,0-18,4
Перевод из другого стационара Transfer from another hospital нет no 725 98,9 97,9-99,5
да yes 8 1,1 0,5-2,1
Предшествующие госпитализации в последние 3 месяца Previous hospitalizations in the last 3 months нет no 427 58,3 54,6-61,9
да yes 306 41,7 38,1-45,4
Пребывание в учреждениях длительного ухода Stay in long-term care facilities нет no 729 99,5 98,6-99,9
да yes 4 0,5 0,1-1,4
Practical Aspects of Epidemiology and Vaccine Prevention
Таблица 5. Продолжение Table 5. Continuation
Число пациентов Number of patients 95% ДИ 95% С
n %
Зарубежные поездки Foreign travel не выезжал за рубеж did not travel abroad 720 98,2 97,0-99,1
выезжал в последний месяц traveled in the last month 2 0,3 0,0-1,0
выезжал в последние 2 месяца traveled in the last 2 months 5 0,7 0,2-1,6
выезжал в последние 3 месяца traveled in the last 3 months 6 0,8 0,3-1,8
Медицинский работник Healthcare worker нет no 719 98,1 96,8-99,0
да yes 14 1,9 1,0-3,2
Эндоскопические исследования в последние 3 месяца Endoscopic examinations in the last 3 months нет no 394 53,8 50,1-57,4
да yes 339 46,2 42,6-49,9
Лечение в дневном стационаре в последние 3 мес Day hospital treatment in the last 3 months нет no 632 86,2 83,5-88,6
да yes 101 13,8 11,4-16,5
Сопутствующие заболевания или состояния Comorbidities or conditions
Длительный прием глюкокортикостероидов Long-term use of glucocorticosteroids нет no 702 95,8 94,1-97,1
да yes 31 4,2 2,9-5,9
Прием цитостатиков Use of cytostatics нет no 723 98,6 97,5-99,3
да yes 10 1,4 0,7-2,5
Противоопухолевая химиотерапия Anticancer chemotherapy нет no 540 73,7 70,3-76,8
да yes 193 26,3 23,2-29,7
Онкологические заболевания Oncological diseases нет no 307 41,9 38,3-45,5
да yes 426 58,1 54,5-61,7
Сахарный диабет Diabetes mellitus нет no 669 91,3 89,0-93,2
да yes 64 8,7 6,8-11,0
ХОБЛ/ астма COPD/asthma нет no 700 95,5 93,7-96,9
да yes 33 4,5 3,1-6,3
ХСН CHF нет no 668 91,1 88,8-93,1
да yes 65 8,9 6,9-11,2
Practical Aspects of Epidemiology and Vaccine Prevention
Таблица 5. Продолжение Table 5. Continuation
Число пациентов Number of patients 95% ДИ 95% с
n %
Гепатит/ цирроз Hepatitis/cirrhosis нет no 716 97,7 96,3-98,6
да yes 17 2,3 1,4-3,7
ХБП CKD нет no 702 95,8 94,1-97,1
да yes 31 4,2 2,9-5,9
Программный диализ Scheduled dialysis нет no 732 99,9 99,2-100,0
да yes 1 0,1 0,0-0,8
Хроническая алкогольная интоксикация Chronic alcohol intoxication нет no 715 97,5 96,1-98,5
да yes 18 2,5 1,5-3,9
Эпизод COVID-19 в последние 3 мес. Episode of COVID-19 in the last 3 months нет no 699 95,4 93,6-96,8
да yes 34 4,6 3,2-6,4
Прием глюкокортикостероидов по поводу COVID-19 Use of glucocorticosteroids for COVID-19 нет no 729 99,5 98,6-99,9
да yes 4 0,5 0,1-1,4
Противовирусная терапия COVID-19 Antiviral therapy for COVID-19 нет no 713 97,3 95,8-98,3
да yes 20 2,7 1,7-4,2
Терапия COVID-19 генно-инженерными биологическими препаратами (ГИБП) COVID-19 therapy with genetically engineered biological drugs (GEBD) не получал did not receive 731 99,7 99,0-100,0
один препарат one medication 1 0,1 0,0-0,8
комбинированная терапия ГИБП combination therapy with GEBD 1 0,1 0,0-0,8
Наличие инвазивных устройств до госпитализации Presence of invasive devices before hospitalization
Уретральный катетер Urethral catheter нет no 694 94,7 92,8-96,2
да yes 39 5,3 3,8-7,2
Сосудистый катетер Vascular catheter нет no 597 81,4 78,4-84,2
да yes 136 18,6 15,8-21,6
Другие инвазивные устройства (катетеры, дренажи и др.) Other invasive devices (catheters, drains, etc.) нет no 711 97,0 95,5-98,1
да yes 22 3,0 1,9-4,5
Practical Aspects of Epidemiology and Vaccine Prevention
Таблица 5. Продолжение Table 5. Continuation
Число пациентов Number of patients 95% ДИ 95% CI
n %
Прием антибиотиков в последние 3 месяца Use of antibiotics in the last 3 months
Прием любых антибиотиков нет no 607 82,8 79,9-85,5
Use of any antibiotics да yes 126 17,2 14,5-20,1
Ингибитор-защищенные аминопенициллины Inhibitor-protected aminopenicillins нет no 700 95,5 93,7-96,9
да yes 33 4,5 3,1-6,3
Цефалоспорины III—IV поколений нет no 719 98,1 96,8-99,0
3rd-4th generation cephalosporins да yes 14 1,9 1,0-3,2
Фтохинолоны нет no 713 97,3 95,8-98,3
Fluoroquinolones да yes 20 2,7 1,7-4,2
Ингибитор-защищенные цефлоспорины Inhibitor-protected cephalosporins нет no 728 99,3 98,4-99,8
да yes 5 0,7 0,2-1,6
Эртапенем нет no 731 99,7 99,0-100,0
Ertapenem да yes 2 0,3 0,0-1,0
Антисинегнойные карбапенемы нет no 726 99,0 98,0-99,6
Antipseudomonal carbapenems да yes 7 1,0 0,4-2,0
Аминогликозиды нет no 730 99,6 98,8-99,9
Aminoglycosides да yes 3 0,4 0,1-1,2
Тигециклин нет no 732 99,9 99,2-100,0
Tigecycline да yes 1 0,1 0,0-0,8
Колистин нет no 732 99,9 99,2-100,0
Colistin да yes 1 0,1 0,0-0,8
Полимиксин В нет no 732 99,9 99,2-100,0
Polymyxin B да yes 1 0,1 0,0-0,8
Другие антибиотики нет no 664 90,6 88,2-92,6
Other antibiotics да yes 69 9,4 7,4-11,8
Таблица 5. Продолжение Table 5. Continuation
Число пациентов Number of patients 95% ДИ 95% С!
n %
Потребность в интенсивной терапии на момент госпитализации Need for intensive care at the time of hospitalization
¡Ï нет no 690 94,1 92,2-95,7
да yes 43 5,9 4,3-7,8
Респираторная терапия Respiratory therapy нет no 668 91,1 88,8-93,1
О2 низкий поток low-flow oxygen 17 2,3 1,4-3,7
О2 высокий поток high-flow oxygen 5 0,7 0,2-1,6
ИВЛ MV 43 5,9 4,3-7,8
Вазопрессорная терапия Vasopressor therapy нет no 704 96,0 94,4-97,3
да yes 29 4,0 2,7-5,6
Примечание: ДИ - доверительный интервал, ОРИТ - отделение реанимации и интенсивной терапии, ХОБЛ - хроническая обструктивная болезнь легких, ХСН - хроническая сердечная недостаточность, ХБП - хроническая болезнь почек, ГИБП - генно-инженерные биологические препараты, ИВЛ - искусственная вентиляция легких.
Note: CI - confidence interval, ICU - Intensive Care Unit, COPD - chronic obstructive pulmonary disease, CHF - chronic heart failure, CKD - chronic kidney disease, GEBD - genetically engineered biological drugs, MV - mechanical ventilation.
среде в значительной мере зависит от географических и социально-экономических особенностей стран и периода выполнения исследования. Авторы некоторых достаточно масштабных работ не обнаружили носительства карбапенемрезистентных микроорганизмов во внегоспитальных условиях [25-29]. В других публикациях сообщается о колебаниях распространенности внебольничного носительства в пределах от 0,04% в Австралии [30] до 21,3-29,5% в остальных странах Азиатско-Тихоокеанского региона [31,32], в США в 2008 -2013 гг. - от 5,6 до 10,8% [33-36]. Авторы работ, выполненных в странах Юго-Восточной Азии в более поздний период, отметили частоту колонизации устойчивыми к карбапенемам микроорганизмами около 7%, однако в эти исследования включали только пациентов с заболеваниями гепато-билиар-ной системы [37,38].
В ходе настоящего исследования мы обнаружили догоспитальное носительство генов карбапе-немрезистентности у 92 пациентов (12,6%), а колонизацию нечувствительными к карбапенемам возбудителями - лишь у 20 (2,7%). Примечательно, что у 75 носителей генов, кодирующих синтез карбапенемаз, мы не выявили колонизацию кар-бапенеморезистентными микроорганизмами ни в одном из исследуемых локусов. Указанное несовпадение вероятно обусловлено большей чувствительностью молекулярно-генетических методов
по сравнению с культуральными. Кроме того, при низкой экспрессии генов карбапенемаз устойчивость к карбапенемам не всегда проявляется фе-нотипически. Тем не менее, с позиций клинической медицины выявление нуклеиновых кислот методом ПЦР может служить эквивалентом обнаружения возбудителя в биоматериале. Зарубежные авторы отметили улучшение результатов лечения тяжелых бактериальных инфекций при условии раннего выявления генетических детерминант резистентности в биоматериале и своевременного назначения адекватной антимикробной терапии по сравнению с традиционной тактикой, предусматривающей коррекцию схем эмпирической терапии в соответствии с чувствительностью выделенных куль-туральным методом микроорганизмов [39]. Протоколы ранней диагностики инфекций, вызванных полирезистентными микроорганизмами, требуют дальнейшей валидации на большом клиническом материале и, в случае получения положительных результатов, внедрения в повседневную практику отечественных стационаров.
Вместе с тем, у трех колонизированных карбапе-немрезистентными микроорганизмами пациентов мы не обнаружили носительства генов, кодирующих синтез карбапенемаз. Этот факт может быть связан, во-первых, с лимитированным набором генетических детерминант резистентности, которые определяли в ходе нашего исследования. К ограничениям
Таблица 6. Характеристики связи предикторов носительством генов карбапенемаз и/или колонизацией карбапенемрезистентными грамотрицательными бактериями
Table 6. Characteristics of the association between predictors and carriage of carbapenemase genes and/or colonization with carbapenem-resistant gram-negative bacteria
Предикторы Predictors НОШ; 95% ДИ UOR, 95% CI p СОШ, 95% ДИ AOR, 95% CI p
Пол: мужской Gender: Male 2,538, 1,634-3,943 < 0,001* 2,127, 1,275- 3,550 0,004*
Профиль: ОРИТ Profile: ICU 5,877, 3,658-9,440 < 0,001* 1,760, 0,712-4,354 0,221
Перевод из другого стационара Transfer from another hospital 21,439, 4,263-107,878 < 0,001* 7,076, 1,074-46,665 0,042*
Прием цитостатиков Use of cytostatics 7,034, 1,998-24,779 0,002* 7,804, 1,495-40,731 0,015*
Наличие ХСН Presence of CHF 2,679, 1,468-4,889 0,001* 1,746, 0,789-3,869 0,169
Наличие ХБП Presence of CKD 3,457, 1,575-7,591 0,002* 1,949, 0,745-5,104 0,174
Наличие хронической алкогольной интоксикации Presence of chronic alcohol intoxication 3,517, 1,288-9,602 0,014* 2,016, 0,525-7,745 0,307
Наличие уретрального катетера Presence of urethral catheter 6,103, 3,105-11,989 < 0,001* 1,691, 0,536-5,339 0,37
Наличие сосудистого катетера Presence of vascular catheter 1,927, 1,179-3,149 0,009* 0,741, 0,334-1,649 0,463
Наличие других инвазивных устройств (катетеры, дренажи и др.) Presence of other invasive devices (catheters, drains, etc.) 4,098, 1,670-10,054 0,002* 0,893, 0,267-2,986 0,855
ИВЛ MV 8,854, 4,646-16,878 < 0,001* 2,402, 0,803-7,185 0,117
Потребность в вазопрессорной терапии Need for vasopressor therapy 15,701, 7,043-35,023 < 0,001* 4,685, 1,432-15,333 0,011*
Прием любых антибиотиков в последние 3 мес. Use of any antibiotics in the last 3 months 2,162, 1,318-3,547 0,002* 2,137, 1,170-3,904 0,014*
Примечание: НОШ - нескорректированное отношение шансов, СОШ - скорректированное отношение шансов, ДИ - доверительный интервал, ОРИТ - отделение реанимации и интенсивной терапии, ХСН - хроническая сердечная недостаточность, ХБП - хроническая болезнь почек, ИВЛ - искусственная вентиляция легких.
Note: UOR - unadjusted odds ratio, AOR - adjusted odds ratio, CI - confidence interval, ICU - Intensive Care Unit, CHF - chronic heart failure, CKD - chronic kidney disease, MV - mechanical ventilation.
нашей работы можно отнести отсутствие возможности выявления генов, кодирующих синтез сериновой карбапенемазы GES-5, которая в ряде случаев может быть ответственна за резистентность грамотри-цательных возбудителей к карбапенемам [40]. Во-вторых, резистентность к карбапенемам могла быть обусловлена неферментативными механизмами, то есть не связанными с продукцией карбапенемаз, например, с активным эффлюксом антибиотиков из микробной клетки или нарушением проницаемости наружной мембраны, вызванной дефектами пори-новых белков.
Мы выявили колонизацию устойчивыми к карбапенемам микроорганизмами у 2,7% поступивших в стационар пациентов, что соответствует данным, полученным в странах Европы [41,42]. Наиболее часто мы сталкивались с колонизацией карбапе-немрезистентными энтеробактериями (24 пациента), значительно реже выявляли колонизацию
A. baumannii (5 пациентов) и P. aeruginosa (4 пациента). Подобную диспропорцию отмечали и другие исследователи [43,44]. Такая микробная структура колонизации существенно отличается от наблюдаемой в условиях стационара и особенно ОРИТ у пациентов с развившимися инфекционными процессами, где этиологическая роль энтеробактерий и неферментирующих грамотрицательных возбудителей в целом сопоставима [45]. Наше наблюдение позволяет предположить, что нозокомиальное инфицирование карбапенеморезистентными энтеробактериями чаще происходит из эндогенного, а псевдомонадами и ацинетобактериями - из экзогенного источника.
В последнее десятилетие зарубежными авторами был опубликован ряд исследований, направленных на выявление факторов риска внебольничной колонизации полирезистентными микроорганизмами [15,18,19,22,37,38,46-49], причем большая
часть работ была посвящена предикторам колонизации энтеробактериями, устойчивыми к незащищенным цефалоспоринам. Нам удалось обнаружить единственную отечественную работу, в ходе которой определяли факторы риска колонизации продуцентами БЛРС у пациентов онкогематологи-ческого профиля [50]. Факторы риска внегоспи-тальной колонизации карбапенемрезистентными микроорганизмами, насколько нам известно, отечественными учеными не исследовались.
Выполненный нами многофакторный анализ выявил, что одним из предикторов внебольничной колонизации карбапенемрезистентными бактериями является мужской пол. К такому же выводу пришли авторы наиболее крупных систематических обзоров [19,44]. Можно предположить, что гендерные различия в частоте выявления колонизации связаны с большей распространенностью в мужской популяции заболеваний сердечно-сосудистой системы, язвенной болезни и, в особенности, ХОБЛ, приводящей к интенсивному контакту с медицинскими организациями и необходимости в антибиотикотерапии.
Мы установили, что перевод из другого стационара является независимым фактором риска колонизации устойчивыми к карбапенемам возбудителями. Следует отметить, что обнаружение у переведенных пациентов генетических детерминант резистентности или колонизации антибио-тикоустойчивых микроорганизмов можно лишь условно рассматривать как проявление внебольничной колонизации,поскольку последняя, вероятнее всего, связана с пребыванием в предыдущем стационаре. На связь колонизации карбапенемре-зистентными возбудителями и недавней госпитализации указывают также авторы других публикаций [18,22,47,49,51-53]. Коп1шек, et а1. отмечают, что недавнее стационарное лечение увеличивает риск колонизации резистентными микроорганизмами не только вследствие селективного давления применяемых антибиотиков, тесного контакта с другими пациентами и медицинским персоналом, ин-вазивного характера диагностических и лечебных вмешательств, но и в связи с психоэмоциональным стрессом и существенным изменением питания. Все указанные факторы в совокупности приводят к изменениям в составе кишечной микробиоты госпитализированных пациентов [54]. Критическая давность предыдущей госпитализации, повышающая вероятность колонизации при поступлении, по данным различных авторов, колеблется от 30 дней до 6 месяцев. В публикациях последних лет активно обсуждается распространение нозокомиальных бактерий во внегоспитальной среде [55], сообщается о генотипическом и фенотипическом сходстве нозокомиальных и внебольничных изолятов кар-бапенемрезистентных микроорганизмов [56]. Указанный факт со всей очевидностью подчеркивает актуальность проблемы выхода резистентности за пределы стационаров и побуждает к активному
скринингу колонизации и носительства генов резистентности у пациентов, поступающих переводом из других медицинских организаций или недавно получавших лечение в условиях стационара.
Выполненный нами многофакторный анализ продемонстрировал, что независимым предиктором колонизации карбапенемрезистентными микроорганизмами при поступлении является прием любых антибиотиков в последние 3 месяца. К подобному заключению пришли авторы ряда оригинальных исследований [57,58], систематических обзоров и мета-анализов [59,22]. В отличие от Mоghniech, et а1. [48] и Caudell, et а1. [47], нам не удалось обнаружить корреляцию между лечением карбапенемами (как и любым другим отдельно взятым антибиотиком) в анамнезе и колонизацией устойчивыми к карбапенемам бактериями при поступлении. С одной стороны, это может быть связано с небольшим числом участников исследования, которым ранее назначали антибиотики в стационарных или амбулаторных условиях. Так, из 733 пациентов, вошедших в наше исследование, антипсевдомонадные карбапенемы ранее получали семь, а эртапенем - два. Указания на прием фторхинолонов в анамнезе имелись у 20 пациентов, аминогликозидов - у трех, а полимик-синов и тигециклина - лишь у одного. С другой стороны, выявленный нами повышенный риск колонизации карбапенемрезистентными возбудителями у пациентов с приемом любых антибиотиков в анамнезе может быть проявлением их коллатерального эффекта, характерного, в частности, для цефалоспоринов поколений [16,38].
Колонизацию карбапенемрезистентными возбудителями при поступлении обнаружили у 5 из 10 пациентов, которым ранее назначали цито-статики по поводу заболеваний соединительной ткани, злокачественных новообразований или COVID-19. В других исследованиях мы не обнаружили указания на роль цитостатиков в качестве детерминанты колонизации и носитель-ства генов, кодирующих синтез карбапенемаз. Значимость приема цитостатиков в качестве фактора риска подтвердил выполненный нами мультивариантный анализ (СОШ 7,804; 95% ДИ 1,495-40,731, р = 0,015). Цитостатики вызывают поражение в норме активно регенерирующих слизистых оболочек, что клинически проявляется стоматитом, энтеритом, колитом и бронхитом. Другим неотъемлемым эффектом цитоста-тических препаратов является угнетение всех ростков кроветворения с супрессией клеточного иммунитета. Вероятно, указанные факторы увеличивают риск колонизации различных экотопов микроорганизмами, в том числе с повышенной резистентностью.
Вазопрессорная поддержка потребовалась при поступлении 29 пациентам из 733 включенных в исследование. Колонизацию карбапенем-резистентными микроорганизмами отметили у 19
(65,5%) пациентов, получавших катехоламины. Как однофакторный, так и многофакторный анализ указывают на то, что необходимость вазопрес-сорной поддержки может с высокой вероятностью предсказать колонизацию устойчивыми к карбапенемам микроорганизмами и носительство генов резистентности. Вероятнее всего, именно нестабильность гемодинамики служит объективным и легко измеряемым интегральным отражением тяжести состояния, компонентами которого могут быть дыхательная недостаточность с потребностью в респираторной поддержке, декомпенсация различных хронических заболеваний и наличие инва-зивных устройств.
Ограничения исследования
Наше исследование не лишено ряда ограничений. Во-первых, оно было одноцентровым, что затрудняет экстраполяцию его результатов на другие клинические центры. Во-вторых, мы не имели возможности выявления некоторых генетических детерминант устойчивости к карбапенемам (например, гена, кодирующего синтез сериновой карба-пенемазы GES-5). В-третьих, в качестве возможной детерминанты колонизации и носительства генов карбапенемрезистентности не исследовали оценку по интегральным шкалам, таким как APACHE II, SOFA, NEWS2.
Заключение
По нашим данным, предикторами догоспитальной колонизации карбапенемрезистентными микроорганизмами являются: прием цитостати-ков, перевод из другого стационара, потребность в вазопрессорной поддержке, прием антибиотиков в предшествующие 3 месяца и мужской пол. Знание факторов-детерминант внебольничной колонизации карбапенемрезистентными микроорганизмами и носительства генов устойчивости способно выделить когорту пациентов наиболее высокого риска, в дальнейшем сделать активный скрининг более целенаправленным и рациональнее использовать ресурсы системы здравоохранения. Достоверные эпидемиологические данные о носительстве и колонизации позволят своевременно принять меры по профилактике распространения карбапенеморезистентности внутри стационара и своевременно назначать адекватную антимикробную терапию в случае развития ИСМП.
Исследование проведено при поддержке Московского центра инновационных технологий в здравоохранении. Исследование поддержано грантом правительства города Москвы (проект № 2312-46/22).
This study was sponsored by the Moscow Center for Innovative Technologies in Healthcare. This research was funded by grant from the Moscow government (research project No. 2312-46/22).
Литература/References
1. World Health Organization. WHO publishes list of bacteria for which new antibiotics are urgently needed. [Internet] Available at: https://www.who.int/news/item/27-02-2017-who-publishes-list-of-bacteria-for-which-new-antibiotics-are-urgently-needed. Accessed: 5 Aug 2024.
2. Козлов Р. С, Кузьменков А. Ю., Виноградова А. Г. Антибиотикорезистентность как медицинская проблема. Вестник Российской академии наук. 2024. - Т. 94. -№1. - C. 11-18./Kozlov RS, Kuzmenkov AY, Vinogradova AG. Antibiotic resistance as a medical problem. Vestnik Rossijskoj akademii nauk. 2024;94(1):11-18 (In Russ). doi: 10.31857/S0869587324010033
3. Falagas ME, Tansarli GS, Karageorgopoulos DE, et al. Deaths Attributable to Carbapenem-Resistant Enterobacteriaceae Infections. Emerging Infectious Diseases. 2014;20(7):1170-1175. doi:10.3201/eid2007.121004.
4. Otter JA, Burgess P, Davies F, et al. Counting the cost of an outbreak of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae: an economic evaluation from a hospital perspective. Clin Microbiol Infect. 2017;23(3):188-196. doi:10.1016/j.cmi.2016.10.005
5. Cerceo E, Deitelzweig SB, Sherman BM, et al. Multidrug-Resistant Gram-Negative Bacterial Infections in the Hospital Setting: Overview, Implications for Clinical Practice, and Emerging Treatment Options. Microb Drug Resist. 2016;22(5):412-431. doi:10.1089/mdr.2015.0220
6. Devi LS, Broor S, Rautela RS, et al. Increasing Prevalence of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae Producing CTX-M-Type Extended-Spectrum Beta-Lactamase, Carbapenemase, and NDM-1 in Patients from a Rural Community with Community Acquired Infections: A 3-Year Study. Int J Appl Basic Med Res. 2020;10(3):156-163. doi:10.4103/ijabmr.IJABMR_360_19
7. Dickstein Y, Edelman R, Dror T, et al. Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae colonization and infection in critically ill patients: a retrospective matched cohort comparison with non-carriers. J Hosp Infect. 2016;94(1):54-59. doi:10.1016/j.jhin.2016.05.018
8. McConville TH, Sullivan SB, Gomez-Simmonds A, et al. Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae colonization (CRE) and subsequent risk of infection and 90-day mortality in critically ill patients, an observational study. PLoS One. 2017;12(10):e0186195. doi:10.1371/journal.pone.0186195
9. Emmanuel Martinez A, Widmer A, Frei R, et al. ESBL-colonization at ICU admission: impact on subsequent infection, carbapenem-consumption, and outcome. Infect Control Hosp Epidemiol. 2019;40(4):408-413. doi:10.1017/ice.2019.5
10. Golzarri MF, Silva-Sánchez J, Cornejo-Juárez P, et al. Colonization by fecal extended-spectrum ß-lactamase-producing Enterobacteriaceae and surgical site infections in patients with cancer undergoing gastrointestinal and gynecologic surgery. Am J Infect Control. 2019;47(8):916-921. doi:10.1016/j.ajic.2019.01.020
11. Massart N, Camus C, Benezit F, et al. Incidence and risk factors for acquired colonization and infection due to extended-spectrum beta-lactamase-producing Gram-negative bacilli: a retrospective analysis in three ICUs with low multidrug resistance rate. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2020;39(5):889-895. doi:10.1007/s10096-019-03800-y
12. EUCAST. Clinical breakpoints - breakpoints and guidance. Archive of EUCAST tables and documents. [Internet]. Available at: https://www.eucast.org/ast_of_bacteria/previ-ous_versions_of_documents. Accessed: 5 Aug 2024.
13. About Carbapenem-resistant Enterobacterales. [Internet]. Available at: https://www.cdc.gov/cre/about/index.html. Accessed: 5 Aug 2024.
14. Эйдельштейн М. В. Выявление ß лактамаз расширенного спектра у грамотрицательных бактерий с помощью фенотипических методов. Клиническая Микробиология-Антимикробная Химиотерапия. 2001. Т.3, № 2. С. 183-189. / Edelstein MV. Detection of Extended Spectrum ß-lactamases by Phenotypic Methods in Gram-negative Bacteria. Kliniceskaa Mikrobiologia i Antimikrobnaa Himioterapia. 2001;3(2): 183-189. (In Russ).
15. Hu Y, Qing Y, Chen J, et al. Prevalence, Risk Factors, and Molecular Epidemiology of Intestinal Carbapenem-Resistant Pseudomonas aeruginosa. Microbiol Spectr. 2021;9(3):e0134421. doi:10.1128/Spectrum.01344-21
16. Программа СКАТ (Стратегия контроля антимикробной терапии) при оказании стационарной медицинской помощи. Российские клинические рекомендации. С. В. Яковлев, Н. И. Брико, С. В. Сидоренко и др., ред. М.: Перо; 2018. / Ed.: Yakovlev S.V., Briko N.I., Sidorenko S.V., et al. AMS program (Strategy for the Control of Antimicrobial Therapy) in the provision of inpatient medical care. Russian clinical guidelines. Moscow: Pero; 2018 (In Russ).
17. Yan L, Sun J, Xu X, Huang S. Epidemiology and risk factors of rectal colonization of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae among high risk patients from ICU and HSCT wards in a university hospital. Antimicrob Resist Infect Control. 2020;9(1):155. doi:10.1186/s13756-020-00816-4
18. Kim HJ, Hyun J, Jeong HS, et al. Epidemiology and Risk Factors of Carbapenemase-Producing Enterobacteriaceae Acquisition and Colonization at a Korean Hospital over 1 Year. Antibiotics (Basel). 2023;12(4):759. doi:10.3390/antibiotics12040759
19. Rodríguez-Villodres Á, Martín-Gandul C, Peñalva G, et al. Prevalence and Risk Factors for Multidrug-Resistant Organisms Colonization in Long-Term Care Facilities Around the World: A Review. Antibiotics (Basel). 2021;10(6):680. doi:10.3390/antibiotics10060680
20. Kajova M, Khawaja T, Kantele A. European hospitals as source of multidrug-resistant bacteria: analysis of travellers screened in Finland after hospitalization abroad. J Travel Med. 2022;29(4):taac022. doi:10.1093/jtm/taac022
21. Heinemann M, Kleinjohann L, Rolling T, et al. Impact of antibiotic intake on the incidence of extended-spectrum ß-lactamase-producing Enterobacterales in sub-Saharan Africa: results from a community based longitudinal study. Clin Microbiol Infect. 2023;29(3):340-345. doi:10.1016/j.cmi.2022.09.008
22. Bar Ilan M, Kjerulf A. Who should be screened for carbapenemase-producing Enterobacterales and when? A systematic review. J Hosp Infect. 2023;142:74-87. doi:10.1016/j. jhin.2023.09.018
23. Мониторинг антибиотикорезистентности с использованием платформы AMRcloud. Практическое руководство. Козлов Р. С., Виноградов А. Г., Кузьменков А. Ю. и др., ред. Смоленск: СГМУ; 2021. / Kozlov RS, Vinogradov AG, Kuzmenkov AYu, et al., editors. Monitoring antibiotikorezistentnosti s ispol'zovaniem platformy AMRcloud. Prakticheskoe rukovodstvo. Smolensk: SGMU;2021 (In Russ).
24. Kelly AM, Mathema B, Larson EL. Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae in the community: a scoping review. Int J Antimicrob Agents. 2017;50(2):127-134. doi:10.1016/j. ijantimicag.2017.03.012
25. Garrido A, Seral C, Gude MJ, et al. Characterization of plasmid-mediated ß-lactamases in fecal colonizing patients in the hospital and community setting in Spain. Microb Drug Resist. 2014;20(4):301-304. doi:10.1089/mdr.2013.0109
26. Alexopoulou A, Papadopoulos N, Eliopoulos DG, et al. Increasing frequency of gram-positive cocci and gram-negative multidrug-resistant bacteria in spontaneous bacterial peritonitis. Liver Int. 2013;33(7):975-981. doi:10.1111/liv.12152
27. Lohiya A, Kant S, Kapil A, et al. Pattern of Antibiotic Resistance Among Community Derived Isolates of Enterobacteriaceae Using Urine Sample: A Study From Northern India. J Clin Diagn Res. 2015;9(7):LC15-LC19. doi:10.7860/JCDR/2015/14230.6254
28. Henderson J, Ciesielczuk H, Nelson SM, et al. Community prevalence of carbapenemase-producing organisms in East London. J Hosp Infect. 2019;103(2):142-146. doi:10.1016/j.jhin.2019.04.014
29. van den Bunt G, van Pelt W, Hidalgo L, et al. Prevalence, risk factors and genetic characterisation of extended-spectrum beta-lactamase and carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (ESBL-E and CPE): a community-based cross-sectional study, the Netherlands, 2014 to 2016. Euro Surveill. 2019;24(41):1800594. doi:10.2807/1560-7917. ES.2019.24.41.1800594
30. Turnidge JD, Gottlieb T, Mitchell DH, et al. Australian Group on Antimicrobial Resistance Community-onset Gram-negative Surveillance Program annual report, 2010. Commun Dis Intell Q Rep. 2013;37(3):E219-E223.
31. Sheng WH, Badal RE, Hsueh PR; et al. Distribution of extended-spectrum ß-lactamases, AmpC ß-lactamases, and carbapenemases among Enterobacteriaceae isolates causing intra-abdominal infections in the Asia-Pacific region: results of the study for Monitoring Antimicrobial Resistance Trends (SMART). Antimicrob Agents Chemother. 2013;57(7):2981-2988. doi:10.1128/AAC.00971-12
32. Tang HJ, Hsieh CF, Chang PC, et al. Clinical Significance of Community- and Healthcare-Acquired Carbapenem-Resistant Enterobacteriaceae Isolates. PLoS One. 2016;11(3):e0151897. doi:10.1371/journal.pone.0151897
33. Miller BM, Johnson SW. Demographic and infection characteristics of patients with carbapenem-resistant Enterobacteriaceae in a community hospital: Development of a bedside clinical score for risk assessment. Am J Infect Control. 2016;44(2):134-137. doi:10.1016/j.ajic.2015.09.006
34. Guh AY, Bulens SN, Mu Y, et al. Epidemiology of Carbapenem-Resistant Enterobacteriaceae in 7 US Communities, 2012-2013. JAMA. 2015;314(14):1479-1487. doi:10.1001/ jama.2015.12480
35. Thaden JT, Lewis SS, Hazen KC, et al. Rising rates of carbapenem-resistant enterobacteriaceae in community hospitals: a mixed-methods review of epidemiology and microbiology practices in a network of community hospitals in the southeastern United States. Infect Control Hosp Epidemiol. 2014;35(8):978-983. doi:10.1086/677157
36. Brennan BM, Coyle JR, Marchaim D, et al. Statewide surveillance of carbapenem-resistant enterobacteriaceae in Michigan. Infect Control Hosp Epidemiol. 2014;35(4):342-349. doi:10.1086/675611
37. Li K, Jiang S, Fu H, et al. Risk Factors and Prognosis of Carbapenem-Resistant Organism Colonization and Infection in Acute Cholangitis. Infect Drug Resist. 2022;15:7777-7787. doi:10.2147/IDR.S398581
38. Tian F, Li Y, Wang Y, et al. Risk factors and molecular epidemiology of fecal carriage of carbapenem resistant Enterobacteriaceae in patients with liver disease. Ann Clin Microbiol Antimicrob. 2023;22(1):10. doi:10.1186/s12941-023-00560-8
39. Satlin MJ, Chen L, Gomez-Simmonds A, et al. Impact of a Rapid Molecular Test for Klebsiella pneumoniae Carbapenemase and Ceftazidime-Avibactam Use on Outcomes After Bacteremia Caused by Carbapenem-Resistant Enterobacterales. Clin Infect Dis. 2022;75(12):2066-2075. doi:10.1093/cid/ciac354
40. Recio R, Villa J, Viedma E, et al. Bacteraemia due to extensively drug-resistant Pseudomonas aeruginosa sequence type 235 high-risk clone: Facing the perfect storm. Int J Antimicrob Agents. 2018;52(2):172-179. doi:10.1016/j.ijantimicag.2018.03.018
41. Baier C, Beck M, Panagiota V, et al. Infection control management and surveillance of carbapenem-resistant Gram-negative bacteria in hematopoietic stem cell recipients. Antimicrob Resist Infect Control. 2019;8:160. doi:10.1186/s13756-019-0606-3
42. Cattaneo C, Di Blasi R, Skert C, et al. Bloodstream infections in haematological cancer patients colonized by multidrug-resistant bacteria. Ann Hematol. 2018;97(9):1717-1726. doi:10.1007/s00277-018-3341-6
43. Jiang Y, Ding Y, Wei Y, Jian C, Liu J, Zeng Z. Carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii: A challenge in the intensive care unit. Front Microbiol. 2022;13:1045206. doi:10.3389/fmicb.2022.1045206
44. Hu H, Wang Y, Sun J, et al. Risk factors and molecular epidemiology of intestinal colonization by carbapenem-resistant Gram-negative bacteria in patients with hemato-logical diseases: a multicenter case^control study. Microbiol Spectr. 2024;12(7):e0429923. doi:10.1128/spectrum.04299-23
45. Кузьменков А. Ю., Виноградова А. Г., Трушин И. В. и др. AMRmap - система мониторинга антибиотикорезистентности в России. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2021. Т.23, №2. С.198-204. / Kuzmenkov AYu., Vinogradova AG., Trushin IV., et al. AMRmap - antibiotic resistance surveillance system in Russia. KliniceskaaMikrobiologia iAntimikrobnaa Himioterapia. 2021; 23(2):198-204 (In Russ). doi:10.36488/cmac.2021.2.198-204
46. Lautenbach E, Mosepele M, Smith RM, et al. Risk Factors for Community Colonization With Extended-Spectrum Cephalosporin-Resistant Enterobacterales (ESCrE) in Botswana: An Antibiotic Resistance in Communities and Hospitals (ARCH) Study. Clin Infect Dis. 2023;77(Suppl 1):S89-S96. doi:10.1093/cid/ciad259
47. Caudell MA, Castillo C, Santos LF, et al. Risk factors for colonization with extended-spectrum cephalosporin-resistant and carbapenem-resistant Enterobacterales among hospitalized patients in Guatemala: An Antibiotic Resistance in Communities and Hospitals (ARCH) study. IJID Reg. 2024;11:100361. doi:10.1016/j.ijregi.2024.100361
48. Moghnieh R, Abdallah D, Jadayel M, et al. Epidemiology, risk factors, and prediction score of carbapenem resistance among inpatients colonized or infected with 3rd generation cephalosporin resistant Enterobacterales. Sci Rep. 2021;11(1):14757. doi:10.1038/s41598-021-94295-1
49. Park SH, Yi Y, Suh W, Ji SK, Han E, Shin S. The impact of enhanced screening for carbapenemase-producing Enterobacterales in an acute care hospital in South Korea. Antimicrob Resist Infect Control. 2023;12(1):62. doi:10.1186/s13756-023-01270-8
50. Клясова Г. А, Коробова А. Г., Фролова И. Н. и др. Детекция энтеробактерий с продукцией бета-лактамаз расширенного спектра у больных острыми миелоидными лейкозами и лимфомами при поступлении в стационар//Гематология и трансфузиология. 2016. Т.61, №1. С. 25-32. /Klyasova GA, Korobova AG, Frolova IN, et al. Detection of extended-spectrum ß-lactamase producing Enterobacteriaceae (ESBL-E) among patients with acute myeloid leukemia and lymphoma upon admission to hospital. Russian journal of hematology and transfusiology. 2016;61(1):25-32 (In Russ.). https://doi.org/10.18821/0234-5730-2016-61-1-25-32
51. Segagni Lusignani L, Presterl E, Zatorska B, et al. Infection control and risk factors for acquisition of carbapenemase producing enterobacteriaceae. A 5year (2011-2016) case-control study. Antimicrob Resist Infect Control. 2020;9(1):18. doi:10.1186/s13756-019-0668-2
52. Salomäo MC, Freire MP, Boszczowski I, et al. Increased Risk for Carbapenem-Resistant Enterobacteriaceae Colonization in Intensive Care Units after Hospitalization in Emergency Department. Emerg Infect Dis. 2020;26(6):1156-1163. doi:10.3201/eid2606.190965
53. Callejón Fernández M, Madueño Alonso A, Abreu Rodríguez R, et al. Risk factors for colonization by carbapenemase-producing bacteria in Spanish long-term care facilities: a multicentre point-prevalence study. Antimicrob Resist Infect Control. 2022;11(1):163. doi:10.1186/s13756-022-01200-0
54. Konturek PC, Brzozowski T, Konturek SJ. Stress and the gut: pathophysiology, clinical consequences, diagnostic approach and treatment options. J Physiol Pharmacol. 2011;62(6):591-599.
55. van Duin D, Paterson DL. Multidrug-Resistant Bacteria in the Community: An Update. Infect Dis Clin North Am. 2020;34(4):709-722. doi:10.1016/j.idc.2020.08.002
56. Shrestha R, Luterbach CL, Dai W, et al. Characteristics of community-acquired carbapenem-resistant Enterobacterales. J Antimicrob Chemother. 2022;77(10):2763-2771.
doi:10.1093/jac/dkac239
57. Salomäo MC, Guimaräes T, Duailibi DF, et al. Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae in patients admitted to the emergency department: prevalence, risk factors, and acquisition rate. J Hosp Infect. 2017;97(3):241-246. doi:10.1016/j.jhin.2017.08.012
58. Barbadoro P, Bencardino D, Carloni E, et al. Carriage of Carbapenem-Resistant Enterobacterales in Adult Patients Admitted to a University Hospital in Italy. Antibiotics (Basel). 2021;10(1):61. doi:10.3390/antibiotics10010061
59. van Loon K, Voor In't Holt AF, Vos MC. A Systematic Review and Meta-analyses of the Clinical Epidemiology of Carbapenem-Resistant Enterobacteriaceae. Antimicrob Agents Chemother. 2017;62(1):e01730-17. doi:10.1128/AAC.01730-17
Об авторах
About the Authors
• Оксана Геннадьевна Ни - заведующая отделением клинической фармакологии - врач-клинический фармаколог, ГБУЗ города Москвы «Московский многопрофильный клинический центр «Коммунарка» Департамента здравоохранения города Москвы». +7 (918) 182-20-27, п1.ок$апэ@ gmail.com. ОРСЮ: 0000-0003-0994-0579.
• Борис Зиновьевич Белоцерковский - заведующий отделением реанимации и интенсивной терапии №5 - врач-анестезиолог-реаниматолог, ГБУЗ города Москвы «Московский многопрофильный клинический центр «Коммунарка» Департамента здравоохранения города Москвы»; доцент кафедры анестезиологии и реаниматологии ФДПО ИНОПР, ФГА-ОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова» Минздрава России. +7 (916) 266-99-01, [email protected]. ОРСЮ: 0000-0002-5758-5703.
• Александр Николаевич Круглов - заведующий лабораторией клинической микробиологии - врач-бактериолог, ГБУЗ города Москвы «Московский многопрофильный клинический центр «Коммунарка» Департамента здравоохранения города Москвы». +7 (910) 460-33-56, [email protected]. ОРСЮ: 0000-0001-6849-0008.
• Максим Игоревич Матяш - врач-анестезиолог-реаниматолог, ГБУЗ города Москвы «Московский многопрофильный клинический центр «Коммунарка» Департамента здравоохранения города Москвы». +7 (905) 656-69-38, [email protected]. ОРСЮ: 0009-0004-0764-4658.
• Андрей Олегович Быков - врач-анестезиолог-реаниматолог, ГБУЗ города Москвы «Московский многопрофильный клинический центр «Коммунарка» Департамента здравоохранения города Москвы»; ассистент кафедры анестезиологии и реаниматологии ФДПО ИНОПР, ФГАОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н. И. Пирогова» Минздрава России. +7 (925) 634-22-24, ьу^аг-87@ mail.ru. ОРСЮ: 0000-0001-5244-7769.
• Сергей Владимирович Яковлев - профессор кафедры госпитальной терапии №2, ФГАОУ ВО Первый МГМУ им. И. М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет); врач-клинический фармаколог, ГБУЗ города Москвы «Городская клиническая больница имени С.С. Юдина Департамента здравоохранения города Москвы». +7 (916) 681-91-92, [email protected]. ОРСЮ: 0000-0001-7606-8608.
• Ефим Муневич Шифман - профессор кафедры анестезиологии и реаниматологии ФДПО ИНОПР, ФГАОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова» Минздрава России; профессор кафедры анестезиологии и реаниматологии ФУВ, ГБУЗ МО Московский областной научно-исследовательский клинический институт им. М. Ф. Владимирского. +7 (925) 072-60-75, [email protected]. ОРСЮ: 0000-0002-6113-8498.
• Денис Николаевич Проценко - директор, ГБУЗ города Москвы «Московский многопрофильный клинический центр «Коммунарка» Департамента здравоохранения города Москвы»; заведующий кафедрой анестезиологии и реаниматологии ФДПО ИНОПР, ФГАОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова» Минздрава России. +7 (909) 901-30-30, drprotsenko@ gmail.com. ОРСЮ: 0000-0002-5166-3280.
Поступила: 04.09.2024. Принята к печати: 17.10.2024.
Контент доступен под лицензией СС БУ 4.0.
• Oksana G. Ni - Head of the Department of Clinical Pharmacology - Clinical Pharmacologist, Moscow City Multi-field Clinical Center «Kommunarka». +7 (918) 182-20-27, [email protected]. ORCID: 0000-0003-0994-0579.
• Boris Z. Belotserkovskiy - Head of the Intensive Care Unit No. 5 - Anesthe-siologist-Intensivist, Moscow City Multifield Clinical Center «Kommunarka»; Associate Professor of the Department of Anesthesiology and Intensive Care at the Faculty of Continuing Professional Education of the Institute of Lifelong Learning and Professional Development, Pirogov National Research Medical University. +7 (916) 266-99-01, [email protected]. ORCID: 0000-00025758-5703.
• Aleksander N. Kruglov - Head of the Clinical Microbiology Laboratory -Medical Bacteriologist, Moscow City Multi-field Clinical Center «Kommunarka». +7 (910) 460-33-56, [email protected]. ORCID: 0000-0001-68490008.
• Maksim Ig. Matyash - Anesthesiologist-Intensivist, Moscow City Multi-field Clinical Center «Kommunarka». +7 (905) 656-69-38, [email protected]. ORCID: 0009-0004-0764-4658.
• Andrey O. Bykov - Anesthesiologist-Intensivist, Moscow City Multi-field Clinical Center «Kommunarka»; Assistant Professor of the Department of Anesthesiology and Intensive Care at the Faculty of Continuing Professional Education of the Institute of Lifelong Learning and Professional Development, Pirogov National Research Medical University. +7 (925) 634-22-24, [email protected]. ORCID: 0000-0001-5244-7769.
• Sergey V. Yakovlev- Professor of the Department of Hospital Therapy No. 2, Sechenov University; Clinical Pharmacologist, City clinical hospital named after S. S. Yudin. +7 (916) 681-91-92, [email protected]. ORCID: 00000001-7606-8608.
• Efim M. Shifman - Professor of the Department of Anesthesiology and Intensive Care at the Faculty of Continuing Professional Education of the Institute of Lifelong Learning and Professional Development, Pirogov National Research Medical University; Professor of the Department of Anesthesiology and Intensive Care at the Faculty for Postgraduate Training of Physicians, Moscow Regional Research Clinical Institute. +7 (925) 072-60-75, eshifman@mail. ru. ORCID: 0000-0002-6113-8498.
• Denis N. Protsenko - Director, Moscow City Multi-field Clinical Center «Kommunarka»; Head of the Department of Anesthesiology and Intensive Care at the Faculty of Continuing Professional Education of the Institute of Lifelong Learning and Professional Development, Pirogov National Research Medical University. +7 (909) 901-30-30, [email protected]. ORCID: 0000-0002-5166-3280.
Received: 04.09.2024. Accepted: 17.10.2024.
Creative Commons Attribution CC BY 4.0.
