Научная статья на тему 'Ассоциация полиморфизмов генов системы интерферона oas-1, oas-3, PKR и хронического вирусного гепатита C'

Ассоциация полиморфизмов генов системы интерферона oas-1, oas-3, PKR и хронического вирусного гепатита C Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
286
63
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ХРОНИЧЕСКИЙ ГЕПАТИТ C / ФИБРОЗ / ОЛИГОАДЕНИЛАТСИНТЕТАЗА-1 / ОЛИГОАДЕНИЛАТСИНТЕТАЗА-3 / ПРОТЕИНКИНАЗА R / CHRONIC HEPATITIS C / FIBROSIS / OLIGOADENILATSYNTHETASE-1 / OLIGOADENILATSYNTHETASE-3 / PROTEIN KINASE R

Аннотация научной статьи по фундаментальной медицине, автор научной работы — Рязанцева Н. В., Новицкий В. В., Семенова Н. А., Клепцова Л. А., Якушина В. Д.

Резюме. Работа посвящена анализу влияния однонуклеотидных полиморфизмов (ОНП) генов на состояние печени при хроническом вирусном гепатите С. У здоровых доноров и у больных хроническим вирусным гепатитом С жителей Томска и Томской области были определены частоты генотипов и аллелей ОНП генов системы интерферона олигоаденилатсинтетазы-1 (-1A/G), олигоаденилатсинтетазы-3 (+1314C/T) и протеинкиназы R (+244A/G). Показана ассоциация ОНП генов олигоаденилатсинтетазы-1 и протеинкиназы R с активностью воспалительного процесса в печени, а также влияние ОНП генов протеинкиназы R и олигоаденилатсинтетазы-3 на фиброгенез.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Рязанцева Н. В., Новицкий В. В., Семенова Н. А., Клепцова Л. А., Якушина В. Д.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Abstract. Present work is devoted to analyzing possible associations of single-nucleotide gene polymorphisms (SNPs) with liver pathology in patients with chronic hepatitis C. SNP genotypes and allele frequencies were identified for some genes of interferon system, i.e., oligoadenilatsynthetase-1 (-1A/G), oligoadenilatsynthetase-3 (+1314C/T), and protein kinase R (+244A/G), using DNA samples from healthy donors and patients with chronic hepatitis C representing population of Tomsk and Tomsk Region. An association has been shown between SNPs of oligoadenilatsynthetase-1 and protein kinase R genes, and clinical activity of inflammatory process in the liver, as well as an impact of certain SNPs of protein kinase R and oligoadenilatsynthetase-3 genes upon fibrogenesis

Текст научной работы на тему «Ассоциация полиморфизмов генов системы интерферона oas-1, oas-3, PKR и хронического вирусного гепатита C»

Медицинская иммунология 2011, Т. 13, № 1, стр. 93-100 © 2011, СПб РО РААКИ

Краткие сообщения

АССОЦИАЦИЯ ПОЛИМОРФИЗМОВ ГЕНОВ СИСТЕМЫ ИНТЕРФЕРОНА OAS-1, OAS-3, PKR И ХРОНИЧЕСКОГО ВИРУСНОГО ГЕПАТИТА C

Бычков В.А., Рязанцева Н.В., Новицкий В.В., Семенова Н.А., Клепцова Л.А., Якушина В.Д.

ГОУ ВПО «Сибирский государственный медицинский университет Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию», г. Томск

Резюме. Работа посвящена анализу влияния однонуклеотидных полиморфизмов (ОНП) генов на состояние печени при хроническом вирусном гепатите С. У здоровых доноров и у больных хроническим вирусным гепатитом С — жителей Томска и Томской области — были определены частоты генотипов и аллелей ОНП генов системы интерферона олигоаденилатсинтетазы-1 (-1A/G), олигоа-денилатсинтетазы-3 (+1314C/T) и протеинкиназы R (+244A/G). Показана ассоциация ОНП генов олигоаденилатсинтетазы-1 и протеинкиназы R с активностью воспалительного процесса в печени, а также влияние ОНП генов протеинкиназы R и олигоаденилатсинтетазы-3 на фиброгенез.

Ключевые слова: хронический гепатит C, фиброз, олигоаденилатсинтетаза-1, олигоаденилатсинтетаза-3, протеинкиназа R

Bychkov V.A., Ryazantseva N.V., Novitskiy V.V., Semenova N.A., Kleptsova L.A., Yakushina V.D.

ASSOCIATIONS OF INTERFERON GENE POLYMORPHISMS OAS-1, OAS-3, PKR WITH CHRONIC VIRAL HEpATITIS c

Abstract. Present work is devoted to analyzing possible associations of single-nucleotide gene polymorphisms (SNPs) with liver pathology in patients with chronic hepatitis C. SNP genotypes and allele frequencies were identified for some genes ofinterferon system, i.e., oligoadenilatsynthetase-1 (-1A/G), oligoadenilatsynthetase-3 (+1314C/T), and protein kinase R (+244A/G), using DNA samples from healthy donors and patients with chronic hepatitis C representing population of Tomsk and Tomsk Region. An association has been shown between SNPs of oligoadenilatsynthetase-1 and protein kinase R genes, and clinical activity of inflammatory process in the liver, as well as an impact of certain SNPs of protein kinase R and oligoadenilatsynthetase-3 genes upon fibrogenesis. (Med. Immunol., 2011, vol. 13, N1, pp 93-100)

Keywords: chronic hepatitis C, fibrosis, oligoadenilatsynthetase-1, oligoadenilatsynthetase-3, protein kinase R

Введение

Вирусный гепатит C представляет собой важную медико-социальную и научную проблему, что обусловлено высокой частотой инфициро-ванности населения, развитием осложнений (цирроз печени, гепатоцеллюлярная карцинома), инвалидности и летальности [5, 7].

Адрес для переписки:

Бычков Вячеслав Алексеевич 634059, г. Томск, ул. Стрелочная, 19-3 E-mail: bva [email protected]

Развитие инфекционного процесса определяется как свойствами возбудителя, так и индивидуальными особенностями организма человека, являющихся, в свою очередь, отражением его генетической структуры. В настоящее время установлен факт влияния генетического состава индивида на восприимчивость и устойчивость к той или иной инфекции [1, 4, 9, 15, 16, 19]. Показана связь между вирусным гепатитом C (HCV-инфекцией) и полиморфизмами более 20 генов, к числу которых относятся гены HLA, гены метаболизма [11], а также гены противоинфекционного иммунитета [8].

93

Бычков В.А. и др.

Медицинская Иммунология

Эффективность противовирусного иммунитета индивида в значительной мере определяется состоянием цитокиновой сети [6]. Одну из важнейших ролей в регуляции ТЫ-пути иммунного ответа играет система интерферона, в состав которой входят сами интерфероны (а, в и у) и продукты индуцируемых ими генов — протеинкиназа R (PKR), 2',5'-олигоаденилатсинтетаза (2',5'-OAS). Интерфероны способны подавлять репродукцию вирусов, воздействуя на транскрипцию их геномов. Как следствие, индуцируется синтез 2',5'-OAS и PKR. Активатором данного процесса является двухцепочечная РНК. Синтез интерферон-индуцируемых белков запускает каскад реакций, который приводит к разрушению одноцепочечных РНК и подавлению синтеза белка в зараженной клетке [12].

Несмотря на актуальность исследования, работы, посвященные ассоциациям полиморфизмов генов системы интерферона с инфекционными заболеваниями, весьма малочисленны. Более того, данные литературы, касающиеся связи полиморфизмов интерферон-индуцируемых генов с особенностями течения и исходами HCV-инфекции, носят весьма противоречивый характер. Так, по результатам одних авторов, у европеоидов показана ассоциация ОНП в З'-нетранслируемой области гена OAS1 с исходом вирусного гепатита C [13]. Согласно данным других исследователей, полиморфные варианты гена OAS1 не ассоциированы с исходом гепатита C [2]. Имеются данные о корреляции воспалительных процессов в печени с количественным содержанием протеинкиназы R [18].

Поскольку патогенез вирусного гепатита C сопряжен с иммуноопосредованным повреждением печени, оценка роли полиморфизмов генов PKR, OAS1 и OAS3 является весьма актуальной и может служить основой для разработки новых подходов прогнозирования клинического течения, а также способов профилактики и иммунокоррекции данной патологии.

Целью данного исследования была оценка роли полиморфизмов системы интерферона +244A/G гена PKR, -1A/G гена OAS1 и +1314C/T гена OAS3 в патогенезе хронического вирусного гепатита С.

Материалы и методы

Обследованы 98 пациентов с диагнозом хронический вирусный гепатит C, находящихся на стационарном лечении и диспансерном учете в отделении гастроэнтерологии Томской областной клинической больницы и клинической больницы № 81 г. Северска. Все обследованные —

представители европеоидной расы, в возрасте от 18 до 56 лет (30,4±10,6 лет) (из них 56 мужчин (59%) и 42 женщины (42%)). В исследовании участвовали 171 здоровый донор, сопоставимые по возрасту и расе (из них 98 мужчин (57,3%) и 73 женщины (42,7%)).

Диагноз заболевания основан на результатах клинико-эпидемиологического исследования, сцинтиграфического и ультразвукового исследования печени, морфологического исследования биоптата печени, серологического и генетического методов исследования.

Для гистологического исследования печени использовали биопсийный фрагмент печеночной паренхимы. Оценка стадии фиброза проводилась согласно системе METAVIR по шкале: 0 — нет фиброза, 1 — перипортальный фиброз, 2 — портопортальный фиброз, 3 — порто-центральный фиброз, 4 — цирроз печени. Степень активности воспалительного процесса в печени определялась в соответствии с полуколичественным гистологическим индексом активности по Knodell с оценкой в баллах разных компонентов повреждения: 1) перипортальный некроз с наличием мостовидных некрозов или без них (0-10 баллов); 2) интралобулярная дегенерация и фокальный некроз (0-4 баллов); 3) портальное воспаление (0-4 баллов). При определении степени активности гепатита баллы гистологического индекса суммировались: 1-3 балла — минимальная; 4-8 — слабовыраженная; 9-12 — умеренно выраженная; 13-18 — выраженная степень активности воспаления.

Образцы крови в количестве 10 мл собирали в вакуумные системы «BD VACUTAINER™». Геномную ДНК выделяли с помощью фенолхлороформной экстракции. Для исследования полиморфных вариантов в изучаемых генах использовали методику ПЦР/ПДРФ (полимеразная цепная реакция с последующей обработкой специфическими рестриктазами и определением длин фрагментов рестрикции).

Амплификацию осуществляли методом ПЦР, используя структуру праймеров и параметры температурных циклов, описанных в литературе.

Фрагмент гена OAS1 анализировали с помощью аллель-специфической ПЦР с использованием трех праймеров: общего (5'-cactggagccctttcccc-3') и двух аллель-специфических (аллель А — 5'-atcatgtgtctcaccctttcga-3' и аллель G —

5'-gatcatgtgtctcaccctttctg-3'). Реакцию с каждой парой праймеров проводили отдельно, ПЦР-продукт образовывался только в случае комплементарного соответствия 3'-концов праймеров к ДНК исследуемых аллелей. Смесь для ампли-

94

2011, Т. 13, № 1

Ассоциация полиморфизмов генов системы интерферона OAS-1, OAS-3, PKR

фикации объемом 10 мкл содержала: 67 мМ Трис-HCl (pH 8,8), 10 мМ в-меркаптоэтанол, 0,01% Tween-20, 0,5 мкг тотальной ДНК, 0,7 мМ каждого из соответствующих праймеров, 0,2 мМ каждого из dNTP, 2,5 мМ MgCl2, 4% глицерин и 0,6 ед. акт. Taq-ДНК-полимеразы («Сибэнзим», г. Новосибирск). Реакция проводилась при следующих условиях: денатурация при 95 °С — 3 мин, 29 циклов амплификации (95 °С — 42 с, 63 °С — 42 с и 72 °С — 48 с) с последующей 10-минутной элонгацией при 72 °С. Гомозиготные (AA и GG) или гетерозиготный (AG) генотипы определяли по наличию или отсутствию на дорожке 4% полиакриламидного геля (ПААГ) продукта амплификации размером 221 п.н. (аллель A) или 222 п.н. (аллель G). Генотип AA определяли по наличию ПЦР -продукта с праймером, который соответствует аллелю A, и по отсутствию ПЦР-продукта с праймером, соответствующим аллелю G. Аналогично определяли генотип GG. Гетерозиготы AG идентифицировали при наличии продукта амплификации на обеих дорожках геля.

Для амплификации фрагмента гена OAS3 (421 bp) использовали следующие праймеры: 5 '-tggatgctcaggtttgggcc-3' и 5' -ccaacctcagctccattgctgta- 3'. Реакционная смесь объемом 25 мкл содержала 75 мМ Трис-HCl (pH 8,8), 20 мМ (NH4)2SO4, 0,01% Tween-20, 15-20 нг геномной ДНК, 0,5 мкМ каждого из праймеров, 0,2 мМ смеси dNTP-mix, 2,5 мМ хлорида магния и 0,6 ед. акт. Taq-ДНК-полимеразы («Сибэнзим», г. Новосибирск). Реакция проводилась при следующих условиях: денатурация при 95 °С — 3 мин, 32 цикла амплификации (95° — 60 с, 63 °С — 60 с и 72 °С — 60 с) с последующей 10-минутной элонгацией при 72 °С. К ПЦР-продукту добавляли 3-5 ед. акт. рестриктазы Taq I («Сибэнзим», г. Новосибирск) и инкубировали 12 ч при 65 °C. После разделения продуктов рестрикции в 4%-ном ПААГ в случае гомозиготного генотипа СС на дорожке наблюдали 2 фрагмента размером 271 и 98 п.н. (фрагмент размером 52 п.н., образующийся из-за наличия второго сайта узнавания рестриктазой Taq I, элюировался из геля), гомозиготного генотипа Т/Т — фрагмент размером 369 п.н., гетерозиготного генотипа СТ — 3 фрагмента (369, 271 и 98 п.н.).

Для амплификации фрагмента гена PKR (255 bp) использовали праймеры 5'-ttaattgctgaagccatggaac-3' и 5'-gacaaatacctggaca aagagctc-3'. Реакционная смесь общим объемом 25 мкл содержала 75 мМ Трис-HCl (pH 8,8), 20 мМ (NH4)2SO4, 0,01% Tween-20, 0,5 мкг тотальной ДНК, 0,5 мкМ каждого из праймеров, 0,2 мМ каждого из dNTP, 1,5 мМ MgCl2 и 0,6 ед. акт. Taq-ДНК-полимеразы («Сибэнзим», г. Но-

восибирск). Реакция проводилась при следующих условиях: денатурация при 95 °С — 3 мин, 32 цикла амплификации (95 °С — 48 с, 64 °С — 48 с и 72 °С — 48 с) с последующей 10-минутной элонгацией при 72 °С.

После этого ПЦР-продукт инкубировали с 4 ед. акт. рестриктазы Bst F5I («Сибэнзим», г. Новосибирск) в течение 12 ч при 65 °С. На дорожках 4%-ного ПААГ в случае гомозигот АА выявляли 2 фрагмента размером 177 и 78 п.н., гомозигот GG — фрагмент размером 255 п.н., гетерозиготного генотипа AG — 3 фрагмента (255, 177 и 78 п.н.).

Результаты исследования обрабатывали с использованием стандартного пакета программ SPSS v.11.0. Распределение генотипов по исследуемым полиморфным локусам проверяли на соответствие равновесию Харди—Вайнберга с помощью точного теста Фишера. Для сравнения частот аллелей между различными группами использовали критерий х2 Пирсона. Обработка результатов генетических исследований осуществлялась с использованием критерия отношения шансов OR с расчетом для него 95% доверительного интервала [3].

Результаты

На первом этапе анализа результатов исследования проводили сравнение частот встречаемости генотипов и соответствующих аллелей ОНП генов PKR, OAS1 и OAS3 у больных HCV-инфекцией и здоровых доноров (табл. 1). На втором этапе анализировали внутригрупповые различия генотипов и аллелей исследуемых генов только у больных HCV-инфекцией в зависимости от степени активности воспалительного процесса в печени (табл. 2) и стадии фиброза (табл. 3).

При оценке полиморфизма +244A/G гена PKR установлено достоверное различие в частотах генотипов и аллелей (p < 0,05) у больных гепатитом C и здоровых доноров. Так, частота встречаемости генотипа АА у больных HCV-инфекцией была достоверно ниже, чем в группе контроля; расчет отношения шансов (OR) позволил ассоциировать данный генотип с наименьшим риском развития HCV Генотип GG, наоборот, определен как прогностический фактор предрасположенности к HCV (табл. 1).

При изучении ассоциации данного полиморфизма у больных HCV со степенью активности воспаления в печени установлено снижение частоты встречаемости генотипа АА и увеличение частоты встречаемости генотипа GG в соответствии с ростом степени активности воспалитель-

95

Бычков В.А. и др.

Медицинская Иммунология

ТАБЛИЦА 1. РАСПРЕДЕЛЕНИЕ ГЕНОТИПОВ И АЛЛЕЛЕЙ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНОВ СРЕДИ ЗДОРОВЫХ ДОНОРОВ

и больных хронической hcv-инфекцией (% (АБс.))

ОНП Генотип Здоровые доноры N = 171 Больные HCV N = 98 х2 р OR знач. (95% CI)

+244A/G PKR A/A 64,9% (111) 46,9% (46) 11,2 0,004 0,48 (0,29-0,75)

A/G 21,1% (36) 23,5 % (23) 1,15 (0,63-2,08)

G/G 14,0% (24) 29,6% (29) 2,57 (1,40-4,75)

A 75,4% (129) 58,7% (57,5) 7,77 0,005 0,46 (0,32-0,67)

G 24,6% (42) 41,3% (40,5) 2,16 (1,49-3,15)

-1A/G OAS1 A/A 48,5% (83) 70,4% (69) 12,1 0,002 2,52 (1,49-4,27)

A/G 33,9% (58) 19,4% (19) 0,47 (0,26-0,85)

G/G 17,6% (30) 10,2% (10) 0,53 (0,25-1,15)

A 65,5% (112) 80,1% (78,5) 5,97 0,015 2,12 (1,40-3,21)

G 34,5% (59) 19,9% (19,5) 0,47 (0,31-0,71)

+1314C/T OAS3 C/C 65,5% (112) 80,6% (79) 13,7 0,001 2,19 (1,21-3,96)

C/T 30,4% (52) 11,2% (11) 0,29 (0,14-0,59)

T/T 4,7% (7) 8,2% (8) 2,08 (0,73-5,93)

C 80,7% (138) 86,2% (84,5) 2,7 0,1 1,50 (0,92-2,44)

T 19,3% (33) 13,8% (13,5) 0,67 (0,41-1,09)

Примечание. р - достоверность различий показателей по сравнению с их значениями у здоровых доноров; х2 -стандартный критерий Пирсона для сравнения частот генотипов и аллелей генов; OR - критерий отношения шансов, отражающий относительный риск развития заболевания при определенном генотипе по сравнению со здоровыми донорами с 95% доверительным интервалом.

ного процесса (табл. 2). Генотип AA встречался в 4,5 раза реже (p < 0,05), а генотип GG в 5,5 раз чаще (p < 0,05) у больных с умеренной степенью активности воспаления по сравнению с больными с минимальной и слабой степенью активности. Исследование распределения генотипов гена PKR в зависимости от степени фиброза печени также показало, что генотип AA у больных с умеренным фиброзом встречался в 2 раза реже (р < 0,05), а генотип GG — в 10 раз чаще (р < 0,05), чем у больных со слабовыраженным фиброзом и больных без фиброза (табл. 3).

При исследовании полиморфизма +1314C/T гена OAS3 установлено, что генотип CC встречался в 2 раза чаще (р < 0,05) у больных HCV-инфекцией, чем у здоровых доноров, следователь-

но, данный генотип ассоциирован с наибольшим риском развития гепатита C (табл. 1). Наименее подверженными риску развития гепатита C оказались лица, гетерозиготные по генотипу CT (OR = 0,29 (0,14-0,59)).

Анализируя ассоциацию воспалительного процесса в печени с полиморфизмом +1314C/T обнаружено, что генотип CC встречался значимо (р < 0,05) чаще, а генотип CT значимо реже (р < 0,05) у больных со слабо выраженной и с умеренной активностью воспаления (табл. 2). При оценке частоты распределения генотипов в зависимости от степени фиброза печени установлено, что генотип CC встречался достоверно (р < 0,05) чаще у больных с умеренным фиброзом, а гено-

96

2011, Т. 13, № 1

Ассоциация полиморфизмов генов системы интерферона OAS-1, OAS-3, PKR

ТАБЛИЦА 2. РАСПРЕДЕЛЕНИЕ ГЕНОТИПОВ И АЛЛЕЛЕЙ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНОВ В ЗАВИСИМОСТИ

от активности воспаления в ткани печени по данным биопсии у больных с хронической HCV-ИнфекцИЕй (% (АБс.))

ОНП Генотип Активность воспаления X2 р

Минимальная Слабо выраженная Умеренно выраженная

+244A/G PKR A/A 58,5% (31) 48,2% (13) 11,1% (2)* ** 39,0 0,001

A/G 24,5% (13) 37,0% (10) 0% (0)* **

G/G 17,0% (9) 14,8% (4) 88,9% (16)* **

A 70,8% (37,5) 66,7% (18) 11,1% (2)* ** 29,2 0,001

G 29,2% (15,5) 33,3% (9) 88,9% (16)* **

-1A/G OAS1 A/A 52,8% (28) 85,2% (23)* 100% (18)* 18,4 0,001

A/G 30,2% (16) 11,1% (3)* 0% (0)*

G/G 17,0% (9) 3,7% (1)* 0% (0)*

A 68,0% (36) 90,7% (24,5)* 100% (29) 8,26 0,016

G 32,0% (17) 9,3% (2,5)* 0% (0)

+1314C/T OAS3 C/C 79,2% (42) 81,5% (22)* 83,3% (15)* 11,8 0,019

C/T 18,9% (10) 3,7% (1)* 0% (0)*

T/T 1,9% (1) 14,8% (4)* 16,7% (3)*

С 88,7% (47) 83,3% (22,5) 83,3% (15) 0,86 0,651

Т 11,3% (6) 16,7% (4,5) 16,7% (3)

Примечание. р - достоверность различий показателей между подгруппами больных ХВГ с различной степенью активности воспаления; х2 - стандартный критерий Пирсона для сравнения частот генотипов и аллелей генов; * - достоверность различий по сравнению с пациентами с минимальной активностью воспаления (р < 0,05); ** - достоверность различий по сравнению с пациентами со слабо выраженной активностью воспаления (р < 0,05).

тип CT, аналогично, достоверно реже (р < 0,05) (табл. 3).

Кроме того, было обнаружено различие в частотах генотипов и аллелей полиморфизма -1A/G гена OAS1 между больными HCV-инфекцией и здоровыми донорами. У больных генотип АА встречался достоверно чаще (p < 0,05), а генотип AG достоверно реже по сравнению с группой контроля. Расчет отношения шансов показал, что наибольший риск развития гепатита у носителей гомозиготного варианта генотипа АА (OR = 2,52 (1,49-4,27)). Наименее подверженными риску развития гепатита оказались лица, гетерозиготные по генотипу AG (0,47 (0,26-0,85)) (табл. 1).

При изучении зависимости распределения полиморфизмов ОНП -1A/G у больных HCV от степени активности воспаления в печени установлено достоверное (p < 0,05) увеличение частоты генотипа АА гена OAS1 в зависимости от роста степени активности воспалительного процесса. Так, группа больных из 18 человек с умеренной степенью воспаления целиком состояла из лиц с генотипом AA. Генотип AG у больных со слабой и умеренной степенью активности воспаления, напротив, встречался реже в сравнении с пациентами с минимальной активностью (табл. 2). Статистически достоверных различий в распространенности частот генотипов полиморфизма

97

Бычков В.А. и др.

Медицинская Иммунология

ТАБЛИЦА 3. РАСПРЕДЕЛЕНИЕ ГЕНОТИПОВ И АЛЛЕЛЕЙ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНОВ В ЗАВИСИМОСТИ ОТ СТЕПЕНИ ФИБРОЗА ткани печени по данным биопсии у больных с хронической HCV-ИнфЕкцИЕй (% (АБс.))

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

ОНП Генотип Степень фиброза X2 р

Нет фиброза Слабо выраженный фиброз Умеренный фиброз

+244A/G PKR A/A 58,0% (18) 70,4% (19) 22,5% (9)* ** 47,5 0,001

A/G 35,5% (11) 29,6% (8) 10,0% (4)* **

G/G 6,5% (2) 0% (0) 67,5% (27)* **

A 75,8% (23,5) 85,2% (23) 23,3% (12) * ** 39,9 0,001

G 24,2% (7,5) 14,8% (4) 76,6% (29) * **

-1A/G OAS1 A/A 54,8% (17) 70,4% (19) 82,5% (33)* 7,7 0,105

A/G 32,3% (10) 14,8% (4) 12,5% (5)*

G/G 12,9% (4) 14,8% (4) 5% (2)*

A 70,9% (22) 77,8% (21) 88,2% (35,5) 1,97 0,373

G 29,1% (9) 22,2% (6) 11,8% (4,5)

+1314C/T OAS3 C/C 61,3% (19) 81,5% (22) 95% (38)* 14,2 0,007

C/T 25,8% (8) 11,1% (3) 0% (0)*

T/T 12,9% (4) 7,4% (2) 5% (2)*

C 74,2% (23) 87,0% (23,5) 95% (38) 4,9 0,084

T 25,8% (8) 13,0% (3,5) 5% (2)

Примечание. р - достоверность различий показателей между подгруппами больных ХВГ с различной стадией фиброза; X2 - стандартный критерий Пирсона для сравнения частот генотипов и аллелей генов; * - достоверность различий по сравнению с пациентами с отсутствием фиброза печени (р < 0,05); ** - достоверность различий по сравнению с пациентами со слабовыраженным фиброзом печени (р < 0,05).

-1A/G в зависимости от степени фиброза установлено не было (х2 = 7,66; p < 0,05) (табл. 3).

Обсуждение

Было обнаружено протективное действие генотипа АА полиморфизма +244A/G гена PKR на степень активности воспалительного процесса печени и степень фиброза. По литературным источникам известно, что генотип AA исследуемого полиморфизма ассоциирован с повышенной базальной активностью протеинкиназы R [10], что, вероятно, способствует более быстрой и полной элиминации вируса HCV и тем самым — более

легкому течению хронического вирусного гепатита C.

Генотип CC полиморфизма +1314C/T гена OAS3, наоборот, определен как прогностически неблагоприятный фактор предрасположенности к HCV, лица с данным генотипом встречались в группе больных в 2 раза чаще, чем в группе здоровых. Генотип CC также оказался сопряжен со степенью воспалительной реакции в печени и степенью фиброза. Исследуемый полиморфизм локализован в экзоне гена. По литературным данным, генотип СС фенотипически проявляется снижением активности фермента [14].

98

2011, Т. 13, № 1

Ассоциация полиморфизмов генов системы интерферона OAS-1, OAS-3, PKR

При исследовании полиморфизма 1A/G гена OAS1 обнаружено, что генотип АА встречается в группе больных хроническим вирусным гепатитом C гораздо чаще, и риск развития заболевания повышается в 2,5 раза. Мутация -1A/G располагается в сайте альтернативного сплайсинга. Каждому генотипу соответствует свой сплайс-вариант мРНК, а, соответственно, и белковый продукт. Различные по своей аминокислотной структуре варианты OAS1 могут проявлять неодинаковую активность и, как следствие, по-разному реализовывать свое противовирусное действие. Известно, что генотип АА ассоциирован с пониженной активностью олигоаденилатсинтетазы-1 [14], и, как следствие, противовирусный эффект реализуется не полностью. Изучение взаимосвязи генотипа АА с активностью воспаления в печени показало, что данный генотип встречался в 3 раза чаще у больных со слабо выраженной и в 4 раза чаще — у больных с умеренно выраженной активностью воспаления. Это свидетельствует о том, что низкая реализация противовирусного эффекта OAS1 приводит к более тяжелому течению вирусного гепатита С.

Список литературы

1. Антошина В.В., Дортман В.В., Коненков В.И., Белобородова Е.В., Наследникова И.О., Новицкий В.В. Прогноз предрасположенности человека к развитию вирусного гепатита C по полиморфизмам генов цитокинов G-308A TNFA, T-330G IL-2, C-590T IL-4, C-703T IL-5 и C-592A IL-10 // Медицинская иммунология. — 2006. — Т. 8, № 5-6. - С. 715-720.

2. Бархаш А.В., Кобзев В.Ф., Пилипенко П.И. Изучение возможной связи полиморфизмов интерферон-индуцируемых генов человека OAS1, OAS3, EIF2AK2 и RNASEL с особенностями течения клещевого энцефалита // Вестник Вавиловского общества генетиков и селекционеров. - 2006. - Т. 10, № 3. - С. 565-571.

3. Боровиков В.В. Statistica. Искусство анализа данных на компьютере. - М., 2001. - 360 с.

4. Гончарова И.А., Фрейдин М.Б., Пузы-рев В.П. Геномные основы подверженности к инфекционным заболеванием // Вестник Вави-ловского общества генетиков и селекционеров. -2006. - Т. 10, № 3. - С. 540-549.

5. Ивашкин В.Т Клеточная и молекулярная биология воспаления печени // Росс. журн. га-строэнтерол., гепатол., колопроктол. - 1998. -№ 5. - С. 13-17.

6. Наследникова И.О., Белобородова Е.В., Рязанцева Н.В., Белобородова Э.И., Новиц-

кий В.В., Черногорюк Г.Э. Иммунорегуляторные цитокины и хронизация вирусного гепатита С: Клинико-иммунологические параллели // Клиническая медицина. - 2005. - № 9. - С. 20-25.

7. Онищенко Г. Г. Эпидемическая ситуация в Российской Федерации и меры по ее стабилизации // Проблемы туберкулеза. - 2003. - № 11. -С. 4-9.

8. Рязанцева Н.В., Жукова О.Б., Белобородова Э.И., Новицкий В.В., Ткаченко С.Б., Белобородова Е.В., Токарева Н.В., Чечина О.Е., Михеев С.Л. Изменения цитогенетического статуса лимфоцитов периферической крови при хронических HBV- и HCV-инфекциях //Росс. журн. гастроэнтерол., гепатол., колопроктол. - 2004. -Т. 14, № 1. - С. 37-40.

9. Симбирцев А.С., Громова А.Ю. Функциональный полиморфизм генов регуляторных молекул воспаления // Цитокины и воспаление. -2005. - № 1. - С. 3-11.

10. Cookson WO., Moffatt M.F. The genetics of specific allergy // Monogr. Allergy. - 1996. -Vol. 33. - P. 71-96.

11. Glass WG., McDermott D.H., Lim J.K. CCR5 deficiency increases risk of symptomatic West Nile virus infection // J. Exptl Med. - 2006. - Vol. 203, N 1. - P. 35-40.

12. Hovnanian A., Rebouillat D., Mattei M.G. The human 2',5'-oligoadenylate synthetase locus is composed of three distinct genes clustered on chromosome 12q24.2 encoding the 100-, 69- and 40-kDa forms //Genomics. - 1998. - Vol. 52, N 3. -P. 267-277.

13. Knapp S., Yee L.J., Frodsham A.J. Polymorphisms in interferon-induced genes and the outcome of hepatitis С virus infection: roles of MxA, OAS-1 and PKR //Genes and Immunity. - 2003. -Vol. 4, N 6. - P. 411-419.

14. Pawlotsky J.M., Hovanessian A.G. Effect of alpha interferon (IFN-alpha) on 2'-5'-oligoadenylate synthetase activity in peripheral blood mononuclear cells of patients with chronic hepatitis C: relationship to the antiviral effect of IFN-alpha // Antimicrob. Agents. Chemother. - 1996. - ЛЫ. 40, N 2. - P. 320324.

15. Richardson M.M., Powell E.E., Barrie H.D., Clouston A.D., Purdie D.M. and Jonsson J.R. A combination of genetic polymorphisms increases the risk of progressive disease in chronic hepatitis C // Genetics. - 2005. - Vol. 42. - P. 45-47.

16. Samson M., Libert F., Doranz B.J. Resistance to HIV-1 infection in Caucasian individuals bearing mutant alleles of the CCR-5 chemokine receptor gene //Nature. - 1996. - Vol. 382. - P. 722-725.

99

Бычков В.А. и др.

Медицинская Иммунология

17. Takizawa T., Ohashi K., Nakanishi Y Possible involvement of double-stranded RNA-activated protein kinase in cell death by influenza virus infection // Virol. - 1996. - Vol. 70, N 11. - P. 81288132.

18. Terada T, Ueyama J., Ukita Y., Ohta T Protein expression of double-stranded RNA-activated protein kinase (PKR) in intrahepatic bile ducts in normal adult livers, fetal livers, primary biliary cirrhosis, hepatolithiasis and intrahepatic

cholangiocarcinoma // Liver. — 2000. — ЛЫ. 20, N 6. - P. 450-457.

19.Yakub I., Lillibridge K.M., Moran A. Single nucleotide polymorphisms in genes for 2'-5'-oligoadenylate synthetase and RNase L in patients hospitalized with West Nile virus infection // J. Inf. Diseases. - 2005. - Vol. 192, N 10. - P. 17411748.

поступила в редакцию 06.08.2010 принята к печати 06.09.2010

100

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.