Научная статья на тему 'Электрофоретический анализ некоторых видов сем. Grossulariaceae DC. Методом белкового маркирования'

Электрофоретический анализ некоторых видов сем. Grossulariaceae DC. Методом белкового маркирования Текст научной статьи по специальности «Биологические науки»

CC BY
119
37
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Аннотация научной статьи по биологическим наукам, автор научной работы — Гнусенкова Е. А.

Сравнительный анализ полипептидных спектров видов Смородины и Крыжовника показал, что между ними различий не больше, чем между некоторыми видами Смородины (общие компоненты 25, 50, 53, 80, 83, 85) и подтверждает кариологические и гибридологические данные о значительной генетической близости этих родов. Изучение значительного числа особей особей R. aureum по полипептидным спектрам выявила их сравнительную мономорфность как в пределах одного географического региона, так и при сопоставлении с североамериканскими популяциями.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «Электрофоретический анализ некоторых видов сем. Grossulariaceae DC. Методом белкового маркирования»

ЭЛЕКТРОФОРЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ НЕКОТОРЫХ ВИДОВ СЕМ. ОРОЗЭиЬАШАСЕАЕ ЭС. МЕТОДОМ БЕЛКОВОГО МАРКИРОВАНИЯ

Сравнительный анализ полипептидных спектров видов Смородины и Крыжовника показал, что между ними различий не больше, чем между некоторыми видами Смородины (общие компоненты 25, 50, 53, 80, 83, 85) и подтверждает кариологические и гибридологические данные о значительной генетической близости этих родов. Изучение значительного числа особей особей Я. аигеит по полипептидным спектрам выявила их сравнительную мономорфность как в пределах одного географического региона, так и при сопоставлении с североамериканскими популяциями.

Принципиально новые возможности в генетических исследованиях, практической селекции, семеноводстве и систематике открылись с использованием методов молекулярной биологии, возникшей около 50 лет назад на стыке биохимии и генетики. Одним из них является метод электрофореза запасных белков семян в ПААГ, позволяющий по спектру компонентов полиморфного белка (белковым маркерам) различать генотипы и отдельные генетические системы.

Белок - обязательный продукт генетических систем клетки, и только через него идет реализация генетической информации в морфогенезе. Соответственно белками может быть маркирована практически любая генетическая система. За счет большого числа характеристик (особенно при электрофоретическом анализе полиморфных белков) белковых маркеров есть возможность выявить генетическую изменчивость в морфологически однородных популяциях и анализировать гибридные популяции уже с первых поколений.

Достоинства белковых маркеров состоят в том, что они могут быть использованы в широком диапазоне - от аллельной и генной изменчивости до сопоставления организмов в эволюционном плане на уровне вида, рода, семейства, класса и царства. В последнее время метод электрофореза белков используется в системе родов, видов, семейств и более мелких внутривидовых категорий, поскольку гены, кодирующие белки, характеризуются стабильной экспрессией [3].

Данный метод (электрофорез) возник вследствие острой необходимости в регистрации и паспортизации имеющегося генофонда, установления его подлинности и ори-

гинальности, что в конечном счете позволяет более эффективно вести селекционный процесс. Полипептиды, являясь непосредственным продуктом гена, отражают происхождение и индивидуальные особенности генотипа.

Метод основан на разделении полипептидов на поверхностной плотности заряда и размерам молекулы и выявлении различий белковых структур. Для этого используются, главным образом, запасные белки семян - проламины злаков и глобулины двудольных [1].

Полипептиды глобулинов на электрофо-реграммах формируют три группы компонентов: с молекулярной массой 19 - 22 кДа (основные полипептиды), около 50 кДа (кислые полипептиды) и третья зона 7S - глобулины (табл. 1, 2).

Сравнительный анализ полипептидных спектров видов Смородины и Крыжовника показывает, что между ними различий не больше, чем между некоторыми видами Смородины, общие компоненты 25, 53, 80. У последних спектры отличаются высокой насыщенностью компонентов, а в зоне кислых полипептидов они значительно более низко-молекулярны. Все это свидетельствует о большей полигенности кластеров генов запасных белков семян видов сем. Grossulariaceae и пониженном их нуклеотидном составе. У восточноазиатской популяции G. burejensis (о. Кунашир) зона основных полипептидов существенно отличается от таковой у материкового G. reclinata, что говорит о географической дифференциации. Полипептидный таксономический анализ подтверждает кариологические и гибридологические данные о значительной генети-

Таблица 1. Типы полипептидного состава запасных белков семян Смородины подрода Eucoreosma,

Symphocalyx и видов Крыжовника

Позиции компонентов спектра по 100 - разрядной шкале

128-глобулины

Основные до 22 кДа Кислые до 50 кДа

95|92| 91|90| 89| 88|87|86|85|84|83|82|81|80|79|78| 77|76|75|74| 73| 72|70|68|67|66|65|63|61|60|59|58| 57|56|55|54| 53| 52|51|50|49|48|47|46|45|44|43|42|41|40|38|36| 32|31|30

R. nigrum

21 1 12 | 1212| 121 |11 |21 |2|| II |2|| III II II II II |111 1 |1| 1 |21 | |2|| II l|1 II 1 1 1 |2

R. pauciflorum

II 1 1' 1 1 |11 1 |11 1 |11 1 |1 | 1 II III 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 II' ММ' И' 1 1 1 1 1 1 1 |1

R. procumbens

II 1 1 |1Ml'Ml'1 1 |11 |1II 1 II III 1 1 1 |11 1 1 1 1 1 1 1 1 |1II 1 |11 1 |1 1 1 1 1 1 1 1 1 |1

R. janczcwskii

2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2

2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2

R. aureum (Северная Аме а о <э р о л о Í2 S к Cl

1 2 2 2 1 1 1 2 2 2 1 1 1

1 2 2 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1

R. Aureum( Восточная Европа)

II 1 1 |1 III'1 1 1 1 |2 1 1 |2И 1 И И 1 1 1 1 11 1 |1II 1 |1 I 1 1 |21 II II'III |1I 1 |1 1 1

R.aureum (П риуралье, О] ренбургская обл.)

1 1 1 2 2 1 1 1 1 2 1 1

1 2 1 2 2 1 1 1 2 1 1 1 1

1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1

1 1 1 2 2 1 1 1 1 2 1 1 1

1 2 2 2 1 1 1 1 2 1 1 1

Grossularia reclinata

1 1 1 1 1 1 1 1 1

1 1 1 2 2 2 2 1 1 1

2 1 2 2 1 1 2

1 1 2 2 2 1 1 1 2 1 1

G. burej ensis

1 il i il il1 i il1 ni1 il1 ni2 i il ni ni Il II II 1 I1 1 III I2 II II II1 III 1 I1 1 1

Таблица 2. Типы полипептидного состава запасных белков семян Смородины подрода Ribesia и Berisia

Позиции компонентов спектров по 100 - разрядной шкале

12S - глобулины

Основные до 22 кДа Кислые до 50 кДа

951 90 | 89 | 88 | 87 | 86 | 85 | 84 | 83 | 82 |81| 80 | 79 | 78 | 77 | 76 | 75 | 74| 73 | 70 | 68| 66 | 65 | 64| 631611 60 | 59 | 58 157| 56 | 55 154| 53 | 52 | 511 50 | 49 |481 47| 46 | 45 | 44 | 43 | 42 | 411 40 | 38 | 32 | 31|30

R.triste

I I I И I И I 12 I I И I 12|1I I I I I I I I I I I I I I I I |1 I 12 I I I |1I I I I I |1I I I I I |1 |1

R. palczewskii

Il 1l II I И I 11 I 12 I |1 II |1III I I I I I I |1 I |1I I |1I |1 |1 I |1 I 12 I I 12 И I I I I I I |1

R. acidum

Il I I И I 12 I I И И I И II I III I I I I I III I I I И I И 12 I I I |2 I I I I |1 I I I I I I |1

R. rubrum

1 1

1 1

R.pubescens

R. hispidulum

Il I И I I I И I I |2 I |1 II 12 III I I I |1 I III I III I |1 III I |2 I I |1 I ПТ

R. meyeri

1 1

1 1

R. spikatum

R. biebersteinii

И I 12 I I И I

Ш

R. orientale

И

R. alpinum

R. heterotrichum

I I 11 1212I IM I |2I I III I I I I I III I III I I I I I 12 И I Ml I I I I |1 И

R. villosum

II III III I 121 |1II |1 12 I I |1 I I |1 II II |1 I I |1 I I 12 I |1 I 1212 I I I I |1 I I I I |1 I |1

R.pulchellum

I И III I 1212 I I I |1 I |1 I I I

III I III I I И II 121 |1I III I I I I |1 I |T

2

1

1

2

1

2

2

2

1

2

2

1

1

2

2

2

1

1

1

2

1

1

1

2

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

1

1

2

1

2

2

1

1

1

2

2

1

2

1

2

1

2

Примечания. 1 - компонент слабой, 2 - сильной интенсивности

ческой близости видов Смородины и Крыжовника [2].

Полипептидные данные по подроду Ribesia во многом уточняют морфологические таксономические данные, маркируя географически локализованные таксоны низкого ранга. Выделяется ряд (подсекция) Vulgare Pojark., однако ее ареал явно более обширный за счет включения, например, R. triste, R. pubescens, R. bibersteinii, а также близкого к ним R. acidum. Первые три вида могут быть объединены в один вид. Ряд Rubrae Pojark. в основном представлен видом R. rubrum, тогда как R. hispidulum, с одной стороны, R. palczewskii, R. spicatum, с другой, явно образуют особый ряд родственных видов. Соответственно сборным представляется ряд Petraeae Pojark., куда входил указанный выше R. bibersteinii. Изученные нами 3 сорта (Версальская Белая, Пригажуна и Голландская Красная) в зоне радикала имеют характерные компоненты 78, 80, 83, 85, а также компонент 88. В подроде Berisia вид R. alpinum, занимающий обширный ареал в Европе и доходящий до Закавказья, является весьма полиморфным. Близки или почти идентичны виды - R. heterotrichum, R. pulchellum. К ним явно близок R. orientale. В тоже время R. villosum резко от них отличается и близок к R. meyeri (табл. 2).

Изученные виды подрода Eucoreosma отличаются довольно сложным полипеп-тидным составом в зоне радикала (основных полипептидов). В этом подроде большой интерес представляет степень сходства самого распространенного в Евразии R. nigrum со среднеазиатским R. janczewskii. Общими в зоне основных полипептидов у них являются компоненты в позициях 79, 81, 83, 85, 87 и 90. К R. nigrum, несомненно, близки виды R. pauciflorum и R. procumbens (табл. 1).

По структуре радикала изученные сорта черной смородины распределили на 3 группы: сорта с шестью общими компонентами (позиции 80, 82, 83, 86, 88, 89), к которым относятся сорта Аргазинская, Бобровая, Десерт Ольхиной, Купаленка; сорта с пятью компонентами (позиции 80, 82, 86, 88, 89) - Зеленая Дымка, Катюша, Куминка, Марьюшка, Подарок Куминову; сорта с четырьмя компонентами (позиции 80, 82, 84, 86) - Плотнокистная, Пушистая, Память Мичурина, Рахиль, Голубка, Сеянец Голубки, Юрюзань. В пределах каждой группы сорта различаются в зоне кислых полипептидов. Эти данные говорят о том, что идентификация сортов черной смородины по полипептидным спектрам вполне перспективна [2].

Изучение значительного числа особей Я. аигеиш по полипептидным спектрам выявило их сравнительную мономорфность, т. е. стабильность, однообразие как в пределах одного географического региона (Восточная Европа, Приуралье, Южный Урал), так и при сопоставлении с североамериканскими популяциями (табл. 1). Сравнительный анализ полипептидных спектров Смородины золотой, произрастающей на территории Оренбургского района, показывает, что исследованные черноплодные особи Я. аигеиш по полипептидным спектрам довольно однородны, при сравнении с другими районами области типы полипептидных спектров выявляют некоторые различия в положении основных полипептидов (в частности, в Ак-булакском районе), что свидетельствует о полиморфизме и о географической изолированности популяций. Что касается спектров семян форм Я. аигеиш с желтой, красной и темно-фиолетовой окраской плодов, то существенных различий с черноплодными особями не обнаружено.

Список использованной литературы:

1. Гаврилюк И.П. Запасные белки в сортовой идентификации двудольных растений // Тез. докл. III Междунар. Симпоз. ИСТА. Л., 1987. С. 15.

2. Гнусенкова Е.А. Биологические особенности и ресурсная оценка Ribes аигеит РигеИ в Приуралье: Автореф. дис... кан. биол. наук. - Оренбург, 2003.

3. Конарев А.В., Конарев В.Г., Губарева Н.К. и др. Белки семян как маркеры в решении проблем генетических ресурсов растений, селекции и семеноводства. Цитология и генетика. 2000. Т. 34 №2.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.