Медицинская иммунология 2011, Т. 13, № 1, стр. 93-100 © 2011, СПб РО РААКИ
Краткие сообщения
АССОЦИАЦИЯ ПОЛИМОРФИЗМОВ ГЕНОВ СИСТЕМЫ ИНТЕРФЕРОНА OAS-1, OAS-3, PKR И ХРОНИЧЕСКОГО ВИРУСНОГО ГЕПАТИТА C
Бычков В.А., Рязанцева Н.В., Новицкий В.В., Семенова Н.А., Клепцова Л.А., Якушина В.Д.
ГОУ ВПО «Сибирский государственный медицинский университет Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию», г. Томск
Резюме. Работа посвящена анализу влияния однонуклеотидных полиморфизмов (ОНП) генов на состояние печени при хроническом вирусном гепатите С. У здоровых доноров и у больных хроническим вирусным гепатитом С — жителей Томска и Томской области — были определены частоты генотипов и аллелей ОНП генов системы интерферона олигоаденилатсинтетазы-1 (-1A/G), олигоа-денилатсинтетазы-3 (+1314C/T) и протеинкиназы R (+244A/G). Показана ассоциация ОНП генов олигоаденилатсинтетазы-1 и протеинкиназы R с активностью воспалительного процесса в печени, а также влияние ОНП генов протеинкиназы R и олигоаденилатсинтетазы-3 на фиброгенез.
Ключевые слова: хронический гепатит C, фиброз, олигоаденилатсинтетаза-1, олигоаденилатсинтетаза-3, протеинкиназа R
Bychkov V.A., Ryazantseva N.V., Novitskiy V.V., Semenova N.A., Kleptsova L.A., Yakushina V.D.
ASSOCIATIONS OF INTERFERON GENE POLYMORPHISMS OAS-1, OAS-3, PKR WITH CHRONIC VIRAL HEpATITIS c
Abstract. Present work is devoted to analyzing possible associations of single-nucleotide gene polymorphisms (SNPs) with liver pathology in patients with chronic hepatitis C. SNP genotypes and allele frequencies were identified for some genes ofinterferon system, i.e., oligoadenilatsynthetase-1 (-1A/G), oligoadenilatsynthetase-3 (+1314C/T), and protein kinase R (+244A/G), using DNA samples from healthy donors and patients with chronic hepatitis C representing population of Tomsk and Tomsk Region. An association has been shown between SNPs of oligoadenilatsynthetase-1 and protein kinase R genes, and clinical activity of inflammatory process in the liver, as well as an impact of certain SNPs of protein kinase R and oligoadenilatsynthetase-3 genes upon fibrogenesis. (Med. Immunol., 2011, vol. 13, N1, pp 93-100)
Keywords: chronic hepatitis C, fibrosis, oligoadenilatsynthetase-1, oligoadenilatsynthetase-3, protein kinase R
Введение
Вирусный гепатит C представляет собой важную медико-социальную и научную проблему, что обусловлено высокой частотой инфициро-ванности населения, развитием осложнений (цирроз печени, гепатоцеллюлярная карцинома), инвалидности и летальности [5, 7].
Адрес для переписки:
Бычков Вячеслав Алексеевич 634059, г. Томск, ул. Стрелочная, 19-3 E-mail: bva [email protected]
Развитие инфекционного процесса определяется как свойствами возбудителя, так и индивидуальными особенностями организма человека, являющихся, в свою очередь, отражением его генетической структуры. В настоящее время установлен факт влияния генетического состава индивида на восприимчивость и устойчивость к той или иной инфекции [1, 4, 9, 15, 16, 19]. Показана связь между вирусным гепатитом C (HCV-инфекцией) и полиморфизмами более 20 генов, к числу которых относятся гены HLA, гены метаболизма [11], а также гены противоинфекционного иммунитета [8].
93
Бычков В.А. и др.
Медицинская Иммунология
Эффективность противовирусного иммунитета индивида в значительной мере определяется состоянием цитокиновой сети [6]. Одну из важнейших ролей в регуляции ТЫ-пути иммунного ответа играет система интерферона, в состав которой входят сами интерфероны (а, в и у) и продукты индуцируемых ими генов — протеинкиназа R (PKR), 2',5'-олигоаденилатсинтетаза (2',5'-OAS). Интерфероны способны подавлять репродукцию вирусов, воздействуя на транскрипцию их геномов. Как следствие, индуцируется синтез 2',5'-OAS и PKR. Активатором данного процесса является двухцепочечная РНК. Синтез интерферон-индуцируемых белков запускает каскад реакций, который приводит к разрушению одноцепочечных РНК и подавлению синтеза белка в зараженной клетке [12].
Несмотря на актуальность исследования, работы, посвященные ассоциациям полиморфизмов генов системы интерферона с инфекционными заболеваниями, весьма малочисленны. Более того, данные литературы, касающиеся связи полиморфизмов интерферон-индуцируемых генов с особенностями течения и исходами HCV-инфекции, носят весьма противоречивый характер. Так, по результатам одних авторов, у европеоидов показана ассоциация ОНП в З'-нетранслируемой области гена OAS1 с исходом вирусного гепатита C [13]. Согласно данным других исследователей, полиморфные варианты гена OAS1 не ассоциированы с исходом гепатита C [2]. Имеются данные о корреляции воспалительных процессов в печени с количественным содержанием протеинкиназы R [18].
Поскольку патогенез вирусного гепатита C сопряжен с иммуноопосредованным повреждением печени, оценка роли полиморфизмов генов PKR, OAS1 и OAS3 является весьма актуальной и может служить основой для разработки новых подходов прогнозирования клинического течения, а также способов профилактики и иммунокоррекции данной патологии.
Целью данного исследования была оценка роли полиморфизмов системы интерферона +244A/G гена PKR, -1A/G гена OAS1 и +1314C/T гена OAS3 в патогенезе хронического вирусного гепатита С.
Материалы и методы
Обследованы 98 пациентов с диагнозом хронический вирусный гепатит C, находящихся на стационарном лечении и диспансерном учете в отделении гастроэнтерологии Томской областной клинической больницы и клинической больницы № 81 г. Северска. Все обследованные —
представители европеоидной расы, в возрасте от 18 до 56 лет (30,4±10,6 лет) (из них 56 мужчин (59%) и 42 женщины (42%)). В исследовании участвовали 171 здоровый донор, сопоставимые по возрасту и расе (из них 98 мужчин (57,3%) и 73 женщины (42,7%)).
Диагноз заболевания основан на результатах клинико-эпидемиологического исследования, сцинтиграфического и ультразвукового исследования печени, морфологического исследования биоптата печени, серологического и генетического методов исследования.
Для гистологического исследования печени использовали биопсийный фрагмент печеночной паренхимы. Оценка стадии фиброза проводилась согласно системе METAVIR по шкале: 0 — нет фиброза, 1 — перипортальный фиброз, 2 — портопортальный фиброз, 3 — порто-центральный фиброз, 4 — цирроз печени. Степень активности воспалительного процесса в печени определялась в соответствии с полуколичественным гистологическим индексом активности по Knodell с оценкой в баллах разных компонентов повреждения: 1) перипортальный некроз с наличием мостовидных некрозов или без них (0-10 баллов); 2) интралобулярная дегенерация и фокальный некроз (0-4 баллов); 3) портальное воспаление (0-4 баллов). При определении степени активности гепатита баллы гистологического индекса суммировались: 1-3 балла — минимальная; 4-8 — слабовыраженная; 9-12 — умеренно выраженная; 13-18 — выраженная степень активности воспаления.
Образцы крови в количестве 10 мл собирали в вакуумные системы «BD VACUTAINER™». Геномную ДНК выделяли с помощью фенолхлороформной экстракции. Для исследования полиморфных вариантов в изучаемых генах использовали методику ПЦР/ПДРФ (полимеразная цепная реакция с последующей обработкой специфическими рестриктазами и определением длин фрагментов рестрикции).
Амплификацию осуществляли методом ПЦР, используя структуру праймеров и параметры температурных циклов, описанных в литературе.
Фрагмент гена OAS1 анализировали с помощью аллель-специфической ПЦР с использованием трех праймеров: общего (5'-cactggagccctttcccc-3') и двух аллель-специфических (аллель А — 5'-atcatgtgtctcaccctttcga-3' и аллель G —
5'-gatcatgtgtctcaccctttctg-3'). Реакцию с каждой парой праймеров проводили отдельно, ПЦР-продукт образовывался только в случае комплементарного соответствия 3'-концов праймеров к ДНК исследуемых аллелей. Смесь для ампли-
94
2011, Т. 13, № 1
Ассоциация полиморфизмов генов системы интерферона OAS-1, OAS-3, PKR
фикации объемом 10 мкл содержала: 67 мМ Трис-HCl (pH 8,8), 10 мМ в-меркаптоэтанол, 0,01% Tween-20, 0,5 мкг тотальной ДНК, 0,7 мМ каждого из соответствующих праймеров, 0,2 мМ каждого из dNTP, 2,5 мМ MgCl2, 4% глицерин и 0,6 ед. акт. Taq-ДНК-полимеразы («Сибэнзим», г. Новосибирск). Реакция проводилась при следующих условиях: денатурация при 95 °С — 3 мин, 29 циклов амплификации (95 °С — 42 с, 63 °С — 42 с и 72 °С — 48 с) с последующей 10-минутной элонгацией при 72 °С. Гомозиготные (AA и GG) или гетерозиготный (AG) генотипы определяли по наличию или отсутствию на дорожке 4% полиакриламидного геля (ПААГ) продукта амплификации размером 221 п.н. (аллель A) или 222 п.н. (аллель G). Генотип AA определяли по наличию ПЦР -продукта с праймером, который соответствует аллелю A, и по отсутствию ПЦР-продукта с праймером, соответствующим аллелю G. Аналогично определяли генотип GG. Гетерозиготы AG идентифицировали при наличии продукта амплификации на обеих дорожках геля.
Для амплификации фрагмента гена OAS3 (421 bp) использовали следующие праймеры: 5 '-tggatgctcaggtttgggcc-3' и 5' -ccaacctcagctccattgctgta- 3'. Реакционная смесь объемом 25 мкл содержала 75 мМ Трис-HCl (pH 8,8), 20 мМ (NH4)2SO4, 0,01% Tween-20, 15-20 нг геномной ДНК, 0,5 мкМ каждого из праймеров, 0,2 мМ смеси dNTP-mix, 2,5 мМ хлорида магния и 0,6 ед. акт. Taq-ДНК-полимеразы («Сибэнзим», г. Новосибирск). Реакция проводилась при следующих условиях: денатурация при 95 °С — 3 мин, 32 цикла амплификации (95° — 60 с, 63 °С — 60 с и 72 °С — 60 с) с последующей 10-минутной элонгацией при 72 °С. К ПЦР-продукту добавляли 3-5 ед. акт. рестриктазы Taq I («Сибэнзим», г. Новосибирск) и инкубировали 12 ч при 65 °C. После разделения продуктов рестрикции в 4%-ном ПААГ в случае гомозиготного генотипа СС на дорожке наблюдали 2 фрагмента размером 271 и 98 п.н. (фрагмент размером 52 п.н., образующийся из-за наличия второго сайта узнавания рестриктазой Taq I, элюировался из геля), гомозиготного генотипа Т/Т — фрагмент размером 369 п.н., гетерозиготного генотипа СТ — 3 фрагмента (369, 271 и 98 п.н.).
Для амплификации фрагмента гена PKR (255 bp) использовали праймеры 5'-ttaattgctgaagccatggaac-3' и 5'-gacaaatacctggaca aagagctc-3'. Реакционная смесь общим объемом 25 мкл содержала 75 мМ Трис-HCl (pH 8,8), 20 мМ (NH4)2SO4, 0,01% Tween-20, 0,5 мкг тотальной ДНК, 0,5 мкМ каждого из праймеров, 0,2 мМ каждого из dNTP, 1,5 мМ MgCl2 и 0,6 ед. акт. Taq-ДНК-полимеразы («Сибэнзим», г. Но-
восибирск). Реакция проводилась при следующих условиях: денатурация при 95 °С — 3 мин, 32 цикла амплификации (95 °С — 48 с, 64 °С — 48 с и 72 °С — 48 с) с последующей 10-минутной элонгацией при 72 °С.
После этого ПЦР-продукт инкубировали с 4 ед. акт. рестриктазы Bst F5I («Сибэнзим», г. Новосибирск) в течение 12 ч при 65 °С. На дорожках 4%-ного ПААГ в случае гомозигот АА выявляли 2 фрагмента размером 177 и 78 п.н., гомозигот GG — фрагмент размером 255 п.н., гетерозиготного генотипа AG — 3 фрагмента (255, 177 и 78 п.н.).
Результаты исследования обрабатывали с использованием стандартного пакета программ SPSS v.11.0. Распределение генотипов по исследуемым полиморфным локусам проверяли на соответствие равновесию Харди—Вайнберга с помощью точного теста Фишера. Для сравнения частот аллелей между различными группами использовали критерий х2 Пирсона. Обработка результатов генетических исследований осуществлялась с использованием критерия отношения шансов OR с расчетом для него 95% доверительного интервала [3].
Результаты
На первом этапе анализа результатов исследования проводили сравнение частот встречаемости генотипов и соответствующих аллелей ОНП генов PKR, OAS1 и OAS3 у больных HCV-инфекцией и здоровых доноров (табл. 1). На втором этапе анализировали внутригрупповые различия генотипов и аллелей исследуемых генов только у больных HCV-инфекцией в зависимости от степени активности воспалительного процесса в печени (табл. 2) и стадии фиброза (табл. 3).
При оценке полиморфизма +244A/G гена PKR установлено достоверное различие в частотах генотипов и аллелей (p < 0,05) у больных гепатитом C и здоровых доноров. Так, частота встречаемости генотипа АА у больных HCV-инфекцией была достоверно ниже, чем в группе контроля; расчет отношения шансов (OR) позволил ассоциировать данный генотип с наименьшим риском развития HCV Генотип GG, наоборот, определен как прогностический фактор предрасположенности к HCV (табл. 1).
При изучении ассоциации данного полиморфизма у больных HCV со степенью активности воспаления в печени установлено снижение частоты встречаемости генотипа АА и увеличение частоты встречаемости генотипа GG в соответствии с ростом степени активности воспалитель-
95
Бычков В.А. и др.
Медицинская Иммунология
ТАБЛИЦА 1. РАСПРЕДЕЛЕНИЕ ГЕНОТИПОВ И АЛЛЕЛЕЙ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНОВ СРЕДИ ЗДОРОВЫХ ДОНОРОВ
и больных хронической hcv-инфекцией (% (АБс.))
ОНП Генотип Здоровые доноры N = 171 Больные HCV N = 98 х2 р OR знач. (95% CI)
+244A/G PKR A/A 64,9% (111) 46,9% (46) 11,2 0,004 0,48 (0,29-0,75)
A/G 21,1% (36) 23,5 % (23) 1,15 (0,63-2,08)
G/G 14,0% (24) 29,6% (29) 2,57 (1,40-4,75)
A 75,4% (129) 58,7% (57,5) 7,77 0,005 0,46 (0,32-0,67)
G 24,6% (42) 41,3% (40,5) 2,16 (1,49-3,15)
-1A/G OAS1 A/A 48,5% (83) 70,4% (69) 12,1 0,002 2,52 (1,49-4,27)
A/G 33,9% (58) 19,4% (19) 0,47 (0,26-0,85)
G/G 17,6% (30) 10,2% (10) 0,53 (0,25-1,15)
A 65,5% (112) 80,1% (78,5) 5,97 0,015 2,12 (1,40-3,21)
G 34,5% (59) 19,9% (19,5) 0,47 (0,31-0,71)
+1314C/T OAS3 C/C 65,5% (112) 80,6% (79) 13,7 0,001 2,19 (1,21-3,96)
C/T 30,4% (52) 11,2% (11) 0,29 (0,14-0,59)
T/T 4,7% (7) 8,2% (8) 2,08 (0,73-5,93)
C 80,7% (138) 86,2% (84,5) 2,7 0,1 1,50 (0,92-2,44)
T 19,3% (33) 13,8% (13,5) 0,67 (0,41-1,09)
Примечание. р - достоверность различий показателей по сравнению с их значениями у здоровых доноров; х2 -стандартный критерий Пирсона для сравнения частот генотипов и аллелей генов; OR - критерий отношения шансов, отражающий относительный риск развития заболевания при определенном генотипе по сравнению со здоровыми донорами с 95% доверительным интервалом.
ного процесса (табл. 2). Генотип AA встречался в 4,5 раза реже (p < 0,05), а генотип GG в 5,5 раз чаще (p < 0,05) у больных с умеренной степенью активности воспаления по сравнению с больными с минимальной и слабой степенью активности. Исследование распределения генотипов гена PKR в зависимости от степени фиброза печени также показало, что генотип AA у больных с умеренным фиброзом встречался в 2 раза реже (р < 0,05), а генотип GG — в 10 раз чаще (р < 0,05), чем у больных со слабовыраженным фиброзом и больных без фиброза (табл. 3).
При исследовании полиморфизма +1314C/T гена OAS3 установлено, что генотип CC встречался в 2 раза чаще (р < 0,05) у больных HCV-инфекцией, чем у здоровых доноров, следователь-
но, данный генотип ассоциирован с наибольшим риском развития гепатита C (табл. 1). Наименее подверженными риску развития гепатита C оказались лица, гетерозиготные по генотипу CT (OR = 0,29 (0,14-0,59)).
Анализируя ассоциацию воспалительного процесса в печени с полиморфизмом +1314C/T обнаружено, что генотип CC встречался значимо (р < 0,05) чаще, а генотип CT значимо реже (р < 0,05) у больных со слабо выраженной и с умеренной активностью воспаления (табл. 2). При оценке частоты распределения генотипов в зависимости от степени фиброза печени установлено, что генотип CC встречался достоверно (р < 0,05) чаще у больных с умеренным фиброзом, а гено-
96
2011, Т. 13, № 1
Ассоциация полиморфизмов генов системы интерферона OAS-1, OAS-3, PKR
ТАБЛИЦА 2. РАСПРЕДЕЛЕНИЕ ГЕНОТИПОВ И АЛЛЕЛЕЙ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНОВ В ЗАВИСИМОСТИ
от активности воспаления в ткани печени по данным биопсии у больных с хронической HCV-ИнфекцИЕй (% (АБс.))
ОНП Генотип Активность воспаления X2 р
Минимальная Слабо выраженная Умеренно выраженная
+244A/G PKR A/A 58,5% (31) 48,2% (13) 11,1% (2)* ** 39,0 0,001
A/G 24,5% (13) 37,0% (10) 0% (0)* **
G/G 17,0% (9) 14,8% (4) 88,9% (16)* **
A 70,8% (37,5) 66,7% (18) 11,1% (2)* ** 29,2 0,001
G 29,2% (15,5) 33,3% (9) 88,9% (16)* **
-1A/G OAS1 A/A 52,8% (28) 85,2% (23)* 100% (18)* 18,4 0,001
A/G 30,2% (16) 11,1% (3)* 0% (0)*
G/G 17,0% (9) 3,7% (1)* 0% (0)*
A 68,0% (36) 90,7% (24,5)* 100% (29) 8,26 0,016
G 32,0% (17) 9,3% (2,5)* 0% (0)
+1314C/T OAS3 C/C 79,2% (42) 81,5% (22)* 83,3% (15)* 11,8 0,019
C/T 18,9% (10) 3,7% (1)* 0% (0)*
T/T 1,9% (1) 14,8% (4)* 16,7% (3)*
С 88,7% (47) 83,3% (22,5) 83,3% (15) 0,86 0,651
Т 11,3% (6) 16,7% (4,5) 16,7% (3)
Примечание. р - достоверность различий показателей между подгруппами больных ХВГ с различной степенью активности воспаления; х2 - стандартный критерий Пирсона для сравнения частот генотипов и аллелей генов; * - достоверность различий по сравнению с пациентами с минимальной активностью воспаления (р < 0,05); ** - достоверность различий по сравнению с пациентами со слабо выраженной активностью воспаления (р < 0,05).
тип CT, аналогично, достоверно реже (р < 0,05) (табл. 3).
Кроме того, было обнаружено различие в частотах генотипов и аллелей полиморфизма -1A/G гена OAS1 между больными HCV-инфекцией и здоровыми донорами. У больных генотип АА встречался достоверно чаще (p < 0,05), а генотип AG достоверно реже по сравнению с группой контроля. Расчет отношения шансов показал, что наибольший риск развития гепатита у носителей гомозиготного варианта генотипа АА (OR = 2,52 (1,49-4,27)). Наименее подверженными риску развития гепатита оказались лица, гетерозиготные по генотипу AG (0,47 (0,26-0,85)) (табл. 1).
При изучении зависимости распределения полиморфизмов ОНП -1A/G у больных HCV от степени активности воспаления в печени установлено достоверное (p < 0,05) увеличение частоты генотипа АА гена OAS1 в зависимости от роста степени активности воспалительного процесса. Так, группа больных из 18 человек с умеренной степенью воспаления целиком состояла из лиц с генотипом AA. Генотип AG у больных со слабой и умеренной степенью активности воспаления, напротив, встречался реже в сравнении с пациентами с минимальной активностью (табл. 2). Статистически достоверных различий в распространенности частот генотипов полиморфизма
97
Бычков В.А. и др.
Медицинская Иммунология
ТАБЛИЦА 3. РАСПРЕДЕЛЕНИЕ ГЕНОТИПОВ И АЛЛЕЛЕЙ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНОВ В ЗАВИСИМОСТИ ОТ СТЕПЕНИ ФИБРОЗА ткани печени по данным биопсии у больных с хронической HCV-ИнфЕкцИЕй (% (АБс.))
ОНП Генотип Степень фиброза X2 р
Нет фиброза Слабо выраженный фиброз Умеренный фиброз
+244A/G PKR A/A 58,0% (18) 70,4% (19) 22,5% (9)* ** 47,5 0,001
A/G 35,5% (11) 29,6% (8) 10,0% (4)* **
G/G 6,5% (2) 0% (0) 67,5% (27)* **
A 75,8% (23,5) 85,2% (23) 23,3% (12) * ** 39,9 0,001
G 24,2% (7,5) 14,8% (4) 76,6% (29) * **
-1A/G OAS1 A/A 54,8% (17) 70,4% (19) 82,5% (33)* 7,7 0,105
A/G 32,3% (10) 14,8% (4) 12,5% (5)*
G/G 12,9% (4) 14,8% (4) 5% (2)*
A 70,9% (22) 77,8% (21) 88,2% (35,5) 1,97 0,373
G 29,1% (9) 22,2% (6) 11,8% (4,5)
+1314C/T OAS3 C/C 61,3% (19) 81,5% (22) 95% (38)* 14,2 0,007
C/T 25,8% (8) 11,1% (3) 0% (0)*
T/T 12,9% (4) 7,4% (2) 5% (2)*
C 74,2% (23) 87,0% (23,5) 95% (38) 4,9 0,084
T 25,8% (8) 13,0% (3,5) 5% (2)
Примечание. р - достоверность различий показателей между подгруппами больных ХВГ с различной стадией фиброза; X2 - стандартный критерий Пирсона для сравнения частот генотипов и аллелей генов; * - достоверность различий по сравнению с пациентами с отсутствием фиброза печени (р < 0,05); ** - достоверность различий по сравнению с пациентами со слабовыраженным фиброзом печени (р < 0,05).
-1A/G в зависимости от степени фиброза установлено не было (х2 = 7,66; p < 0,05) (табл. 3).
Обсуждение
Было обнаружено протективное действие генотипа АА полиморфизма +244A/G гена PKR на степень активности воспалительного процесса печени и степень фиброза. По литературным источникам известно, что генотип AA исследуемого полиморфизма ассоциирован с повышенной базальной активностью протеинкиназы R [10], что, вероятно, способствует более быстрой и полной элиминации вируса HCV и тем самым — более
легкому течению хронического вирусного гепатита C.
Генотип CC полиморфизма +1314C/T гена OAS3, наоборот, определен как прогностически неблагоприятный фактор предрасположенности к HCV, лица с данным генотипом встречались в группе больных в 2 раза чаще, чем в группе здоровых. Генотип CC также оказался сопряжен со степенью воспалительной реакции в печени и степенью фиброза. Исследуемый полиморфизм локализован в экзоне гена. По литературным данным, генотип СС фенотипически проявляется снижением активности фермента [14].
98
2011, Т. 13, № 1
Ассоциация полиморфизмов генов системы интерферона OAS-1, OAS-3, PKR
При исследовании полиморфизма 1A/G гена OAS1 обнаружено, что генотип АА встречается в группе больных хроническим вирусным гепатитом C гораздо чаще, и риск развития заболевания повышается в 2,5 раза. Мутация -1A/G располагается в сайте альтернативного сплайсинга. Каждому генотипу соответствует свой сплайс-вариант мРНК, а, соответственно, и белковый продукт. Различные по своей аминокислотной структуре варианты OAS1 могут проявлять неодинаковую активность и, как следствие, по-разному реализовывать свое противовирусное действие. Известно, что генотип АА ассоциирован с пониженной активностью олигоаденилатсинтетазы-1 [14], и, как следствие, противовирусный эффект реализуется не полностью. Изучение взаимосвязи генотипа АА с активностью воспаления в печени показало, что данный генотип встречался в 3 раза чаще у больных со слабо выраженной и в 4 раза чаще — у больных с умеренно выраженной активностью воспаления. Это свидетельствует о том, что низкая реализация противовирусного эффекта OAS1 приводит к более тяжелому течению вирусного гепатита С.
Список литературы
1. Антошина В.В., Дортман В.В., Коненков В.И., Белобородова Е.В., Наследникова И.О., Новицкий В.В. Прогноз предрасположенности человека к развитию вирусного гепатита C по полиморфизмам генов цитокинов G-308A TNFA, T-330G IL-2, C-590T IL-4, C-703T IL-5 и C-592A IL-10 // Медицинская иммунология. — 2006. — Т. 8, № 5-6. - С. 715-720.
2. Бархаш А.В., Кобзев В.Ф., Пилипенко П.И. Изучение возможной связи полиморфизмов интерферон-индуцируемых генов человека OAS1, OAS3, EIF2AK2 и RNASEL с особенностями течения клещевого энцефалита // Вестник Вавиловского общества генетиков и селекционеров. - 2006. - Т. 10, № 3. - С. 565-571.
3. Боровиков В.В. Statistica. Искусство анализа данных на компьютере. - М., 2001. - 360 с.
4. Гончарова И.А., Фрейдин М.Б., Пузы-рев В.П. Геномные основы подверженности к инфекционным заболеванием // Вестник Вави-ловского общества генетиков и селекционеров. -2006. - Т. 10, № 3. - С. 540-549.
5. Ивашкин В.Т Клеточная и молекулярная биология воспаления печени // Росс. журн. га-строэнтерол., гепатол., колопроктол. - 1998. -№ 5. - С. 13-17.
6. Наследникова И.О., Белобородова Е.В., Рязанцева Н.В., Белобородова Э.И., Новиц-
кий В.В., Черногорюк Г.Э. Иммунорегуляторные цитокины и хронизация вирусного гепатита С: Клинико-иммунологические параллели // Клиническая медицина. - 2005. - № 9. - С. 20-25.
7. Онищенко Г. Г. Эпидемическая ситуация в Российской Федерации и меры по ее стабилизации // Проблемы туберкулеза. - 2003. - № 11. -С. 4-9.
8. Рязанцева Н.В., Жукова О.Б., Белобородова Э.И., Новицкий В.В., Ткаченко С.Б., Белобородова Е.В., Токарева Н.В., Чечина О.Е., Михеев С.Л. Изменения цитогенетического статуса лимфоцитов периферической крови при хронических HBV- и HCV-инфекциях //Росс. журн. гастроэнтерол., гепатол., колопроктол. - 2004. -Т. 14, № 1. - С. 37-40.
9. Симбирцев А.С., Громова А.Ю. Функциональный полиморфизм генов регуляторных молекул воспаления // Цитокины и воспаление. -2005. - № 1. - С. 3-11.
10. Cookson WO., Moffatt M.F. The genetics of specific allergy // Monogr. Allergy. - 1996. -Vol. 33. - P. 71-96.
11. Glass WG., McDermott D.H., Lim J.K. CCR5 deficiency increases risk of symptomatic West Nile virus infection // J. Exptl Med. - 2006. - Vol. 203, N 1. - P. 35-40.
12. Hovnanian A., Rebouillat D., Mattei M.G. The human 2',5'-oligoadenylate synthetase locus is composed of three distinct genes clustered on chromosome 12q24.2 encoding the 100-, 69- and 40-kDa forms //Genomics. - 1998. - Vol. 52, N 3. -P. 267-277.
13. Knapp S., Yee L.J., Frodsham A.J. Polymorphisms in interferon-induced genes and the outcome of hepatitis С virus infection: roles of MxA, OAS-1 and PKR //Genes and Immunity. - 2003. -Vol. 4, N 6. - P. 411-419.
14. Pawlotsky J.M., Hovanessian A.G. Effect of alpha interferon (IFN-alpha) on 2'-5'-oligoadenylate synthetase activity in peripheral blood mononuclear cells of patients with chronic hepatitis C: relationship to the antiviral effect of IFN-alpha // Antimicrob. Agents. Chemother. - 1996. - ЛЫ. 40, N 2. - P. 320324.
15. Richardson M.M., Powell E.E., Barrie H.D., Clouston A.D., Purdie D.M. and Jonsson J.R. A combination of genetic polymorphisms increases the risk of progressive disease in chronic hepatitis C // Genetics. - 2005. - Vol. 42. - P. 45-47.
16. Samson M., Libert F., Doranz B.J. Resistance to HIV-1 infection in Caucasian individuals bearing mutant alleles of the CCR-5 chemokine receptor gene //Nature. - 1996. - Vol. 382. - P. 722-725.
99
Бычков В.А. и др.
Медицинская Иммунология
17. Takizawa T., Ohashi K., Nakanishi Y Possible involvement of double-stranded RNA-activated protein kinase in cell death by influenza virus infection // Virol. - 1996. - Vol. 70, N 11. - P. 81288132.
18. Terada T, Ueyama J., Ukita Y., Ohta T Protein expression of double-stranded RNA-activated protein kinase (PKR) in intrahepatic bile ducts in normal adult livers, fetal livers, primary biliary cirrhosis, hepatolithiasis and intrahepatic
cholangiocarcinoma // Liver. — 2000. — ЛЫ. 20, N 6. - P. 450-457.
19.Yakub I., Lillibridge K.M., Moran A. Single nucleotide polymorphisms in genes for 2'-5'-oligoadenylate synthetase and RNase L in patients hospitalized with West Nile virus infection // J. Inf. Diseases. - 2005. - Vol. 192, N 10. - P. 17411748.
поступила в редакцию 06.08.2010 принята к печати 06.09.2010
100