Научная статья на тему 'Детекция генов приобретенных карбапенемаз у изолятов Acinetobacter baumannii, выделенных из гемокультуры больных опухолями системы крови'

Детекция генов приобретенных карбапенемаз у изолятов Acinetobacter baumannii, выделенных из гемокультуры больных опухолями системы крови Текст научной статьи по специальности «Клиническая медицина»

CC BY
179
35
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ACINETOBACTER BAUMANNII / ГЕМОКУЛЬТУРА / ОПУХОЛИ СИСТЕМЫ КРОВИ / КАРБАПЕНЕМЫ / РЕЗИСТЕНТНОСТЬ / OXA-КАРБАПЕНЕМАЗЫ / BLOOD CULTURE / HEMATOLOGICAL MALIGNANCIES / CARBAPENEMS / RESISTANCE / OXA-CARBAPENEMASE

Аннотация научной статьи по клинической медицине, автор научной работы — Хрульнова С. А., Коробова А. Г., Фёдорова А. В., Фролова И. Н., Савочкина Ю. А.

Цель. Изучить распространенность генов приобретенных карбапенемаз среди изолятов A. baumannii, выделенных из гемокультуры больных опухолями системы крови. Материалы и методы. В исследование были включены изоляты A. baumannii, выделенные из гемокультуры пациентов, находившихся на лечении в 7 стационарах России (2003-2015 гг.). Чувствительность изолятов A. baumannii к карбапенемам оценивали согласно критериям CLSI (2017). Наличие генов карбапенемаз класса D (групп blaOXA-51, blaOXA-24/40, blaOXA-23 и blaOXA-58) и класса B (групп blaIMP, blaVIM и blaNDM) определяли методом ПЦР в режиме реального времени с использованием коммерческих наборов. Результаты. Всего исследовано 74 изолята A. baumannii, выделенных из гемокультуры, из которых 55 (74,3%) были нечувствительными к меропенему и/или имипенему. Гены приобретенных OXA-карбапенемаз обнаружены у 70,9% (39/55) карбапенемонечувствительных изолятов. Гены металло-бета-лактамаз (blaNDM, blaVIM и blaIMP) выявлены не были. Наиболее распространенными генами приобретенных OXA-карбапенемаз были blaOXA-24/40-like (51,3%), далее следовали гены групп blaOXA-23 (38,5%) и blaOXA-58 (10,3%). Значения МПК50/90 меропенема и имипенема оказались выше у изолятов A. baumannii, несущих гены приобретенных карбапенемаз, по сравнению с нечувствительными к карбапенемам изолятами без приобретенных карбапенемаз. Наиболее высокие значения МПК50/90 карбапенемов регистрировались у продуцентов ферментов группы OXA-24/40 (64 и 128 мкг/мл). Выводы. Гены приобретенных OXA-карбапенемаз выявлены у 70,9% карбапенемонечувствительных изолятов A. baumannii, среди которых преобладали продуценты ферментов группы OXA-24/40, имеющие наиболее высокие значения МПК.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по клинической медицине , автор научной работы — Хрульнова С. А., Коробова А. Г., Фёдорова А. В., Фролова И. Н., Савочкина Ю. А.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Detection of acquired carbapenemase genes among Acinetobacter baumannii isolated from blood culture in patients with hematological malignancies

Objective. To evaluate the prevalence of acquired carbapenemase genes among A. baumannii isolates collected from blood culture in patients with hematological malignancies. Materials and methods. This prospective multicenter study included A. baumannii isolated from blood culture in hematological patients in 7 Russian hospitals (2003-2015). Minimum inhibitory concentrations (MICs) of meropenem and imipenem were determined by broth microdilution method (CLSI, 2017). All A. baumannii isolates were tested by multiplex real-time PCR for presence of acquired carbapenemase genes (blaOXA-23-like, blaOXA-24/40-like, blaOXA-58-like, blaNDM-like, blaVIM-like and blaIMP-like). Results. A total of 74 A. baumannii isolates were studied, of them 55 (74.3%) were non-susceptible to meropenem and/or imipenem. Genes of acquired OXA-carbapenemases were detected in 70.9% (39/55) of carbapenem non-susceptible isolates. Metallo-beta-lactamase genes (blaNDM-like, blaVIM-like and blaIMP-like) were not detected. The most prevalent carbapenemase genes were blaOXA-24/40-like (51.3%), followed by blaOXA-23-like (38.5%) and blaOXA-58-like (10.3%). The MIC50/90 values of meropenem and imipenem were higher in carbapenem non-susceptible A. baumannii harboring carbapenemase genes compared to isolates without acquired carbapenemase genes. A. baumannii isolates carrying blaOXA-24/40-like demonstrated the highest MIC50/90 values of carbapenems. Conclusions. The majority of carbapenem non-susceptible A. baumannii isolates (70.9%) carried acquired carbapenemase genes, of which blaOXA-24/40-like were predominant. The highest MIC50/90 values of carbapenems were detected in A. baumannii harboring blaOXA-24/40-like.

Текст научной работы на тему «Детекция генов приобретенных карбапенемаз у изолятов Acinetobacter baumannii, выделенных из гемокультуры больных опухолями системы крови»

КМАХ www.antibiotic.ru/cmac/ КЛИНИЧЕСКАЯ МИКРОБИОЛОГИЯ Тем 21 N°1

И АНТИМИКРОБНАЯ ХИМИОТЕРАПИЯ 2019

Детекция генов приобретенных карбапенемаз у изолятов ЛапеОЬаЫег ЬаитаппИ, выделенных из гемокультуры больных опухолями системы крови

Хрульнова С.А.1, Коробова А.Г.1, Фёдорова А.В.1, Фролова И.Н.1, Савочкина Ю.А.2, Клясова Г.А.1

1 ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр гематологии» Минздрава России, Москва, Россия

2 ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия

Цель. Изучить распространенность генов приобретенных карбапенемаз среди изолятов Л. Ьаи-таппИ, выделенных из гемокультуры больных опухолями системы крови.

Материалы и методы. В исследование были включены изоляты Л. ЬаитаппИ, выделенные из гемокультуры пациентов, находившихся на лечении в 7 стационарах России (2003-2015 гг.). Чувствительность изолятов Л. ЬаитаппИ к карбапенемам оценивали согласно критериям CLSI (2017). Наличие генов карбапенемаз класса D (групп Ыаохд-51, Ыаохд-24/40, Ь/аохА-23 и Ыаохд-5в) и класса В (групп Ь/вщр, Ы/агт и Ыаырм) определяли методом ПЦР в режиме реального времени с использованием коммерческих наборов.

Результаты. Всего исследовано 74 изолята Л. ЬаитаппИ, выделенных из гемокультуры, из которых 55 (74,3%) были нечувствительными к меропенему и/или имипенему. Гены приобретенных ОХА-карбапенемаз обнаружены у 70,9% (39/55) карбапенемонечувствительных изолятов. Гены ме-талло-бета-лактамаз (Ыаырм, Ь/ат и Ь/вщр) выявлены не были. Наиболее распространенными генами приобретенных ОХА-карбапенемаз были ЫаохА-24/40-мкв (51,3%), далее следовали гены групп Ь/аохА-23 (38,5%) и Ы/аохА-58 (10,3%). Значения МПК50/90 меропенема и имипенема оказались выше у изолятов Л. ЬаитаппИ, несущих гены приобретенных карбапенемаз, по сравнению с нечувствительными к карбапенемам изолятами без приобретенных карбапенемаз. Наиболее высокие значения МПК50/90 кар-бапенемов регистрировались у продуцентов ферментов группы 0хА-24/40 (64 и 128 мкг/мл). Выводы. Гены приобретенных ОхА-карбапенемаз выявлены у 70,9% карбапенемонечувствительных изолятов Л. ЬаитаппИ, среди которых преобладали продуценты ферментов группы ОхА-24/40, имеющие наиболее высокие значения МПК.

Detection of acquired carbapenemase genes among Acinetobacter baumannii isolated from blood culture in patients with hematological malignancies

Khrulnova S.A.1, Korobova A.G.1, Fyodorova A.V.1, Frolova I.N.1, Savochkina Yu.A.2, Klyasova G.A.1

1 National Medical Research Center of Hematology, Moscow, Russia

2 Central Research Institute of Epidemiology, Moscow, Russia

Objective. To evaluate the prevalence of acquired carbapenemase genes among A. baumannii isolates collected from blood culture in patients with hematological malignancies.

Materials and methods. This prospective multicenter study included A. baumannii isolated from blood culture in hematological patients in 7 Russian hospitals (2003-2015). Minimum inhibitory concentrations (MICs) of meropenem and imipenem were determined by broth microdilution method (CLSI, 2017). All A. baumannii isolates were tested by multiplex real-time PCR for presence of acquired carbapenemase genes (b/aoXA-23-like, b/aoXA-24/40-like, b/aoXA-58-like, b/aNDM-like, blavIM-like and b/aIMP-like).

Results. A total of 74 A. baumannii isolates were studied, of them 55 (74.3%) were non-susceptible to meropenem and/or imipenem. Genes of acquired OXA-carbapenemases were detected in 70.9% (39/55) of carbapenem non-susceptible isolates. Metallo-beta-lactamase genes (b/aNDM-like, b/avIM-like and b/aMP-like) were not detected. The most prevalent carbapenemase genes were b/aoXA-24/40-like (51.3%), followed by b/aoXA-23-like (38.5%) and b/aoXA-58-like (10.3%). The MIC50/90 values of meropenem and imipenem were higher in carbapenem non-susceptible A. baumannii harboring carbapenemase genes compared to isolates without acquired carbapenemase genes. A. baumannii isolates carrying b/aoXA-24/40-like demonstrated the highest MIC50/90 values of carbapenems.

Conclusions. The majority of carbapenem non-susceptible A. baumannii isolates (70.9%) carried acquired carbapenemase genes, of which b/aoXA-24/40-like were predominant. The highest MIC50/90 values of carbapenems were detected in A. baumannii harboring b/aoXA-24/40-like.

Введение

Acinetobacter baumannii относится к значимым нозоко-миальным возбудителям, способным вызывать вспышки инфекций, особенно в отделениях реанимации и интенсивной терапии [1]. Согласно результатам ряда исследований, в России доля A. baumannii, выделенных из гемо-

Хрульнова С.А. и соавт.

Контактный адрес:

Светлана Алексеевна Хрульнова

Эл. почта: [email protected]

Ключевые слова: ЛапеОЬа^ег ЬаитаппИ, гемокультура, опухоли системы крови, карбапенемы, резистентность, ОхА-карбапенемазы.

Contacts:

Svetlana A. Khrulnova E-mail: [email protected]

Key words: Acinetobacter baumannii, blood culture, hematological malignancies, carbapenems, resistance, OXA-carbapenemases.

культуры больных опухолями системы крови, составляет 3-4% [2-4]. По данным литературы, этот показатель варьируется от 2,9% до 6% [5, 6], а у реципиентов гемо-поэтических стволовых клеток достигает 11,8% [7]. По результатам российского многоцентрового эпидемио-

логического исследования антибиотикорезистентности возбудителей нозокомиальных инфекций «МАРАФОН», проведенного в 2013-2014 гг., в многопрофильных стационарах доля А. ЬаитаппИ составила 13,7% от всех выделенных бактериальных изолятов [8].

В настоящее время актуальной проблемой является распространение карбапенемонечувствительных А. ЬаитаппИ. Высокая резистентность к карбапенемам отмечается и у изолятов, выделенных из гемокультуры больных опухолями системы крови. Так, согласно результатам российского исследования, у 66-69% изолятов А. ЬаитаппИ была выявлена нечувствительность к карбапенемам [4]. В исследовании, проведенном в Беларуси, доля карбапенеморезистентных изолятов среди А. ЬаитаппИ, вызывающих инфекции кровотока у реципиентов гемопоэтических стволовых клеток, составила 75% (12/16 изолятов) [7]. Кроме того, выделение резистентных к карбапенемам изолятов А. ЬаитаппИ из гемо-культуры являлось фактором риска летального исхода в течение 30 дней у больных опухолями системы крови [5, 7]. О высоком уровне устойчивости к карбапенемам сообщается также и у А. ЬаитаппИ, выделенных в многопрофильных стационарах. По данным проспективного исследования (2008-2009 гг.), проведенного в 10 странах Азии, 67,3% изолятов Acinetobacter spp., ставших причиной нозокомиальных пневмоний, оказались устойчивыми к имипенему [9]. Согласно данным Европейской системы по надзору за антибиотикорезистентностью (EARS-Net), в 2012-2015 гг. наиболее высокий уровень устойчивости к карбапенемам наблюдался в Греции, Хорватии и Румынии (81,5-93,5%) [10]. Следует отметить, что во всем мире продолжает увеличиваться доля инфекций, вызванных карбапенемонечувствительными А. ЬаитаппИ. По данным российского исследования «МАРАФОН», доля нечувствительных к карбапенемам А. ЬаитаппИ за 7 лет увеличилась на 36-66% [8]. По результатам анализа EARS-Net, в течение 4 лет наблюдений (2012-2015 гг.) наибольший прирост доли устойчивых к карбапенемам Acinetobacter spp. был зарегистрирован в Польше и на Кипре (на 27,4% и 26,6% соответственно), а в Норвегии за тот же период частота детекции резистентных к карбапенемам изолятов увеличилась на 9,4% при их полном отсутствии в 2012-2013 гг. [10]. В США доля устойчивых к карбапенемам изолятов выросла с 20,6% (2002 г.) до 49,2% (2008 г.) [11].

Причины устойчивости к карбапенемам АапеОЬа^ег spp. разнообразны и включают в себя изменение проницаемости наружной клеточной мембраны, эффлюкс, продукцию приобретенных карбапенемаз (металло-бе-та-лактамаз [МБЛ], ОХА-карбапенемаз), гиперпродукцию видоспецифических бета-лактамаз (ОХА-51 и родственных ферментов у А. ЬаитаппИ) [1, 12, 13]. Наиболее значимым из известных механизмов резистентности к карбапенемам является продукция приобретенных карбапенемогидролизующих бета-лактамаз класса D (ОХА-карбапенемазы) и класса В (МБЛ).

Гены Ь1аОХА, кодирующие карбапенемазы А. ЬаитаппИ, относят к 5 филогенетическим группам: Ь1аОХА-51-1|ке, ЫаоХА-23-11ке, Ь1аоХА-24/40-Ике, Ь1аоХА-58-Ике и ЫаоХА-143-1!ке [13]. Гены группы ЫаОХА-51 являются видоспецифическими для А. ЬаитаппИ, а групп ЫаоХА^-ике, Ь1аоХА-24/40-ике, ЫаоХА^а-ике и Ь1аОХА-143-|;ке - приобретенными. Видоспецифические гены Ь1аОХА-51-|;ке экспрессируются слабо, но при определенных

Хрульнова С.А. и соавт.

условиях экспрессия этих генов может увеличиваться, что приводит к гиперпродукции фермента и появлению устойчивости к карбапенемам у изолятов A. baumannii. Продукция приобретенных карбапенемаз групп OXA-23, OXA-24/40, OXA-58 и OXA-143 всегда обуславливает устойчивость к карбапенемам.

Целью данного исследования было изучить распространенность генов приобретенных карбапенемаз среди изолятов A. baumannii, выделенных из гемокультуры больных опухолями системы крови.

Материалы и методы

Источники бактериальных изолятов

Изоляты A. baumannii (n = 74) были выделены из гемокультуры у пациентов, находившихся на лечении в гематологических отделениях 7 стационаров 6 городов России (Москва, Челябинск, Ростов-на-Дону, Иркутск, Новосибирск, Барнаул) в период с 2003 по 2015 гг. В исследование включали первый бактериальный изолят, выделенный из гемокультуры. Все включенные в исследование изоляты были доставлены в лабораторию ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России, где проводились окончательная идентификация микроорганизмов, определение чувствительности к антимикробным препаратам (АМП) и детекция генов резистентности к карбапенемам.

Видовая идентификация и хранение

Видовую идентификацию полученных изолятов проводили в ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России методом матричной лазерной десорбционной ионизационной времяпролетной масс-спектрометрии (MALDI-TOF MS) на анализаторе Microflex LT (Bruker Daltonics, Германия). Для идентификации полученных изолятов до вида брали изолированные колонии бактерий. Ионизацию бактериальных белков осуществляли с помощью специального реагента - матрицы (а-циано-4-гидроксикоричная кислота и раствор, содержащий 50% ацетонитрила и 2,5% трифторуксусной кислоты). Идентификацию проводили в автоматическом режиме с использованием программы MALDI Biotyper Real Time Classification, версия 3.1 (Bruker Daltonics, Германия). В качестве критерия надежной видовой идентификации использовали рекомендуемые значения коэффициента совпадения (Score) от 2,0 и выше. Видовую идентификацию изолятов A. baumannii дополнительно подтверждали с помощью детекции генов видоспецифических бета-лактамаз группы OXA-51 методом полимеразной цепной реакцией (ПЦР) в режиме реального времени с использованием коммерческого набора «АмплиСенс® MDR Ab-OXA-FL» (ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Россия). Изоляты хранили при температуре -70°С в триптика-зо-соевом бульоне с добавлением 20% глицерина.

Определение чувствительности к антибактериальным препаратам

Чувствительность к АМП исследовали методом последовательных микроразведений в бульоне в соответствии с рекомендациями CLSI, 2017 [14]. Категории чувствительности A. baumannii к меропенему и имипенему определяли на основании пограничных значений минимальных подавляющих концентраций (МПК), установленных CLSI (чувствительные <2 мкг/мл, умеренно резистентные

АНТИБИОТИКОРЕЗИСТЕНТНОСТЬ

КМАХ • 2019 - Том 21 • N°1

4 мкг/мл, резистентные >16 мкг/мл). Термин «нечувствительные» изоляты объединял умеренно резистентные и резистентные к АМП микроорганизмы. Статистическую обработку и анализ результатов определения чувствительности проводили с помощью программы WHONET 5.6. Для внутреннего контроля качества определения чувствительности использовали референтные штаммы Escherichia coli АТСС® 25922 и Pseudomonas aeruginosa АТСС 27853.

Детекция генов карбапенемаз

Выделение ДНК проводили с помощью коммерческого набора «ГК-Экспресс» (ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Россия). Наличие у A. baumannii генов карбапенемаз класса D (групп OXA-23, OXA-24/40 и OXA-58) и класса B (групп IMP, VIM и NDM) определяли методом ПЦР в режиме реального времени с использованием коммерческих наборов «АмплиСенс® MDR Ab-OXA-FL» и «АмплиСенс® MDR MBL-FL» (ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Россия). Амплификацию проводили в термоциклере CFX96 Touch (Bio-Rad, США).

Результаты

Всего исследовано 74 изолята A. baumannii, выделенных из гемокультуры больных опухолями системы крови. Из них 55 (74,3%) изолятов были нечувствительными к меропенему и/или имипенему (53 (71,6%) и 51 (68,9%) изолятов соответственно). Частота обнаружения генов приобретенных OXA-карбапенемаз у всех A. baumannii составила 52,7% (39/74 изолятов), а среди карбапене-монечувствительных изолятов - 70,9% (39/55 изолятов). Гены МБЛ (b/aNDM, b/aVIM и b/aIMP) обнаружены не были.

Изоляты A. baumannii характеризовались высоким уровнем устойчивости к карбапенемам в течение всего анализируемого периода. В разные годы исследования доля карбапенемонечувствительных A. baumannii составляла от 64,5% до 90,5% (Рисунок 1). Несмотря на то что с 2003 по 2006 гг. у подавляющего большинства изолятов (72,7%) была выявлена нечувствительность к карбапенемам, ни у одного из них не были обнаружены гены приобретенных карбапенемаз. Первые гены приобретенных OXA-карбапенемаз были выявлены у карбапенемонечувствительных A. baumannii в 2007 г. Все последующие нечувствительные к карбапенемам A. baumannii, выделенные в 2007-2010 и 2011-2015 гг., содержали гены приобретенных карбапенемаз (Рисунок 1).

В Таблице 1 представлены данные по детекции генов приобретенных OXA-карбапенемаз, которые были отнесены к 3 филогенетическим группам: b/aOXA-24/40-like, b/aoxA-23-like и b/aoXA-58-like. В геномах карбапенемонечув-ствительных изолятов с продукцией приобретенных

II карбапенемо-нечувствительные А. ЬаитаппИ

II А. ЬаитаппИ с продукцией приобретенных ОХА-ка рбапенемаз

72,7

64,5 64,5

90,5 90,5 1

2003-2006 2007-2010 2011-2015 гады всего изолятов A. baumannii п=22 п=31 п=21

карбапенемонечувсгвительные п-16 п-20 п-19

с продукцией приобретенных п=0 п=20 п=19

ОХА-ка рбапенемаз

Рисунок 1. Распределение карбапенемонечувствительных изолятов A. baumannii в разные периоды исследования

OXA-карбапенемаз преобладали гены группы b/aOXA-24/40, выявленные у 20 (51,3%) из 39 изолятов, далее следовали гены группы b/aOXA-23 (38,5%) и b/aOXA-58 (10,3%). В анализируемый период доля A. baumannii, несущих гены группы b/aOXA-24/40, увеличилась незначительно -с 50% (2007-2010 гг.) до 52,6% (2011-2015 гг.), в то время как доля A. baumannii, содержащих гены группы b/aOXA-23, выросла с 30% до 47,4%. Гены группы b/aOXA-58 обнаружены только у 4 (20%) изолятов A. baumannii, выделенных в 2007-2010 гг. (Таблица 1).

Значения МПК50 и МПК90 меропенема и имипенема у A. baumannii с продукцией приобретенных OXA-кар-бапенемаз были выше значений МПК50 и МПК90 этих антибиотиков среди карбапенемонечувствительных изолятов без продукции OXA-карбапенемаз (Таблица 2). Значения МПК50 меропенема составили 64 мкг/мл у изолятов-про-дуцентов приобретенных карбапенемаз против 16 мкг/мл у изолятов без продукции этих ферментов, а имипенема -32 против 4 мкг/мл соответственно. Наиболее высокие значения МПК50 и МПК90 карбапенемов определены у изолятов A. baumannii, несущих гены группы b/aOXA-24/40,

Таблица 2. Значения МПК меропенема и имипенема

у A. baumannii, нечувствительных к карбапенемам (n = 55)

Гены приобре- Значения МПК (мкг/мл)

тенных OXA-карбапенемаз Количество меропенем имипенем

изолятов, n МПК50 МПК90 МПК50 МПК90

Не выявлены 16 16 32 4 16

Выявлены, 39 64 128 32 128

из них:

b/aOXA-24/40-like 20 64 128 64 128

b/aOXA-23-like 15 16 64 16 64

b/aOXA-58-like 4 16 64 32 32

Таблица 1. Распределение изолятов A. baumannii с продукцией приобретенных OXA-карбапенемаз в разные периоды исследования

Период исследования (годы) Число изолятов с приобретенными OXA-карбапенемазами, n Число изолятов, содержащих гены OXA-карбапенемаз, n приобретенных (%)

blaOXA-24/40-like blaOXA-23-like blaOXA-58-like

2003-2006 0 0 0 0

2007-2010 20 10 (50) 6 (30) 4 (20)

2011-2015 19 10 (52,6) 9 (47,4) 0

Всего, n (%) 39 20 (51,3) 15 (38,5) 4 (10,3)

Хрульнова С.А. и соавт.

и составили 64 и 128 мкг/мл соответственно. Значения МПК50 и МПК90 карбапенемов у изолятов, содержащих в своем геноме гены группы blaOXA-23, были ниже и соответствовали 16 и 64 мкг/мл (Таблица 2).

Обсуждение

В проведенном нами исследовании нечувствительность к карбапенемам была выявлена у 74,3% изолятов A. baumannii. По результатам ряда других исследований, посвященных изучению A. baumannii, выделенных из гемокультуры больных гемобластозами, доля кар-бапенемонечувствительных изолятов варьировала от 36,1% [5] до 100% [6]. О различиях в уровне устойчивости к карбапенемам сообщалось и среди изолятов A. baumannii, выделенных в многопрофильных стационарах. Так, в Испании доля нечувствительных к карбапе-немам изолятов A. baumannii, выделенных из гемокуль-туры, составила 84,75% [15], а в Италии - 54% [16].

Первыми OXA-карбапенемазами, обнаруженными у A. baumannii, стали ферменты группы OXA-23. Изолят A. baumannii, содержащий ген blaOXA-23, выделили из ге-мокультуры больного в 1985 г. в Эдинбурге (Шотландия) [13]. В настоящее время в большинстве стран мира доминируют A. baumannii с продукцией OXA-23-подобных карбапенемаз [17, 18]. Следующей охарактеризованной группой OXA-карбапенемаз стали ферменты OXA-24/40-подобные: изолят A. baumannii, несущий ген blaOXA-24/40, выделили в Испании в 1997 г. [13]. Гены группы bla0XA-24/40 чаще встречаются в геномах изоля-тов A. baumannii, выделенных в странах Пиренейского полуострова и Азии [18], и являются доминирующими среди карбапенемонечувствительных A. baumannii в России (39,7%) [8]. В 2003 г. во Франции обнаружили изоляты A. baumannii, содержащие гены blaOXA-58, которые принадлежали к новой группе OXA-карбапенемаз -OXA-58-подобные [13]. В период с 1999 по 2009 гг. в ряде средиземноморских стран, в том числе в Италии, Греции, Ливане и Турции, среди устойчивых к карбапе-немам A. baumannii преобладали изоляты, содержащие в своем геноме гены blaOXA-58 [20].

По результатам данного исследования, впервые гены приобретенных OXA-карбапенемаз были обнаружены у A. baumannii в 2007 г. и относились к группе OXA-23-подобных. Изоляты A. baumannii, выделенные в 20072010 гг., характеризовались разнообразием генов приобретенных OXA-карбапенемаз (bla0XA-24/40, blaOXA-23 и bla0XA- 58). Во всех анализируемых периодах преобладали изоляты A. baumannii, содержащие гены blaOXA- 24/40-like, что соотносится с данными других российских исследований, проведенных в многопрофильных стационарах. Так, согласно результатам исследования «МАРАФОН», доля A. baumannii с продукцией OXA-24/40-подобных карбапенемаз составила 81,1% в 2011-2012 гг. и 62,5% в 2013-2014 гг. [8, 21]. Гены группы blaOXA-24/40 были обнаружены у 94,2% изолятов A. baumannii, выделенных при раневой ожоговой инфекции [22]. Следует отметить, что в первых российских исследованиях («РЕЗОРТ» и «РЕВАНШ» в 2002-2004 и 2006-2008 гг.), включавших карбапенемонечувствительные A. baumannii с продукцией приобретенных OXA-карбапенемаз, преобладали гены группы blaOXA-58 ( 85%), в то время как доля изолятов, несущих гены blaOXA-23-like, составляла всего 15%, а гены группы blaOXA-24/40 выявлены не были [12]. В

Хрульнова С.А. и соавт.

проведенном нами исследовании доля A. baumannii, несущих гены blaOXA-58, составила всего 10,3%, и эти изо-ляты были выделены только в течение одного периода времени (2007-2010 гг.). Постепенное уменьшение доли A. baumannii с продукцией OXA-58-подобных ферментов в России отмечено и в исследовании «МАРАФОН», по результатам которого в 2011-2012 гг. гены blaOXA-58-like были обнаружены у 9% изолятов с приобретенными OXA-карбапенемазами, а в 2013-2014 гг. их доля составила только 0,9% [8, 21]. Противоположная ситуация наблюдается с изолятами A. baumannii, содержащими гены группы blaOXA-23, процент которых в России постепенно растет. Так, в данном исследовании доля A. baumannii, содержащих гены группы blaOXA-23, увеличилась с 30% (2007-2010 гг.) до 47,4% (20112015 гг.), в российском исследовании «МАРАФОН» -с 9,9% (2011-2012 гг.) до 36,6% (2013-2014 гг.) [8, 21]. Увеличение доли изолятов A. baumannii, содержащих гены группы blaOXA-23, отмечалось и в аналогичных зарубежных исследованиях. Так, в Италии в 2007 г. у A. baumannii преобладали гены группы blaOXA-58-like (82,3%), к 2011-2013 гг. частота их выявления уменьшилась до 4,5% [16, 23], в то время как доля A. baumannii, содержащих гены группы blaOXA-23, увеличилась до 81,7-100%. [16, 24]. Похожая картина наблюдалась также в Греции, где до 2009 г. преобладали A. baumannii, несущие гены группы blaOXA-58, а в 20102011 гг. наибольшее распространение у A. baumannii получили гены blaOXA-23-like (72,4%), доля которых к 2015 г. увеличилась до 96,9% [25, 26].

Было высказано предположение, что распространение OXA-23-продуцирующих A. baumannii может быть связано с более высокой гидролитической активностью ферментов данной группы по сравнению с OXA-58-подобными ферментами. Возможно, более высокие значения МПК карбапенемов у изолятов, содержащих гены blaOXA-23-like, создают им преимущества для персистенции как в макроорганизме, так и в окружающей среде лечебных учреждений [25]. В данном исследовании наиболее высокие значения МПК карбапенемов имели изоляты A. baumannii с продукцией карбапенемаз группы OXA-24/40. Учитывая тенденцию к увеличению доли изолятов, несущих гены группы blaOXA-23-like, можно предположить, что в России доминирующим типом OXA-карбапенемаз могут быть OXA-23-подобные ферменты, вытеснив с лидирующей позиции OXA-24/40-подобные ферменты. Похожая ситуация наблюдалась в Португалии, где в начале 2000-х гг. большинство кар-бапенемонечувствительных изолятов A. baumannii несли гены группы blaOXA-24/40, а уже в 2004-2008 гг. преобладали изоляты, содержащие гены blaOXA-23-like (63,4%) [27].

Заключение

Среди исследованных A. baumannii, выделенных из гемокультуры больных опухолями системы крови, преобладали карбапенемонечувствительные изоляты (74,3%), из которых 70,9% содержали в своем геноме гены приобретенных OXA-карбапенемаз. Наиболее распространенными генами были blaOXA-24/40-like (51,3%). У изоля-тов A. baumannii с продукцией карбапенемаз группы OXA-24/40 регистрировались более высокие значения МПК50/90 карбапенемов по сравнению с изолятами, несущими гены blaOXA-23-iike.

АНТИБИОТИКОРЕЗИСТЕНТНОСТЬ

КМАХ . 2019 . Том 21. №1

Литература

1. Peleg A.Y., Seifert H., Paterson D.L. Acinetobacter baumannii: emergence of a successful pathogen. Clin Microbiol Rev.

2008;21(3):538-582. DOI: 10.1128/CMR.00058-07

2. Klyasova G.A., Speranskaya L.L., Mironova A.V., et al. The pathogens causing sepsis in immunocompromized patients: structure and problems of antibiotic resistance. Results of a multi-center cooperative study. Gematologiya i transfuziologiya. 2007;52(1):13-18. Russian. (Клясова Г.А., Сперанская Л.Л., Миронова А.В. и соавт. Возбудители сепсиса у иммунокомпрометированных больных: структура и проблемы антибиотикорезистентности (результаты многоцентрового исследования). Гематология и трансфузеология.

2007;52(1):13-18.).

3. Klyasova G.A. Antimicrobial therapy. In: Savchenko V.G., ed. Program treatment of blood system diseases. Moscow: Praktika; 2012. p. 82753. Russian. (Клясова Г.А. Антимикробная терапия. Под редакцией Савченко В.Г. Программное лечение заболеваний системы крови. Москва: Практика; 2012. с. 827-853.).

4. Klyasova G.A. Okhmat V.A. Antimicrobial therapy. In: Savchenko V.G., ed. Algorithms of diagnosing and protocols of treatment of blood system diseases. Moscow: Praktika; 2018. P. 1069-1113. Russian. (Клясова Г.А. Охмат В.А. Антимикробная терапия. Под редакцией Савченко В.Г. Алгоритмы диагностики и протоколы лечения заболеваний системы крови. Москва: Практика; 2018. с. 1067-1113.).

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

5. Wang X., Zhang L., Sun A., et al. Acinetobacter baumannii bacteraemia in patients with haematological malignancy: a multicenter retrospective study from the Infection Working Party of Jiangsu Society of Hematology. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2017;36(7):1073-1081. DOI: 10.1007/s10096-016-2895-2

6. Gedik H., Simsek F., Kantürk A., et al. Bloodstream infections in patients with hematological malignancies: which is more fatal -cancer or resistant pathogens? Ther Clin Risk Manag. 2014;10:743-752. DOI: 10.2147/TCRM.S68450

7. Stoma I., Karpov I., Milanovich N., Uss A., Iskrov I. Risk factors for mortality in patients with bloodstream infections during the pre-engraftment period after hematopoietic stem cell transplantation. Blood Res. 2016;51(2):102-106. DOI: 10.2147/TCRM.S68450

8. Sukhorukova M.V., Edelstein M.V., Skleenova E.Yu., et al. Antimicrobal resistance of nosocomial Acinetobacter spp. isolates in Russia: results of multicenter epidemiological study «MARATHON» 20132014. Klinicheskaja mikrobiologija i antimikrobnaja himioterapija. 2017;19(1):42-47. Russian. (Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю. и соавт. Антибиотикорезистентность нозокоми-альных штаммов Acinetobacter spp. в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования «МАРАФОН» в 2013-2014 гг. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2017;19(1):42-47.).

9. Chung D.R., Song J.H., Kim S.H., et al. High prevalence of multidrug-resistant nonfermenters in hospital-acquired pneumonia in Asia. Am J Respir Crit Care Med. 2011;184:1409-1417. DOI: 10.1164/ rccm.201102-0349OC

10. European Centre for Disease Prevention and Control. Antimicrobial resistance surveillance in Europe 2015. Annual Report of the European Antimicrobial Resistance Surveillance Network (EARS-Net). Stockholm: ECDC; 2017. Available at: https://ecdc.europa.eu/en/ publications-data/surveillance-antimicrobial-resistance-europe-2017.

11. Mera R.M., Miller L.A., Amrine-Madsen H., Sahm D.F. Acinetobacter baumannii 2002-2008: increase of carbapenem-associated multiclass resistance in the United States. Microb Drug Resist. 2010;16:209-215. DOI: 10.1089/mdr.2010.0052

12. Martinovich A.A. Resistance Trends and Epidemiology of Acinetobacter Infections in Russia. Klinicheskaja mikrobiologija i antimikrobnaja himioterapija. 2010;12(2):96-105. Russian. (Мартинович А.А. Динамика антибиотикорезистентности и эпидемиология инфекций, вызванных Acinetobacter spp., в России. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2010;12(2):96-105.).

13. Evans B.A., Amyes S.G. OXA ß-lactamases. Clin Microbiol Rev. 2014;27:241-263. DOI: 10.1128/CMR.00117-13

14. Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance Standards

for Antimicrobial Susceptibility Testing; Twenty-Seventh Informational Supplement. CLSI document M100-S27. Wayne, PA: Clinical and Laboratory Standarts Institute; 2017.

15. Dahdouh E., Gomez-Gil R., Pacho S., et.al. Clonality, virulence determinants, and profiles of resistance of clinical Acinetobacter baumannii isolates obtained from a Spanish hospital. PLoS One. 2017;12(4):e0176824. DOI: 10.1371/journal.pone.0176824

16. Principe L., Piazza A., Giani T., et al. Epidemic diffusion of OXA-23-producing Acinetobacter baumannii isolates in Italy: results of the first cross-sectional countrywide survey. J Clin Microbiol. 2014;52(8):3004-3010. DOI: 10.1128/JCM.00291-14

17. Mugnier P.D., Poirel L., Naas T., Nordmann P. Worldwide dissemination of the blaOXA-23 carbapenemase gene of Acinetobacter baumannii. Emerg Infect Dis. 2010;16(1):35-40. DOI: 10.3201/ eid1601.090852

18. Viana G.F., Zago M.C., Moreira R.R., et al. ISAbai/bla: a serious obstacle to controlling the spread and treatment of Acinetobacter baumannii strains. Am J Infect Control. 2016;44:593-595. DOI: 10.1016/j.ajic.2015.11.020

19. Zarrilli R., Giannouli M., Tomasone F., Triassi M., Tsakris A. Carbapenem resistance in Acinetobacter baumannii: the molecular epidemic features of an emerging problem in health care facilities. J Infect Dev Ctries. 2009;3:481-489.

20. Di Popolo A., Giannouli M., Triassi M., Brisse S., Zarrilli R. Molecular epidemiological investigation of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii strains in four Mediterranean countries with a multilocus sequence typing scheme. Clin Microbiol Infect. 2011;17(2):197-201. DOI: 10.1111/j.1469-0691.2010.03254.x

21. Sukhorukova M.V., Edelstein M.V., Skleenova E.Yu., et al. Antimicrobal resistance of nosocomial Acinetobacter spp. isolates in Russia: results of multicenter epidemiological study «MARATHON» 2011-2012. Klinicheskaja mikrobiologija i antimikrobnaja himioterapija. 2014; 16 (4):266-272. Russian. (Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю. и соавт. Антибиотикорезистентность нозоко-миальных штаммов Acinetobacter spp. в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования «МАРАФОН» в 2011-2012 гг. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2014;16(4):266-272.).

22. Gordinskaya N.A., Sabirova E.V., Abramova N.V., Karaseva G.N., Nekaeva E.S. Antibiotics sensitivity and molecular mechanisms of resistance of Acinetobacter baumanii, infectious agents of burn-wound infection. Medicinskij almanah. 2015;5(40):99-101. Russian. (Гординская Н.А., Сабирова Е.В., Абрамова Н.В., Карасева Г.Н., Некаева Е.С. Антибиотикочувствительность и молекулярные механизмы резистентности Acinetobacter baumanii, возбудителей раневой ожоговой инфекции. Медицинский альманах.

2015;5(40):99-101.).

23. Migliavacca R., Espinal P., Principe L., et al. Characterization of resistance mechanisms and genetic relatedness of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii isolated from blood, Italy. Diagn Microbiol Infect Dis. 2013;75(2):180-186. DOI: 10.1016/j. diagmicrobio.2012.11.002

24. Mezzatesta M.L., Caio C., Gona F., et al. Carbapenem and multidrug resistance in Gram-negative bacteria in a single centre in Italy: considerations on in vitro assay of active drugs. Int J Antimicrob Agents. 2014;44:112-116. DOI: 10.1016/j.ijantimicag.2014.04.014

25. Liakopoulos A., Miriagou V., Katsifas E.A., et al. Identification of OXA-23-producing Acinetobacter baumannii in Greece, 2010 to 2011. Euro Surveill. 2012;17(11). pii: 20117.

26. Pournaras S., Dafopoulou K., Del Franco M., et al. Predominance of international clone 2 OXA-23-producing-Acinetobacter baumannii clinical isolates in Greece, 2015: results of a nationwide study. Int J Antimicrob Agents. 2017;49(6):749-753. DOI: 10.1016/j. ijantimicag.2017.01.028

27. Grosso F., Quinteira S., Peixe L. Understanding the dynamics of imipenem-resistant Acinetobacter baumannii lineages within Portugal. Clin Microbiol Infect. 2011;17(8):1275-1279. DOI: 10.1111/j.1469-0691.2011.03469.x

Хрульнова С.А. и соавт.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.