Научная статья на тему 'Характеристика Rf-линий подсолнечника коллекции ВНИИМК с помощью микросателлитных маркеров ДНК'

Характеристика Rf-линий подсолнечника коллекции ВНИИМК с помощью микросателлитных маркеров ДНК Текст научной статьи по специальности «Сельскохозяйственные науки»

CC BY
23
6
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
генетическое разнообразие / генотипирование / подсолнечник / Helianthus annuus / маркер / SSR / линии-восстановители фертильности / genetic diversity / genotyping / sunflower / Helianthus annuus / marker / SSR / lines-restorers of fertility

Аннотация научной статьи по Сельскохозяйственные науки, автор научной работы — Саида Заурбиевна Гучетль, Елизавета Дмитриевна Логинова, Игорь Васильевич Рябовол, Анна Владимировна Головатская, Дмитрий Леонидович Савиченко

Подсолнечник – одна из наиболее рентабельных масличных культур. Задача селекции подсолнечника – создание новых высокоурожайных гибридов. Для ее решения важное значение имеет генетическое разнообразие исходного селекционного материала. Оценить это разнообразие можно с использованием молекулярно-генетических маркеров, в частности микросателлитов. Цель данной работы заключалась в генотипировании коллекции Rf-линий, анализе ее генетического разнообразия с помощью микросателлитных маркеров. Анализ для 54 Rf-линий коллекции ФГБНУ ФНЦ ВНИИМК выполнен с помощью 12 SSR-маркеров. По этим маркерам были составлены генетические паспорта для всех изучаемых линий и определены основные показатели информативности SSR-локусов. Коллекция характеризовалась большим генетическим разнообразием, в сумме были получены (Nа) 55 аллелей, в среднем 4,58 аллеля на локус. Эффективное число аллелей (Ne) в среднем 2,48. Индекс полиморфного информационного содержания (PIC) составил 0,51. Уровень гетерогенности линий был достаточно низким (5,5 %), что говорит об их хорошей генетической выровненности. По результатам анализа коллекция была разделена на два кластера на уровне объединения 15,8. Минимальная генетическая дистанция между линиями составила 0. Первый кластер cформировали 11 линий. Большая часть линий (43 шт.) образовали второй кластер. Уникальность коллекции составила 91 %.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по Сельскохозяйственные науки , автор научной работы — Саида Заурбиевна Гучетль, Елизавета Дмитриевна Логинова, Игорь Васильевич Рябовол, Анна Владимировна Головатская, Дмитрий Леонидович Савиченко

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Characteristic of Rf-lines from sunflower collec-tion of VNIIMK using microsatellite DNA-markers

Sunflower is one of the most profitable oil crops. The task of sunflower breeding is development of highly productive hybrids. The genetic diversity of initial germplasm is very important in this case. Molecular-genetic markers, particularly microsatellites, are used for the estimation of such material. The purpose of this research concluded in the genotyping of an Rf-lines collection, analyzing its genetic diversity using microsatellite markers. The analysis of 54 Rf-lines from a collection of V.S. Pustovoit All-Russian Re-search Institute of Oil Crops was carried out using 12 SSR-markers. Genetic passports of all studied lines were composed by these markers, the main indicators of SSR-loci information capacity were determined. The collection is characterized with a high genetic diversity, in total (Nа) 55 alleles were obtained, in average 4.58 alleles per locus. An effective allele amount (Ne) averaged 2.48. An index of polymorphic information content (PIC) was 0.51. A level of line heterogeneity was quite low (5.5%) that certifies their good genetic uniformity. Due to the results, the collec-tion was divided in two cluster at a joint level of 15.8. A minimal genetic distance between lines was equal 0. Eleven lines formed one cluster. The most lines (43 pcs) formed another cluster. The uniqueness of the collection was 91%.

Текст научной работы на тему «Характеристика Rf-линий подсолнечника коллекции ВНИИМК с помощью микросателлитных маркеров ДНК»

ISSN pr. 2412–608Х, ISSN on. 2412-6098

лей, в среднем 4,58 аллеля на локус. Эффективное

Масличные культуры.

число аллелей (Ne) в среднем 2,48. Индекс поли-

Вып. 1 (197). 2024

морфного информационного содержания (PIC)

_______________________________________________________________

составил 0,51. Уровень гетерогенности линий был

_______________________________________________________________

достаточно

Научная статья

низким (5,5 %), что говорит об их хо-

рошей генетической выровненности. По результа-

там анализа коллекция была разделена на два

УДК 631.523:633.854.78

кластера на уровне объединения 15,8. Минималь-

ная генетическая дистанция между линиями

DOI: 10.25230/2412-608Х-2024-1-197-17-23

составила 0. Первый кластер cформировали 11 ли-

ний. Большая часть линий (43 шт.) образовали

Характеристика Rf-линий

второй кластер. Уникальность коллекции состави-

подсолнечника коллекции

ла 91 %.

ВНИИМК с помощью

Ключевые слова: генетическое разнообразие,

микросателлитных маркеров

генотипирование,

подсолнечник,

Helianthus

ДНК

annuus, маркер, SSR, линии-восстановители фер-

тильности

Для цитирования: Гучетль С.З., Логинова Е.Д.,

Саида Заурбиевна Гучетль1

Рябовол И.В., Головатская А.В., Савиченко Д.Л.,

Елизавета Дмитриевна Логинова1

Волошко А.А., Борисенко О.М., Савченко В.Д.,

Игорь Васильевич Рябовол1

Фролов С.С., Горбаченко О.Ф., Пихтярева А.А.

Анна Владимировна Головатская1

Характеристика Rf-линий подсолнечника коллек-

Дмитрий Леонидович Савиченко1

ции ВНИИМК с помощью микросателлитных

Анастасия Александровна Волошко1

маркеров ДНК // Масличные культуры. 2024. Вып.

Оксана Михайловна Борисенко1

1 (197). С. 17–23

Валентина Демьяновна Савченко1

Сергей Сергеевич Фролов2

UDC 631.523:633.854.78

Олег Федорович Горбаченко2

Анастасия Александровна Пихтярева 1

Characteristic of Rf-lines from sunflower collec-

1ФГБНУ ФНЦ ВНИИМК

tion of VNIIMK using microsatellite DNA-

350038, Россия, г. Краснодар, ул. Филатова, д. 17

markers

[email protected]

Guchetl S.Z.1, head of the lab., leading researcher, PhD in biology

2Донская опытная станция – филиал ФГБНУ ФНЦ

Loginova Е.D.1, junior researcher

ВНИИМК

Ryabovol I.V.1, junior researcher

346754, Ростовская область, Азовский район,

Golovatskaya А.V.1, junior researcher

пос. Опорный, ул. Жданова, д. 2

Savichenko D.L.1, researcher

[email protected]

Voloshko А.А.1, analyst

Borisenko О.М.1, head of the lab., leading researcher, PhD in Аннотация. Подсолнечник – одна из наиболее

biology

рентабельных масличных культур. Задача селек-

Savchenko V.D.1, expert of 2nd category, PhD in agriculture ции подсолнечника – создание новых высокоуро-

Frolov S.S.2, PhD in agriculture

жайных гибридов. Для ее решения важное

Gorbachenko О.F.2, head of the department, chief research-

значение имеет генетическое разнообразие исход-

er, doctor of agriculture

ного селекционного материала. Оценить это раз-

Pikhtyaryova А.А.1, leading researcher, PhD in biology

нообразие можно с использованием молекулярно-

1V.S. Pustovoit All-Russian Research Institute of Oil

генетических маркеров, в частности микросател-

Crops

литов. Цель данной работы заключалась в геноти-

17 Filatova str., Krasnodar, 350038, Russia

пировании коллекции Rf-линий, анализе ее

[email protected]

генетического разнообразия с помощью микроса-

2

теллитных маркеров. Анализ для 54 Rf

Don experimental station – a branch of V.S.

-линий кол-

лекции ФГБНУ ФНЦ ВНИИМК

Pustovoit All-Russian Research Institute of Oil Crops

выполнен с

помощью 12

2 Zhdanova str., Oporny settl., Azov district, Rostov

SSR-маркеров. По этим маркерам

были составлены генетические паспорта для всех

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

region 346754, Russia

изучаемых линий и определены основные показа-

[email protected]

тели информативности

SSR-локусов. Коллекция

характеризовалась большим генетическим разно-

Abstract. Sunflower is one of the most profitable

образием

oil crops. The task of sunflower breeding is develop-

, в сумме были получены (Nа) 55 алле-

ment of highly productive hybrids. The genetic diver-

17

sity of initial germplasm is very important in this ходного материала для селекции [4; 5; 6;

case. Molecular-genetic markers, particularly mi-

7]. Так, L.S. Zhang с соавторами разрабо-

crosatellites, are used for the estimation of such mate-

тали систему из 78 SSR-маркеров подсол-

rial. The purpose of this research concluded in the

нечника и с ее помощью определили

genotyping of an Rf-lines collection, analyzing its

генетическое разнообразие 124 инбред-

genetic diversity using microsatellite markers. The

ных линий, включая 67 материнских (сте-

analysis of 54 Rf-lines from a collection of V.S.

Pustovoit All-Russian Research Institute of Oil Crops

рильных) и 57 линий-востановителей

was carried out using 12 SSR-markers. Genetic pass-

фертильности [5]. И.А. Шилов с соавто-

ports of all studied lines were composed by these

рами на основе семи микросателлитных

markers, the main indicators of SSR-loci information

локусов (ORS815, ORS394, HA140,

capacity were determined. The collection is character-

HA432, ORS546, ORS1144, ORS78) разра-

ized with a high genetic diversity, in total (Nа) 55

ботал мультиплексную систему генетиче-

alleles were obtained, in average 4.58 alleles per lo-

ской идентификации линий и гибридов

cus. An effective allele amount (Ne) averaged 2.48.

подсолнечника, идентифицировал девять

An index of polymorphic information content (PIC)

гибридов и их родительских форм, уста-

was 0.51. A level of line heterogeneity was quite low

(5.5%) that certifies their good genetic uniformity.

новил их однородность по всем локусам

Due to the results, the collection was divided in two

[8]. В ФГБНУ ФНЦ ВНИИМК разработа-

cluster at a joint level of 15.8. A minimal genetic dis-

на система микросателлитных маркеров

tance between lines was equal 0. Eleven lines formed

для генотипирования подсолнечника, и с

one cluster. The most lines (43 pcs) formed another

ее помощью проводится идентификация,

cluster. The uniqueness of the collection was 91%.

паспортизация и оценка генетической чи-

стоты линий и гибридов [6; 9]. Целью

Key words: genetic diversity, genotyping, sun-

данной работы является генотипирование

flower, Helianthus annuus, marker, SSR, lines-

коллекции Rf-линий, анализ ее генетиче-

restorers of fertility

ского разнообразия с помощью микроса-

Введение. Поскольку селекция гибри-

теллитных маркеров.

дов подсолнечника представляет собой

Материалы и методы. Анализ генети-

динамично

развивающуюся

отрасль

ческого разнообразия выполнен для 54 Rf-

сельского хозяйства, для эффективной ре-

линий коллекции ФГБНУ ФНЦ ВНИИМК,

ализации селекционных программ необ-

включающей наиболее ценные селекци-

ходимо

создавать

новый

исходный

онные формы (табл. 1).

материал, отличающийся генетическим

Таблица 1

разнообразием. Надежным инструментом

в изучении и поддержании разнообразия

54 Rf-линии подсолнечника ФГБНУ ФНЦ

выступает анализ ДНК. В последние годы

ВНИИМК, использованные в работе

все большую популярность приобретают

Название линии

Происхождение

методы анализа однонуклеотидного по-

ВК585, ВК303, ВК551, ВК529-1, Центральная экспери-

лиморфизма (

ВК548, ВК549-1, ВК595-1, ВК595,

ментальная база

SNP). С их помощью как у

ВК525, ВК989, ВК930, ВК944, МоР,

(ЦЭБ ВНИИМК)

подсолнечника, так и у других сельскохо-

Л 006, ВК301, ВК304, И613033, ФГБНУ ФНЦ ВНИИМК

08

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

зяйственных культур изучаются уровни

КЗ619, ВК195, ВК305, ВК23-ими,

ВК21-сур, ВК21-клп, СОНО-1, СО-

разнообразия и популяционной структуры

НО-2, СОНО-3,ЭОЛ-1, ЭОЛ-2, ЭОЛ-

зародышевой плазмы [1; 2; 3]. Вместе с

3, ЭОЛ-4, ЭОЛ-5, ЭОЛ-6, ЭОЛ-7,

тем не теряют своей актуальности и мик-

ЭОЛ-8, ЭОЛ-9, ЭОЛ-10, ЭОЛ-11,

ЭОЛ-12, ЭОЛ-13, ЭОЛ-14

росателлитные (SSR) маркеры, быстрый

Донская опытная

прогресс в использовании которых отме-

станция имени

Л.А. Жданова

чен с начала 2000-х годов. Они характери-

ЭД114, ЭД155, ВД541, ЭД193, ЭД788

(ДОС ВНИИМК) –

зуются богатым аллельным разнообразием

филиал ФГБНУ

ФНЦ ВНИИМК

и высокой степенью гетерозиготности,

Армавирская опытная

вследствие чего активно используются

станция

ВА337, ВА384, ВА389, ВА568,

как для создания генетических паспортов

(АОС ВНИИМК)

ВА737, ВА820, ВА325, ВА317

филиал ФГБНУ ФНЦ

сельскохозяйственных культур, так и для

ВНИИМК

мониторинга аллелофонда коллекций ис-

18

ДНК была выделена из смеси сухих

языка программирования R версии 4.3.2

зародышей пяти семян каждой линии с

(R Core Team, 2023) по методу ward.D2

помощью набора МагноПрайм® ФИТО

[14].

(НекстБио, РФ) на автоматической стан-

Результаты и обсуждение. Для гено-

ции Auto-pure 96 (Allsheng, КНР). Кон-

типирования и определения генетическо-

центрацию и качество полученной ДНК

го разнообразия линий по результатам

определяли с помощью микроспектрофо-

наших предыдущих исследований были

тометра Nano-300 (Allsheng, КНР).

отобраны 12 микросателлитных маркеров,

Для проведения ПЦР использовали

часть из которых разработана в лаборато-

25 мкл реакционной смеси следующего

рии молекулярно-генетических исследо-

состава: 67 мМ трис-HCl, рН8,8; 16,6 мM

ваний ВНИИМК. Критерием отбора

сульфата аммония; 2,5 мM MgCl2;

маркеров служил высокий или средний

0,01%-ный Tween 20; по 0,2 мM каждого

дискриминационный потенциал (PIC ˃

dNTP; по 10 пМ каждого праймера; 10 нг

0,3), кодоминантное наследование и спе-

матричной ДНК и 1 ед. рекомбинантной

цифичность к целевому локусу [6; 12].

термостабильной ДНК полимеразы (Син-

По этим маркерам были составлены гене-

тол, РФ). Амплификацию выполняли в

тические паспорта для всех изучаемых

термоциклере MiniAmp™ plus (Thermo

54 линий. По результатам генотипирова-

Scientific, США) при следующих темпе-

ния были определены основные показатели

ратурно-временных режимах: начальная

информативности SSR-локусов (табл. 2).

денатурация при 96 °С в течение 2 мин,

затем 30 циклов при температурно-

Таблица 2

временном режиме: денатурация при

Основные показатели информативности

94 °С – 30 сек, отжиг при 60 °С – 40 сек,

12 SSR-локусов у 54 Rf-линий ФГБНУ ФНЦ

элонгация при 70 °С – 1 мин, финальная

ВНИИМК

элонгация при 70° С – 2 мин. Все образцы

SSR-локус

Na

Ne

PIC

были генотипированы с использованием

Размах варьирова-

12 опубликованных геномных SSR-марке-

ния признака

2–10

1,25–5,78

0,20–0,83

Среднее

ров

4,58

2,48

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

0,51

[10; 11; 12].

Примечание: Na – число аллелей на локус,

Разделение продуктов амплификации

Ne – эффективное число аллелей, PIC – индекс

SSR-локусов, полученных с использова-

полиморфного информационного содержания

нием пары праймеров, один из которых

был флуоресцентно мечен (FAM, R6G,

Для коллекции образцов в сумме были

TAMRA или ROX), осуществляли мето-

получены 55 аллелей. Количество аллелей

дом капиллярного электрофореза в дена-

на локус составило от 2 до 11, в среднем

турирующих условиях на генетическом

4,58 аллелей на локус. Эффективное чис-

анализаторе «Нанофор-05» (ИАП РАН,

ло аллелей варьировало от 1,25 до 5,78

РФ). Размер фрагментов определяли от-

при среднем значении 2,48. PIC – от 0,20

носительно размерного стандарта СД-600

до 0,83, в среднем – 0,51. Эти показатели

с помощью GeneMarker software version

характеризуют изученную коллекцию как

3.0.1. (State College, PA). Индекс поли-

отличающуюся большим разнообразием.

морфного информационного содержания

Для коллекций, отличающихся общим

(PIC) и эффективное число аллелей (Ne)

происхождением или объединенных об-

вычисляли с помощью программного

щим признаков, этот показатель обычно

обеспечения Gene-Calc [13].

не превышает 0,4 [6; 15].

Для оценки генетических взаимосвязей

Поскольку для анализа брали не от-

применялся иерархический кластерный

дельные растения, а смесь генотипов, у

анализ с помощью функции hclust() стан-

трех образцов были выявлены от одного

дартного программного пакета stats для

до двух локусов в гетерозиготном состоя-

19

нии, что свидетельствует о недостаточной

ЦЭБ, ДОС и АОС ВНИИМК была харак-

выровненности линий по используемым

терна группировка отцовских линий в от-

маркерам или же загрязненности чуже-

дельные кластеры или субкластеры,

родным генетическим материалом (рис. 1).

которые демонстрируют, соответственно,

большую степень сходства [6]. ЦМС- и

А

Rf-линии

различного

происхождения

(США, Индия) с использованием 39

SSR-праймеров в исследованиях K. T. Ramya

с соавторами также сгруппированы в от-

дельные кластеры [15]. В наших исследо-

ваниях отцовские линии демонстрируют

Б

генетическую близость и формируют,

преимущественно, один кластер. Это, ве-

роятно, связано со сходством по призна-

кам, которые характерны для линий-

восстановителей фертильности.

Часть линий обладала идентичными

Рисунок 1 – ДНК-профили линии ВД 541

генотипами по аллельному состоянию

по SSR-маркерам HA 514 (А)

микросателлитных локусов. Всего таких

и CHR682 (Б), полученные методом

групп было две (табл. 3).

фрагментного анализа (ориг.)

Таблица 3

Распределение изученных линий

Следует отметить, что уровень гетеро-

в группы с идентичными генотипами

генности линий, наблюдаемый в настоя-

по 12 микросателлитным маркерам

щем исследовании, достаточно низкий

Номер группы

Линии с идентичными генотипами

(5,5 %), следовательно, инбредные линии

I

ВА325, ВК21-сур, ВК21-клп

все же генетически выровнены. Для

II

ВК304, ЭОЛ-1

определения генетических взаимоотно-

шений между изучаемыми линиями под-

Сходство образцов внутри каждой

солнечника выполнен кластерный анализ

группы вполне закономерно, поскольку

с построением диаграммы c помощью ме-

ВА325, ВК21-сур, ВК21-клп являются

тода ward.D2 [14] (рис. 2).

линиями-аналогами, а линии ВК304,

По результатам анализа коллекция

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

ЭОЛ-1 имеют общее происхождение. Для

была разделена на два кластера на уровне

идентификации таких близкородственных

объединения 15,8. Минимальная генети-

линий необходимо использовать либо

ческая дистанция между линиями соста-

большее число маркеров, либо маркеры к

вила 0. Первый кластер cформировали

целевым генам, по которым велась селек-

11 линий. Большая часть линий (43 шт.)

ция каждого аналога. Вместе с тем неко-

образовали второй кластер. В первый

торые линии, которые также являлись

кластер вошли селекционные линии ЦЭБ

близкородственными (например, ВК595-1

ВНИИМК и образцы ЭОЛ-1, ЭОЛ-2,

и ВК595), были дифференцированы друг

ЭОЛ-7, ЭОЛ-9, ЭОЛ-11, ЭОЛ-13. Боль-

от друга, что говорит о достаточной дис-

шим разнообразием отличался второй

криминационной силе системы маркеров.

кластер, включающий Rf-линии как ЦЭБ,

Уникальность изученной коллекции Rf-

так и АОС и ДОС ВНИИМК. Ранее при

линий составила 91 %.

оценке

генетического

разнообразия

Заключение. Таким образом, в резуль-

селекционных

линий

подсолнечника

тате проведенных исследований у кол-

ВНИИМК с помощью микросателлитных

лекции из 54 Rf-линий подсолнечни-

локусов было установлено, что для линий

ка селекции ВНИИМК был установлен

20

Рис. 2

21

достаточно высокий уровень генетическо-

сахарной свёклы с применением микросателлит-

го разнообразия по 12 микросателлитным

ного анализа // Сахар. – 2020. – № 8. – С. 27–31.

маркерам, уникальность 91 %. При

8. Шилов И.А., Велишаева Н.С., Анискина

построении дендрограммы генетических

Ю.В., Колобова О.С., Шалаева Т.В., Борисенко

О.М., Демурин Я.Н., Фролов С.С. Генетическая

расстояний большинство линий формиро-

идентификация линий и гибридов подсолнечника

вало один кластер, что может быть

Helianthus annuus L. на основе мультиплексного

следствием наличия признаков, объеди-

микросателлитного анализа // Достижения науки и

няющих линии-восстановители фертиль-

техники АПК. – 2023. – Т. 37. – № 1. – С. 10–15.

ности.

9. Гучетль С.З., Фролов С.С., Кузнецова Е.С.

Оптимизация определения параметров генетиче-

Список литературы

ской чистоты линий подсолнечника на основе

микросателлитных локусов ДНК // Масличные

1. Filippi C.V., Merino G.A., Montecchia J.F.,

культуры. Науч.-тех. бюл. ВНИИМК. – 2018. –

Aguirre N.C., Rivarola M., Naamati G., Fass M.I.,

Вып. 3 (175). – С. 34–39.

Álvarez D., Di Rienzo J., Heinz R.A., Contreras

10. Paniego N., Echaide M., Muñoz M., Fernán-

Moreira B., Lia V.V., Paniego N.B. Genetic diversity,

dez L., Torales S., Faccio P. [et al.]. Microsatellite population structure and linkage disequilibrium as-isolation and characterization in sunflower ( Helian-

sessment among international sunflower breeding

thus annuus L.) // Genome. – 2002. – V. 43. – P. 34–

collections // Genes. – 2020. – 11 (3). – 283. DOI:

43. DOI: 10.1139/g01-120/.

10.3390/genes11030283.

11. Tang S., Yu J-K., Slabaugh B., Shintani K.,

2. Goryunova S.V., Goryunov D.V., Chernova A.I.,

Knapp J. Simple sequence repeat map of the sunflow-

Martynova E.U., Boldyrev S.V., Ayupova A.F., Mazin

er genomen // Theoretical and Applied Genetics. –

P.V., Gurchenko E.A., Pavlova A.S., Petrova D.A.,

2002. – 105. – P. 1124–36. DOI: 10.1007/s00122-Dmitriev A.E., Chebanova Y.V., Gorlova L.A.,

002-0989-y.

Demurin Y.N., Garkusha S.V., Mukhina Z.M., Saven-

12. Логинова Е.Д., Савиченко Д.Л., Гучетль

ko E.G. Genetic and phenotypic diversity of the sun-

С.З. Разработка новых SSR-маркеров для геноти-

flower collection of the Pustovoit All-Russia

пирования линий и гибридов подсолнечника ( He-

Research Institute of Oil Crops (VNIIMK) // Helia. –

lianthus annuus L.) // В сб. материалов 12-й

2019. – 42 (70). – Р. 45–60. DOI: 10.1515/helia-

Международной конференции молодых учёных и

2018-0021.

специалистов: Актуальные вопросы биологии,

3. Velimirović A., Jovović Z., Perović D., Lehnert

селекции, технологии возделывания и переработ-

H., Mikić S., Mandić D., Pržulj N., Mangini G., Finet-

ки сельскохозяйственных культур. – Краснодар,

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

ti-Sialer M.M. SNP diversity and genetic structure of

“Rogosija”, an

2023. – С. 153–158.

old Western Balkan durum wheat col-

13. Binkowski J., Miks S. Gene-Calc [computer

lection // Plants. – 2023. – 12 (5). – 1157. DOI:

software]. URL: https://gene-calc.pl/pic.

10.3390/plants12051157.

14. Murtagh F., Legendre P. Ward’s hierarchical

4. Duca M., Port A., Cucereavî A., Șestacova T.

agglomerative clustering method: which algorithms

SSR markers assessment in estimation of genetic pol-

implement Ward’s criterion? // Journal of Classifica-

ymorphism in sunflower // International Journal of

tion. – 2014. – V. 31 (3). – P. 274–295.

Advanced Research in Biological Sciences. – 2015. –

15. Ramya K.T., Vishnuvardhan Reddy A. and

2 (1). – Р. 70–77.

Sujatha M. Agromorphological and molecular analy-

5. Zhang L.S., Clerc V. Le, Li S., Zhang D. Estab-

sis discloses wide genetic variability in sunflower

lishment of an effective set of simple sequence repeat

breeding lines from USDA, USA // Indian Journal of

markers for sunflower variety identification and di-

Genetics and Plant Breeding. – 2019. – V. 79 (2) – P.

versity assessment // Canadian Journal of Botany. –

444–452. DOI: 10.31742/IJGPB.79.2.8.

2005. – V. 83. – P. 66–72. DOI: 10.1139/ B04-155.

6. Гучетль С.З., Головатская А.В., Рамазанова

Referencers

С.А., Волошко А.А. Генетическое разнообразие

линий подсолнечника российской селекции, вы-

1. Filippi C.V., Merino G.A., Montecchia J.F.,

явленное с помощью анализа микросателлитных

Aguirre N.C., Rivarola M., Naamati G., Fass M.I.,

локусов // Аграрная наука Евро-Северо-Востока. –

Álvarez D., Di Rienzo J., Heinz R.A., Contreras

2023. – Т. 24. – №. 2. – С. 173–186.

Moreira B., Lia V.V., Paniego N.B. Genetic diversity,

7. Шилов И.А., Анискина Ю.В., Шалаева Т.В.,

population structure and linkage disequilibrium as-

Колобова О.С., Велишаева Н.С., Мищенко В.Н.,

sessment among international sunflower breeding

Логвинов А.В.

collections // Genes. – 2020. – 11 (3). – 283. DOI:

Создание современных гибридов

10.3390/genes11030283.

22

2. Goryunova S.V., Goryunov D.V., Chernova

2002. – 105. – P. 1124–36. DOI: 10.1007/s00122-

A.I., Martynova E.U., Boldyrev S.V., Ayupova A.F.,

002-0989-y.

Mazin P.V., Gurchenko E.A., Pavlova A.S., Petrova

12. Loginova E.D., Savichenko D.L., Guchetl'

D.A., Dmitriev A.E., Chebanova Y.V., Gorlova L.A.,

S.Z. Razrabotka novykh SSR-markerov dlya genotipi-

Demurin Y.N., Garkusha S.V., Mukhina Z.M., Saven-

rovaniya liniy i gibridov podsolnechnika (Helianthus

ko E.G. Genetic and phenotypic diversity of the sun-

annuus L.) // V sb. materialov 12-y Mezhdunarodnoy

flower collection of the Pustovoit All-Russia

konferentsii molodykh uchenykh i spetsialistov: Ak-

Research Institute of Oil Crops (VNIIMK) // Helia. –

tual'nye voprosy biologii, selektsii, tekhnologii

2019. – 42 (70). – Р. 45–60. DOI: 10.1515/helia-

vozdelyvaniya i pererabotki sel'skokhozyaystvennykh

2018-0021.

kul'tur. – Krasnodar, 2023. – S. 153–158.

3. Velimirović A., Jovović Z., Perović D., Lehnert

13. Binkowski J., Miks S. Gene-Calc [computer

H., Mikić S., Mandić D., Pržulj N., Mangini G., Fi-

software]. URL: https://gene-calc.pl/pic.

netti-Sialer M.M. SNP diversity and genetic structure

14. Murtagh F., Legendre P. Ward’s hierarchical

of “Rogosija”, an old Western Balkan durum wheat

agglomerative clustering method: which algorithms

collection // Plants. – 2023. – 12 (5). – 1157. DOI:

implement Ward’s criterion? // Journal of Classifica-

10.3390/plants12051157.

tion. – 2014. – V. 31 (3). – P. 274–295.

4. Duca M., Port A., Cucereavî A., Șestacova T.

15. Ramya K.T., Vishnuvardhan Reddy A. and

SSR markers assessment in estimation of genetic pol-

Sujatha M. Agromorphological and molecular analy-

ymorphism in sunflower // International Journal of

sis discloses wide genetic variability in sunflower

Advanced Research in Biological Sciences. – 2015. –

breeding lines from USDA, USA // Indian Journal of

2 (1). – Р. 70–77.

Genetics and Plant Breeding. – 2019. – V. 79 (2) – P.

5. Zhang L.S., Clerc V. Le, Li S., Zhang D. Estab-

444–452. DOI: 10.31742/IJGPB.79.2.8.

lishment of an effective set of simple sequence repeat

markers for sunflower variety identification and di-

versity assessment // Canadian Journal of Botany. –

2005. – V. 83. – P. 66–72. DOI: 10.1139/ B04-155.

Сведения

6. Guchetl' S.Z., Golovatskaya A.V., Ramazanova

об авторах

S.A., Voloshko A.A. Geneticheskoe raznoobrazie

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

liniy podsolnechnika rossiyskoy selektsii, vyyavlen-

noe s pomoshch'yu analiza mikrosatellitnykh lokusov

С.З. Гучетль, зав лаб., вед. науч. сотр., канд. биол. наук

// Agrarnaya nauka Evro-Severo-Vostoka. – 2023. – T.

Е.Д. Логинова, мл. науч. сотр.

24. – №. 2. – S. 173–186.

И.В. Рябовол, мл. науч. сотр.

7. Shilov I.A., Aniskina Yu.V., Shalaeva T.V.,

А.В. Головатская, мл. науч. сотр.

Kolobova O.S., Velishaeva N.S., Mishchenko V.N.,

Д.Л. Савиченко, науч. сотр.

Logvinov A.V. Sozdanie sovremennykh gibridov

А.А. Волошко, аналитик

sakharnoy svekly s primeneniem mikrosatellitnogo

О.М. Борисенко, зав. лаб., вед. науч. сотр., канд биол. наук

analiza // Sakhar. – 2020. – № 8. – S. 27–31.

В.Д. Савченко, эксперт 2-й кат., канд. с.-х. наук

8. Shilov I.A., Velishaeva N.S., Aniskina Yu.V.,

С.С. Фролов, канд. с.-х. наук

Kolobova O.S., Shalaeva T.V., Borisenko O.M.,

О.Ф. Горбаченко, зав. отд., гл. науч. сотр., д-р с.-х. наук

Demurin Ya.N., Frolov S.S. Geneticheskaya identif-

А.А. Пихтярева, вед. науч. сотр., канд. биол. наук

ikatsiya liniy i gibridov podsolnechnika Helianthus

annuus L. na osnove mul'tipleksnogo mikrosatellit-

nogo analiza // Dostizheniya nauki i tekhniki APK. –

2023. – T. 37. – № 1. – S. 10–15.

9. Guchetl' S.Z., Frolov S.S., Kuznetsova E.S. Op-

timizatsiya opredeleniya parametrov geneticheskoy

Получено/Received

chistoty liniy podsolnechnika na osnove mikrosatel-

19.02.2024

litnykh lokusov DNK // Maslichnye kul'tury. Nauch.-

Получено после рецензии/Manuscript peer-reviewed

tekh. byul. VNIIMK. – 2018. – Vyp. 3 (175). – S. 34–

21.02.2024

39.

Получено после доработки/Manuscript revised

10. Paniego N., Echaide M., Muñoz M., Fernán-

26.02.2024

dez L., Torales S., Faccio P. [et al.]. Microsatellite

Принято/Accepted

isolation and characterization in sunflower (Helian-

13.03.2024

thus annuus L.) // Genome. – 2002. – V. 43. – P. 34–

Manuscript on-line

43. DOI: 10.1139/g01-120/.

30.05.2024

11. Tang S., Yu J-K., Slabaugh B., Shintani K.,

Knapp J. Simple sequence repeat map of the sunflow-

er genomen // Theoretical and Applied Genetics. –

23

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.