МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ПОПУЛЯЦИИ MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS В ВОЛОГОДСКОЙ ОБЛАСТИ - РЕГИОНЕ С НИЗКОЙ ЗАБОЛЕВАЕМОСТЬЮ ТУБЕРКУЛЕЗОМ

Вязовая А.А.; Лебедева И.А.; Ушакова Н.Б.; Павлов В.В.; Герасимова А.А.; Соловьева Н.С.; Журавлев В.Ю.; Нарвская О.В.

Original articles

Оригинальные статьи

Russian Journal of Infection and Immunity = Infektsiya i immunitet Инфекция и иммунитет

2021, vol. 11, no. 3, pp. 497-505 2021, Т. 11, № 3, с. 497-505

МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ПОПУЛЯЦИИ MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS В ВОЛОГОДСКОЙ ОБЛАСТИ -РЕГИОНЕ С НИЗКОЙ ЗАБОЛЕВАЕМОСТЬЮ ТУБЕРКУЛЕЗОМ

А.А. Вязовая1, И.А. Лебедева2, Н.Б. Ушакова2, В.В. Павлов2, А.А. Герасимова1, Н.С. Соловьева3, В.Ю. Журавлев3, О.В. Нарвская1,3

1ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия 2БУЗ ВО Вологодский областной противотуберкулезный диспансер, г. Вологда, Россия 3 ФГБУНИИфтизиопульмонологии Минздрава России, Санкт-Петербург, Россия

Резюме. Вологодская область характеризуется относительно спокойной эпидемической ситуацией по туберкулезу в России: показатель заболеваемости туберкулезом в 2010—2018 гг. снизился с 45,2 до 15,8 на 100 тыс. населения (44,4 в Российской Федерации). Однако доля больных туберкулезом с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ) возбудителя выросла с 12,1% в 2016 г. до 23,7% в 2018 г. Целью исследования была характеристика генетической структуры популяции M. tuberculosis и выявление основных генотипов, ассоциированных с первичной МЛУ возбудителя туберкулеза в Вологодской области. Изучено 82 штамма M. tuberculosis, выделенных в 2018 г. от вновь выявленных больных туберкулезом. Лекарственную чувствительность определяли стандартным методом абсолютных концентраций и с помощью BACTEC MGIT 960. Штаммы M. tuberculosis относили к генотипу Beijing и его основным подтипам, определяя специфические маркеры. Штаммы Beijing субтипировали методом MIRU-VNTR по стандартным 24 локусам, вычисляя индекс разнообразия Хантера— Гастона (HGDI). Штаммы группы non-Beijing сполиготипировали. К генотипу Beijing принадлежали 62,2% (51 из 82) штаммов. Среди штаммов Beijing наиболее многочисленным был кластер Central Asian/Russian (41,5%; 34 из 82 штаммов). Доли штаммов субтипа Central Asia Outbreak (CAO) и кластера B0/W148 составили 8,5% и 7,3% соответственно. Установлена принадлежность штаммов non-Beijing к семействам T (11%; 9 из 82), LAM (11%), Haarlem (6,1%) и Ural (4,9%). Среди 82 изолятов M. tuberculosis выявлено 33 (40,2%) МЛУ штамма, включая 27 принадлежащих к генотипу Beijing, в том числе, к кластерам Central Asian/Russian — 18 (66,7%), B0/W148 и CAO — по 4 (14,8%). MIRU-VNTR-типирование 51 штамма Beijing выявило 22 варианта профилей (HGDI = 0,852): самые многочисленные — 94-32 (35,3%) и 95-32 (15,7%) включали штаммы Central Asian/Russian и CAO; четыре штамма B0/W148 принадлежали к кластеру 100-32. Наиболее полиморфными были локусы QUB26 и MIRU26. Впервые проведенное в Вологодской области молекулярно-генетическое исследование выявило гетерогенность популяции M. tuberculosis, в которой доминировали штаммы генотипа Beijing. При этом доля

Адрес для переписки:

Вязовая Анна Александровна

197101, Россия, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14,

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера.

Тел.: 8 (812) 233-21-49.

E-mail: [email protected]

Для цитирования:

Вязовая А.А., Лебедева И.А., Ушакова Н.Б., Павлов В.В., Герасимова А.А., Соловьева Н.С., Журавлев В.Ю., Нарвская О.В. Молекулярно-генетический анализ популяции Mycobacterium tuberculosis в Вологодской области — регионе с низкой заболеваемостью туберкулезом // Инфекция и иммунитет. 2021. Т. 11, № 3. C. 497-505. doi: 10.15789/2220-7619-MAG-1545

Contacts:

Anna A. Vyazovaya

197101, Russian Federation, St. Petersburg, Mira str., 14, St. Petersburg Pasteur Institute. Phone: +7 (812) 233-21-49. E-mail: [email protected]

Citation:

Vyazovaya A.A., Lebedeva I.A., Ushakova N.B., Pavlov V.V., Geraslmova A.A., Solovleva N.S., Zhuravlev V.Yu., Narvskaya O.V. Molecular and genetic analysis of Mycobacterium tuberculosis population in the Vologda Region with low tuberculosis incidence // Russian Journal of Infection and Immunity = Infektsiya i immunitet, 2021, vol. 11, no. 3, pp. 497-505. doi: 10.15789/2220-7619-MAG-1545

Исследование выполнено при финансовой поддержке РНФ № 19-15-00028. © Вязовая А.А. и соавт., 2021 DOI: http://dx.doi.org/10.15789/2220-7619-MAG-1545

известного в России и за ее пределами эпидемиологически и клинически значимого кластера Beijing B0/W148, ассоциированного с МЛУ, составила лишь 7,3%, что значительно меньше, чем в других регионах СЗФО РФ (~19%). Вместе с тем в структуре генотипов и среди МЛУ штаммов M. tuberculosis преобладали представители кластера Central Asian/Russian генотипа Beijing.

Ключевые слова: Mycobacterium tuberculosis, множественная лекарственная устойчивость, сполиготипирование, MIRU-VNTR, генотип Beijing, кластер Central Asian/Russian, кластер B0/W148.

MOLECULAR AND GENETIC ANALYSIS OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS POPULATION IN THE VOLOGDA REGION WITH LOW TUBERCULOSIS INCIDENCE

Vyazovaya А.А.а, Lebedeva I.A.b, Ushakova N.B.b, Pavlov V.V.b, Gerasimova A.A.a, Solovieva N.S.c, Zhuravlev V.Yu.c, Narvskaya O.V.ac

a St. Petersburg Pasteur Institute, St. Petersburg, Russian Federation b Tuberculosis Dispensary of the Vologda Region, Vologda, Russian Federation cResearch Institute of Phthisiopulmonology, St. Petersburg, Russian Federation

Abstract. The Vologda Region is characterized by a relatively calm epidemic situation for tuberculosis in Russia: the incidence rate in 2010—2018 is decreased from 45.2 to 15.8 per 100 thousand of the population (44.4 in Russia). However, the proportion of patients with multiple drug resistance (MDR) of the pathogen increased from 12.1% in 2016 to 23.7% in 2018. The aim of the study was to characterize the genetic structure of the M. tuberculosis population and identify the main genotypes associated with the primary multidrug resistance of the pathogen in the Vologda Region. A total of 82 strains of M. tuberculosis isolated in 2018 from newly diagnosed tuberculosis patients were studied. Drug susceptibility testing was performed using the standard method of absolute concentration and BACTEC MGIT 960 kit. M. tuberculosis strains were assigned to the Beijing genotype and its main subtypes based on the analysis of specific markers. The Beijing strains were subtyped by the MIRU-VNTR method (24 standard loci), calculating the Hunter—Gaston Discriminatory Index (HGDI). Other strains of the non-Beijing group were spoligotyped. The majority of the strains were of the Beijing genotype (62.2%; 51 of 82). The most numerous cluster was Central Asian/Russian (41.5%; 34 of 82 strains). The shares of the Central Asia Outbreak (CAO) subtype and cluster B0/W148 amounted to 8.5% and 7.3%, respectively. The non-Beijing strains belonged to the genetic families T (11%; 9 of 82), LAM (11%), Haarlem (6.1%), and Ural (4.9%). Among 82 M. tuberculosis isolates, 33 (40.2%) MDR strains were identified, counting 27 of the Beijing genotype, including those ofthe Central Asian/Russian - 18 (66.7%), B0/W148 and CAO - 4 each (14.8%) clusters. MIRU-VNTR typing of 51 Beijing strains revealed 22 profiles (HGDI = 0.852); the largest clusters were 94-32 (35.3%) and 95-32 (15.7%), which included strains Central Asian/Russian and CAO. Four strains of genotype B0/W148 belonged to cluster 100-32. The loci QUB26 (HGDI = 0.493) and MIRU26 (HGDI = 0.388) had the highest polymorphism. For the first time, a molecular genetic study carried out in the Vologda region revealed the heterogeneity of the M. tuberculosis population with strains of the Beijing genotype dominated. At the same time, the share of the associated with MDR, epidemiologically and clinically significant cluster Beijing B0/W148, well defined in Russia and abroad, was only 7.3%, which is significantly less than in other regions of the Northwestern Federal District of the Russian Federation (~19%). Concurrent, representatives of the Central Asian/Russian cluster of the Beijing genotype prevailed in the structure of genotypes and among MDR M. tuberculosis strains.

Key words: Mycobacterium tuberculosis, multiple drug resistance, spoligotyping, MIRU-VNTR, Beijing genotype, cluster Central Asian/ Russian, cluster B0/W148.

Введение

Вологодская область по численности населения (1 167 713 чел. на 2019 г.) — крупнейший, после Санкт-Петербурга и Ленинградской области, регион Северо-Западного федерального округа (СЗФО) Российской Федерации (РФ). Площадь области — 144 527 км2; административный центр — город Вологда (311 846 чел.). Область граничит с восемью субъектами РФ: Архангельской областью на севере, Кировской — на востоке, Костромской и Ярославской — на юге, Тверской и Новгородской — на юго-западе, Ленинградской — на западе и Республикой Карелия — на северо-западе. Вологодская область характеризуется относительно спокой-

ной эпидемической ситуацией по туберкулезу (ТБ) в СЗФО и входит в число семи сравнительно благополучных регионов РФ. Показатель заболеваемости ТБ общего населения области за период 2010—2018 гг. снизился с 45,2 до 15,8 (28,6 по СЗФО; 44,4 по РФ) на 100 тыс. населения [5]. При этом заболеваемость ТБ постоянного населения также уменьшилась до 13,2 на 100 тыс. в 2018 г. (25,7 по СЗФО). В целом заболеваемость ТБ за 2018 г. сократилась на 26%, а смертность — на 14%. Однако отмечен рост доли инфицированных ВИЧ с 7,1% в 2017 г. до 9,6% в 2018 г. (20,9% и 23,1% по РФ) среди впервые выявленных больных ТБ постоянных жителей Вологодской области и рост заболеваемости ТБ больных с коинфекцией — 1,2 против

I,3 (8,3 и 8,5 по РФ) на 100 тыс. соответственно. В структуре впервые выявленного ТБ увеличилась доля больных туберкулезом с множественной лекарственной устойчивостью возбудителя (МЛУ-ТБ) к противотуберкулезным препаратам (ПТП) с 12,1% в 2016 г. до 23,7% (35,1% в 2018 г. (30,4% по СЗФО, 31,9 % по РФ) [ 5].

В структуре впервые выявленных бактерио-выделителей при ТБ органов дыхания увеличилась доля больных МЛУ-ТБ с 28,4% в 2017 г. до 34,6% в 2018 г. (31,6% по СЗФО, 32,2% по РФ) [5]. Среди причин роста МЛУ-ТБ в РФ отмечают широкое распространение штаммов Mycobacterium tuberculosis генетического семейства (линии, lineage) Beijing, в частности его основных кластеров — Central Asian/Russian (Центрально-Азиатский/Российский, CC1, также именуемый «кластер 94-32») и B0/W148 (CC2) [3, 6, 7, 8, 9, 11, 13, 14, 15]. Неоднородный Central Asian/ Russian кластер включает распространенный в Средней Азии, ассоциированный с устойчивостью к ПТП эпидемиологически значимый субтип CAO (англ. Central Asia Outbreak — Центрально-Азиатская вспышка), выявляемый и в России [8, 12].

В ряде регионов СЗФО доля штаммов M. tuberculosis генотипа Beijing у впервые выявленных больных ТБ составляла 45—63% [1, 2,

II, 15]. По Вологодской области информация о распространенности генетических семейств возбудителя туберкулеза отсутствует, поскольку популяционные исследования M. tuberculosis на данной территории до настоящего времени не проводились.

Целью исследования была характеристика генетической структуры популяции M. tuberculosis и выявление основных генотипов, ассоциированных с первичной МЛУ возбудителя туберкулеза в Вологодской области.

Материалы и методы

Согласно официальным данным, с марта 2018 г. по март 2019 г. в Вологодской области был выявлен 161 больной ТБ (156 случаев — туберкулез легких, 4 — туберкулез плевры, 1 — внеле-гочный туберкулез), из них 110 бактериовыдели-телей. Критериями включения в исследование стали впервые выявленный туберкулез, возраст старше 18 лет, постоянное проживание в регионе, наличие культуры M. tuberculosis. Нами изучены 82 изолята M. tuberculosis, впервые полученных от бактериовыделителей (в том числе от 9 больных ВИЧ/ТБ), — 51 (62,2%) мужчины и 31 женщины. Культивирование клинического материала осуществляли с использованием стандартных методов; определение лекарственной чувствительности изолятов M. tuberculosis к ПТП проводили методом абсолютных кон-

центраций на плотных питательных средах и/или методом пропорций на жидкой питательной среде в системе Bactec MGIT 960 (приказ Минздрава РФ от 21.03.2003 г. № 109).

При наличии устойчивости к одному из ПТП (стрептомицину) штаммы M. tuberculosis считали монорезистентными, к двум препаратам (стрептомицину и изониазиду) — полирезистентными, одновременно устойчивые к рифампицину и изониазиду — мультирезистентными (МЛУ) (приказ Минздрава РФ № 951, ред. от 29.10.2014).

Выделение ДНК из чистых культур M. tuberculosis, вывление генотипа Beijing (включая кластеры B0/W148 и Central Asian/Russian, CAO), дифференциацию современной и древней сублиний генотипа Beijing, MIRU-VNTR-типи-рование по 24 локусам и сполиготипирование проводили как описано ранее [15]. Полученные сполигопрофили сопоставляли с профилями из международной базы SITVIT2 (http://www. pasteur-guadeloupe.fr:8081/SITVIT2) и определяли сполиготип — SIT (Spoligotype International Type).

Число повторов в каждом локусе MIRU-VNTR — числовой профиль штамма — сравнивали с профилями в международной базе данных MIRU-VNTRplus (http://www.miru-vntrplus. org) и находили MIRU-VNTR-тип согласно номенклатуре (MLVA Mtbc 15-9). Построение филогенетического древа для оценки родства штаммов осуществляли методом невзвешен-ной попарной группировки с усреднением (Unweighted Pair-Group Method Using Arithmetic Averages, UPGMA). Для оценки аллельного полиморфизма локусов и дискриминирующей способности MIRU-VNTR-типирования рассчитывали индекс разнообразия Хантера—Гастона (HGDI, Hunter—Gaston Discriminatory Index) [15].

Статистическую обработку полученных результатов проводили с использованием пакета программ Excel и ресурса «Медицинская статистика» (https://medstatistic.ru/calculators.html), вычисляя значения критерия хи-квадрат Пирсона (для степеней свободы, f), точного критерия Фишера с помощью четырехпольных таблиц или произвольных таблиц сопряженности и отношения шансов (ОШ). Различия между группами считали статистически значимыми при доверительном интервале (ДИ) 95 % и p < 0,05.

Результаты и обсуждение

Из 82 штаммов M. tuberculosis, выделенных от впервые выявленных больных ТБ в Вологодской области, 34 (41,5%) были лекарственно-чувствительными (ЛЧ), 15 (18,3%) — моно- и полирезистентными. МЛУ обладали 33 (40,2%) штамма. Все МЛУ-штаммы, за исключением одного, проявляли устойчивость к стрептомицину; 72,7% (24 из 33) штаммов были резистент-

Таблица 1. Генотипы и лекарственная устойчивость штаммов M. tuberculosis

Table 1. Genotypes and drug resistance of M. tuberculosis strains

Генотип Genotype ЛЧ М/П* МЛУ Всего

Sensitive M/P* MDR Total

n = 34 n = 15 n = 33 n = 82

Beijing 14 10 27 51

B0/W148 0 2 4 6

Central Asian/Russian 11 5 18 34

Central Asia Outbreak (CAO) 0 3 4 7

Другой/Other 2 0 1 3

Древний/Ancient 1 0 0 1

Non-Beijing 20 5 6 31

Т 6 1 0 7

LAM 7 2 2 11

Ural 2 0 2 4

Haarlem 2 1 2 5

Unknown 3 1 0 4

Примечание. * Моно-/полирезистентный. Note. Mono-/polyresistant.

UPGMA-Tree, MIRU-VNTR [24]: Categorical (1). RD: Categorical (1)

ны к этамбутолу, 18,2% — к пиразинамиду. Устойчивостью к инъекционным ПТП — кана-мицину и капреомицину — обладали 45,5 и 9,1% штаммов соответственно. Доля МЛУ-штаммов у больных ВИЧ+/ТБ (77,8%; 7 из 9) значимо превышала таковую у ВИЧ-отрицательных больных ТБ (35,6%; 26 из 73) (p < 0,05).

Установлена принадлежность 62,2% (51 из 82) штаммов M. tuberculosis к генотипу Beijing (табл. 1), что сопоставимо с данными по Калининградской области (63,0%) [1]. Для сравнения: в среднем по СЗФО доля генотипа Beijing в разные периоды составляла около 50,0% [2, 11, 15].

Штаммы генотипа Beijing, за исключением одного ЛЧ, относились к современной сублинии, превалирующей в российской популяции M. tuberculosis [10]. Как видно из табл. 1, наиболее многочисленным был кластер Central Asian/Russian (41,5%; 34 из 82 штаммов). Доля субтипа CAO в исследуемой выборке составила 8,5% (7 из 82), что превышало значение данного показателя в Омской области (3,8%; 5 из 131)

Кластер Beijing

MIRU-VNTR

™п mimmüímé

- 2044 Polyresistant

- 781 MDR

- 1019 MDR

j 1221 Sensitive ' 3459 Sensitive 1033 Sensitive 1290 MDR 1737 Sensitive 1902 Polyresistant 203 MDR 2194 Sensitive 2620MDR 2715 MDR 3219 MDR 374 MDR 3773 Sensitive 3809 MDR 4139 MDR 4435 MDR 4640 MDR 5015 MDR

- 546 Sensitive 970 MDR

j 124 MDR ' 2605 Polyresistant

- 1702 Polyresistant

- 4418 Sensitive 1485 MDR 2026 MDR 2134 MDR 2283 MDR 2879 MDR

4119 Polyresistant 575 MDR 800 Sensitive

- 1654 MDR

- 2999 Polyresistant

4787 Monoreslstant

- 537 Sensitive

- 2320 Monoreslstant

- 4798 Polyresistant

- 2193 MDR

3135 Polyresistant 4179 MDR 4321 MDR 57 MDR

- 2169 Sensitive

- 4219!

Central-Asian/Russian Central-Aslan/Russlan CAO

Central-Asian/Russian Central-Asian/Russian Central-Asian/Russian Ce ntra l-Asla n/Russ la n Central-Asian/Russian CAO

Central-Asian/Russian Ce ntra l-Asla n/Russ la n CAO CAO

Central-Asian/Russian Central-Aslan/Russlan Central-Asian/Russian Ce ntra l-Asla n/Russ I a n Central-Asian/Russian Central-Aslan/Russlan CAO

Central-Asian/Russian Ce ntra l-Asla n/Russ I a n Central-Asian/Russian Ce ntra l-Asla n/Russ la n Central-Asian/Russian CAO

Central-Asian/Russian Central-Aslan/Russlan Central-Asian/Russian Central-Aslan/Russlan Central-Asian/Russian Central-Aslan/Russlan Central-Asian/Russian Central-Aslan/Russlan Central-Asian/Russian Central-Asian/Russian CAO

Central-Asian/Russian

Ce ntra l-Asla n/Russ la n

Central-Asian/Russian

Ce ntra l-Asla n/Russ la n

B0/W148

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

B0/W148

9360-32

9360-15

9358-32

7-32

?-32

94-32

94-32 1065-32 1065-32 9125-32

99-32

95-32 95-32 95-32 95-32 95-32 95-32 95-32 95-32 18075-32 9129-32 10520-32 10519-32 1068-32 11780-32 9378-32 4737-32

100-32 100-32 100-32 100-32 1048-32 3838-32 893-32

?-114

4 4 2.

2 4 2

2 4 2.

2 4 2 4 4 2.

4 4 2. 4 4 2.

4 4 2.

4 4 2,

4 4 2.

4 4 2. 4 4 2.

4 4 2,

4 4 2.

4 4 2,

4 4 2.

4 4 2,

4 4 2. 4 4 2,

4 4 2.

4 4 2,

4 4 2. 4 4 2,

4 4 2,

4 4 2.

4 4 2, 4 4 2.

4 4 2,

4 4 2.

4 4 2,

4 4 2.

4 4 2,

4 4 2 4 4 2,

4 4 2. 4 4 2,

4 4 2.

4 4 2,

4 4 2, 4 4 2.

4 4 2,

2 4 2 2 4 2,

2 6 4 4 2 2

2 6 4 4 4 2

2 6 3 4 4 2

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

2 6 3 4 4 2

2 6 4 4 4 2

5 1 5 3 3 4

5 1 5 3 3 5

î 3 4

i 3 4

5 1 5 3 3 5

3 3 4

i 3 4

5 1 4 3 3 5

5 1 5 3 3 5

5 1 7 3 3 5

5 1 7 3 3 4

5 1 7 3 3 5

3 1 5 3 3 4

3 8 2 2

3 8 2 3

3 6 2 3

3 9 2 3

3 7 2 3

3 8 2 3

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

3 8 2 3

3 6 2 3

3 7 2 3

3 8 2 3

3 7 2 3

3 8 2 3

3 5 2 3

3 7 2 3

3 6 3 2

Рисунок 1. Дендрограмма на основе профилей 24 локусов MIRU-VNTR штаммов Beijing M. tuberculosis

Figure 1. The dendrogram plotted by using 24 MIRU-VNTR loci of M. tuberculosis Beijing strains Примечание. Для каждого штамма указаны номер и отношение к ПТП (Sensitive — ЛЧ, Monoresistant — монорезистентность, Polyresistant — полирезистентность, MDR — МЛУ).

Note. Strain number, drug resistance profile (Sensitive, Monoresistant, Polyresistant, MDR) are depicted in box.

и Республике Коми (1,5%; 2 из 130), однако различия не были статистически значимыми (p > 0,05) [12, 15]. Доля штаммов кластера Beijing B0/W148 (7,3%; 6 из 82) в Вологодской области была существенно меньше, чем в соседних регионах СЗФО — Республиках Карелия (17,9%, 14 из 78; p = 0,043), Коми (18,5%, 24 из 130; p = 0,024) и в Калининградской области (19,2%; 14 из 73) (p = 0,028) [1, 2, 15]. При этом все штаммы кластеров CAO и B0/W148 были устойчивы хотя бы к одному ПТП, а 57,1 (4/7) и 66,7% (4/6) штаммов соответственно обладали МЛУ (табл. 1). Из 34 штаммов кластера Central Asian/ Russian лекарственно-чувствительными были 32,3% (11); МЛУ выявлена у 52,9% (18) штаммов.

MIRU-VNTR-типирование 51 штамма Beijing M. tuberculosis выявило 22 варианта паттернов (профилей) (HGDI = 0,852) (рис. 1). Как видно на рис. 1, пять паттернов представлены кластерами: из них наиболее крупные — 94-32 (35,3%; 18 из 51) и 95-32 (15,7%; 8), которые включали штаммы Central Asian/Russian и CAO. Три из семи штаммов САО имели индивидуальные MIRU-VNTR-паттерны, остальные вошли в кластер 94-32, но различались по фенотипи-ческому профилю резистентности, то есть, скорее всего, были выделены от эпидемиологически не связанных больных ТБ. Четыре штамма генотипа В0/^48 принадлежали к кластеру 100-32. Ранее установлено, что паттерны 9432 и 100-32 являются наиболее распространенными у штаммов российской популяции M. tuberculosis Beijing [3, 14].

Из 24 локусов MIRU-VNTR локусы MIRU02, MIRU04, MIRU10, MIRU16, MIRU20, MIRU24, MIRU27, MIRU40, ETR-B, ETR-С, QUB11b, Mtub29, Mtub34, Mtub39 были мономорфны — все штаммы имели один и тот же аллельный вариант. Наибольшим полиморфизмом обладали локусы QUB26 (HGDI = 0,493) и MIRU26 (HGDI = 0,388), что позволяет использовать их для дифференциации штаммов M. tuberculosis Beijing.

Сполиготипирование 31 штамма non-Beijing выявило 13 сполиготипов (SIT) четырех генетических семейств: T, LAM, Haarlem и Ural (табл. 2). Принадлежность к семейству не определена для штаммов с новыми сполигопро-филями, SIT877 и SIT56: в табл. 2 обозначены Unknown (неизвестный). Обнаружение редких сполиготипов (SIT56, SIT1173, SIT2384) M. tuberculosis вне семейных очагов у пациентов, проживающих в одном населенном пункте, не исключает наличие скрытых эпидемиологических связей в парных случаях.

Гетерогенное семейство T (11%; 9 из 82) было представлено ЛЧ изолятами M. tuberculosis, за исключением одного (SIT1173) монорезистентного к этамбутолу (табл. 2). Генетическое семейство

со

ф са

■S2 w о

3

у со

ф II

■о 3 с

О)

§

Ой ю

о m

s £=

г О

л £=

1- (Л

3 С

.а <Я i_

1- ■4—'

и (Л

о

Ой Я

s

У "3

>s о

о 1- ^ tu

и -Q

> :з 4—.

CK re S

X Ч—

X О

ф ш

и 1- и о £= te

а. ■4—'

ге m

Ü ся

Ф ^ Ш i_

О)

s

i_

.а "О

с s 1- "О £= te

о ^ СЯ

s ^ о ф > ■4—'

с О

и .Е?

сч "о

ге СО

s сО

s

^ CD

VO _Q

te 1—

1-

00

о

S со

S с

<5 'го

з со СО см СО см см см см

о "rö

^ о

ф 1-

и

со

> сс

^ Q см

s 2

>s

z

X

H X С

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

ф го

H

и со

s 'СО

И ф

ф . s с ^ о с/ см

о о

с: с о

о

X

о

S

ф

>

со с ф СО СО см СМ см см см

■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ □ □ ■

■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ □ □ □

□ ■ ■ □ ■ ■ ■ □ ■ ■ ■ ■ ■ □ □ □

■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ □ □ ■

■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ □ □ □

□ □ □ □ □ □ □ □ □ □ □ □ □ □ □ □

s ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ □ □ □

s ■ ■ ■ ■ ■ ■ □ ■ □ □ □ □ □ □ □ □

ГС ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ □ ■ □ □ □ □ □ □

00 ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ □ ■ □ □ □ □ □ □

о Ф ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ □ ■ □ □ ■ □ □ □

. ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ □ ■ □ ■ ■ □ □ □

с О ■ ■ □ ■ ■ ■ ■ ■ □ ■ □ ■ ■ □ □ □

s ■ ■ ■ ■ ■ □ ■ □ ■ ■ □ ■ ■ □ □ □

H CT ■ ■ ■ ■ □ □ □ □ □ ■ □ □ ■ ■ ■ ■

о С ■ ■ ■ ■ □ □ □ □ □ ■ □ □ ■ ■ ■ ■

s 'ü ■ ■ ■ ■ □ □ □ □ □ ■ □ □ ■ ■ ■ ■

с ■ ■ ■ ■ □ □ □ □ □ ■ ■ □ ■ ■ ■ ■

о о ■ ■ ■ ■ □ □ ■ □ □ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■

с и о ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ □ □ □ □ □ ■ ■ □ □ □ □ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ □ ■ ■

Е^ со ■ ■ ■ □ □ □ ■ □ □ ■ ■ ■ ■ ■ □ ■

S ■ ■ ■ □ □ □ ■ □ □ ■ ■ ■ ■ ■ □ ■

- ■ ■ ■ □ □ □ ■ □ □ ■ ■ ■ ■ ■ □ ■

о ■ ■ ■ □ ■ □ ■ □ □ ■ ■ ■ ■ ■ □ ■

. ■ ■ ■ □ ■ ■ ■ ■ □ ■ ■ ■ ■ □ □ ■

с ■ ■ ■ □ ■ ■ ■ ■ □ ■ ■ ■ ■ ■ □ ■

■ ■ ■ □ ■ ■ ■ ■ □ ■ ■ ■ ■ ■ □ ■

■ ■ ■ □ ■ ■ ■ ■ □ ■ ■ ■ □ ■ □ ■

■ ■ ■ □ ■ ■ ■ ■ □ ■ ■ ■ ■ ■ □ ■

■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ □ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■

■ ■ ■ ■ □ ■ ■ ■

1—

с s СО

H ф"

о ^ s ^ о 2 ю СО ю 2 2 1173 4 ю 2 4 CD 2 ю СО СО 2384 2 о ю ю 2854 2 CD 2 CD 5 7 7 8 NEW

о

с "Ô

О CP со

с Ф С с с

s £ £ £ Е s s s

о о о о о о о о о

X ф с ф ш S S S та та та та "та с с с

а О < < < < та та та та с с с

1- 1- 1- 1- —1 —1 —1 —1 э э э э

LAM включало девять (11%) штаммов, из них два обладали МЛУ. Штаммы генотипа Ural (4,9%; 4) были представлены лишь одним спо-лиготипом — SIT262, и, как видно из таблицы 2, два штамма проявляли МЛУ Семейство Haarlem представлено пятью (6,1%) штаммами, в том числе двумя МЛУ-штаммами (SIT50 и SIT511). Сравнимые значения частоты встречаемости генотипов Т (14 и 15%), LAM (10 и 12%) и Haarlem (5 и 4%) наблюдали в Республиках Карелия и Коми, генотипа Ural (6 и 7%) — в Калининградской области и Республике Коми соответственно [1, 2, 15].

Доля МЛУ штаммов non-Beijing составила 7,3% (6 из 82) (табл. 1), что близко к показателю по Калининградской области (9,6%, 7 из 73; p = 0,611) и Республике Карелия (10,3%, 7 из 78; p = 0,702) и незначительно превышает показатель по Республике Коми (3,8%, 5 из 130; p =

0,268) [1, 2, 15]. Доли устойчивых к этамбутолу МЛУ-штаммов Beijing (81,5%; 22 из 27) и non-Beijing (33,3%; 2 из 6) существенно различались (p < 0,05).

С учетом выявленных различий между группами Beijing и non-Beijing штаммов M. tuberculosis был проведен анализ клинико-эпидемиоло-гических данных пациентов (табл. 3). В обеих группах преобладали мужчины (суммарно 62,2%), что в целом отражает статистику заболеваемости туберкулезом мужчин в России (67,8%) [5]. Однако статистически значимой связи между полом пациентов и генотипом возбудителя не обнаружено (табл. 3). Средний возраст инфицированных возбудителем генотипа Beijing составил 42,8 года против non-Beijing 47 лет. Выявлена статистически значимая связь между возрастом пациентов и генотипом возбудителя (х2 = 8,417 при f = 3; p = 0,039). При этом

Характеристика Characteristics Beijing N, абс./ abs. (%) non-Beijing N, абс./ abs. (%) X2 Уровень значимости p-value ОШ OR 95% ДИ 95% CI

Всего/Total 51 (100) 31 (100)

Пол/Sex

мужчины/males 29 (56,9) 22 (71,0) 1,631 0,202 0,54 0,21-1,40

женщины/females 22 (43,1) 9 (29,0)

Средний возраст, лет/Median age, years

мужчины/males 43,6±12,6 48,3±9,4

женщины/females 41,6±11,8 43,7±6,4

Возрастные группы, лет/Age groups, years

18-34 18 (35,3) 3 (9,7) 6,641 0,010 5,091 1,357-19,095

35-44 10 (19,6) 13(41,9) 4,763 0,030 0,338 0,125-0,912

45-54 11 (21,6) 7 (22,6) 0,012 0,915

55 и старше/55 and older 12 (23,5) 8 (25,8) 0,054 0,816

Место проживания/Residence

городские жители/urban 32 (62,7) 18 (58,1) 0,178 0,674 1,216 0,489-3,027

сельские жители/rural 19 (37,3) 13(41,9)

ВИЧ+/Н1У+ 8 (15,7) 1 (3,2) 0,142* > 0,05 5,581 0,663-46,992

Клинические формы туберкулеза/Clinical forms of tuberculosis

инфильтративный туберкулез легких infiltrative pulmonary tuberculosis 27 (52,9) 15 (48,4) 0,160 0,690

диссеминированный туберкулез легких disseminated pulmonary tuberculosis 11 (21,6) 8 (25,8) 0,195 0,660

очаговый туберкулез легких focal pulmonary tuberculosis 3(5,9) 2(6,5) 0,138* 0,711

фиброзно-кавернозный туберкулез cavernous tuberculosis 2(3,9) 0 0,524* > 0,05

генерализованный туберкулез generalised tuberculosis 2(3,9) 1 (3,2) 0,361* > 0,05

прочие other 6(11,8) 5 (16,1) 0,316 0,574

Примечание. * — точный критерий Фишера (двусторонний). Note. Fisher exact test (two tailed).

Таблица 3. Характеристика больных туберкулезом, вызванным штаммами M. tuberculosis генотипа Beijing и non-Beijing

Table 3. Characteristics of patients with tuberculosis caused by M. tuberculosis strains of Beijing and non-Beijing genotypes

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

значимые различия выявлены в возрастных группах 18—34 (чаще встречался генотип Beijing) и 35—44 (чаще встречались другие генотипы — non-Beijing) (табл. 3). Лица данного возраста принадлежат к группе трудоспособного и наиболее социально активного населения, что повышает риск распространения туберкулеза.

В 2018 г. среди впервые выявленных больных ТБ из числа постоянных жителей Вологодской области доля ВИЧ-положительных составила 9,6% [5]. В нашем исследовании доля зараженных ВИЧ среди пациентов, инфицированных возбудителем генотипа Beijing, составила 15,7% против 3,2% в группе инфицированных другими генотипами (non-Beijing) возбудителя. Среди клинических диагнозов в обеих группах чаще встречались инфильтративный и диссемини-рованный туберкулез легких. Связь между клинической формой туберкулеза, ВИЧ статусом

пациентов и генотипом возбудителя (Beijing или non-Beijing) статистически не значима (р > 0,05) (табл. 3).

Далее был проведен анализ распределения основных генотипов возбудителя у больных туберкулезом на территориях в Вологодской области (рис. 2): на северо-западе (n = 11), юго-западе (n = 17), в центральной части (n = 11), на востоке (n = 10). Отдельно оценивали структуру генотипов M. tuberculosis больных ТБ, проживающих в Вологде (n = 33). Как видно на рис. 2, штаммы генотипа Beijing преобладали на всех территориях, однако их доля была больше на северо-западе, нежели в других районах Вологодской области. Распределение штаммов Beijing кластера Central Asian/Russian по территории области было относительно равномерным.

Штаммы кластера В0/^48 и субтипа CAO кластера Central Asian/Russian (по 18,2%) гено-

----Волго-Балтийский водный путь

Volga-Baltic waterway

О Beijing Central Asian/Russian □ Beijing other ЕЭ Ural

I Beijing B0/W148 IT

I Haarlem

Щ Beijing CAO □ LAM ■ Unknown

Рисунок 2. Генотипы M. tuberculosis в Вологодской области

Figure 2. Genotypes of M. tuberculosis identified in the Vologda Region

Примечания. Северо-запад области включали Вытегорский, Белозерский, Вашкинский и Кирилловский районы; юго-запад — Чагодощенский, Устюженский, Кадуйский, Череповецкий, Бабаевский и Шекснинский районы; центральная часть — Вологодский, Усть-Кубинский, Вожегодский, Харовский, Сямженский, Сокольский, Междуреченский и Грязовецкий районы; восток — Верховажский, Тотемский, Бабушкинский, Тарногский, Нюксенский, Великоустюгский, Кичменгско-Городецкий и Никольский районы.

Notes. The North-West of the Region consisted of Vytegorsky, Belozersky, Vashkinsky and Kirillovsky Districts; South-West — Chagodoshchensky, Ustyuzhensky, Kaduysky, Cherepovets, Babaevsky and Sheksninsky Districts; the central part — Vologda District, Ust-Kubinsky, Vozhegodsky, Kharovsky, Syamzhensky, Sokolsky, Mezhdurechensky and Gryazovets Districts; East — Verkhovazhsky, Totemsky, Babushkinsky, Tarnogsky, Nyuksensky, Velikoustyugsky, Kichmengo-Gorodetsky and Nikolsky Districts.

типа Beijing преимущественно были выделены в северо-западных районах области (рис. 2). Данная территория отличается развитой транспортной инфраструктурой: именно здесь проходит обеспечивающий коммуникацию Волго-Балтийский водный путь (объединяет в единую систему воды Балтийского, Белого, Каспийского, Азовского и Черного морей), что может способствовать распространению определенных вариантов возбудителя туберкулеза.

Согласно гипотезе появления штаммов M. tuberculosis генотипа Beijing на территории бывшего СССР, первоначально штаммы данного генотипа были занесены из Китая работниками Китайско-Восточной железной дороги, а затем получили распространение в исправительно-трудовых лагерях (ИТЛ) системы ГУЛАГ и среди гражданского населения СССР [6]. В Вологодской области самым крупным являлся Вытегорский ИТЛ (Вытегорлаг, дислоцировался в г. Вытегра) (1948— 1952 гг.), контингент которого был привлечен к строительству Волго-Балтийского водного пути на участке «озеро Онежское — озеро Белое» [4]. Это отчасти объясняет циркуляцию штаммов генотипа Beijing в целом, а также кластера В0/^148 и субтипа CAO кластера Central Asian/Russian на северо-западе Вологодской области в современных условиях.

В структуре M. tuberculosis группы non-Beijing распределение штаммов других генетических семейств также имело свои особенности. Популяции M. tuberculosis Вологды и юго-запада области оказались неоднородными; штаммы

Список литературы/References

семейства T были обнаружены только на востоке области и в Вологде (рис. 2).

Отмеченные тенденции в географическом распределении генотипов M. tuberculosis в Вологодской области следует интерпретировать с осторожностью из-за небольшого размера выборки, относительно короткого периода наблюдения (1 год) и неполноты эпидемиологической характеристики случаев заболевания.

Заключение

Впервые проведенное в Вологодской области молекулярно-генетическое исследование возбудителя ТБ позволило выявить гетерогенность популяции M. tuberculosis, в которой более половины (62%) штаммов принадлежали к генотипу Beijing. При этом доля распространенного в России и за ее пределами кластера Beijing B0/W148, ассоциированного с МЛУ, составила лишь 7,3%, что значительно меньше, чем в других регионах СЗФО РФ (~19%). Вместе с тем в структуре генотипов и среди МЛУ-штаммов M. tuberculosis преобладали представители кластера Central Asian/Russian генотипа Beijing.

Представленные данные могут послужить основой для разработки методологии молеку-лярно-генетического мониторинга популяции M. tuberculosis в целях совершенствования контроля распространения эпидемиологически и клинически значимых вариантов возбудителя туберкулеза в Вологодской области и других регионах Северо-Запада России.

1. Военнопленные в СССР. 1936-1956. Том 6. Лагеря для военнопленных НКВД-МВД СССР (1939-1956) / под ред. М.М. Загорулько. Волгоград, 2013. 766с. [War prisoners in the USSR. 1936-1956. Volume 6. Penitentiary camps for prisoners of war of the NKVD-Ministry of Internal Affairs of the USSR (1939-1956). Volgograd, 2013. 766p. (In Russ.)]

2. Вязовая А.А., Ахмедова Г.М., Соловьева Н.С., Герасимова А.А., Старкова Д.А., Туркин Е.Н., Журавлев В.Ю., Нарвская О.В., Мокроусов И.В. Молекулярная эпидемиология туберкулеза в Калининградской области России: 10 лет спустя // Инфекция и иммунитет. 2017. Т. 7, № 4. С. 367—374. [Vyazovaya A.A., Akhmedova G.M., Solovieva N.S., Gerasimova A.A., Starkova D.A., Turkin E.N., Zhuravlev V.Y., Narvskaya O.V., Mokrousov I.V. Molecular epidemiology of tuberculosis in the Kaliningrad region of Russia: 10 years after. Infektsiya i immunitet = Russian Journal of Infection and Immunity, 2017, vol. 7, no. 4, pp. 367-374. (In Russ.)] doi: 10.15789/2220-7619-2017-4-367-374

3. Вязовая А.А., Соловьева Н.С., Сунчалина Т.В., Мокроусов И.В., Журавлев В.Ю., Нарвская О.В. Характеристика популяции Mycobacterium tuberculosis в Республике Карелия // Туберкулез и болезни легких. 2016. № 8. С. 48-53. [Vyazovaya A.A., Solovieva N.S., Sunchalina T.V., Mokrousov I.V., Zhuravlev V.Yu., Narvskaya O.V. Characteristics of Mycobacterium tuberculosis population in Republic of Karelia. Tuberkulez i bolezni legkih = Tuberculosis and Lung Diseases, 2016, no. 8, pp. 48-53. (In Russ.)] doi: 10.21292/2075-1230-2016-94-8-48-53

4. Жданова С.Н., Огарков О.Б., Синьков В.В., Хромова П. А., Орлова Е.А., Кощеев М.Е., Савилов Е.Д. Эпидемиологическое обоснование распространения основных клонов генотипа Beijing Mycobacterium tuberculosis в Иркутской области // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2017. № 6. С. 88-94. [Zhdanova S.N., Ogarkov O.B., Sinkov V.V., Khromova P.A., Orlova E.A., Koshcheev M.E., Savilov E.D. Epidemiological study of main clones distribution genotype Beijing of Mycobacterium tuberculosis within Irkutsk region. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii = Journal of Microbiology Epidemiology andImmunobiology, 2017, no. 6, pp. 88-94. (In Russ.)] doi: 10.36233/0372-9311-2017-6-88-94

5. Ресурсы и деятельность противотуберкулезных организаций Российской Федерации в 2017-2018 гг. (статистические материалы). М.: РИО ЦНИИОИЗ, 2019. 101 с. [Resources and activities of anti-tuberculosis organizations of the Russian Federation in 2017-2018 (statistical materials). M.: RIO TSNIIOIZ, 2019. 101 p. (In Russ.)]

6. Синьков В.В., Огарков О.Б., Савилов Е.Д. Реконструкция эпидемической истории «пекинского генотипа» Mycobacterium tuberculosis в России и странах бывшего СССР по результатам сполиготипирования // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2011. № 3. С. 25-29. [Sinkov VV., Ogarkov O.B., Savilov E.D. Reconstruction of the epidemic his-

tory of the Beijing genotype of Mycobacterium tuberculosis in Russia and Former Soviet Countries using spoligotyping. Molekuljarnaia genetika, mikrobiologia i virusologia = Molecular Genetics Microbiology and Virology, 2011, no. 3, pp. 25—29. (In Russ.)]

7. Умпелева Т.В., Кравченко М.А., Еремеева Н.И., Вязовая А.А., Нарвская О.В. Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих на территории Уральского региона России // Инфекция и иммунитет. 2013. Т. 3, № 1. C. 21—28. [Umpeleva T.V., Kravchenko M.A., Eremeeva N.I., Vyazovaya A.A., Narvskaya O.V. Molecular characterization of Mycobacterium tuberculosis strains circulating in the Ural region, Russia. Infektsiya i immunitet = Russian Journal of Infection and Immunity, 2013, vol. 3, no. 1, pp. 21—28. (In Russ.)] doi: 10.15789/2220-7619-2013-1-21-28

8. Merker M., Barbier M., Cox H., Rasigade J.P., Feuerriegel S., Kohl T.A., Diel R., Borrell S., Gagneux S., Nikolayevskyy V., Andres S., Nübel U., Supply P., Wirth T., Niemann S. Compensatory evolution drives multidrug-resistant tuberculosis in Central Asia. eLife, 2018, no. 7: e38200. doi: 10.7554/eLife.38200

9. Merker M., Blin C., Mona S., Duforet-Frebourg, N., Lecher S., Willery E., Blum M.G., Rüsch-Gerdes S., Mokrousov I., Aleksic E., Allix-Béguec C., Antierens A., Augustynowicz-Kopec E., Ballif M., Barletta F., Beck H.P., Barry C.E. the 3rd, Bonnet M., Borroni E., Campos-Herrero I., Wirth T. Evolutionary history and global spread of the Mycobacterium tuberculosis Beijing lineage. Nature Genetics, 2015, vol. 47, no. 3, pp. 242-249. doi: 10.1038/ng.3195

10. Mokrousov I., Ly H.M., Otten T., Lan N.N., Vyshnevskyi B., Hoffner S., Narvskaya O. Origin and primary dispersal of the Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: clues from human phylogeography. Genome Res., 2005, vol. 15, no. 10, pp. 13571364. doi: 10.1101/gr. 3840605

11. Narvskaya O., Mokrousov I., Otten T., Vishnevsky B. Molecular markers: application for studies of Mycobacterium tuberculosis population in Russia. In: Trends in DNA Fingerprinting Research. Ed. by M.M. Read. New York: Nova Science Publishers, 2005, pp. 111-125.

12. Shitikov E., Vyazovaya A., Malakhova M., Guliaev A., Bespyatykh J., Proshina E., Pasechnik O., Mokrousov I. Simple assay for detection of the Central Asia outbreak clade of the Mycobacterium tuberculosis Beijing Genotype. J. Clin. Microbiol., 2019, vol. 57, no. 7: e00215-19. doi: 10.1128/JCM.00215-19

13. Umpeleva T., Belousova K., Golubeva L., Boteva T., Morozova I., Vyazovaya A., Mokrousov I., Eremeeva N., Vakhrusheva D. Molecular characteristics of Mycobacterium tuberculosis in the "closed" Russian town with limited population migration. Infect. Genet. Evol, 2020, no. 79:104174. doi: 10.1016/j.meegid.2020.104174

14. Vyazovaya A., Mokrousov I., Solovieva N., Mushkin A., Manicheva O., Vishnevsky B., Zhuravlev V., Narvskaya O. Tuberculous spondylitis in Russia and prominent role of multidrug-resistant clone Mycobacterium tuberculosis Beijing B0/W148. Antimicrob. Agents Chemother., 2015, vol. 59, no. 4, pp. 2349-2357. doi: 10.1128/AAC.04221-14

15. Vyazovaya A., Proshina E., Gerasimova A., Avadenii I., Solovieva N., Zhuravlev V., Narvskaya O., Mokrousov I. Increased trans-missibility of Russian successful strain Beijing B0/W148 of Mycobacterium tuberculosis: Indirect clues from history and demographics. Tuberculosis (Edinb.), 2020, vol. 122:101937. doi: 10.1016/j.tube.2020.101937

Авторы:

Вязовая А.А., к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии и эволюционной генетики ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия;

Лебедева И.А., зав. клинико-диагностической лабораторией БУЗ ВО Вологодский областной противотуберкулезный диспансер, г. Вологда, Россия;

Ушакова Н.Б., зам. главного врача по медицинской части БУЗ ВО Вологодский областной противотуберкулезный диспансер, г. Вологда, Россия;

Павлов В.В., главный врач БУЗ ВО Вологодский областной противотуберкулезный диспансер, г. Вологда, Россия; Герасимова А.А., младший научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии и эволюционной генетики ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия;

Соловьева Н.С., к.м.н., зав. бактериологической лабораторией Санкт-Петербургского НИИ фтизиопульмонологии, Санкт-Петербург, Россия; Журавлев В.Ю., к.м.н., руководитель отдела лабораторной диагностики Санкт-Петербургского НИИ фтизиопульмонологии, Санкт-Петербург, Россия; Нарвская О.В., д.м.н., профессор, ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии и эволюционной генетики ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия; научный консультант ФГБУ Санкт-Петербургский НИИ фтизиопульмонологии Минздрава России, Санкт-Петербург, Россия.

Поступила в редакцию 17.07.2020 Отправлена на доработку 10.12.2020 Принята к печати 30.12.2020

Authors:

Vyazovaya A.A., PhD (Biology), Senior Researcher, Laboratory of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics, St. Petersburg Pasteur Institute, St. Petersburg, Russian Federation; Lebedeva I.A., Head of the Laboratory of Clinical Diagnostics, Tuberculosis Dispensary of the Vologda Region, Vologda, Russian Federation;

Ushakova N.B., Deputy of Chief Medical Officer, Tuberculosis

Dispensary of the Vologda Region, Vologda, Russian Federation;

Pavlov V.V., Head Physician, Tuberculosis Dispensary of the

Vologda Region, Vologda, Russian Federation;

Gerasimova A.A., Junior Researcher, Laboratory of Molecular

Epidemiology and Evolutionary Genetics, St. Petersburg Pasteur

Institute, St. Petersburg, Russian Federation;

Solovieva N.S., PhD (Medicine), Head of the Bacteriological

Laboratory, Research Institute of Phthisiopulmonology,

St. Petersburg, Russian Federation;

Zhuravlev V.Yu., PhD (Medicine), Head of the Department

of the Laboratory Diagnostics, Research Institute

of Phthisiopulmonology, St. Petersburg, Russian Federation;

Narvskaya O.V., PhD, MD (Medicine), Professor, Leading

Researcher, Laboratory of Molecular Epidemiology and Evolutionary

Genetics, St. Petersburg Pasteur Institute, St. Petersburg, Russian

Federation; Scientific Advisor, St. Petersburg Research Institute

of Phthisiopulmonology, St. Petersburg, Russian Federation.

Received 17.07.2020 Revision received 10.12.2020 Accepted 30.12.2020

Аннотация научной статьи по фундаментальной медицине, автор научной работы — Вязовая А. А., Лебедева И. А., Ушакова Н. Б., Павлов В. В., Герасимова А. А.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Вязовая А. А., Лебедева И. А., Ушакова Н. Б., Павлов В. В., Герасимова А. А.

MOLECULAR AND GENETIC ANALYSIS OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS POPULATION IN THE VOLOGDA REGION WITH LOW TUBERCULOSIS INCIDENCE

Текст научной работы на тему «МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ПОПУЛЯЦИИ MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS В ВОЛОГОДСКОЙ ОБЛАСТИ - РЕГИОНЕ С НИЗКОЙ ЗАБОЛЕВАЕМОСТЬЮ ТУБЕРКУЛЕЗОМ»