CC BY
1342 ^^pfcСвиноводство
www.agroyug.ru
DOI 10.24412/cl-33489-2023-7-42-43 УДК 636.4
Р.М. Зайнуллин,1 генеральный директор
А.И. Рудь1, доктор с.-х. наук, руководитель научно-исследовательского отдела селекции животных А.С. Кокорев1, начальник селекционно-генетического управления, А.Д. Самойлов2, директор по цифровой трансформации П.С. Воронин2, исполнительный директор
1 ООО «Башкирская мясная компания»,
2 АО «Смарт Технологии Инвест»
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ПРОГРАММЫ ПУЛЬС ЦСС ПРИ ОЦЕНКЕ ГЕНЕТИЧЕСКОГО ПОТЕНЦИАЛА
СВИНЕЙ
Аннотация. В статье рассмотрена важность периодической оценки генетического потенциала свиней в племенной работе. Рассмотрено использование программы Пульс ЦСС и метода BLUP для более точной оценки генетического потенциала свиней, приведены алгоритм оценки племенной ценности животного методом BLUP и результаты применения метода.
Ключевые слова:свиноводство, селекция, зоотехнический учёт, зона бонитировки, масса поросят при рождении, оценка генотипа, программное обеспечение, Пульс ЦСС.
Annotation. The article considers the importance of periodic genotypic evaluation in breeding work. The use of the Pulse.CSS software and the BLUP method for a more accurate evaluation of the genetic potential of pigs was considered, the algorithm for assessing the breeding value of an animal by the BLUP method and the results of the application of the method were presented.
Keywords: pig management, breeding selection, tracking and accounting, evaluation, weight of piglets at birth, genotypic evaluation, software, Pulse CSS.
Важнейшей составляющей племенной работы является периодическая оценка генетического потенциала животных. От суммарного поголовья йоркширов и ландрасов на предприятии только 8-12% свиноматок используют для чистопородного разведения. На основании оценки генетического потенциала селекционер принимает решение, какие генотипы необходимо сохранить в породе, а какие исключить, направив их носителей для производства гибридной свинки F1 в сочетании с хряками другой породы.
Важнейшим элементом при оценке потенциала животных является метод BLUP, который используется всеми зарубежными селекционными центрами. Аббревиатура BLUP складывается из первых букв словосочетания Best Linear Unbiased Prediction (метод наилучшего линейного неискаженного прогноза).
Метод показал отличные результаты в следующих случаях:
1) низкой наследуемости селекционных признаков (h2 до 0,3); к данной категории относится большинство признаков, характеризующих воспроизводительные качества животных: многоплодие, молочность и др.;
2) наличия внешних факторов, оказывающих существенное влияние на реализацию генотипа оцениваемых животных;
3) оценке племенной ценности разновозрастных животных (например, свиноматок, от которых получено различное количество опоросов) [1].
Расчет генетических оценок сопряжен со сложными математическими вычислениями, которые невозможно сделать вручную. Для этих функций зарубежные коллеги используют две основные
селекционные программы: MIXBLUP (Нидерланды) [2, 3] и BLUP-F-90 [4-6].
ООО «Башкирская мясная компания» совместно с бизнес-партнерами из АО «Смарт Технологии Инвест» реализовала оценку генетического потенциала по методу BLUP в отечественной программе Пульс ЦСС (рис. 1).
Алгоритм оценки племенной ценности животного методом BLUP предусматривает ряд последовательных операций:
1) выбор результирующего признака, по которому будет производиться оценка племенной ценности животных, и факторов, оказывающих на него влияние;
2) построение модели;
3) расчет коэффициентов наследуемости и коэффициента повторяемости (методом дисперсионного анализа);
4) построение матрицы родства, расчет генетических коварианс между пробандом и его родственниками;
5) оценка племенной ценности животных - прогнозирование его продуктивности в потомстве (EBV);
6) расчет достоверности сделанного прогноза (REL, Reliability).
Для повышения качества базы данных зоотехнического учета в программе предусмотрены допустимые коридоры значений по каждому селекционному признаку (Отчет «Проблемные значения селекционных признаков») (рис. 2).
Эффективность селекции оценивается с помощью блока «Моделирования отбора» (рисунок 3); который на фактических данных показывает, приведет ли определенный вариант отбора родителей
ЭФФЕКТИВНОЕ ЖИВОТНОВОДСТВО
F AM SUN
Aikgrp4rd ïnifiip^wJir
генеральный партнер спецвыпуска свиноводство
Рисунок 1.
Меню управления селекционным блоком в программе Пульс ЦСС.
Рисунок 2.
Отчет «Проблемные значения селекционных признаков».
Рисунок 3.
Блок «Моделирование отбора» в программе Пульс ЦСС.
к улучшению анализируемых селекционных признаков у их потомков.
Архитектура программы Пульс ЦСС предусматривает разносторонние инструменты для разработки методических подходов к оценке эффективности селекционной работы: влияния на эффект селекции количества родственников и степени их родства; фиксированных факторов (номер цикла, дата отъема, возраст первого опороса) и др. Алгоритмы, заложенные в программу, позволяют конструировать модель оценки животного по выбору зоотехника селекционера и проводить расчет эффекта селекции по любому селекционному признаку, информация о котором есть в базе данных зоотехнического учета.
Широкое внедрение метода BLUP в селекционную практику отечественных племенных предприятий позволит существенно повысить эффективность селекции и улучшить производственные показатели чистопородных и, далее, товарных животных.
ЛИТЕРАТУРА
1. Даншин В.А. Оценка генетической ценности животных. -К.: Аграрная наука, 2008. - 180 с.
2. https://www.mixblup.eu.
3. MiXBLUP 3.0 - Software for large genomic evaluations in animal breeding programs / J. Vandenplas.; R.F. Veerkamp; M.P.L.Calus et al.// World Congress on Genetics Applied to Livestock Production - 2022 (https://www.wageningenacademic. com/pb-assets/wagen/WCGALP2022/36_004.pdf).
4. http://nce.ads.uga.edu/software/.
5. Aguilar, I; Misztal, I; Tsuruta, S; Legarra, A; Wang, H (2014). PREGSF90 - P0STGSF90: Computational Tools for the Implementation of Single-step Genomic Selection and Genome
-wide Association with Ungenotyped Individuals in BLUPF90 Programs (PDF). 10th World Congress of Genetics Applied to Livestock Production. American Society of Animal Science, Champaign, IL.
6. Legarra. Tutorial of use of the blupf 90 suite for (SSG) BLUP of line crosses (with metafounders). - 24.04.2020. (http://genoweb. toulouse.inra.fr/~alegarra/ThreeWayDist/crosses_blupf90.pdf).
