СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННАЯ БИОЛОГИЯ, 2015, том 50, № 2, с. 198-207
Генетическая структура популяций
УДК 636.52/58:575.17 doi: 10.15389/agrobiology.2015.2.198rus
ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНОВ ГОРМОНА РОСТА, РЕЦЕПТОРА ГОРМОНА РОСТА, ПРОЛАКТИНА И РЕЦЕПТОРА ПРОЛАКТИНА В СВЯЗИ С ЯИЧНОЙ ПРОДУКТИВНОСТЬЮ У КУР ПОРОДЫ ПОЛТАВСКАЯ
ГЛИНИСТАЯ
Р.А. КУЛИБАБА
В основе геномной селекции лежит изучение полиморфизма целевых генов, аллельные варианты которых связаны с продуктивными качествами животных. Аллельные варианты функциональных генов возникают в результате различных модификаций нуклеотидного состава, таких как точечные мутации (однонуклеотидный полиморфизм, single nucleotide polymorphism — SNP), инсерции/делеции (indel) и т.д. В любом случае выявление полиморфизма и последующее изучение его корреляции с продуктивными признаками служат основой дальнейшей направленной селекции. Наиболее интересен поиск полиморфизма в генах, которые кодируют регуляторные белки, участвующие в контроле роста и дифференцировки, в частности гормоны. В свою очередь, физиологический эффект любого гормона напрямую зависит от его рецептора, что определяет целесообразность изучения полиморфизма генов, кодирующих как сами гормоны, так и их рецепторы. В Украине не проводилось исследований связи между полиморфизмом перечисленных генов и продуктивными качествами кур отечественной селекции, что во многом определяет актуальность и новизну выполненной работы. Популяцию кур яично-мясной породы полтавская глинистая (линия 14, n = 98, лабораторный виварий Государственной опытной станции птицеводства Национальной академии аграрных наук Украины, Харьковская обл.) изучили по распределению частот аллелей и генотипов по локусам GH (гормон роста), GHR (рецептор гормона роста), PRL (пролактин) и PRLR (рецептор пролактина). Полиморфизм генов определяли с использованием ПЦР-ПДРФ анализа (полиморфизм длин рестрикционных фрагментов — PCR-RFLP, restriction fragment length polymorphism) и посредством сравнительного анализа длин амплифицирован-ных фрагментов при изучении инсерции в локусе пролактина. Показано, что гены гормона роста, рецептора гормона роста и пролактина в опытной популяции кур являются полиморфными. По гену пролактина (PRL-AluI) частота аллеля C составила 0,372; аллеля T — 0,628; по гену гормона роста (GH-MspI, 1-й интрон) частота аллеля A — 0,908; B — 0,020; C — 0,072; по гену гормона роста (GH-SacI, 4-й интрон) частота аллеля A — 0,036; B — 0,964; по гену рецептора гормона роста (GHR-NspI) частота аллеля A — 0,280; B — 0,720. По всем изученным полиморфным локусам популяция кур породы полтавская глинистая находилась в состоянии генетического равновесия по Харди-Вайнбергу. Гены пролактина (по наличию инсерции в промоторном участке) и рецептора пролактина оказались мономорфны-ми. Также была изучена связь различных генотипов по пролактину, гормону роста и рецептору гормона роста с показателями яичной продуктивности. Выявлены достоверные различия в показателях продуктивности у особей с разными генотипами по локусам пролактина (PRL-AluI) и гормона роста (GH-SacI). Так, у кур с генотипом CC-PRL яичная продуктивность за 12 нед превышала таковую у особей с генотипом TT-PRL и равнялась соответственно 75,38+2,33 и 67,82+1,21 шт. (P < 0,01). У кур с генотипом CC-PRL яичная продуктивность за 40 нед составила 201,50+8,43; TT-PRL — 188,32+3,45 шт. Были обнаружены различия по массе яйца на 30-ю нед жизни — 54,80+1,44 г у особей с генотипом CC-PRL против 50,95+0,54 г у кур с генотипом CT-PRL (P < 0,05). В то же время гетерозиготные особи AB (SacI+/SacI-) по гену гормона роста характеризовались достоверно большей яичной продуктивностью за 12 нед продуктивного периода, чем куры с генотипом BB (SacI-/SacI-) (72,00+1,67 против 66,98+1,05 шт.). Также отмечались различия по массе яйца на 30-ю нед жизни — 55,02+1,52 г у особей с генотипом AB против 51,40+0,42 г у кур с генотипом BB (P < 0,05).
Ключевые слова: ПЦР, полиморфизм, яичная продуктивность, гормон роста, пролактин, куры.
В современной генетике домашней птицы все большее распространение получают молекулярно-генетические методы. Будучи до недавнего времени своеобразной экзотикой, молекулярно-генетические маркеры стали обыденным инструментом при генетико-селекционных исследованиях
198
(1). Повсеместное распространение ДНК-технологий позволило создать предпосылки для проведения селекции птицы на принципиально новом уровне, учитывая все возможности, которые создаются при непосредственной работе с наследственным материалом.
В основе геномной селекции лежит изучение полиморфизма целевых генов, аллельные варианты которых связаны с продуктивными качествами животных. Аллельные варианты функциональных генов возникают в результате различных модификаций нуклеотидного состава, таких как точечные мутации (однонуклеотидный полиморфизм, single nucleotide polymorphism — SNP), инсерции/делеции (indel) и т.д. В любом случае выявление полиморфизма и последующее изучение его связи с продуктивными признаками служат основой дальнейшей направленной селекции. Все вышеизложенное в полной мере относится и к птицеводству (1).
Наиболее интересен поиск полиморфизма в генах, продукты которых участвуют в регуляции различных функций, прежде всего связанных с обеспечением роста и дифференцировки (2). К таким объектам относятся гены, кодирующие регуляторные белки, в частности гормоны. В свою очередь, физиологический эффект любого гормона напрямую зависит от его рецептора, что определяет целесообразность изучения полиморфизма генов, кодирующих как сами гормоны, так и их рецепторы.
С этой точки зрения в генетике птицы в качестве одних из наиболее перспективных генов-кандидатов для изучения полиморфизма и связи аллельных вариантов с продуктивными качествами птицы рассматриваются гены гормона роста, пролактина, а также их рецепторов (3, 4).
Гормон роста и пролактин относятся к классу пептидных гормонов с широким спектром регулируемых функций (5). Так, гормон роста принимает непосредственное участие в регуляции роста и дифференцировки различных типов тканей организма. Наряду с этим пролактин у птиц принимает участие в регуляции репродуктивного цикла, будучи своеобразным инициатором проявления насиживания (увеличение концентрации плазматического пролактина приводит к постепенному снижению интенсивности, а затем и к полному прекращению яйцекладки) (6, 7).
Ген гормона роста (GH), расположенный в 27-й хромосоме, содержит 5 экзонов, 4 интрона при общей длине ~ 4,35 т.п.н. Показано наличие различных SNP (G662A, T3094C, C3199T и т.д.) в разных участках гена (интроны, экзоны и т.д.) (8). Выявлена связь аллельных вариантов с продуктивными признаками (яичная и мясная продуктивность) (9). Отмечена позитивная корреляция SacI+ аллеля (4-й интрон) с показателями резистентности к болезни Марека, в свою очередь MspI-полиморфизм в 1-м интроне связан с яичной продуктивностью птицы (10, 11).
Ген рецептора гормона роста (GHR) содержит 10 экзонов и 9 ин-тронов, общая длина — ~ 130,33 т.п.н., расположен в Z-хромосоме, что определяет его гемизиготное состояние у самок птицы. Показано наличие нескольких различных типов SNP (G565A, A1512T и т.д.), затрагивающих интронную и экзонную части, а также нетранслируемые 5'- и 3'-участки гена (8, 12, 13). Выявлена связь аллельных вариантов гена GHR с показателями качества скорлупы, живой массы, а также с карликовостью кур.
Ген пролактина (PRL) включает 5 экзонов и 4 интрона, общая длина ---6,14 т.п.н., находится во 2-й хромосоме. Показан полиморфизм по
наличию инсерции в промоторном участке гена, а также несколько SNP (14, 15). Выявлена связь различных аллельных вариантов гена пролактина с показателями яичной продуктивности у кур разных пород, с проявлени-
199
ем насиживания и т.д. Например, наличие инсерции размером 24 п.н. положительно коррелирует с повышенной яйценоскостью и отрицательно — с проявлением насиживания (16). В гене пролактина описана транзиция цитозина в тимин в положении -2402, установлена положительная связь яйценоскости с CC-генотипом (17). В целом, принимая во внимание важную роль пролактина в регуляции репродуктивного цикла птицы, можно отметить особые перспективы изучения полиморфизма этого гена, в первую очередь в связи с яичной продуктивностью (18).
Ген рецептора пролактина (PRLR) содержит 12 экзонов, 11 интро-нов, общая длина составляет ~ 20,89 т.п.н., расположен, как и ген рецептора гормона роста, в Z-хромосоме. Показано наличие SNP в различных участках гена и их связь с продуктивными признаками кур. Так, аллельный вариант BamHI+ по 5-му экзону гена положительно коррелирует с яичной продуктивностью (3).
В Украине не проводилось исследований связи между полиморфизмом перечисленных генов и продуктивными качествами кур отечественной селекции, что во многом определяет актуальность и новизну выполненной работы.
Исходя из вышеизложенного, цель представляемой работы заключалась в изучении генетической структуры популяции у кур породы полтавская глинистая по локусам гормона роста, рецептора гормона роста, пролактина, рецептора пролактина, а также в выявлении связи между аллельными вариантами перечисленных генов и яичной продуктивностью.
Методика. Для проведения исследований была использована птица украинской селекции — куры яично-мясные породы полтавская глинистая, линия 14 (п = 98), содержащиеся в лабораторном виварии опытной станции. ДНК выделяли из образцов крови, которые отбирали из гребня с помощью скарификатора на стерильную фильтровальную бумагу. Каждый образец подсушивали, маркировали и индивидуально упаковывали для предотвращения контаминации. При выделении ДНК пользовались коммерческим набором реагентов «ДНК-сорб-В» («АмплиСенс», Россия). Успешное выделение необходимой для анализа ДНК оценивали с помощью электрофореза в 0,7 % агарозном геле (CSL-AG100, «Cleaver Scientific», Великобритания) при 200 V в течение 5 мин.
Ген пролактина изучали по двум показателям — наличию инсер-ции размером 24 п.н. в промоторном участке гена (24 indel) и однонуклеотидному полиморфизму (транзиция цитозина в тимин) в положении -2402 (C-2402T) (эндонуклеаза рестрикции AluI). В гене рецептора пролактина оценивали BamHI-полиморфизм в 5-м экзоне. Ген гормона роста, как и в случае пролактина, исследовали по двум показателям — MspI-полиморфизму в 1-м интроне и SacI-полиморфизму в 4-м интроне. В гене рецептора гормона роста определяли транзицию цитозина в тимин в 5-м интроне (эндонуклеаза рестрикции NspI).
При амплификации были использованы следующие нуклеотидные последовательности праймеров: для PRL (24 indel) — 5'-TTTAA-TATTGGTGGGTGAAGAGACA-3' и 5'-ATGCCACTGATCCTCGAAAACTC-3' (14); для PRL (C-2402T) — 5'-AGAGGCAGCCCAGGCATTTTAC-3' и 5'-CCTGGGTCTGGTTTGGAAATT-3' (14); для GH (1-й интрон) — 5'-ATCC-CCAGGCAAACATCCTC-3' и 5'-CCTCGACATCCAGCTCACAT-3' (19); для GH (4-й интрон) — 5'-CTAAAGGACCTGGAAGAAGGG-3' и 5'-AACTTGTC-GTAGGTGGGTCTG-3' (11); для PRLR (5-й экзон) — 5'-TTGTCTGCTTTGA-TTCATTTCC-3' и 5'-TGCATTTCATTCTTCCCTTTTT-3' (3); для GHR (5-й интрон) — 5'-ACGAAAAGTGTTTCAGTGTTGA-3' и 5'-TTTATCCCGTGTTCT-
200
CTTGACA-3' (20).
ПЦР проводили с использованием реагентов DreamTaq PCR Master Mix («Thermo Scientific», США) с помощью программируемого термоциклера Терцик («ДНК-технология», Россия) по соответствующим программам: один цикл — денатурация 5 мин при 94 °С; 35 циклов — денатурация 45 с при 94 °С, отжиг 45 с при 54 °С для PRL (24 indel), 62 °С для PRL (C-2402T), 56 °С для PRLR (5-й экзон) и GH (4-й интрон), 55 °С для GH (1-й интрон) и 60 °С для GHR (5-й интрон), элонгация 60 с при 72 °С; один цикл — финальная элонгация 10 мин при 72 °С. Объем реакционной смеси составлял 20 мкл, концентрация праймеров для каждого локуса — 0,2 мкM.
Обработку амплифицированных фрагментов эндонуклеазами рестрикции проводили согласно прилагаемым инструкциям (FastDigest, «Thermo Scientific», США). Продукты рестрикции разделяли в 1,5 % агарозном геле (CSL-AG100, «Cleaver Scientific», Великобритания) при напряжении 150 V в течение 40 мин. Визуализацию проводили с использованием бромистого этидия в ультрафиолетовом свете. Размер рестрикционных фрагментов определяли с использованием маркеров молекулярных масс М-50 и М-100 («ИзоГен», Россия).
Для генотипирования особей по каждому из локусов сопоставляли длины рестрикционных фрагментов на электрофореграммах.
На основе полученных данных рассчитывали фактическое (O) и теоретическое (E) распределение генотипов, частоты генотипов и аллелей, соответствие генетическому равновесию популяции по Харди-Вайнбергу методом х2, фактическую (Ho) и теоретическую (He) гетерозиготность, общее число аллелей (Na), эффективное число аллелей (ne), индекс фиксации Райта (Fis) согласно общепринятым методикам (21). Также проводили учет показателей яичной продуктивности кур: En12 и En40 (egg number) — число яиц соответственно за 12 и 40 нед продуктивного периода; Ew30 и Ew52 (egg weight) — масса яйца соответственно на 30-й и 52-й нед жизни.
Достоверность различий определяли с использованием 1-критерия Стьюдента (22).
Результаты. Известно, что в локусе PRL (24 indel) аллель I содержит инсерцию размером 24 п.н., в то время как аллель D ее не содержит. Генотип II представлен на электрофореграмме фрагментом размером 154 п.н., DD — 130 п.н., ID — 130 и 154 п.н. В случае PRL (C-2402T) аллель C имеет три сайта рестрикции для AluI (два мономорфных и один полиморфный), аллель T — два. Следовательно, генотип CC представлен на электрофореграмме набором фрагментов размером 160, 144, 81 и 54 п.н.; TT — 304, 81 и 54 п.н.; CT — 304, 160, 144, 81 и 54 п.н. Наличие того или иного аллеля определяется присутствием цитозина или тимина в сайте рестрикции. У гена GH (1-й интрон) возможны три аллеля. Для аллеля A характерно наличие одного сайта рестрикции, для аллеля B — двух, C — трех. Генотип AA представлен на электрофореграмме фрагментами размером 539 и 237 п.н., BB — 392, 237 и 147 п.н., CC — 267, 237, 147 и 125 п.н., AB — 539, 392, 237 и 147 п.н., AC — 539, 267, 237, 147 и 125 п.н., BC — 392, 267, 237, 147 и 125 п.н. Ген GH (4-й интрон) существует в виде двух аллелей — A и B. Аллель A несет два сайта рестрикции для SacI (полиморфный и мономорфный сайты), аллель B — один (мономорфный сайт). Генотип AA представлен фрагментами рестрикции размером 584, 440 и 144 п.н.; BB — 1024 и 144 п.н., AB — 1024, 584, 440 и 144 п.н. У PRLR (5-й экзон) имеется аллель A, который содержит один сайт рестрикции для BamHI, и аллель B, который его не содержит. Генотип A0 представлен
201
на электрофореграмме фрагментами размером 195 и 55 п.н., B0 — 250 п.н. У гена GHR (5-й интрон) имеется аллель B с одним сайтом рестрикции для NspI и аллель A, у которого он отсутствует. Генотип A0 представлен на электрофореграмме фрагментом размером 750 п.н., B0 — фрагментами 200 и 550 п.н.
Проведенные исследования показали, что в популяции кур породы полтавская глинистая локусы гена гормона роста (по 1-му и 4-му интронам), рецептора гормона роста и пролактина (C-2402T) полиморфны, в то время как 24 indel и ген рецептора пролактина — моно-морфны (рис.).
PRL (24 indel)
PRL (C-2402T)
12 3 4 5М6 7 8 9 10 ■ 1 2 345М6789 10
DD DD DD DD DD DD DD DD DD DD ■ СТ TT СТ СС TT СТ TT СТ СС СТ
GH (1-й интрон)
GH (4-й интрон)
12 3 4 5М6 7 8 9 10 И 1 2345М6789 10
АА АА АС АА АА АА АВ АС АА ААИ АВ ВВ ВВ ВВ ВВ ВВ ВВ ВВ ВВ ВВ
1 2345М6789 10 И1 2345М6 78 9 10
АО АО АО АО АО АО АО АО АО АО ■ АО АО ВО ВО АО АО ВО АО АО АО
Электрофореграмма продуктов амплификации промоторного участка гена пролактина PRL 24 indel, продуктов рестрикции фрагмента гена пролактина PRL C-2402T, 1-го интро-на гена гормона роста GH, 4-го интрона гена гормона роста GH, 5-го экзона гена рецептора пролактина PRLR и 5-го интрона гена рецептора гормона роста GHR в популяции кур породы полтавская глинистая: 1-10 — номера лунок; М — маркер молекулярных масс (M-50, M-100, «ИзоГен», Россия); II, ID, DD, CC, CT, TT, AA, AB, AC, BB, A0, B0 — соответствующие генотипы (виварий Государственной опытной станции птицеводства Национальной академии аграрных наук Украины, Харьковская обл., 2013 год).
В случае с 24 indel в популяции кур породы полтавская глинистая наблюдали наличие особей только одного генотипа DD (то есть по наличию инсерции в промоторном участке гена локус пролактина мономорфен). Мономорфный характер этого локуса резко отличает кур анализируемой линии от ранее изученных особей из популяций пород борковская барви-стая и белый плимутрок (23).
По наличию однонуклеотидного полиморфизма в положении -2402
202
гена пролактина в популяции были обнаружены особи всех трех возможных генотипов (см. рис.).
По результатам оценки MspI-полиморфизма в 1-м интроне гена гормона роста в изученной популяции кур имелись особи трех (из шести возможных) генотипов — AA, AB и AC. Гомозиготных по аллелям B и C особей не обнаружили. Также в изученной популяции отсутствовали особи с генотипом BC.
В свою очередь, по SacI-полиморфизму в 4-м интроне гена гормона роста были выявлены особи двух генотипов — AB (SacI+/SacI-) и BB (SacI-/SacI-). Особей с генотипом AA (SacI+/SacI+) в исследуемой популяции мы не обнаружили.
У изученных кур ген, кодирующий рецептор пролактина, был представлен одним вариантом (A0) (BamHI-полиморфизм в 5-м экзоне). Как и в случае с геном пролактина (24 indel), он оказался мономорфным.
По гену GHR в популяции имелись особи двух генотипов — A0 и B0. Вследствие гемизиготности локусов по генам PRLR и GHR у самок птицы гетерозиготы в популяции в обоих случаях отсутствовали (см. рис.).
Анализ фактического и теоретического распределений особей разных генотипов (по всем изученным локусам) в опытной популяции кур не выявил нарушения генетического равновесия, что свидетельствует об отсутствии давления отбора.
По сравнению с популяциями других пород кур украинской селекции (белый плимутрок, борковская барвистая) (23) в изученной нами популяции имелся ряд существенных особенностей. Так, для кур яичного направления продуктивности (борковская барвистая) по локусу PRL характерна высокая частота аллеля I (содержит инсерцию), для кур мясояичного направления продуктивности (белый плимутрок) — аллеля D (не содержащего инсерции), в то время как в популяции кур породы полтавская глинистая указанный локус вообще был мономорфен (табл. 1).
1. Частота генотипов и аллелей генов пролактина (PRL), рецептора пролактина (PRLR), гормона роста (GH) и рецептора гормона роста (GHR) в популяции кур породы полтавская глинистая (виварий Государственной опытной станции птицеводства Национальной академии аграрных наук Украины, Харьковская обл., 2013 год)
Локус
Генотип, его частота
Частота аллелей
PRL (24 indel)
PRL (C-2402T) PRLR (5-й экзон) GH (1-й интрон) GH (4-й интрон) GHR (5-й интрон)
DD— 1
CC — 0,110; CT — 0,520; TT — 0,370 A0 — 1
AA — 0,820; AB — 0,040; AC — 0,140 AB — 0,070; BB — 0,930 A0 — 0,280; B0 - 0,720
D— 1
C — 0,372; T — 0,628 A —1
A — 0,908; B — 0,020; C — 0,072 A — 0,036; B — 0,964 A — 0,280; B — 0,720
Примечание. Результаты получены с использованием ПЦР-ПДРФ анализа (полиморфизм длин рестрикционных фрагментов — PCR-RFLP, restriction fragment length polymorphism) и посредством сравнительного анализа длин амплифицированных фрагментов при изучении инсерции в локусе пролактина. Описание аллелей и генотипов см. в тексте.
При анализе MspI-полиморфизма в 1-м интроне гена гормона роста в исследуемой популяции кур был найден аллель C в гетерозиготном состоянии (AC), при этом его частота составила 0,072. Следует отметить тот интересный факт, что как таковой аллель C, согласно данным специальной литературы, практически полностью отсутствует в популяциях коммерческих линий, однако присутствует у некоторых аборигенных пород (19). При этом аллель C, как и в представляемой работе, найден в популяциях кур других пород украинской селекции (борковская барвистая и белый плимутрок), в которых его частота составляла 0,17 (23).
Анализ наблюдаемых и ожидаемых распределений генотипов в вы-
203
борке в целом показал наличие некоторого эксцесса гетерозигот по локусам PRL (C-2402T) и GH (1-й интрон) (табл. 2). В то же время по локусу GH (4-й интрон) показатели, отражающие фактическую и теоретическую гетерозиготность, практически совпадали (соответственно 0,071 и 0,069).
2. Популяционно-генетическая характеристика кур породы полтавская глинистая по изученным локусам (виварий Государственной опытной станции птицеводства Национальной академии аграрных наук Украины, Харьковская обл., 2013 год)
Локус гена I Na 1 H„ 1 He 1 Fis | ne
PRL (24 indel) 1 - - - -
PRL (C-2402T, AluI) 2 0,520 0,467 -0,113 1,876
GH (1-й интрон, MspI) 3 0,184 0,170 -0,082 1,205
GH (4-й интрон, SacI) 2 0,071 0,069 -0,029 1,074
PRLR (5-й экзон, BamHI) 1 - - - -
GHR (NspI) 2 - - - -
Примечание. Na — общее число аллелей; Ho — фактическая гетерозиготность; He — теоретическая гетерозиготность; Fis — индекс фиксации Райта; ne — эффективное число аллелей. Прочерк означает, что показатель не может быть рассчитан из-за мономорфности локусов (PRL 24 indel и PRLR и гемизигот-ности (GHR). Результаты получены с использованием ПЦР-ПДРФ анализа (полиморфизм длин рестрикционных фрагментов — PCR-RFLP, restriction fragment length polymorphism) и посредством сравнительного анализа длин амплифицированных фрагментов при изучении инсерции в локусе пролактина.
Среди полиморфных локусов наибольшее значение эффективного числа аллелей наблюдалось по гену пролактина (C-2402T) (ne = 1,876); наименьшее (ne = 1,074) — гормона роста (SacI-полиморфизм). Таким образом, среди всех изученных генов локус пролактина (C-2402T) характеризовался самым высоким уровнем полиморфизма.
Наряду с генетико-популяционными исследованиями мы оценили яичную продуктивность у кур разных генотипов.
3. Продуктивные признаки у кур породы полтавская глинистая с разными аллельными вариантами генов пролактина (PRL), гормона роста (GH) и рецептора гормона роста (GHR) (виварий Государственной опытной станции птицеводства Национальной академии аграрных наук Украины, Харьковская обл., 2013 год)
_____________ Продуктивный признак_______________________
En12, шт. I En40, шт. I Ew30, г I Ew52, г
PRL
CC 75,38±2,33** 201,50±8,43 54,80±1,44* 58,57±1,86
CT 67,04±1,34** 192,29±3,09 50,95±0,54* 57,46±0,60
TT 67,82±1,21** 188,32±3,45 GH (MspI) 52,25±0,65 59,50±0,82
AA 67,53±1,05 191,01±2,65 51,63±0,42 58,34±0,57
AB 66,50±3,62 181,79±8,57 51,08±2,81 58,93±2,91
AC 63,00±4,40 171,50±26,05 GH (SacI) 51,27±2,34 58,94± 1,33
AB 72,00±1,67* 199,00± 10,13 55,02±1,52* 58,80±1,13
BB 66,98±1,05* 187,56±2,83 GHR 51,40±0,42* 58,42±0,53
A0 65,58±2,38 186,91±6,36 52,28±0,99 58,35±0,76
B0 68,67±0,87 189,67±2,99 51,46±0,48 57,48±1,21
Примечание. En12 и En40 — число яиц соответственно за 12 и 40 нед продуктивного периода; Ew30 и Ew52 — масса яйца соответственно на 30-ю и 52-ю нед жизни; MspI, SacI — эндонуклеазы рестрикции. Описание генотипов по аллельным вариантам см. в тексте.
*
Достоверность различий соответственно Р < 0,05 и Р < 0,01.
В связи с мономорфным характером гена пролактина по наличию инсерции в промоторном участке изучение связи аллельных вариантов с продуктивными признаками у кур породы полтавская глинистая было невозможно. При этом благодаря наличию однонуклеотидного полиморфизма в локусе PRL (C-2402T) показано, что яичная продуктивность за 12 нед у особей с генотипом CC-PRL превышала таковую у особей с генотипом TT-PRL и составила соответственно 75,38±2,33 и 67,82± 1,21 шт. (P < 0,01)
204
(табл. 3). Яичная продуктивность за 40 нед у кур с генотипом CC-PRL равнялась 201,50±8,43; TT-PRL — 188,32±3,45 шт.; эти различия были недостоверными, что во многом обусловлено небольшим числом особей с генотипом CC-PRL (11 кур) по сравнению с TT-PRL (36 кур). Данные о положительной связи генотипа CC-PRL с яичной продуктивностью у кур породы полтавская глинистая соответствуют результатам, полученным на породах кур зарубежной селекции (14, 17).
Также отмечались различия по массе яйца на 30-ю нед жизни — 54,80±1,44 г у особей с генотипом CC-PRL против 50,95±0,54 г у кур с генотипом CT-PRL (P < 0,05) (см. табл. 3).
По локусу GH (MspI-полиморфизм в 1-м интроне) значительных различий по показателям продуктивности между особями разных генотипов выявлено не было, что, вероятно, связано с отсутствием в популяции кур с генотипами BB-GH и CC-GH (мы сравнивали продуктивность особей, гомозиготных и гетерозиготных по аллелю A) (см. табл. 3).
В то же время были показаны различия по яичной продуктивности между особями с разным генотипом вследствие SacI-полиморфизма гена GH. Так, гетерозиготные особи AB (SacI+/SacI-) характеризовались большей яичной продуктивностью, чем куры с генотипом BB (SacI-/SacI-). Тенденция к превышению показателей у гетерозиготных особей над таковыми у гомозиготных сохранялась и в случае с массой яйца на 30-ю нед жизни (см. табл. 3). По локусу GHR мы не выявили достоверных различий в показателях яичной продуктивности. Локус PRLR, как и пролактина (по наличию инсерции в промоторном участке), оказался мономорфным, что исключило возможность изучения связи между генотипом и продуктивными признаками у кур.
Итак, изучена генетическая структура популяции кур породы полтавская глинистая по локусам генов гормона роста, рецептора гормона роста, пролактина и рецептора пролактина. Показано, что гены гормона роста, рецептора гормона роста и пролактина в опытной популяции кур полиморфны. По всем изученным полиморфным локусам популяция кур породы полтавская глинистая находится в состоянии генетического равновесия по Харди-Вайнбергу. Гены пролактина (по наличию инсерции в промоторном участке) и рецептора пролактина мономорфны. Показана положительная связь генотипов по пролактину CC-PRL и гормону роста AB-GH (SacI+/SacI-) с числом яиц за 12 нед продуктивного периода и массой яйца на 30-ю нед жизни. Полученные данные можно в дальнейшем использовать для направленной селекции кур породы полтавская глинистая с целью получения потомства от желательных генотипов, что в сочетании с классическими селекционными методами позволит максимально эффективно раскрыть продуктивный потенциал птицы.
Государственная опытная станция птицеводства Поступила в редакцию
Национальной академии аграрных наук Украины, 16 июня 2014 года
63421 Украина, Харьковская обл., Змиевской р-н, с. Борки, e-mail: [email protected]
Sel’skokhozyaistvennaya biologiya/Agricultural Biology, 2015, V. 50, № 2, pp. 198-207
POLYMORPHISM OF GROWTH HORMONE, GROWTH HORMONE RECEPTOR, PROLACTIN AND PROLACTIN RECEPTOR GENES IN CONNECTION WITH EGG PRODUCTION IN POLTAVA CLAY CHICKEN
RA. Kulibaba
State Poultry Research Station, National Academy of Agrarian Sciences of Ukraine, Borky, Zmiiv Region, Kharkiv
205
Province, 63421 Ukraine, e-mail [email protected]
Received June 16, 2014
doi: 10.15389/agrobiology.2015.2.198eng
Abstract
The molecular assisted selection in animals is based on polymorphism study of desired gene alleles related to economic important traits, particularly productivity parameters. Allelic variants can be a result of different modification of DNA nucleotide composition, i.e. spot mutations leading to a single nucleotide polymorphism (SNP), insertions and deletions (indel), etc. Anyway, targeted selection necessitates detecting gene polymorphism and estimating its relationship with productivity. The genes encoding proteins which are involved in the growth and development regulation, such as hormones, are considered the most perspective and attractive candidates. So far as the physiological effect of any hormone is known to be directly related to its receptor, it is advisable to study gene polymorphism of both hormones and their receptors. In the Ukraine the relationship between polymorphism of the genes mentioned hereinabove and hen performance was not still studied. Therefore these stipulate the relevance and novelty of our investigation presented in the paper. The genetic structure of Poltava Clay chicken egg-and-meat breed (line 14, n = 98, laboratory population of State Poultry Research Station of the National Academy of Agrarian Sciences of Ukraine) was studied on growth hormone (GH), growth hormone receptor (GHR), prolactin (PRL) and prolactin receptor genes (PRLR). Gene polymorphism was determined by PCR-RFLP analysis and by comparative analysis of amplified fragment length when studying insertion in the prolactin locus. The growth hormone, growth hormone receptor and prolactin genes were polymorphic. The frequencies obtained were as follows: 0.372 and 0.628 for alleles C and T (PRL-AluI), respectively, in GH-MspI (inton 1) 0.908 for alleles A, 0.020 for B, 0.072 for C; in GH-SacI (the intron 4) 0.036 for A, 0.964 for B; in GHR-NspI 0.280 for A, 0.720 for B. The prolactin gene (24 indel) and prolactin receptor gene were monomorphic. The relationship of different genotypes of prolactin, growth hormone, and growth hormone receptor genes with egg productivity was studied. All studied polymorphic loci were in Hardy-Weinberg equilibrium in population of Poltava clay chicken breed. It is shown the significant differences in the productivity of individuals of different genotypes for the loci of prolactin (PRL-AluI) and growth hormone (GH-SacI). The egg production for 12 weeks in the individuals with genotype CC-PRL exceeded that in the individuals with genotype TT-PRL and amounted to 75.38±2.33 and 67.82±1.21, respectively (P < 0.01). Egg production for 40 weeks in the chickens with genotype CC-PRL reached 201.50±8.43, and in TT-PRL hens it was 188.32±3.45. The egg weight at 30th week of life was 54.80±1.44 g in the individuals with CC-PRL genotype against 50.95±0.54 g in the individuals with CT-PRL genotype (P < 0.05). At the same time the heterozygous individuals with genotype AB (SacI +/SacI-) on growth hormone gene were characterized by a significantly higher egg production during 12 week productive period compared to chickens with genotype BB (SacI-/SacI-), particularly 72.00±1.67 against 66.98±1.05. Also the differences were shown in the egg weight at the 30th week of life. Its value reached 55.02±1.52 g in the individuals with genotype AB while in hens with genotype BB it was 51.40±0.42 g (P < 0.05).
Keywords: PCR, polymorphism, egg production, growth hormone, prolactin, chicken.
REFERENCES
1. Fulton J.E. Molecular genetics in a modern poultry breeding organization. World’s Poultry Sci. J, 2008, 64: 171-176 (doi: 10.1017/S0043933907001778).
2. Enayati B., Rahimi-Mianji G. Genomic growth hormone, growth hormone receptor and transforming growth factor p-3 gene polymorphism in breeder hens of Mazandaran native fowls. African J. Biotechnol., 2009, 8(14): 3154-3159.
3. Rashidi H., Rahimi-Mianji G., Farhadi A., Gholizadeh M. Association of prolactin and prolactin receptor gene polymorphisms with economic traits in breeder hens of indigenous chickens of Mazandaran province. Iranian J. Biotechnol., 2012, 10(2): 129-135.
4. Nie Q., Sun B., Zhang D., Luo C., Ishag N.A., Lei M., Yang G., Zhang X. High diversity of the chicken growth hormone gene and effects on growth and carcass traits. J. Hered, 2005, 96(6): 698-703 (doi: 10.1093/jhered/esi114).
5. Kansaku N., Hiyama G., Sasanami T., Zadworny D. Prolactin and growth hormone in birds: protein structure, gene structure and genetic variation. The Journal of Poultry Science, 2008, 45: 1-6 (doi: 10.2141/jpsa.45.1).
6. El Halawani M.E., Silsby J.L., Behnke E.J. Fehrer S.C. Hormonal induction of incubation behavior in ovarioectomized female turkeys (Meleagris gallopavo). Biol. Reprod., 1986, 35: 59-67 (doi: 10.1095/biolreprod35.1.59).
7. Reddy I.J., David C.G., R a j u S.S. Chemical control of prolactin secretion and it’s effect on pause days, egg production and steroid hormone concentration in Girirani birds. Int. J. Poult. Sci., 2006, 5(7): 685-692 (doi: 10.3923/ijps.2006.685.692).
8. Nie Q., Lei M., Ouyang J., Zeng H., Yang G., Zhang X. Identification and char-
206
acterization of single nucleotide polymorphisms in 12 chicken growth-correlated genes by denaturing high performance liquid chromatography. Genet Sel. Evol., 2005, 37: 339-360 (doi: 10.1051/gse:2005005).
9. Nie Q., Ip S.C.Y., Zhang X., Leung F.C., Yang G. New variations in intron 4 of growth hormone gene in Chinese native chickens. J. Hered., 2002, 93(4): 277-279 (doi: 10.1093/jhered/93.4.277).
10. Liu H., Kung H., Fulton J., Morgan R.W., Cheng H.H. Growth hormone interacts with the Marek's disease virus SORF2 protein and is associated with disease resistance in chicken. PNAS USA, 2001, 98(16): 9203-9208 (doi: 10.1073/pnas.161466898).
11. Feng X.P., Kuhnlein U., Aggrey S.E., Gavora J.S., Zadworny D. Trait association of genetic markers in the growth hormone and the growth hormone receptor gene in a white leghorn strain. Poult. Sci, 1997, 76: 1770-1775 (doi: 10.1093/ps/76.12.1770).
12. Khoa D., Khang N., Ngu N., Matey J., Loan H.T.P., Thuy N.T.D. Single nucleotide polymorphisms in GH, GHR, GHSR and insulin candidate genes in chicken breeds of Vietnam. Greener Journal of Agricultural Science, 2013, 3(10): 716-724.
13. Ouy ang J.H., Xie L., Nie Q., Luo C., Liang Y., Z e ng H., Zhang X. Single nucleotide polymorphism (SNP) at the GHR gene and its associations with chicken growth and deposition traits. Br. Poultry Sci, 2008, 49(2): 87-95 (doi: 10.1080/00071660801938817).
14. Cui J.-X., Du H.-L., Liang Y., Deng X.-M., Li N., Zhang X.-Q. Association of polymorphisms in the promoter region of chicken prolactin with egg production. Poult. Sci., 2006, 85: 26-31 (doi: 10.1093/ps/85.1.26).
15. Jiang R.-S., Xu G.-Y., Zhang X.-Q., Leung F.C.C., Zhang X. Polymorphisms of 5' flanking region of chicken prolactin gene. Domestic Animal Endocrinology, 2006, 30: 1-16 (doi: 10.1016/j.domaniend.2005.05.006).
16. Jiang R.-S., Xu G.-Y., Zhang X.-Q., Yang N. Association of polymorphisms for prolactin and prolactin receptor genes with broody traits in chickens. Poultry Sci., 2005, 84: 839-845 (doi: 10.1093/ps/84.6.839).
17. Bagheri Sarvestani A.S., Niazi A., Zamiri M.J., Dadpasand Taromsari M. Polymorphisms of prolactin gene in a native chicken population and its association with egg production. Iranian J. Vet. Res., 2013, 14(2): 113-119.
18. Alipanah M., Shojaian K., Bandani H.K. The polymorphism of prolactin gene native chicken Zabol region. J Anim. Vet. Adv, 2010, 9(24): 3005-3007 (doi: 10.3923/javaa.2011.619.621).
19. Ip S.C.Y., Zhang X., Leung F.C. Genomic growth hormone gene polymorphisms in native Chinese chickens. Exp. Biol. Med., 2001, 226(5): 458-462.
20. Li H., Zhu W., Chen K., Wu X., Tang Q., Gao Y. Associations between GHR and IGF-1 gene polymorphisms, and reproductive traits in Wenchang chickens. Turk. J. Vet. Anim. Sci., 2008, 32(4): 281-285 (doi: 10.3923/rjpscience.2010.19.22).
21. Merkur'eva E.K. Geneticheskie osnovyselektsii vskotovodstve [Genetic bases for livestock breeding]. Moscow, 1977.
22. Merkur'eva E.K. Biometriya v selektsii i genetike sel'skokhozyaistvennykh zhivotnykh [Biometry in genetics and breeding farm animals]. Moscow, 1970.
23. Kulibaba R.A., Podstreshnyi A.P. Tsitologiya i genetika, 2012, 6: 75-82 (doi: 10.3103/S0095452712060060).
207