https://doi.org/10.17116/molgen20234102142
Хантавирусы в природных популяциях полевок в Сибири
© Л.Н. ЯШИНА1, С.А. АБРАМОВ2, Н.А. СМЕТАННИКОВА1, Б.С. МАЛЫШЕВ1, Т.А. ДУПАЛ2, А.В. КРИВОПАЛОВ2
'ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора, р.п. Кольцово, Новосибирская область, Россия;
2ФГБУН «Институт систематики и экологии животных Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Россия РЕЗЮМЕ
Хантавирусы (род Orthohantavirus, семейство Hantaviridae) широко распространены во многих регионах мира и являются возбудителями двух клинических форм заболевания человека. В последние годы установлена патогенность для человека ортохантавируса Тула, циркулирующего на территории Европы среди обыкновенных полевок (Microtus arvalis). Цель работы. Выявление природных очагов циркуляции хантавирусов среди полевок на территории Сибири и их идентификация.
Материал и методы. 254 грызуна подсемейства Arvicolinae были отловлены на территории Западной и Восточной Сибири. Образцы были проанализированы методом непрямого иммунофлюоресцентного анализа и обратной транскрипции — полимеразной цепной реакции.
Результаты. Специфические антитела к хантавирусам выявлены у полевок-экономок (Alexandromys oeconomus), темных полевок (Microtus agrestis), узкочерепных полевок (Lasiopodomys gregalis), степных пеструшек (Lagurus lagurus) в Алтайском и Красноярском краях, Томской, Новосибирской областях и Республике Алтай. У сероположительных животных двух видов была обнаружена РНК хантавируса, идентифицированного как вирус Тула. Филогенетический анализ показал, что сибирские РНК изоляты вируса Тула относятся к разным генетическим вариантам, Russia II и Russia III, ассоциированным с узкочерепными полевками и степными пеструшками соответственно.
Заключение. Наши данные показывают, что ареал вируса Тула на азиатской территории РФ включает Алтайский край, Новосибирскую и Томскую области в Западной Сибири и достигает территории Восточной Сибири (Красноярского края).
Ключевые слова: хантавирус Тула, полевки, филогенетический анализ, Сибирь. ИНФОРМАЦИЯ ОБ АВТОРАХ:
Яшина Л.Н. — https://orcid.org/0000-0003-2844-7835; e-mail: [email protected] Абрамов С.А. — https://orcid.org/0000-0001-7921-6696; e-mail: [email protected] Сметанникова Н.А. — https://orcid.org/0000-0002-5082-8071; e-mail: [email protected] Малышев Б.С. — https://orcid.org/0000-0003-3004-3020; e-mail: [email protected] Дупал Т.А. — https://orcid.org/0000-0002-4487-1815; e-mail: [email protected] Кривопалов А.В. — https://orcid.org/0000-0003-4824-6061; e-mail: [email protected] Автор, ответственный за переписку: Яшина Л.Н. — e-mail: [email protected]
КАК ЦИТИРОВАТЬ:
Яшина Л.Н., Абрамов С.А., Сметанникова Н.А., Малышев Б.С., Дупал Т.А., Кривопалов А.В. Хантавирусы в природных популяциях полевок в Сибири. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2023;41(2):42—47. https://doi.org/10.17116/molgen20234102142
Hantaviruses in populations of voles in Siberia
© L.N. YASHINA1, S.A. ABRAMOV2, N.A. SMETANNIKOVA1, B.S. MALYSHEV1, T.A. DUPAL2, A.V. KRIVOPALOV2
'State Research Center of Virology and Biotechnology «VECTOR» of Rospotrebnadzor, Koltsovo, Novosibirsk Region, Russia; institute of Systematics and Ecology of Animals, Novosibirsk, Russia
ABSTRACT
Hantaviruses (genus Orthohantavirus, family Hantaviridae) have been identified worldwide and cause two kinds of human disease. During the last years genetic evidence of pathogenicity for humans has been demonstrated for Tula virus, circulating in Europe among common voles (Microtus arvalis).
The goal of the study was the detection of natural foci of hantavirus infection among voles in Siberia and genetic identification of vole-borne hantaviruses.
Material and methods. A total of 254 rodents of Arvicolinae subfamily were captured in West and East Siberia and tested for hanta-virus-specific antibodies by immunofluorescent assay and for hantavirus RNA using reverse transcription polymerase chain reaction. Results. Hantavirus antibody-positive rodents were found in Altai and Krasnoyarsk Krai, Tomsk, Novosibirsk regions, and Altai Republic among root voles (Alexandromys oeconomus), field voles (Microtus agrestis), narrow-headed voles (Lasiopodomys gregalis) and steppe lemmings (Lagurus lagurus). Viral RNA was detected and identified as Tula virus in two species of seropositive animals. Phylogenetic analysis showed that Siberian strains of Tula virus represent distinct genetic variants, Russia II and Russia III, associated with narrow-headed voles and steppe lemmings, respectively.
Conclusion. Our data demonstrated the presence of Tula virus from the Altai Krai, Tomsk, Novosibirsk regions in West Siberia up to East Siberia (Krasnoyarsk Krai) in Asian Russia.
Keywords: hantavirus Tula, voles, phylogenetic analysis, Siberia.
INFORMATION ABOUT THE AUTHORS:
Yashina L.N. — https://orcid.org/0000-0003-2844-7835; e-mail: [email protected] Abramov S.A. — https://orcid.org/0000-0001-7921-6696; e-mail: [email protected] Smetannikova N.A. — https://orcid.org/0000-0002-5082-8071; e-mail: [email protected] Malyshev B.S. — https://orcid.org/0000-0003-3004-3020; e-mail: [email protected] Dupal T.A. — https://orcid.org/0000-0002-4487-1815; e-mail: [email protected] Krivopalov A.V. — https://orcid.org/0000-0003-4824-6061; e-mail: [email protected] Corresponding author: Yashina L.N. — e-mail: [email protected]
TO CITE THIS ARTICLE:
Yashina LN, Abramov SA, Smetannikova NA, Malyshev BS, Dupal TA, Krivopalov AV. Hantaviruses in populations of voles in Siberia. Molekulyarnaya Genetika, Mikrobiologiya i Virusologiya (Molecular Genetics, Microbiology and Virology). 2023;41(2):42—47. (In Russ.). https://doi.org/10.17116/molgen20234102142
Введение
Хантавирусы, принадлежащие роду Orthohanta-семейства Hantaviridae, широко распространены во многих регионах мира и являются возбудителями двух клинических форм заболевания человека: геморрагической лихорадки с почечным синдромом (ГЛПС) и хантавирусного кардио-легочного синдрома (ХЛС) [1, 2]. В настоящее время для обозначения заболеваний человека, вызванных хантавирусами, международным сообществом предлагается использовать термин «хантавирусное заболевание» вместо терминов ГЛПС и ХЛС [3]. Это связано с накоплением данных об общей природе нарушений в организме человека, вызванных разными видами ханта-вирусов. Установлено, что на территории Евразии возбудителями хантавирусного заболевания являются вирусы Хантаан (НТКУ), Сеул (8ЕОУ), Добрава/ Белград фОВУ), Пуумала (РииУ) и Тула (ТШУ).
Долгое время ТИЬУ относили к непатогенным для человека хантавирусам. Основанием для этого служило отсутствие зарегистрированных случаев хантавирусного заболевания, вызванных ТИЬУ, а также использование отличающегося от других патогенных хантавирусов рецептора, отвечающего за связывание и проникновение ТИЬУ в клетку [4]. Однако со временем в литературе стали накапливаться данные, которые давали основания предполагать патогенность ТиЬУ для человека. Исследование более 500 образцов сывороток, взятых у работников лесного хозяйства в Германии, выявило 3,9% сывороток, реагирующих исключительно с антигеном вируса ТИЬУ [5]. Анализ методом реакции нейтрализации более широкой выборки, 6500 образцов сывороток, представляющих репрезентативную популяцию жителей Германии, также подтвердил случаи инфицирования Ти1У Все известные к настоящему времени прямые молекулярные доказательства ТИЬУ-инфекции у человека получены в европейских странах. Впервые заболевание, ассоциированное с ТИ1У с тяжелым клиническим течением на фоне иммунодефицита, было диагностировано молекулярно-генетическими и серологическими методами в 2003 г. в Чехии [6]. Второй случай с легкой клинической формой хантавирус-
ного заболевания выявлен у иммунокомпетентного пациента без сопутствующих заболеваний из Франции [7]. Третий случай заболевания с типичными проявлениями хантавирусной инфекции выявлен в Германии также у иммунокомпетентного человека [8]. Все эти случаи обусловлены заражением вариантами TULV, циркулирующими среди обыкновенных полевок (Microtus arvalis).
Причиной редкого выявления TULV-ассоци-ированных заболеваний человека может быть значительное генетическое и антигенное сходство с другим патогенным для человека хантавирусом, PUUV, циркулирующим среди рыжих полевок (Myodes glare-olus) и широко распространенным на территории Европы и части Азии [9]. Поскольку антитела к TULV и PUUV не могут быть дифференцированы с помощью стандартных серологических тестов (за исключением реакции нейтрализации), заболевание, вызванное вирусом TULV, при рутинном анализе может быть ошибочно диагностировано как хантавирусная инфекция, вызванная PUUV.
Вирус Тула (TULV) впервые был изолирован от обыкновенной (M. arvalis) и восточноевропейской (M. rossiaemeridionalis) полевок, отловленных в европейской части России [10]. Дальнейшие исследования показали широкое распространение TULV на территории Евразии, при этом обнаружено 11 генетических вариантов вируса [11—17]. Основным природным резервуаром TULV является обыкновенная полевка, включая кариоформу obscurus, рассматриваемую иногда как самостоятельный подвид или даже вид [12—14, 17]. Помимо M. arvalis и M. rossiaemeridionalis, TULV выявлен у многих других видов полевок: темных полевок (M. agrestis), кустарниковых полевок (M. majori), подземных полевок (Terrícola subterraneus, ранее Microtus subterraneus), узкочерепных полевок (Lasiopodomys gregalis, ранее Microtus gregalis), водяных полевок (Arvicola amphibius) и степных пеструшек (Lagurus lagurus) на обширной территории Евроазиатского континента от Бельгии, Франции и Германии до Турции, Казахстана и Китая. Как правило, выявляют видоспецифическое и географическое группирование штаммов TULV. Однако в местах
совместного обитания разных видов серых полевок рода Microtus наблюдается циркуляция одного варианта вируса в популяциях M. arvalis и M. agrestis, M. arvalis и M. rossiaemeridionalis. В России ранее выявлены пять генетических вариантов TULV [10, 15—17], два из которых циркулируют в Сибири на территории Омской и Новосибирской областей среди L. gregalis и L. lagurus [16].
Способность TULV от M. arvalis вызывать ханта-вирусное заболевание даже у исходно здоровых людей свидетельствует о его патогенном потенциале и ставит задачу изучения распространения TULV среди различных видов природных носителей на территории РФ. В данном исследовании представлены новые данные по выявлению и идентификации вариантов TULV, циркулирующих на территории Сибири.
Материал и методы
Экспедиции по отлову мелких млекопитающих и сбору образцов были проведены в 2007—2008 гг. в различных регионах Западной Сибири (Республике Алтай, Кемеровской, Новосибирской и Томской областях, Алтайском и Красноярском краях). Отлов мелких млекопитающих и отбор образцов осуществляли в соответствии с протоколом и рекомендациями по безопасной работе, согласно МУ 3.1.1029-01. утв. 06.04.2001.
Таксономическая принадлежность млекопитающих определена на основе анализа морфологических признаков [18] и путем сравнения с базой данных GenBank фрагмента гена цитохрома b митохондри-альной ДНК. На протяжении последних десятилетий статус и названия таксонов внутри группы по-левочьих часто менялись. В данной работе названия таксонов грызунов приведены согласно таксономической сводке по млекопитающим России [19]. В отдельных случаях при необходимости приводятся прежние названия таксонов.
Инфицированных хантавирусами животных выявляли путем детекции вирус-специфических антител в сыворотках крови и/или хантавирусной РНК в образцах легких. Специфические антитела к хан-тавирусу в сыворотках крови грызунов выявляли непрямым методом флюоресцирующих антител, применяя культуральный диагностикум антигенов вирусов Hantaan, Seoul, Puumala.
Фрагменты ткани легких помещали в раствор RNAlater для последующего выделения РНК и ее анализа методом обратной транскрипции — полимераз-ной цепной реакции (ОТ-ПЦР). Суммарную РНК выделяли из тканей легких набором RNeasy MiniKit («Qiagen», Германия). Для обратной транскрипции применяли обратную транскриптазу Expand («Roche», Швейцария) и универсальный олигонуклеотидный праймер (OSM55, 5'-TAGTAGTAGACTCC-3'), сконструированный на основе консервативных последова-
тельностей З'-концов S-, M- и L-сегментов хантави-русов. Для предварительного скрининга посредством гнездовой ОТ-ПЦР использовали родоспецифич-ные праймеры к участку L-сегмента [20]. Праймеры, специфичные для S-сегмента генома (позиции 3611219) вируса Тула, описаны нами ранее [17]. Полученные ампликоны разделяли электрофорезом в 1,2% агарозном геле, затем проводили их очистку набором QIAQuick Gel Extraction Kit («Qiagen», Германия). Прямое секвенирование ДНК выполняли на автоматическом анализаторе ABI Prism 310 («Applied Biosystems», США).
Выравнивание нуклеотидных последовательностей осуществляли с помощью алгоритма ClustalW в программе MEGAX [21]. Для построения филогенетических деревьев использовали метод ближайших соседей (NJ) с моделью эволюции Tamura-Nei и метод максимального правдоподобия ML с моделью GTR+I+Г. Вычисления проводили для 1000 итераций.
Результаты
Первичный скрининг сывороток крови от 254 грызунов подсемейства Arvicolinae (11 M. agrestis, 80 Alexandromys oeconomus, 151 L. gregalis, 12 L. lagurus), отловленных на территории шести административных регионов Сибири, проведен методом непрямого иммунофлюоресцентного анализа. Специфические антитела к хантавирусам выявлены у полевок-экономок (Alexandromys oeconomus), темных полевок (Microtus agrestis), узкочерепных полевок (Lasiopodomys gregalis), степных пеструшек (Lagurus lagurus) в Алтайском и Красноярском краях, Томской, Новосибирской областях и Республике Алтай (рис. 1, см. https://mediasphera.ru/upload/medialibrary/files/Mol_ genetika_2023_02_045_add.zip; см. таблицу). Титры антител к хантавирусам у животных варьировали от 1:40 до 1:320. Образцы тканей легких всех серополо-жительных полевок исследованы методом ОТ-ПЦР с использованием праймеров к L- и S-сегментам вирусного генома. Вирусная РНК обнаружена в 6 образцах: 4/7 сероположительных L. gregalis и 2/4 L. lagurus. В сероположительных образцах от темных полевок и полевок-экономок вирусная РНК не обнаружена. Вирусная РНК не выявлена в образцах от L. gregalis из Томской области, хотя данный вид доминировал в отловах и у 6% особей выявляли специфические антитела к хантавирусам. Для последующего филогенетического анализа взаимосвязей российских штаммов TULV нами дополнительно получены последовательности L-сегмента вирусного генома от двух обыкновенных полевок формы obscurus, отловленных на территории Республики Крым, в которых ранее была обнаружена РНК вируса TULV [17].
Генетический анализ полученных фрагментов L- и S-сегментов генома длиной соответственно
Выявление инфицированных хантавирусами серых полевок методом непрямого иммунофлюоресцентного анализа и методом ОТ-ПЦР в Сибири
Регион/место отлова Вид грызуна Количество сероположитель-ных/исследованных Количество положительных/исследованных РНК
Новосибирская область/Карасук Lasiopodomys gregalis 3/49 2/3
Lagurus lagurus 4/12 2/4
Alexandromys oeconomus 0/17 —
Алтайский край/Покровка Alexandromys oeconomus 2/7 0/2
Алтайский край/Хмелевка Alexandromys oeconomus 1/8 0/1
Алтайский край/Курья Lasiopodomys gregalis 1/2 1/1
Microtus agrestis 0/1 —
Республика Алтай/Артыбаш Alexandromys oeconomus 0/9 —
Томская область/Бакса Lasiopodomys gregalis 4/67 0/4
Кемеровская обл./Балахнино Alexandromys oeconomus 0/21 —
Lasiopodomys gregalis 0/13 —
Красноярский край/Средняя Шушь Alexandromys oeconomus 0/11 —
Microtus agrestis 1/9 0/1
Красноярский край/Шушенское Alexandromys oeconomus 0/2 —
Lasiopodomys gregalis 3/20 1/ 3
Красноярский край/Парная Alexandromys oeconomus 1/2 0/1
Microtus agrestis 0/1 —
346 и 837 нуклеотидных остатков (н.о.) показал их принадлежность к TULV. Новые РНК изоляты продемонстрировали видоспецифическое группирование и принадлежность к 2 из 5 генетических вариантов TULV (Russia II и Russia III), обнаруженных на территории России. Уровень различия нуклеотидных последовательностей S-сегментов генома между этими вариантами оказался значительным и составил 17,8—19,7%, аминокислотные последовательности отличались на 4,8—5,6%. При этом 2 различающихся варианта, ассоциированных с L. gregalis и L. lagurus, были обнаружены в одном месте отлова на территории Новосибирской области, где ареалы природных хозяев перекрываются и оба вида полевок сосуществуют на одной территории. РНК изоляты от узкочерепных полевок принадлежали к варианту Russia II. Уровень различий нуклеотидных последовательностей в группе составлял 5,9—7,6% для изолятов из Омской (Omsk/Mg22), Новосибирской (Karasuk-Mg90) областей, Алтайского края (Kurya-Mg713) и был значительно выше (12,9— 14,4%) при сравнении с изолятом из Красноярского края (Shush-Mg1136). РНК изоляты от L. lagurus из одного места отлова (Karasuk-Lg128 и Karasuk-Lg153) относились к варианту Russia III и имели относительно низкий уровень различий между собой и с РНК изолятами из Омской области (Omsk LL2 и Omsk-LL58), для нуклеотидных последовательностей 0,2— 6,2%, для аминокислотных — 0—1,5%. Анализ нукле-отидных последовательностей более консервативного L-сегмента генома показал аналогичную картину. Различия сибирских РНК изолятов вариантов Russia II и Russia III составили 16,8—19,1% для нуклеотидных последовательностей и 1,7—3,5% для аминокислотных последовательностей. Наибольшее разли-
чие между РНК изолятами от L. gregalis для варианта Russia II так же, как и в случае S-сегмента, выявлено для изолята из Красноярского края и составило для нуклеотидных последовательностей 13,0—14,2%, что выше по сравнению с уровнем 8,1% для остальных РНК изолятов из Западной Сибири.
Филогенетический анализ полученных последовательностей подтвердил данные генетического анализа. Новые последовательности S- и L-сегментов вирусного генома группировались по видоспеци-фическому принципу, формируя варианты Russia II и Russia III (рис. 2, см. https://mediasphera.ru/upload/ medialibrary/files/Mol_genetika_2023_02_046_add.zip).
Следующий уровень группирования основан на географическом принципе. При этом на дереве L-сегмента географически более удаленный РНК изолят из Красноярского края формирует отдельную ветвь. Это же демонстрируют РНК изоляты от M. arvalis формы obscurus с территории Республики Крым, которые объединяются с ранее описанными изолятами от M. arvalis из европейской части России и Литвы, формируя вариант Russia IV вируса TULV.
Обсуждение
Отрицательный результат ОТ-ПЦР для ряда се-ропозитивных животных может быть обусловлен минимальной концентрацией вируса в организме, ниже уровня, доступного для используемого метода детекции. Ранее установлено, что уровень вирусной нагрузки у инфицированных животных изменяется со временем и у некоторых серопозитивных особей мог быть на минимальном уровне на фоне относительно высокого титра специфических ан-
тител [22, 23]. Дополнительной причиной того, что хантавирусная РНК не выявлена у двух видов полевок, M. agrestis и Л. oeconomys, могло быть ограниченное количество (4 особи) серопозитивных животных, в то время как количество исследованных серо-позитивных Ь. gregalis и Ь. \agurus, среди которых были выявлены РНК-позитивные, составило 15 особей.
Поскольку нам не удалось получить хантавирус-ную РНК от серопозитивных сибирских М. agrestis и Л. оесопотуъ, нельзя утверждать, что именно ТИРУ циркулирует среди этих двух видов. Ранее показано, что, кроме ТИРУ, среди М. agrestis и Л. оесопотуъ на территории Европы выявляли новый хантавирус Та1епа1е/Тгаешшег8ее [24—26]. Для сибирских видов этот вопрос остается открытым. Поскольку все ранее идентифицированные случаи заболевания человека, вызванные ТИРУ, были обусловлены вариантами вируса, циркулирующими среди М. arvalis, значение в патологии человека сибирских вариантов вируса, относящихся к отличающимся генетическим вариантам, остается неизвестным.
Заключение
Таким образом, нами установлено, что ареал ТИРУ на азиатской территории РФ включает Алтай-
ЛИТЕРАТУРА/REFERENCES
1. Jonsson CB, Figueiredo LT, Vapalahti O. A global perspective on hantavirus ecology, epidemiology, and disease. Clin Microbiol. Rev. 2010;23(2):412-441. https://doi.org/10.1128/CMR.00062-09
2. Avsic-Zupanc T, Saksida A, Korva M. Hantavirus infections. Clin Microbiol Infect. 2019;21:6-16. https://doi.org/10.1111/1469-0691.12291
3. Clement J, Maes P, Lagrou K, Van Ranst M, Lameire N. A unifying hypothesis and a single name for a complex globally emerging infection: hantavirus disease. Eur J Clin Microbiollnfect Dis. 2012;31(1):1-5. https://doi.org/10.1007/s10096-011-1456-y
4. Ткаченко Е.А., Дзагурова Т.К., Ткаченко П.Е. Хантавирусы: экология, молекулярная биология, морфология, патогенез и диагностика ханта-вирусных инфекций. Молекулярная медицина. 2009;5:36-41. Tkachenko EA, Dzagurova TK, Tkachenko PE. Hantaviruses: ecology, molecular biology, morphology, pathogenesis and diagnostics of hantaviral infections. Molekulyarnaya meditsina. 2009;5:36-41. (In Russ.).
5. Hofmann MM, Petraityte-Burneikiene R, Ziller M, Sanauskas K, Friedrich R, Neiderstrasser O et al. Seroprevalence study in forestry workers of a non-endemic region in eastern Germany reveals infection by Tula and Do-brava-Belgrade hantaviruses. Med Microbiol Immunol. 2011;200(4):263-268. https://doi.org/10.1007/s00430-011-0203-4
6. Zelena H, Mrazek J, Kuhn T. Tula hantavirus in immunocompromised host, Czech Republic. Emerg Infect Dis. 2013;19:1873-1876. https://doi.org/10.3201/eid1911.130421
7. Reynes JM, Carli D, Boukezia N, Debruyne M, Herti S. Tula hantavirus infection in a hospitalised patient, France, June 2015. Euro Surveill. 2015;20(50):30095.
https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2015.20.50.30095
8. Hofmann J, Kramer S, Herrlinger KR, Jeske K, Kuhns M, Weiss S et al. Tula Virus as Causative Agent of Hantavirus Disease in Immunocompetent Person, Germany. Emerg Infect Dis. 2021;27(4):1234-1237. https://doi.org/10.3201/eid2704.203996
9. Kruger DH, Figueiredo LT, Song JW, Klempa B. Hantaviruses — globally emerging pathogens. J Clin Virol. 2015;64:128-136. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2014.08.033
ский край, Новосибирскую и Томскую области в Западной Сибири и достигает территории Восточной Сибири (Красноярский край). Сибирские РНК изо-ляты вируса TULV относятся к двум генетическим вариантам, Russia II и Russia III, ассоциированным с узкочерепными полевками и степными пеструшками соответственно.
Финансирование. Исследование выполнено за счет Государственного бюджета и при частичной финансовой поддержке Программы фундаментальных научных исследований FWGS-2021-0002.
Конфликт интересов. Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
Conflict of interest. The authors declare no conflict of interest.
Соблюдение этических стандартов
Исследование выполнено в соответствии с Правилами проведения работ с использованием экспериментальных животных (Приказ Министерства высшего и среднего образования №742 от 13.11.1984), а также Европейской конвенцией о защите позвоночных животных, используемых для экспериментов или в иных научных целях (ETS №123, 18 марта 1986 г.). В исследовании не использовались исчезающие или охраняемые виды.
10. Plyusnin A, Vapalahti O, Lankinen H, Lehvaslaiho H, Apekina N, Myas-nikov Y, et al. Tula virus: a newly detected hantavirus carried by European common voles. J Virol. 1994;68:7833-7839.
11. Schmidt-Chanasit J, Essbauer S, Petraityte R, Yoshimatsu K, Tackmann K, Conraths FJ, et al. Extensive host sharing of central European Tula virus. J Virol 2010;84:459-474. https://doi.org/10.1128/JVI.01226-09
12. Chen JT, Qin J, Li K, Xu QY, Wang XP, Plyusnin A, et al. Identification and characterization of a novel subtype of Tula virus in Microtus arvalis obscurus voles sampled from Xinjiang, China. Infect Genet Evol. 2019;75:104012. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2019.104012
13. Polat C, Ergünay K, Irmak S, Erdin M, Brinkmann A, Qetinta§ O, et al. A novel genetic lineage of Tula orthohantavirus in Altai voles (Microtus obscurus) from Turkey. Infect Genet Evol. 2019;67:150-158. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2018.11.015
14. Plyusnina A, Laakkonen J, Niemimaa J, Henttonen H, Plyusnin A. New Genetic Lineage of Tula Hantavirus in Microtus arvalis obscurus in Eastern Kazakhstan. Open Virol J. 2008;2:32-36. https://doi.org/10.2174/1874357900802010032
15. Tkachenko EA, Witkowski PT, Radosa L, Dzagurova TK, Okulova NM, Yunicheva YV, et al. Adler hantavirus, a new genetic variant of Tula virus identified in Major's pine voles (Microtus majori) sampled in southern European Russia. Infect Genet Evol. 2015;29:156-163. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2014.11.018
16. Якименко В.В., Гаранина С.Б., Малькова М.Г., Валицкая А.В., Константинова Г.А., Танцев А.К. и др. Итоги изучения хантавирусов в Западной Сибири. Тихоокеанский медицинский журнал. 2008;2:20-26. Yakimenko VV, Garanina SB, Mal'kova MG, Valickaja AV, Konstantino-va GA, Tancev AK, et al. Results of hantavirus investigation in Western Siberia. Tikhookeanskiy Meditsinskiy Zhurnal. 2008;2:20-26. (In Russ.).
17. Яшина Л.Н., Зайковская А.В., Протопопова Е.В., Бабкин И.В., Малышев Б.С., Товпинец Н.Н., Евстафьев И.Л. Хантавирус Тула на территории Крыма. Молекулярная генетикамикробиол. вирусол. 2015;4:38-41.
Yashina LN, Zaykovskaya AV, Protopopova EV, Babkin IV, Malyshev BS, Tovpinets NN, Evstafiev IL. Tula hantavirus in Crimea. Molecular Genetic Microbiology Virology. 2015;30(4):201-205. (In Russ.).
18. Громов И.М., Ербаева М.А. Млекопитающие фауны России и сопредельных территорий. Зайцеобразные и грызуны. СПб.: ЗИН РАН; 1995. Gromov IM, Erbaeva MA. Mammals oof Russia and Adjacent Territories: Lag-omorphs and Rodents. [Mlekopitayushchiye fauny Rossii i sopredel'nykh terri-toriy. Zaytseobraznyye i gryzuny]. SPb.: Zoological Institute of the Russian Academy of Sciences; 1995. (In Russ.).
19. Млекопитающие России: систематико-географический справочник. Под ред. Павлинова И.Я., Лисовского А.А. М.: Товарищество научных изданий КМК; 2012.
Pavlinov IYa, Lisovskiy AA, eds. Mammals oof Russia: systematic-geographical reference book. [Mlekopitayushchiye Rossii: sistematiko-geograficheskiy sprav-ochnik]. M.: KMK Scientific Press Ltd.; 2012. (In Russ.).
20.
21.
Klempa B, Fichet-Calvet E, Lecompte E, Auste B, Aniskin V, Meisel H, et al. Hantavirus in African wood mouse, Guinea. EmergInfect Dis. 2006;12:838-840. https://doi.org/10.3201/eid1205.051487
Kumar S, Stecher G, Li M, Knyaz C, Tamura K. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across Computing Platforms. Mol Biol Evol. 2018;35(6):1547-1549. https://doi.org/10.1093/molbev/msy096
22. Yashina LN, Abramov SA, Dupal TA, Danchinova GA, Malyshev BS, Hay J, et al. Hokkaido genotype of Puumala virus in the grey red-backed vole (Myo-des rufocanus) and northern red-backed vole (Myodes rutilus) in Siberia. Infect Genet Evol. 2015;33:304-313. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2015.05.021
23. Klingstrom J, Heyman P, Escutenaire S, Sjolander KB, De Jaegere F, Hent-tonen H, et al. Rodent host specificity of European hantaviruses: evidence of Puumala virus interspecific spillover. J Med Virol. 2002;68(4):581-588. https://doi.org/10.1002/jmv.10232
24. Jeske K, Hiltbrunner M, Drewes S, Ryll R, Wenk M, Spakova A, et al. Field vole-associated Traemmersee hantavirus from Germany represents a novel hantavirus species. Virus Genes. 2019;55(6):848-853. https://doi.org/10.1007/s11262-019-01706-7
25. Drewes S, Jeske K, Strakova P, Balciauskas L, Ryll R, Balciauskiené L, et al. Identification of a novel hantavirus strain in the root vole (Microtus oeconomus) in Lithuania, Eastern Europe. Infect Genet Evol. 2021;90:104520. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2020.104520
26. Thomason AG, Begon M, Bradley JE, Paterson S, Jackson JA. Endemic Hantavirus in Field Voles, Northern England. Emerg Infect Dis. 2017;23(6):1033-1035. https://doi.org/10.3201/eid2306.161607
Поступила в редакцию 06.04.2023 Received 06.04.2023 После доработки 12.04.2023 Revised 12.04.2023 Принята к публикации 12.04.2023 Accepted 12.04.2023