CC BY
25
Г.Т. Балпанова, Б.Б. Бижигитова
С.Д.Асфендияров атындагы Цазац ¥лттыцмедициналыцуниверситетi, Алматы
СОЗЫЛМАЛЫ КАБЫНУ ЖЭНЕ ОБЫР
tywh: Кыск;аша шолуда к;атерлi трансформацияланудагы созылмалы ;абынудыц р0лi берiлген. Обырланудагы туа 6iTKeH иммунитеттiц жасушаларыныц мэш, iciK жасушаларыныц макрофагтарды «бас;аша мамандандыруы» мен ;абыну цитокиндердiц созылмалы 0ндiрiлуiнiц обыр 0ршуiндегi р0лi K0рсетiлген.
ТYЙiндi сездер: созылмалы ;абыну, обыр, иммунды жасушалар, ;абыну цитокиндер.
G.T.Balpanova, B.B.Bizhigitova
Asfendiyarov Kazakh National Medical University, Almaty
CHRONIC INFLAMMATION AND CANCER
Resume: The brief review presents the role of chronic inflammation in malignant transformation. The value of innate immunity cells in malignancy, the role of "retraining" of macrophages by cancer cells and the chronic production of proinflammatory cytokines in tumor progression are shown.
Keywords: chronic inflammation, cancer, immune cells, pro-inflammatory cytokines.
OПРЕДЕЛЕНИЕ АНТИГЕНОВ ГИСТОСОВМЕСТИМОСТИ ДЛЯ ТРАНСПЛАНТАЦИЙ ОРГАНОВ И ТКАНЕЙ. BЫЯВЛЕНИЕ НОВОГО
АЛЛЕЛЯ HLA-DQB1*03:82
Ж.К. Буркитбаев1, С.А. Абдрахманова1, И.Р. Рамильева1, А.А. Турганбекова1, Д.К. Баймукашева1, Е.Б. Жибурт2
1РГП на ПХВ «Научно-производственный центр трансфузиологии»
Министерства здравоохранения Республики Казахстан, 010000, г. Астана, Казахстан 2ФГБУ «Национальныймедико-хирургический центр имени Н.И. Пирогова»
Министерства здравоохранения
В статье представлено описание нового аллельного варианта генаHLA-DQB1, впервые выявленного в Республике Казахстан. В Научно-производственном центре трансфузиологии г. Астана в 2011 - 2015 гг. было обследовано 3501 потенциальных доноров Национального регистра гемопоэтических стволовых клетоки 936 пациентов с онкогематологическими заболеваниями (в возрасте от 0-66 лет). Методом аллельспецифического секвенирования у казахстанского онкогематологического пациента с диагнозом острый миелобластный лейкоз (ОМЛ) выявлен новый аллельный вариант HLA11 класса локуса DQB1*03:82. Новый аллель похож на уже ранее известный аллель HLA-DQB1*03:01, отличается заменой в кодоне 223 (TGC>TAC), приводящей к замене аденина на гуанин в 223 пептидсвязывающей бороздки. Показано, что аллель является наследуемым, а не возникшим в результате мутации при ОМЛ.
Ключевые слова: распределения и специфичность HLA; новый аллельный вариант, HLA-DQB1*03:82.
УДК 612.118.221.1.1:612.112+575.113.2
Введение: Определение гистосовместимости у пар «донор-реципиент» играет большую роль в приживлении трансплантата. По мере накопления хирургического опыта по трансплантациям и совершенствования качества Humanleukocyteantigen (HLA) типирования стало ясным, что выживаемость пересаженного органа, несомненно, связано со степенью HLA-несовместимости. Поэтому сейчас во всех трансплантологических центрах не делают пересадку «вслепую», обязательно определяют степень HLA-cовместимости у пар «донор-реципиент». Многократно доказано, что, чем меньше различий между HLA-антигенами донора и реципиента, тем успешней в конечном итоге результат, тем выше выживаемость трансплантатов [1]. Трансплантация гемопоэтических стволовых клеток (ТГСК)с иммунологических позиций наиболее сложный вид пересадок, поскольку пересаживается иммунокомпетентная ткань, и в случае ее приживления иммунологический конфликт развивается в двух направлениях: «хозяин против трансплантата» и «трансплантат против хозяина» [2-
3].Поэтому основным условием для ТГСК является HLA-идентичность между донором и реципиентом. Наиболее эффективным донором при ТГСК является однояйцевый близнец или идентичный с больным по всем антигенам 5-ти локуса HLA-системы сиблинг, обследованный на высокоразрешающем типировании [4-5]. Сейчас проведение сложнейших операций по пересадке жизненно важных органов стало возможным в Казахстане. И ключевое значение в успешном осуществлении трансплантации имеет лабораторное исследование совместимости донора и пациента, так называемое ^А-типирование пересаживаемых органов и тканей. Эти исследования на протяжении уже без малого пяти лет в Казахстане осуществляет первая и уникальная на сегодня лаборатория иммунологического типирования тканей -HLA-лаборатория службы крови, созданная в 2010 году на базе Научно-производственного центра трансфузиологии (НПЦТ).С 2011 года отделение HLA-лаборатории НПЦТсогласно приказа Министерства здравоохранения
Республики Казахстан № 928 от 27 декабря 2011 года «О некоторых вопросах трансплантации тканей и (или) органов (части органов)» была определена базой лабораторного сопровождения процесса трансплантации в Республике Казахстан. Лабораторией проводятся как серологические, так и молекулярно-генетические виды исследования антигенов системы ИЬА. Все виды серологических исследований основаны на микролимфоцитотоксическом тесте.
Типирование, основанное на анализе ДНК, имеет несколько преимуществ по сравнению с серологическими методами: высокая чувствительность и специфичность, небольшие объемы проб, отсутствие необходимости использовать живые клетки и наличие антигенов на поверхности клетки. Также анализ ДНК дает возможность определить намного больше аллельных вариантов антигенов ИЬА-системы. В последнее десятилетие широко применяется секвенирование ДНК, то есть, определение нуклеиновой последовательности определенного участка хромосомы. В нашем случае, для изучения антигенов системы ИЬА, исследуется последовательность нуклеотидов,
расположенных на коротком плече 6-ой хромосомы. Широкое применение метода секвенирования ДНК дала возможность открытия новых вариантов антигенов системы ИЬА [6].
Встатье представлено описание нового аллельного вариантагенаHLA-DQB1, впервые выявленного в Республике Казахстан.
Материалы и методы: В НПЦТ г. Астана в 2011- 2015 гг. было обследовано 3501 потенциальных доноров Национального регистра ГСК и 936 пациентов с онкогематологическими заболеваниями (в возрасте от 0-66 лет).
Препараты ДНК для проведения ИЬА-типирования были получены из свежеи цельнои крови (антикоагулянт - ЭДТА) методом колоночной фильтрации с использованием наборов реагентов PROTRANSDNABox 500 FastDNA. Концентрация препаратов ДНК, определенная на
спектрофотометре UV-visNanoDrop 2000 (Канада), составляла 25-40 нг/мкл при соотношении А260/А280 = 1,75-1,95.
HLA-типирование по локусам HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DRB1 проводили по технологии Sequencing Based Typing (SBT) с использованием набора реагентов PROTRANS HLA-A*, B*, C*, DRB1*, DQB1* (Protrans, Германия), основанные на технологии моноаллельного секвенирования. Анализ полученных сиквенсов проводили с использованием программного обеспечения SequencePilot. Капиллярный электрофорез осуществляли с использованием генетического анализатора 3500xl (Applied Biosystems, США). Полученные сиквенсы просматривали в программном обеспечении SeqPilotv3.14. с использованием библиотек HLA-аллелеи - IMGT/HLA. Частоты HLA-аллелеи и частоты их гаплотипов были определены методом максимального правдоподобия с помощью алгоритма максимизации ожидания для данных с неизвестной гаметическои фазои [7-8], реализованным в программном обеспечении Arlequin v .3.1. Стандартные отклонения рассчитывали при начальном значении итерации, равном 100. В случае определения одного аллеля индивидуум считали гомозиготным по данному аллелю. Результаты и обсуждение. В сентябре 2012 года у 83-го по счету онкогематологического пациента с острым миелобластным лейкозом (ОМЛ) по методу аллельспецифического секвенирования была обнаружена неоднозначность во II классе системы HLA, в локусе DQB1, такая же неоднозначность была найдена и у потенциальных доноров по материнской линий: у матери и дедушки. У пациента был получен следующий результат HLA-типирования: HLA-A*03:01, *31:01, B*07:02, *35:01, C*03:03, *03:03, DRB1*01:01, *11:01, DQB1*03, 05:01. Новый аллель похож на известный аллель HLA-DQB1*03:01. Отличие находится в экзоне 2 в позиции 223. В этой позиции представлен аденин (A), в то время как до этого дня в этой позиции был описан только гуанин (G) (рисунок 1).
Рисунок 1 - Электрофореграммасиквенса 2 экзона НЬА-0(2В1* локусаобразца ДНК пациента. В 223 позиции представлен четкий
пикаденина, когда в консенсусе описан только гуанин
Для исключения данного изменения от точечной мутации было проведено семейное обследование. В итоге было замечено, что такая же картина наблюдалась в образцах
крови матери (рисунок 2) и дедушки (рисунок 3) по материнской линии.
Рисунок 2- Электрофоре грамма сиквенса 2 экзона НЬА-0(2В1* локуса образца ДНК мамы пациента. На 223 позиции также выявлен
аденин, а не гуанин
РисунокЗ- Электрофореграмма сиквенса образца ДНК дедушки пациента по материнской линии. На 223 позиции
также выявлен аденин, а не гуанин
Результаты типирования потенциального донора мамы методом SBT: HLA-A*24:02:01G, *31:01:02; HLA-B*35:01:01G, *40:02:01; HLA-C*03:03:01G, *03:04:01G; HLA-DRB1*08:02:01, *11:01:01G; HLA-DQB1*03:02:01G, *03. Результаты типирования дедушки по материнской линий следующие: HLA-A*24:02:01G, *31:01:02; HLA-B*35:01:01G, *40:02:01;
HLA-C*03:03:01G, *03:04:01G; HLA-DRB1*08:02:01, *11:01:01G; HLA-DQB1*03:02:01G, *03.
Выявленный новый аллельный вариант был подан на регистрацию в WHO Nomenclature Committeevia the IMGT/HLA Database) под номером заявления HWS 10018423 и получил официальное название: HLA-DQB1*03:82 (рисунок 4).
BE A HATCH, SAVE A LIFE
Prof*** о г Steven GE Marsh
Deputy Director of Research ANTHONY NOLAN ReMarch Institute The Royal Free Hospital Pond Street London NW3 2QG 020 7284 8321 [email protected]
Dr Aida Turganbekova H LA-La borato ry Blood Center
Kerey, Zhanibek Khans, 10 Astana 010000 Kazakhstan
30 Juna, 2013
Dear Dr Aida Turganbekova
Thank you for the communication regarding your new HLA sequence (submission number HWS10018423). The WHO Nomenclature Committee for factors of the HLA System has officially named your sequence:
DQB1*03:82
This information will be included in the next lull Nomenclature report and will also be listed In a monthly update on new sequences assigned which will be published in Tissue Antigens, Human Immunology and the International Journal of Immunogenetlcs.
In the publication where this sequence first appears, It Is suggested a sentence on the nomenclature should be added:
The name DQB1 "03:82 has been officially assigned by the WHO Nomenclature Committee In June 2013. This follows the agreed policy that, subject to the conditions stated In the most recent Nomenclature Report (Marsh et al. 2010), names will be assigned to new sequences as they are identified. Lists of such new names will be published in the following WHO Nomenclature Report.
Reference
Marsh SGE, Albert ED. Bodmer WF, Bontrop RE. Dupont B. Erllch HA. Femândez-VIfia M, Geraghty DE, Holdsworth R. Hurley CK. Lau M. Lee KW. Mach B, Malers M, Mayr WR, Müller CR. Parham P, Petersdorf EW. Sasazukl T, Strominger JL, Svejgaard A, Terasakl PI, Tlercy JM, Trowsdale J : Nomenclature for Factors of the HLA System. 2010. Tissue Antigens (2010) 75 291 -455
I would appreciate a copy of any paper describing your allele sequence, once it has been published.
Best wishes,
Professor Steven GE Marsh
Chairman, WHO Nomenclature Committee for Factors of the HLA System
hla.alleles.org
www.ebl.ac.uk/lpd/lmgt/hla
^0 a anthonynolan anthonynolan
Anthony Nolan is a rcgistsrsd charity no S037I6/SC038B27 and
charity times Awards
Winner
Рисунок 4 - Свидетельство номенклатурного
Заключение: Методом аллельспецифического
секвенирования у казахстанского онкогематологического пациента с ОМЛ выявлен новый аллельный вариант HLA II класса локуса DQB1*03:82. Новый аллель похож на уже ранее известный аллель HLA-DQB1*03:01, отличается заменой в
;та ВОЗ на DQB1*03:82 аллельный вариант
кодоне 223 (TGC>TAC), приводящей к замене аденина на гуанин в 223 пептидсвязывающей бороздке. Показано, что аллель является наследуемым, а не возникшим в результате мутации при ОМЛ.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
1 Хаитов Р.М., Алексеев Л.П., Кофиади И.А. Иммуногенетика и персонализированная медицина // Физиология и патология иммунной системы. - 2G16. - №20(6). - С. 3-23.
2 Румянцев А.Г., Масчан А.А. Трансплантация гемопоэтических стволовых клеток у детей // Медицинское информационное агентство. - 2GG3. - С.912-918.
3 Савченко В.Г. Трансплантация костного мозга в онкогематологии. Клиническая онкогематология // Фундаментальные исследования и клиническая практика. - 2G1G. - №3(4). - С. 410-411.
4 Ефимов Г.А., Вдовин А.С., Григорьев А.А., Филькин С.Ю., Быкова Н.А., Савченко В.Г. Иммунобиология острой реакции «трансплантат против хозяина» // Медицинская иммунология. - 2G1S. - №17(6). - С. 499-51б.
5 Кузьмич Е.В., Алянский А.Л., Иванова Н.Е. Анализ результатов аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток в зависимости от степени HLA-подбора пациента и неродственного донора // Онкогематология. -2G14. - №3. - С. 25-31.
6 Логинова М.А., Парамонов И.В., Павлов В.Н., Сафуанова Г.Ш. Генетические особенности популяции, проживающей на территории Республики Башкортостан // Вестник трансплантологии и искусственных органов. - 2G16. - №1. - С. 58-бб.
7 7Excoffier L., Laval G., Schneider S. Arlequin. (version 3.G): An integrated software package for population genetics data analysis //Evolutionary Bioinformatics On-line. - 2GGS. - №1. - С. 47-SG.
8 Excoffier L., Slatkin M. Maximum-likelihood estimation of molecular haplotype frequencies in a diploid population // Molecular Biology and Evolution. -199S. - №12. - С. 921-927.
Ж.К. Бурютбаев1, С.А. Абдрахманова1, И.Р. Рамильева1, А.А. TypFaH6eKOBa1, Д.К. Байму^ашева1, Е.Б. Жибурт2
1К,азацстан республикасы денсаулыц сацтау министрлг «Трансфузиология гылыми-енд!р1ст1к орталыгы» ШЖЦРМК, Астана к,
К,азацстан
2РФ Денсаулыц сацтау министрлг "Н.И. Пирагов атындагы улттыцмедико-хирургия орталыгы" ФМБК, Мэскеу, Ресей
AF3A1AP МЕН Т1НДЕРД1 ТРАНСПЛАНТТАУ УШ1Н Т1Н УЙЛЕС1МД1Л1П АНТИГЕНДЕР1Н АНЬЩТАУ. ЖАНА HLA-DQB1*03:82
АЛЛЕЛЬД1АНЬЩТАУ
Тушн: Ма;алада Казахстан Республикасында бiрiнше рет аны;талган HLA-DQB1т¥к;ымыныц жаца аллельдiк нускэсыныц сипаты усынылган. Астана ;аласыныц Трансфузиология гылыми-ендарктш орталыгында 2011-2015 жылдары гемопоэздш дiц жасушалары ¥лтты; ^ркеудщ 3501 элеуетт доноры жэне онкогематологиялы; аурулармен ауыратын (жастары 0-66 жастан бастап) 936 емделушi тексерiлдi. Аллельдiк ерекше секвенирлеу эдiсiмен Казак;стандык; ас;ынган миелобласты; авданды; (АМА) диагнозы бар онкогематологиялы; емделушiде жаца аллельдiк нуск;асы HLA II класс DQB1*03:82 локусы аны;талды. Жаца аллель HLA-DQB1*03:01 алдыцгы белгш аллельге ук;сайды, 223 пептид байланыстырушы жырашыгында адениндi гуанинге алмастыруга экелеиш, 223 (TGC>TAC) кодонды ауыстыруда ерекшеленедь Аллель тук;ым куалаушы болып табылады, ал АМА кезiндегi 0згерiс нэтижейнде туындамаганы K0рсетiлген.
ТYЙiн свздер: HLA белу жэне ерекшШп; жаца аллельдш нуск;а, HLA-DQB1*03:82.
Z.K. Burkitbayev1, S.A. Abdrakhmanova1, I.R. Ramilyeva1, A.A. Turganbekova1, D.K. Baymukasheva1, E.B. Zhiburt2
1RSE on REM «Scientific-Production Center of Transfusiology», Ministry of Health of the Republic of Kazakhstan, Astana, Kazakhstan 2FSBI «National Medical and Surgical Center named after N.I. Pirogov» Ministry of Healthcare of the Russian Federation, Moscow, Russia
DETERMINATION OF HISTOCOMPATIBILITY ANTIGENS FOR ORGAN AND TISSUE TRANSPLANTATIONS. DETECTION OF A NEW
ALLELE HLA-DQB1*03:82
Resume. The study shows the descriptionof a new allelic variant of the HLA-DQB1 gene, first identified in the Republic of Kazakhstan. From 2011 to 2015 at the Scientific-Production Center of Transfusiology of Astana city,3501 potential donors for blood stem cell transplantation for the National Register of Blood and 936 patients with oncohematological diseases (aged 0-66 years) were analysed.During the allele-specific sequencing of Kazakhstani oncohematological patient with acute myeloid leukaemia (AML), a new allelic variant of HLA II class DQB1*03:82 lociwasdetected.The novel allele is similar to the existingHLA-DQB1*03:01 with a single non-synonymous difference, at position 223 peptide binding grooveG>A (codon 79 TGC to TAC). It is shown that this novel allele has been inheritedand was not because of mutation in AML.
Keywords: Distribution and specificity of HLA, a new allelic variant, HLA-DQB1*03:82.
РИСК РАЗВИТИЯ ИММУНОДЕФИЦИТНЫХ СОСТОЯНИЙ И АЛЛЕРГОПАТОЛОГИИ У НАСЕЛЕНИЯ ЭКОЛОГИЧЕСКИ НЕБЛАГОПОЛУЧНЫХ РЕГИОНОВ РЕСПУБЛИКИ КАЗАХСТАН
М.А. Газалиева1, Н.Ш. Ахметова1, Г.Ж. Утеубаева2, А.С. Барменова1,
А.С., Куликбаева1, С.Т. Исина1
1 - Карагандинский государственный медицинский университет,
кафедра иммунологии и аллергологии 2 - АО Медицинский университет Астана кафедра инфекционных болезней,
эпидемиологии и иммунологии
Результаты исследований состояния иммунной системы у населения экологически неблагополучных регионов Казахстана и прилегающих к ним территорий свидетельствуют о том, что техногенное загрязнение окружающей среды формирует иммунодефицитные состояния с риском развития аллергопатологии. Перспективными методическими подходами к управлению рисками является научное обоснование валеолого-экологической реабилитации населения и разработка технологии скрининговых легко доступных методов прогноза эколого-ассоциированных иммунопатологических заболеваний.
Ключевые слова: эколого-зависимые иммунопатологические состояния, функциональная активность субпопуляций лимфоцитов, иммуносупрессия, аллергопатология, иммунодефицитные состояния.
УДК 614.2-616-03
На современном этапе экология и здоровье человека - одна из актуальных стратегических мировых проблем, к которой привлечено внимание исследователей. Организм человека в процессе жизнедеятельности подвергается воздействию комплекса факторов внешней среды политропного действия, которые способствуют формированию изменённой реактивности организма, увеличивая степень
риска развития инфекционных, аутоиммунных иммунопролиферативных, аллергических заболеваний [1,2]. Одним из перспективных методических подходов для прогноза эколого-зависимых иммунопатологических состояний является и разработка технологии скрининговых легко доступных методов. Например, при проведении скрининга распространённости бронхиальной астмы в
