CC BY
34
УДК 616.98:578.835.17(571.6)-036.22:311 001: 10.17238 /РшД609-1175.2018.3.92-96
Молекулярно-эпидемиологическая характеристика групповой заболеваемости энтеровирусной инфекцией, обусловленной вирусом Коксаки А6, среди населения Дальнего Востока Российской Федерации в 2016-2017 гг.
Л.В. Бутакова', Е.Ю. Сапега1, О.Е. Троценко', Т.А. Зайцева2, Т.Н. Каравянская2, О.А. Фунтусова3, Г.П. КовтонюкЗ, И.Ю. Феделеш4, Э.Х. Манджиев4
1 Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии (680610, г. Хабаровск, ул. Шевченко, 2),
2 Управление Роспотребнадзора по Хабаровскому краю (680009, г. Хабаровск, ул. Карла Маркса, 109б),
3 Управление Роспотребнадзора по Сахалинской области (693020, г. Южно-Сахалинск, ул. Чехова, 30а),
4 Управление Роспотребнадзора по Чукотскому автономному округу (689000, г. Анадырь, ул. Ленина, 11)
Представлена молекулярно-эпидемиологическая характеристика очагов групповой заболеваемости Коксаки А6-ин-фекцией, зарегистрированных в 2016-2017 гг. в Хабаровском крае, Сахалинской области и Чукотском автономном округе. С помощью молекулярного типирования энтеровирус Коксаки А6 был выявлен в 2013 г. в пяти из девяти субъектов Дальнего Востока России и к 2017 г. распространился по всей территории округа. В 2015 г. зарегистрирована первая на Дальнем Востоке подтвержденная вспышка Коксаки А6. Филогенетический анализ дальневосточных штаммов вируса позволил установить их принадлежность к генотипу Э, а также предположить, что общий предок для них ориентировочно существовал в 2008 г., что совпадает со значительным ростом регистрации вспышек Коксаки А6-инфекции во всем мире.
Ключевые слова: вирусы Коксаки, вспышечная заболеваемость, молекулярное типирование, филогенетический анализ
Глобальное распространение энтеровирусной инфекции (ЭВИ), поражающей как детское, так и взрослое население, периодически возникающие вспышки, в том числе в организованных коллективах и отсутствие средств специфической профилактики обусловливают ее высокую значимость для здравоохранения многих стран мира. На ряде территорий Российской Федерации, в частности в Дальневосточном федеральном округе (ДВФО), ЭВИ считается эндемичной. Постоянной циркуляции неполиомиелитных энте-ровирусов в ДВФО способствуют климатогеографи-ческие и миграционные факторы, а также растущая с каждым годом популярность среди дальневосточных туристов стран Восточной и Юго-Восточной Азии, где наблюдается эпидемиологическое неблагополучие по заболеваемости энтеровирусной инфекцией [9].
Причиной вспышек ЭВИ, как правило, служит появление «нового» для определенной территории, возможно завозного, типа вируса и отсутствие к нему иммунитета среди населения. В последнее десятилетие одно из ведущих мест в этиологии групповой заболеваемости ЭВИ во всем мире занимает энтеро-вирус Коксаки А6 (К А6), выявляющийся чаще всего при экзантемных формах инфекции, в т.ч. при энте-ровирусном везикулярном стоматите с экзантемой и герпангине [3, 15].
В данной работе представлена молекулярно-эпиде-миологическая характеристика случаев вспышечной заболеваемости К А6-инфекцией, зарегистрированных в ряде субъектов ДВФО в 2016 и 2017 гг.
Бутакова Людмила Васильевна - научный сотрудник Хабаровского НИИЭМ; e-mail: [email protected]
Материал и методы
Для анализа заболеваемости ЭВИ использованы данные форм государственного статистического наблюдения № 1 и 2 «Сведения об инфекционных и паразитарных заболеваниях», № 23-09 «Сведения о вспышках инфекционных заболеваний», материалы управлений Роспотребнадзора и центров гигиены и эпидемиологии субъектов ДВФО.
В лаборатории Дальневосточного регионального научно-методического центра по изучению энте-ровирусной инфекции Хабаровского НИИЭМ был исследован биологический материал от заболевших ЭВИ из двух очагов, созданных энтеровирусом К А6 (в Хабаровском крае и Сахалинской области в 2016 г.) и из двух очагов К А6-инфекции в Чукотском АО и Сахалинской области в 2017 г. Обследованы 42 человека, включая 35 больных и 7 контактных лиц. Идентификацию энтеровирусов в биологических пробах осуществляли молекулярно-биологическим методом -секвенированием частей участков генома VP1 и VP2 (при отрицательном результате VP1-типирования), используя праймеры и программы амплификации, указанные в работах W.A. Nix et al. [13] и D. Nasri et al. [12].
Филогенетический анализ проводили при помощи байесовского алгоритма моделирования эволюционных взаимоотношений с помощью методов Монте-Карло по схеме Марковской цепи, представленного в программном обеспечении BEAST. Отобранные филогенетические деревья были суммированы в TreeAnnotator в виде дерева с максимальным доверием к кладам с последующей визуализацией в FigTree [4].
Результаты исследования
В 2016 г. на территории ДВФО были выявлены 15 очагов групповой заболеваемости ЭВИ, в двух из которых при молекулярно-генетическом исследовании биоматериала от больных типированы энтеровирусы Коксаки А6.
Первый очаг К А6-инфекции был зарегистрирован в детском дошкольном образовательном учреждении № 45 «Семицветик» г. Южно-Сахалинска в июле 2016 г. В эпидемический процесс оказались вовлечены дети от 2 до 5 лет, посещавшие разные группы. Общее число пострадавших - десять человек. ЭВИ в виде герпан-гины диагностирована у шести детей, герпангины с экзантемой - у троих заболевших, у одного ребенка наблюдалась экзантема. Заболевание протекало в легкой и среднетяжелой формах, был госпитализирован только один ребенок. При эпидемиологическом расследовании установлено, что формирование очага инфекции было связано с несвоевременной изоляцией больного острой формой ЭВИ, основным путем передачи стал контактно-бытовой с реализацией через контаминированные энтеровирусами игрушки, развивающие игровые изделия. Методом полимеразной цепной реакции ЭВИ была подтверждена у 7 из 10 человек.
Еще один очаг групповой заболеваемости ЭВИ в июле 2016 г. был обнаружен в детском саду № 21 села Бичевая района имени Лазо Хабаровского края. При этом пострадали 16 детей в возрасте от 3 до 6 лет, у которых ЭВИ протекала в виде герпангины или катаральной формы. РНК энтеровирусов была выделена из биологического материала 14 заболевших.
В 2017 г., несмотря на неблагополучную эпидемиологическую ситуацию по ЭВИ, в целом на Дальнем Востоке были зарегистрированы лишь два очага групповой заболеваемости, в обоих случаях порожденные вирусами К А6. Так, в начале сентября 2017 г. вспышка ЭВИ была выявлена в дошкольном учреждении «Детский сад с. Молодежное» Тымовского района Сахалинской области. Пострадали 5 детей 3-4 лет, посещавших одну группу. Инфекция протекала в виде экзантемы и в легкой форме. При эпидемиологическом расследовании в детском саду были зарегистрированы нарушения санитарно-эпидемиологического режима. Энтеровирусная этиология заболевания подтверждена полимеразной цепной реакцией во всех наблюдениях.
В конце сентября 2017 г. в поселке городского типа Эвгекинот Чукотского автономного округа сформировался очаг групповой заболеваемости ЭВИ среди детей
в возрасте от 2 до 6 лет, посещавших детский сад «Аленушка». У заболевших были выявлены лихорадка до 40 °С, герпангина, экзантема, имевшая пятнисто-вези-кулезный и геморрагический характер, с локализацией на лице, верхних и нижних конечностях, ягодицах, что свидетельствовало о нетипичном течении одной из форм ЭВИ - энтеровирусного везикулярного стоматита с экзантемой (или hand-foot-and-mouth disease - HFMD). Общее количество пострадавших в очаге составило 15 человек, кроме того, в эпидемический процесс оказались вовлечены неорганизованные дети до 2 лет и взрослые, то есть инфекция вышла за пределы первичного очага. При исследовании биологического материала РНК энтеровирусов была обнаружена у 18 больных и у 7 контактных лиц.
Все РНК-положительные на энтеровирусы пробы, отобранные в указанных очагах групповой заболеваемости ЭВИ и поступившие в Дальневосточный региональный научно-методический центр по изучению энтеровирусной инфекции, были подвергнуты молекулярному типированию, благодаря которому установлен единый этиологический агент - вирус К А6.
2013 (2011-2015)
Г 686_ChAD_2017 " 685_ChAD_2017 738_Magadan_2016 743_Magadan_2016 Khabarovsk_2016 219_Bichevaya_Khabarovsk_2016 76_Khabarovsk_2016 r—# Sakhalin_region_2015
KR014386_RUS_Yakutia_2014 297_Magadan_reg_2016 296_Magadan_reg_2016 443_Sakhalin_region_2015 KR014401_RUS_KHV_2014 — AB649246_JPN_2011
_Г 506_Sakhalin_2016
" 504_Sakhalin_2016 r«(| Khabarovsk_2015 KR014402_RUS_KHV_2014 — KR014382_RUS_KHV_2014 GU248439_FIN_2008 HE572902_FRA_2010 GU248476_FIN_2008 FR797987_ESP_2008 FR797986_ESP_2008 GU248460_ICE_2002
SWE 2005; FIN, LVA 2008 AB114112_JPN_1999
JPN 1999-2005; Europe 2007-2010 HQ844644_CHN_2008 1 CHN 1992, 2003, 2004, 2010; JPN 1994, 1996
£ i
AY421764_Gdula_1949
1950
1960
1970
1980
1990
2000
2010
2020
Рис. 1. Дерево с максимальным доверием к кладам, построенное на основе анализа частичных нуклеотидных последовательностей области генома УР1 (321 н.о.) энтеровируса Коксаки А6 с использованием Байесовского филогенетического анализа. Кружками обозначены статистически достоверные узлы с апостериорной вероятностью выше 0,95.
При филогенетическом анализе нуклеотидных последовательностей участка УР1 вируса, полученных при расследовании вспышек в Хабаровском крае (с. Бичевая) в 2016 г. и в Чукотскром АО в 2017 г., установлено, что данные возбудители совместно с другими дальневосточными штаммами К А6 2014-2015 гг. составили общий кластер и внутри него образовали две группы (рис. 1). В первую группу вошли энтеро-вирусы, идентифицированные в 2016 г. у больных ЭВИ из с. Бичевая, и вирусы, выявленные в том же году среди населения г. Хабаровска, что указывает на возможную эпидемиологическую связь заболеваний в г. Хабаровске и с. Бичевая. Вирус, идентифицированный у заболевших в Эвгекиноте (Чукотский АО) в 2017 г., вошел во вторую группу кластера и оказался генетически родственным магаданскому варианту 2016 г. При этом установлено, что общий предок для вирусов К А6, образовавших обе группы кластера, существовал ориентировочно в 2013 г. (95 % Байесовский доверительный интервал - 2011-2015).
Следует отметить, что идентификацию энтеровиру-сов из биологического материала от больных из очагов ЭВИ в Сахалинской области в 2016-2017 гг. удалось провести лишь секвенированием УР2-участка генома, в то время как УР1-типирование не дало результата.
Реконструкция эволюционных взаимоотношений по УР2-фрагменту генома для штаммов К А6, явившихся причиной возникновения очагов групповой заболеваемости в Сахалинской области в 2016-2017 гг., позволила установить их принадлежность к одному кластеру (рис. 2), в который помимо «вспышечных» штаммов также вошли энтеровирусы, циркулировавшие среди населения ряда территорий ДВФО (Амурская и Сахалинская области, Хабаровский край) и Сибири (Иркутская область и Красноярский край) в 2016-2017 гг., а также в странах Азии в 2009-2013 гг.
Обсуждение полученных данных
На Дальнем Востоке Российской Федерации летне-осенний сезон ежегодно сопровождается подъемом заболеваемости ЭВИ с преимущественным вовлечением в эпидемический процесс детского населения, с преобладанием возрастной группы 3-6 лет. При этом показатели значительно превышают общероссийские (рис. 3). Кроме того, отмечается широкое разнообразие представителей неполиомиелитных энтеровирусов. Молекулярно-генетическим методом каждый год выявляются более 25 их различных типов.
В 2016 г. по сравнению с 2015 г. рост заболеваемости ЭВИ в среднем в 4,6 раза наблюдался на шести из девяти территорий ДВФО: в Сахалинской, Амурской и Магаданской областях, в Приморском и Камчатском краях, в Республике Саха. Кроме того, на явное эпидемиологическое неблагополучие в ДВФО в 2016 г. указывали многочисленные очаги групповой заболеваемости - 15 очагов в четырех субъектах округа (Хабаровский край, Якутия, Сахалинская и Амурская области) с общим количеством пострадавших 213 человек.
В 2017 г. показатели заболеваемости ЭВИ, превышавшие таковые 2016 г., отмечены в Республике Саха, Магаданской области и Камчатском крае. В то же время в Сахалинской области, где в 2017 г. был зарегистрирован один из вспышечных очагов, показатели заболеваемости сохранялись на уровне 2016 г.
Необходимо подчеркнуть, что в 2017 г. в Чукотском автономном округе впервые за долгие годы наблюдения (2006-2017) были выявлены случаи ЭВИ, в том числе с формированием вышеуказанного эпидемического очага, что может свидетельствовать о завозе
Amur Region 2017; Krasnoyarsk 2017
ч
CHN 2013 —К] Irkutsk 2017 I— 314_Irkutsk_2016
165_Sakhalin_outbreak_2016 171_Sakhalin_outbreak_2016 LC126161_Japan_2013 LC126162_Japan_2013
644_Sakhalin_Molodezhnoe_2017 648_Sakhalin_Molodezhnoe_2017 641_Sakhalin_2017 647_Sakhalin_Molodezhnoe_2017 645_Sakhalin_Molodezhnoe_2017 11_Khabarovsk_2017 L 180_Sakhalin_2017 '—«d Irkutsk 2017 KJ541158_China_2013 - KP289378_China_2013 KJ541157_China_2012 — KP289377_China_2013 - JQ946055_Taiwan_2010 LC126151_Japan_2009 LC126150_Japan_2009 AB779615_Japan_2009 — KM114057_Finland_2008
-JPN 2010-2011; CHN 2013
JQ946050_Taiwan_2009 JPN 2003-2009 L AB779614_Japan_1999 LC126144_Japan_1999
4
4
LC126143_Japan_1999
AY421764 Gdula 1949
1950
1960
1970
1980
1990
2000
2010
2020
Рис. 2. Дерево с максимальным доверием к кладам, построенное на основе анализа частичных нуклеотидных последовательностей области генома УР2 (430 н.о.) энтеровируса Коксаки А6 с использованием Байесовского филогенетического анализа. Кружками обозначены статистически достоверные узлы с апостериорной вероятностью выше 0,95.
2006 г. 2007 г. 2008 г. 2009 г. 2010 г. 2011 г. 2012 г. 2013 г. 2014 г. 2015 г. 2016 г. 2017 г. Рис. 3. Показатели заболеваемости ЭВИ в ДВФО в сравнении с общероссийскими.
энтеровирусов на Чукотку благодаря активным миграционным процессам.
Случаи энтеровирусной инфекции завозного характера среди людей, совершавших зарубежные поездки с различными целями, описаны рядом иностранных авторов [10, 14]. Кроме того, широкий общественный резонанс в 2017 г. вызвали массовые заболевания ЭВИ российских граждан на курортах Турции (данный факт, предположительно, установлен на основе многочисленных обращений граждан в Роспотребнадзор).
Следует отметить, что во многих странах мира наблюдается нестабильная эпидемиологическая ситуация по заболеваемости ЭВИ. Особенно это характерно для государств Азии, таких как Китай (включая Гонконг и Макао), Таиланд, Япония, Южная Корея, Вьетнам, Тайвань, Малайзия, среди населения которых регистрируются многочисленные случаи заболеваний эн-теровирусного везикулярного стоматита с экзантемой (код В08.4 в МКБ-10) или НБМБ. Основными этиологическими агентами данной клинической формы ЭВИ служат энтеровирусы вида А, при этом энтеровирус А71 и К А6 наиболее часто служат причиной вспышечной заболеваемости [8, 9]. Однако с 2008 г. одним из ведущих патогенов при НБМБ во всем мире стал К А6, ранее обусловливавший легкие формы ЭВИ [5]. В настоящее время характерной особенностью течения НБМБ, вызванного К А6, считается наличие атипичных признаков: полиморфный характер сыпи, склонность экзантемы к обширному распространению, дистрофия ногтевых пластин с последующим отслоением [7].
На территории ДВФО циркуляция К А6 наблюдается с 2009 г., когда были получены изоляты вируса от больных в Хабаровском крае и Еврейской АО. В то же время известно, что представители группы Коксаки А слабо идентифицируются при использовании клеточных культур [11], в связи с чем дату начала выявления в ДВФО К А6 вирусологическими методами можно считать условной. Широкое внедрение в эпидемиологический надзор за ЭВИ методов молекулярного типирования, осуществляемых на базе Дальневосточного регионального научно-методического центра по изучению ЭВИ, позволило значительно увеличить частоту идентификации возбудителей, в том числе К А6, на Дальнем Востоке России.
Так, при помощи секвенирования в 2013 г. вирус К А6 был выявлен в биологическом материале от заболевших в Хабаровском, Камчатском краях, Амурской, Еврейской автономной и Сахалинской областях. В 2014 г. вирус распространился на территорию Республики Саха. Наибольшее количество вирусов К А6 типировано в 2015 г. - 111 штаммов (35,7 %). Тогда же была зарегистрирована первая подтвержденная вспышка ЭВИ в ДВФО, обусловленная этим энтеро-вирусом, в пос. Лазарево Николаевского района Хабаровского края [2]. К 2017 г. циркуляция К А6 охватила все субъекты ДВФО, включая Чукотский АО, где ранее случаи ЭВИ не регистрировались. В летне-осенний эпидемический сезон 2017 г. отмечено активное вовлечение в эпидемический процесс К А6-вирусной инфекции населения отдаленных малонаселенных пунктов (помимо крупных административных образований), что свидетельствует о недостаточной иммунной прослойке в дальних районах субъекта, способствующей широкому распространению вируса и формированию очагов групповой заболеваемости.
Описанное на территории Дальнего Востока России географическое распространение вирусов К А6 подтверждено и результатами филогенетического анализа. Так, на филограммах штаммы К А6, идентифицированные в разных субъектах ДВФО, образовали единый кластер. Установлено, что вирусы, вошедшие в данный кластер - потомки аналогичного вируса, циркулировавшего примерно в 2008 г. (95 % Байесовский доверительный интервал - 2006-2011), что совпадает со значительным ростом регистрации случаев К А6-инфекции во всем мире, в том числе в виде вспышек [5]. Установленный факт указывает на приблизительный временной промежуток, в который произошло расхождение генетических признаков общего предка вирусов К А6, стремительно распространившихся и по территории Дальнего Востока Российской Федерации.
Кроме того, выяснено, что все изученные нами штаммы К А6, в том числе из эпидемических очагов 2016-2017 гг., принадлежали к генотипу Б, согласно условной классификации, основанной на различии нуклеотидных последовательностей, не менее 15 % [1, 6].
Заключение
На территории ДВФО существуют благоприятные условия для циркуляции энтеровирусов, обусловленные климато-географическими и социально-экономическими факторами. В то же время, активные миграционные процессы среди населения создают опасность завоза «новых» генетических вариантов вирусов, что в свою очередь повышает риск вспышечной заболеваемости.
В настоящей работе проведен молекулярно-эпи-демиологический анализ случаев групповой заболеваемости ЭВИ, зарегистрированных в 2016-2017 гг. в Хабаровском крае, Сахалинской области и Чукотском автономном округе. Идентифицирован этиологический агент - энтеровирус К А6, штаммы которого принадлежат к генотипу D, активно циркулирующему в азиатских странах и субъектах ДВФО. По данным филогенетического анализа при расследовании указанных вспышек установлен общий предок для дальневосточного варианта вируса, ориентировочно существовавший в 2008 г.
Полученные результаты исследования свидетельствуют о необходимости молекулярно-генетического типирования в эпидемиологическом надзоре за ЭВИ с целью изучения закономерностей развития эпидемического процесса. Литература / References
1. Сапега Е.Ю., Бутакова Л.В., Котова В.О. [и др.]. Молеку-лярно-биологические особенности циркуляции энтеровирусов в Дальневосточном федеральном округе Российской Федерации в 2014-2015 годах // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2016. № 30. С. 38-44.
Sapega E.Yu., Butakova L.V., Kotova VO. [et al.]. Molecular genetic peculiarities of enterovirus circulation in the Far Eastern federal district ofthe Russian Federation in 2014-2015 // Dal'nevostochnyy zhurnal infektsionnoy patologii. 2016. No. 30. P. 38-44.
2. Троценко О. Е., Котова В.О., Сапега Е.Ю. [и др.]. Внедрение методов молекулярно-генетического анализа в практику этиологической расшифровки очагов инфекционных болезней в Хабаровском крае // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2016. № 31. С. 6-11. Trotsenko O.E., Kotova VO., Sapega E.Yu. [et al.]. Implementation of molecular genetic analysis methods in etiological interpretation practice of infectious diseases focal points in Khabarovsk region // Dal'nevostochnyy zhurnal infektsionnoy patologii. 2016. No. 31. P. 6-11)
3. Cabrerizo M., Tarragó D., Muñoz-Almagro C. [et al.]. Molecular epidemiology of enterovirus 71, coxsackievirus A16 and A6 associated with hand, foot and mouth disease in Spain // Clin. Microbiol. Infect. 2014. Vol. 20, No. 3. P. 150-156.
4. Drummond A.J., Rambaut A. BEAST: Bayesian evolutionary analysis by sampling trees // BMC Evol. Biol. 2007. No. 7. P. 214.
5. Gaunt E., Harvala H., Osterback R. [et al.]. Genetic characterization ofhuman coxsackievirus A6 variants associated with atypical hand, foot and mouth disease: a potential role of recombination in emergence and pathogenicity // J. Gen. Virol. 2015. Vol. 96. P. 1067-1079.
6. He Y.Q., Chen L., Xu W.B. [et al.]. Emergence, circulation, and spatiotemporal phylogenetic analysis of coxsackievirus A6- and coxsackievirus A10-associated Hand, Foot, and Mouth Disease infections from 2008 to 2012 in Shenzhen, China // J. Clin. Microbiol. 2013. Vol. 51, No. 11. P. 3560-3566.
7. Horsten H.H., Kemp M., Fischer T.K. [et al.]. Atypical Hand, Foot, and Mouth Disease Caused by Coxsackievirus A6 in Denmark: A diagnostic mimicker // Acta Derm. Veneriol. 2017. Vol. 98, No. 3. P. 350-354.
8. Khanh T.H., Sabanathan S., Thanh T.T. [et al.]. Enterovirus 71-associated hand, foot, and mouth disease, Southern Vietnam, 2011 // Emerg. Infect. Dis. 2012. Vol. 18, No. 12. P. 2002-2005.
9. Li Y., Bao H., Zhang X. [et al.]. Epidemiological and genetic analysis concerning the non-enterovirus 71 and non-coxsackievirus A16 causative agents related to hand, foot and mouth disease in Anyang city, Henan Province, China, from 2011 to 2015 // J. Med. Virol. 2017. Vol. 89, No. 10. P. 1749-1758.
10. Magnelli D., Zammarchi L., Antonelli A. [et al.]. Atypical hand, foot and mouth disease due to Coxsackievirus A6 in a traveler returning from Indonesia to Italy // J. Travel. Med. 2017. Vol. 24, No. 5. doi: 10.1093/jtm/tax029.
11. Muir P., Kämmerer U., Korn K. [et al.]. Molecular typing of enteroviruses: current status and future requirements. The European Union Concerted Action on Virus Meningitis and Encephalitis // Clin. Microbiol. Rev. 1998. Vol. 11, No. 1. P. 202-227.
12. Nasri D., Bouslama L., Omar S. [et al.]. Typing of human enterovirus by partial sequencing of VP2 // J. Clin. Microbiol. 2007. Vol. 45, No. 8. P. 2370-2379.
13. Nix W.A., Oberste M.S., Pallansch M.A. Sensitive, seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens // J. Clin. Microbiol. 2006. Vol. 44, No. 8. P. 2698-2704.
14. Rapp C., Aoun O., Ficko C. [et al.]. Travel-related cerebro-men-ingeal infections: the 8-year experience of a French infectious diseases unit // J. Travel. Med. 2010. Vol. 17, No. 1. P. 1-7.
15. Yao X., Bian L.L., Lu W.W. [et al.]. Epidemiological and etiological characteristics of herpangina and hand foot mouth diseases in Jiangsu, China, 2013-2014 // Hum. Vaccin. Immunother. 2017. Vol. 13, No. 4. P. 823-830.
Поступила в редакцию 30.05.2018.
MOLECULAR AND EPIDEMIOLOGICAL FEATURES OF GROUP INCIDENCE OF ENTEROVIRUS INFECTION CAUSED BY THE COXSACKIE A6 VIRUS AMONG THE POPULATION OF THE RUSSIAN FAR EAST IN 2016-2017
L.V. Butakova1, E.Yu. Sapega1, O.E. Trotsenko1, T.A. Zaytseva2, T.N. Karavyanskaya2, O.A. Funtusova3, G.P. Kovtonyuk3, I.Yu. Fedelesh4, E.Kh. Mandzhiev4
1 Khabarovsk Research Institute For Epidemiology and Microbiology (2 Shevchenko St. Khabarovsk 680610 Russian Federation),
2 Federal Service on Surveillance for Consumer rights protection and human well-being in Khabarovsk Territory (109b Karla Marksa St. Khabarovsk 680009 Russian Federation), 3 Federal Service on Surveillance for Consumer rights protection and human well-being in Sakhalin Region (30a Chekhova St. Yuzhno-Sakhalinsk 693020 Russian Federation), 4 Federal Service on Surveillance for Consumer rights protection and human well-being in Chukotka Autonomous Okrug (11 Lenina St. Anadyr 689000 Russian Federation) Objective. There are favorable conditions for an annual seasonal increase in the incidence of enterovirus infection in the Russian Far East.
Methods. Molecular typing of PCR-positive samples of biological material from four outbreaks of enterovirus infection registered in the Far East in 2016-2017 was carried out. Results. The cause of all flares was the Coxsackie A6 virus. Phylogenetic analysis of the strains revealed their similarity to the Coxsackie A6 virus, which circulated in 2016-2017 in other regions of Russia, as well as in Asian countries in 2009-2013. Conclusions. With molecular typing, the Coxsackie A6 virus was identified in 2013 in five of the nine administrative regions of the Russian Far East and by 2017 it spread throughout its territory. In 2015, the first outbreak in the Far East caused by the Coxsackie A6 virus was registered, a phylogenetic analysis of the strains of which allowed them to be identified as belonging to genotype D and assume an approximate existence of a common ancestor in 2008, which coincided with an increase in the registration of Coxsackie outbreaks of A6 infection worldwide. Keywords: Coxsackie viruses, flare morbidity, molecular typing, phylogenic analysis
Pacific Medical Journal, 2018, No. 3, p. 92-96.
