CC BY
44
5. Pyatnitska I.N. Addiction / M.: Medicine. — 1994. — 542p. (in Russian)
6. PyatnitskaI.N., NaydenovN.G. Teenage drug and alcohol abuse: a guide for physicians / M.: Medicine, 2002. — 256p. (in Russian)
7. Guidelines for Addiction / Ed. N.N. Ivanets. — 2nd ed. — Moscow: Meditsinskoe Informatsionnoe Agentstvo, 2008. — 944 p. (in Russian)
8. Fergusson D.M. Cannabian psychosis Accumulating evidence
//Addiction. — 2004. — Vol. 99. — N10. — P. 1351-1352.
9. Fergusson D.M., Boden J.M., Horwood L.J. Cannabis use and other ullicit drug use. Testing the cannabis gateway hypothesis // Addiction. — 2006. — Vol. 101. — N4. — P. 556-569.
10. Niemi-Pynttari J.A., Sund R., Putkonen H. Substance-induced psychoses converting into schizophrenia: a register-based study of 18,478 Finishing patient cases // J. Clin. Psychiatry. — 2013. — Vol. 74(1). — P. 94-95.
Информация об авторах: Иванова Людмила Александровна — ассистент, к.м.н., 664079, Иркутск, м/р Юбилейный, 100, тел. 8 (3952) 763-857, e-mail: [email protected]; Задарновская Галина Леонидовна — заведующая общим отделением №2 ИОКПБ №1, 664079, Иркутск, м/р Юбилейный 11а, тел. (3952) 763857, e-mail: [email protected]; Фролова Катерина Аркадьевна — врач-психиатр ИОКПБ №1, 664079, Иркутск, м/р Юбилейный 11а, тел. 8(3952) 763-857, e-mail: [email protected]; Шаевич Александр Соломонович — врач-психиатр ИОКПБ №1, 664079, Иркутск, м/р Юбилейный 11а, тел. 8(3952)763-857, e-mail: bobrov_irkutsk@ rambler.ru; Туаева Екатерина Евгеньевна — интерн кафедры психиатрии и наркологии ИГМАПО, 664079, Иркутск, м/р Юбилейный, 100, тел. 8 (3952) 763-857, e-mail: [email protected]
Information about the Authors: Ivanova Lyudmila, assistant, PhD, 664079, Irkutsk, Jubileiny, 100, tel. 8 (3952) 763-857, e-mail: [email protected]; Zadarnovskaya Galina — head of Department general №2, 664079, Irkutsk, Jubileiny 11a, tel. 8 (3952) 763-857, e-mail: [email protected]; Frolova Katerina — psychiatrist, 664079, Irkutsk, Jubileiny 11a, tel. 8 (3952) 763-857, e-mail: [email protected]; Shaevich Alexandr — psychiatrist, 664079, Irkutsk, Jubileiny 11a, tel. 8 (3952) 763-857, e-mail: [email protected]; Tuaeva Catherine — intern, Department of Psychiatry and Addiction, 664079, Irkutsk, Jubileiny, 100, tel. 8 (3952) 763-857, e-mail: [email protected]
© ОГАРКОВ О.Б., ЖДАНОВА С.Н., МОКРОУСОВ И.В., ВИНОКУРОВА М.К., АЛЕКСЕЕВА Г.И.,
БАРАНОВА Ю.А., ТЕЙХРИБ Л.В., САВИЛОВ Е.Д., КРАВЧЕНКО А.Ф. — 2014 УДК: 579.873.21: 579.253.2
МОЛЕКУЛЯРНО-ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ШТАММОВ M. TUBERCULOSIS СЕМЕЙСТВА S В САХА (ЯКУТИИ)
Олег Борисович Огарков1,2, Светлана Николаевна Жданова1,4, Игорь Владиславович Мокроусов3, Мария Константиновна Винокурова5, Галина Ивановна Алексеева5, Юлия Александровна Баранова1,4, Лидия Владимировна Тейхриб1,4, Евгений Дмитриевич Савилов1,2, Александр Федорович Кравченко5 ('Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека СО РАМН, директор — член-корр. РАМН, д.м.н., проф. Л.И. Колесникова, лаборатория эпидемиологически и социально значимых инфекций, зав. — к.б.н. О.Б. Огарков; 2Иркутская государственная медицинская академия последипломного образования, ректор —
д.м.н., проф. В.В. Шпрах, кафедра эпидемиологии и микробиологии, зав. — д.м.н., проф. Е.Д. Савилов; 'Научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, директор — член корр. РАН, д.м.н., проф. А.Б. Жебрун; 4Иркутский государственный университет, ректор — д.ф-м.н., проф. А.В. Аргучинцев, кафедра микробиологии, зав. кафедрой д.б.н., проф. Б.Н. Огарков; 5Научно-практический центр «Фтизиатрия» Республики Саха (Якутия), директор — д.м.н. А.Ф. Кравченко)
Резюме. Дано описание генетических особенностей второго по распространенности среди M. tuberculosis в Саха (Якутии) генотипа S, частота выявления которого составила 16,7% (36/215) случаев. Группа семейства S представлена изолятами, имевшими в 83,3% (30/36) общий сполиготип (SIT 1253), и собрана на филогенетическом древе в отдельный кластер со сходными MIRU-VNTR профилями. Выявлен кластер S256 (MIRU12 профиль 233325153325), который, наряду с Beijing MIT17, имел наибольший показатель множественной лекарственной устойчивости среди изолятов из Саха (Якутии). Выдвинута гипотеза о давнем заносе и формировании эндемичного варианта штаммов генотипа S на исследуемой территории.
Ключевые слова: туберкулез, генотип S, эпидемический штамм.
MOLECULAR EPIDEMIOLOGICAL FEATURES OF M. TUBERCULOSIS FAMILY S IN SAKHA (YAKUTIA)
Oleg Borisovich Ogarkov1,2, Svetlana Nikolaevna Zhdanova1,4, Igor Vladislavovich Mokrousov3, Maria Konstantinivna Vinokurova3, Galina Ivanovna Alekseeva3, Yuliya Alexandrovna Baranova4, Lydia Vladimirovna Teyhrib4, Evgeny Dmitrievich Savilov1,2 , Alexander Fedorovich Kravchenko3 ('Irkutsk State Medical Academy of Continuing Education; 2Scientific Center for Family Health and Human Reproduction Problems, Siberian Branch, Russian Academy of Medical Sciences; 3St. Petersburg Pasteur Institute, St. Petersburg Pasteur Institute, Russia; 4Irkutsk State University; Laboratory of Molecular Microbiology, 5State Budgetary Institution of Sakha
Republic (Yakutia), Research Practice Center for Phthisiatry)
Summary. The genetic features of MBT strains of S genotype are described. Genotype S is the second among genetic families of M. tuberculosis in Sakha (Yakutia). The detection rate of S genotype was 16.7% (36/215) of cases. Family group S is represented by isolates with common Spoligotype (SIT 1253) in 83.3% (30/36), They have been collected in a separate cluster with similar MIRU-VNTR profiles on the phylogenetic tree. The cluster S256 was isolated (MIRU12 profile 233325153325), which, together with Beijing MIT17 subtype, demonstrated the highest rate of MDR in strains of Sakha (Yakutia). There is considered a hypothesis about long-standing introduction and formation of endemic variant of strains of S genotype.
Key words: tuberculosis, genotype S, epidemic strain.
Результаты современных молекулярно-эпидемиоло- детельствуют о неравномерности географического рас-гических исследований возбудителя туберкулеза сви- пространения основных генетических семейств мико-
бактерий туберкулеза (МБТ), которое обеспечивается их эволюционным фоном [3]. Генетическая идентификация штаммов с использованием различных технологий типирования обеспечивает возможность мониторинга штаммов с целью оценки распространения и их эволюционной адаптации в современных условиях на конкретных территориях. Изучение генотипической структуры популяции возбудителя туберкулеза (ТБ) в Саха (Якутии) привело к обнаружению значительного количества штаммов, принадлежащих семейству S [1], случаи выявления которого до сих пор были единичными в России и странах ближнего зарубежья [6]. Штаммы этого кластера отличаются множественной лекарственной устойчивостью [1]. Это явление, получившее распространение в единственном регионе страны потребовало подробной характеристики этого генотипа, что и явилось целью настоящей работы
Материалы и методы
В исследовании использованы ДНК микобактерий туберкулеза, выделенные от 215 пациентов из Саха (Якутии), проходивших лечение в НПЦ «Физиатрия» в 2010-2013 годы. Штаммы были получены от пациентов из выборок, значимо не отличающихся по половому и возрастному составу. Сбор образцов культур, выросших из посевов мокроты больных туберкулезом легких на плотной среде Левенштейна — Йенсена, был осуществлен в разработанный нами ранее консервант [1], содержащий изопропанол и стабилизатор ДНК CTAB (цетил-триметил аммония бромид). Пробы доставлялись для молекулярно-генетического анализа в специализированных герметически закрытых пробирках (2мл) из бактериологической лаборатории научно-практического центра «Фтизиатрия». ДНК выделяли и генотипи-ровали методами MIRU-VNTR по 24 локусам, методом делеционного анализа по RD 105 и 207, как описано ранее [2], и сполиготипирования [5]. Профили были сгруппированы путем построения NJ-tree (Онлайн-инструменты MIRUVNTRplus базы данных (http://www. miru-vntrplus.org/MIRU/index.faces).
Полученные данные исследований были статистически обработаны, представлены в виде частоты встречаемости, выраженной в процентах и соотношении числа присутствия признака к числу общей выборки.
Результаты и обсуждение
Делеционный анализ на RD 105 и RD 207 позволил разделить выборку на две части: штаммы, принадлежащие доминирующему в России генотипу Beijing — 32,6% изолятов (70/215), и представителей других генетических семейств, идентифицированных с помощью спо-лиго- и MIRU-VNTR типирования: T — 18,1% (39/215), S — 16,7% (36/215), , Ural — 9,8% (21/215), Haarlem — 6,4% (13/215), LAM — 5,1% (11/215), Uganda — 2,8% (6/215), H — 1,9% (4/215), X — 1,3% (3/215), Cameroon — 0,5% (1/215), а также группа из 13 неидентифицируемых штаммов (6,0%) — Orphan, отнесенных по сполигопро-филю к новым 12-ти типам.
На основе анализа сполиготипов были выявлены некоторые особенности двух наиболее представительных после Beijing генотипов в выборке штаммов из Саха (Якутии). Группа из семейства Т состояла из разнообразных по MIRU-VNTR и сполигопрофилей, преимущественно относящихся к Т1. Напротив, группа семейства S была представлена штаммами, имевшими в 83,3% (30/36) общий сполиготип (SIT 1253), и собрана на филогенетическом древе в отдельный кластер со сходными MIRU-VNTR профилями. Среди них выделяется 21 изолят, идентифицируемый по MIRU-VNTR как MIT 256 (12 локусный паттерн 233325153325). В этой группе 24 локусные профили были разделены на две подгруппы, отличающиеся только в одном гипервариабельном локусе Qub 26 числом повторов. Сполиготип SIT 1253
имели также штаммы с 12 локусными паттернами, определяемыми SITVIT как MIT 804, 805 и "Orphan". Кроме того, сполиготипирование позволило выявить дополнительно два изолята, несших информацию о двух случаях присутствия S и Beijing генотипов.
Таким образом, сравнение MIRU-VNTR и сполиго-типных паттернов для тридцати шести штаммов семейства S позволило выявить следующие маркеры данного генетического семейства, активно циркулирующего в Саха (Якутии). Общим по сполигопрофилю для семейства S является отсутствие спейсеров 9-10 и 33-36. При сполиготипировании штаммов MIT 256 отсутствуют дополнительно спейсеры в 3 и 22 позициях.
Сполиготип SIT 1253 определяется также консерватизмом 8 из 12 MIRU-VNTR локусов: в позициях 2 и 20 — по два повтора; в 10,27,31 — по 3 повтора; в 23 — пять повторов. Вариабельными для S группы являются 26-й и 40-й локусы (по 4-5 повторов), 4, 16 и 39 локусы (по 2-3 повтора). Таким образом, при анализе штаммов всего семейства S обращает на себя внимание неоднородность MIRU-VNTR профилей. Подобного рода схема кластера свидетельствует об активном процессе генотипообразования, происходящем на исследуемой территории. При этом по распространенности семейство S, наряду со штаммами разнородной группы Т, занимает вторую позицию после штаммов генотипа Beijing в Республике Саха (Якутия). В противоположность этому представители других семейств, таких как Haarlem, Н, Х, Uganda, Cameroon, выглядят как заносные случаи.
Исходя из полученной схемы, можно предполагать, что группы штаммов из семейства Beijing, как было описано ранее [1], и S являются эпидемичными для РС (Я). Вопрос давности циркуляции указанных генотипов на исследуемой территории носит дискутабельный характер. В качестве рабочей гипотезы можно предположить активный занос штаммов Beijing на территорию РС (Я) из соседних регионов, где доминируют основные субтипы этого генотипа — Beijing MIT 16 и Beijing MIT 17. Учитывая предположение о недавней диссеминации этих субтипов из общего резервуара инфекции (Тыва и Монголия) по территории России в целом, усиление миграции и распространение транспортных сетей в РС(Я) могло также привести к заносу и укоренению Beijing MIT 16 и Beijing MIT 17 и на исследуемом регионе. Подобной гипотезы распространения для штаммов семейства S высказано быть не может вследствие обнаружения подобного количества изолятов этого генотипа только на территориях Европейских стран [7].
Одной из версий широкого распространения штаммов S генотипа может быть факт обнаружения их в 90% случаев у жителей столицы Саха (Якутии). По всей видимости, формирование первичного резервуара инфекции должно было произойти вне большой городской популяции людей, где соотношение убиквитарных и эндемических генотипов и субтипов МБТ находится в динамическом равновесии. Условия для закрепления нового варианта возбудителя могли возникнуть или при социальных катаклизмах или в условиях пенитенциарной системы. Штаммы эпидемического генотипа S, по всей видимости, циркулируют на территории Якутии достаточно продолжительное время, распространившись в отдельных субпопуляциях местных жителей в условиях крайне низкой плотности населения. Исходя из этого сценария, в настоящий момент в большой городской популяции г. Якутска происходит интродукция эпидемических генотипов микобактерий туберкулеза, появившихся в результате миграционных процессов (генотип Beijing) в популяцию людей, пораженных «традиционными» эпидемическими штаммами, возможно циркулировавшими в этой популяции не одно столетие.
Понятно, что доказательством существования таких событий могут быть результаты широкого мониторинга других районов Саха (Якутии). С другой стороны наличие значительной доли таких штаммов по срав-
нению с преобладающими на соседних территориях сублиниями генотипа Пекин заставляет думать о роли давней изоляции исследуемой территории. При усиле-
нии транспортного обмена, вероятно, повысится риск активации других факторов, ответственных за успех современных генотипов.
ЛИТЕРУТУРА
1. Жданова С.Н., Алексеева Г.И., Огарков О.Б. и др. Сравнительный анализ генотипов Mycobacterium tuberculosis в республике Саха (Якутия) и Иркутской области // Якутский медицинский журнал. 2013. — №1 (41). — С. 68-71.
2. Медведева Т.В., Огарков О.Б., Некипелов О.М. и др. MIRU-VNTR генотипирование штаммов Mycobacterium tuberculosis в Восточной Сибири: семейство Beijing против Kilimanjaro // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. — 2004. — №4. — С. 33-38.
3. Casali N., Nikolayevskyy V., Balabanova Y., et al. Microevolution of extensively drug-resistant tuberculosis in Russia. // Genome Res. — 2012. — Vol. 22(4). — P. 735-745.
4. Comas I., Coscolla M, Luo T, et al. Out-of-Africa migration and Neolithic coexpansion of Mycobacterium tuberculosis with modern
humans. // Nat Genet. — 2013. — Vol. 45(10). — P. 1176-1182.
5. Kamerbeek J., Schouls L., Kolk A. et al. Simultaneous detection and strain differentiation of Mycobacterium tuberculosis for diagnosis and epidemiology.// J. Clin. Microbiol. — 1997. — №35. — P. 907-914.
6. Nikolayevskyy V.V., Brown T.J., Bazhora Y.I., et al. Molecular epidemiology and prevalence of mutations conferring rifampicin and isoniazid resistance in Mycobacterium tuberculosis strains from the southern Ukraine. // Clin Microbiol Infect. — 2007. — Vol. 13(2). — P. 129-138.
7. Valcheva V., Mokrousov I., Narvskaya O., et al. Utility of new 24-locus variable-number tandem-repeat typing for discriminating Mycobacterium tuberculosis clinical isolates collected in Bulgaria. // J Clin Microbiol. — 2008. — Vol. 46 (9). — P. 3005-3011.
REFERENCES
1. Zhdanova S.N., Alekseeva G.I., Ogarkov O.B., et al. Comparative analysis of Mycobacterium tuberculosis genotypes in the Republic Sakha (Yakutia) and the Irkutsk region // Yakutskij Medicinskij Zurnal. — 2013. — № 1 (41). — P. 68-71 (in Russian).
2. Medvedeva T.V., Ogarkov O.B., Nekipelov O.M., et al. MIRU-VNTR genotyping of Mycobacterium tuberculosis strains in Eastern Siberia: Beijing family versus Kilimanjaro // Molecularnaya Genetika, Microbiologiya and Virusologiya. 2004. — № 4. — Р. 3338. (in Russian).
3. Casali N., Nikolayevskyy V., Balabanova Y., et al. Microevolution of extensively drug-resistant tuberculosis in Russia. //Genome Res. — 2012. Vol. 22 (4). — P. 735-45.
4. Comas I., Coscolla M., Luo T., et al. Out-of-Africa migration and Neolithic coexpansion of Mycobacterium tuberculosis with modern
humans. // Nat Genet. — 2013. — Vol. 45(10). — P. 1176-1182.
5. Kamerbeek J., Schouls L., Kolk A., et al. Simultaneous detection and strain differentiation of Mycobacterium tuberculosis for diagnosis and epidemiology.// J. Clin. Microbiol. — 1997. — №35. — P. 907-914.
6. Nikolayevskyy V.V., Brown T.J., Bazhora Y.I., et al. Molecular epidemiology and prevalence of mutations conferring rifampicin and isoniazid resistance in Mycobacterium tuberculosis strains from the southern Ukraine. // Clin Microbiol Infect. — 2007. — Vol. 13(2). — P. 129-138.
7. Valcheva V., Mokrousov I., Narvskaya O., et al. Utility of new 24-locus variable-number tandem-repeat typing for discriminating Mycobacterium tuberculosis clinical isolates collected in Bulgaria. // J Clin Microbiol. — 2008. — Vol. 46 (9). — P. 3005-3011.
Информация об авторах: Огарков Олег Борисович — заведующий лабораторией, к.б.н., 664025, Иркутск, ул. Карла Маркса, 3, тел. (3952)333425, e-mail: [email protected]; Жданова Светлана Николаевна — старший научный сотрудник; к.м.н., 664025 Иркутск, ул. Карла Макса, 3, тел. (3952) 333425, e-mail: [email protected]; Мокроусов Игорь Владиславович — ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной биологии, д.б.н.,
197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14, тел. (812) 233-20-92, e-mail: [email protected]; Винокурова Мария Константиновна — заместитель директора по научной работе, д.м.н., 677005, г. Якутск, ул. Алексеева, 93, тел. (4112)448383, e-mail: [email protected]; Алексеева Галина Ивановна — заведующая бактериологической лабораторией д.м.н., 677005, г. Якутск, ул. Алексеева, 93б тел. (4112)448383, e-mail: [email protected]; Баранова Юлия Александровна — лаборант, студентка, 664025, Иркутск, ул. Карла Маркса, 3, тел. (3952)333425; e-mail: bariulja@ mail.ru; Тейхриб Лидия Владимировна — лаборант, студентка, 664025, Иркутск, ул. Карла Маркса, 3, тел. (3952) 333425, e-mail: [email protected]; Савилов Евгений Дмитриевич — главный научный сотрудник, профессор, д.м.н., 664025, Иркутск, ул. Карла Маркса, 3, тел. (3952) 333425, e-mail: [email protected]; Кравченко Александр Федорович — директор, д.м.н., 677005, г. Якутск, ул. Алексеева, 93, тел. (4112) 44-83-83, e-mail: [email protected].
Information about the authors: Ogarkov Oleg Borisovich — Head of Laboratory, PhD, 664003, Irkutsk, Karl Marks st., 3, phone (3952)333425, e-mail: [email protected]; Zhdanova Svetlana Nikolaevna — Senior Researcher, PhD, 664003, Irkutsk, Karl Marks st., 3, phone (3952)333425, e-mail: [email protected]; Mokrousov Igor Vladislavovich — Leading Researcher, Laboratory of Molecular Biology, PhD, MD, 197101, St. Petersburg., Mira st., 14, phone 8 (812) 233-20-92; e-mail: [email protected]; Vinokourova Maria Konstantinovna — Deputy Director, PhD, MD, 677005, Yakutsk, Alekseeva st. 93, phone (4112) 44-83-83, e-mail: [email protected]; Alekseeva Galina Ivanovna — head of the bacteriological laboratory, PhD, MD, 677005, Yakutsk, Alekseeva st., 93, phone (4112) 44-83-83, e-mail: agi_nik@mail. ru; Baranova Yuliya Alexandrovna — assistant, student, 664003, Irkutsk, Karl Marks st., 3, phone (3952)333425; e-mail: [email protected]; Teyhrib Lidia Vladimirovna — assistant, student, 664003, Irkutsk, Karl Marks st., 3; phone (3952)333425, e-mail: [email protected]; Savilov Eugeniy Dmitrievich — Chief Scientist, PhD, MD, Prof., 664003, Irkutsk, Karl Marks st., 3, phone (3952)333425, e-mail: [email protected]; Kravchenko Alexander Fedorovich — Director, PhD, MD, 677005, Yakutsk, Alekseeva st., 93, phone (4112) 448383; e-mail: [email protected].
© РУСАНОВА Д.В., СУДАКОВА Н.Г., ЛАХМАН О.Л. — 2014 УДК: 613.632:616.1:616.833
СОПРЯЖЕННОСТЬ ИЗМЕНЕНИЙ ПЕРИФЕРИЧЕСКОГО КРОВООБРАЩЕНИЯ И СОСТОЯНИЯ ПЕРИФЕРИЧЕСКИХ НЕРВОВ У ЛИЦ, КОНТАКТИРОВАВШИХ С МЕТАЛЛИЧЕСКОЙ РТУТЬЮ НА ПРОИЗВОДСТВЕ
(Дина Владимировна Русанова1, Наталья Гавриловна Судакова1, Олег Леонидович Лахман1,2) ('Восточно-Сибирский научный центр экологии человека СО РАМН, директор — д.м.н., член-корр. РАН, В.С.
