Научная статья на тему 'АНАЛИЗ ВКЛАДА ИЗМЕНЕНИЯ НУКЛЕОТИДНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ДНК C.C4366T ГЕНА MYH14 РАЗВИТИИ РАКА ЯИЧНИКОВ В РЕСПУБЛИКЕ БАШКОРТОСТАН'

АНАЛИЗ ВКЛАДА ИЗМЕНЕНИЯ НУКЛЕОТИДНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ДНК C.C4366T ГЕНА MYH14 РАЗВИТИИ РАКА ЯИЧНИКОВ В РЕСПУБЛИКЕ БАШКОРТОСТАН Текст научной статьи по специальности «Биотехнологии в медицине»

CC BY
32
6
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
РАК ЯИЧНИКОВ / СЕКВЕНИРОВАНИЕ НОВОГО ПОКОЛЕНИЯ / ГЕН MYH14 / РИСК РАЗВИТИЯ РАКА ЯИЧНИКОВ / ЧАСТОТА ВСТРЕЧАЕМОСТИ / OVARIAN CANCER / NEW GENERATION SEQUENCING / MYH14 GENE / RISK OF OVARIAN CANCER / FREQUENCY OF OCCURRENCE

Аннотация научной статьи по биотехнологиям в медицине, автор научной работы — Шаяхметова А. К., Прокофьева Д. С., Мингажева Э. Т., Хуснутдинова Э. К.

Злокачественные новообразования занимают второе место по смертности, уступая только сердечнососудистым заболеваниям. К большему числу смертей в год, чем любой другой рак репродуктивной системы, приводит рак яичников (РЯ). В России ежегодно диагностируют более 14000 новых случаев заболевания, половина из которых имеют смертельный исходом[1]. Не более 15% всех случаев РЯ можно объяснить нарушениями в генах BRCA1/2, большая часть патологии вызвана изменениями в других генах[2]. Поиск и идентификация новых генов-кандидатов РЯ будет способствовать ранней диагностики заболевания и созданию персонифицированной терапии[3]. Важнейшим геном-кандидатом выступает ген MYH14. Нарушение C.C4366T (p.Q1456X) в гене MYH14 было впервые выявлено при экзомном секвенировании; высокий уровень этого белка был обнаружен при различных злокачественных новообразованиях, в том числе при карциноме яичников[4,5]. Нами был проведен поиск ранее неизвестного варианта c.C4366T гена MYH14 у женщин из Республики Башкортостан. В результате было установлено, что вариант p.Q1456X в гене MYH14 встречается с низкой частотой (0,4%) только у больных раком яичников.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по биотехнологиям в медицине , автор научной работы — Шаяхметова А. К., Прокофьева Д. С., Мингажева Э. Т., Хуснутдинова Э. К.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

ANALYSIS OF THE CONTRIBUTION OF CHANGES IN THE NUCLEOTIDE SEQUENCE OF DNA C.C4366T MYH14 GENE IN OVARIAN CANCER PATHOGENESIS IN WOMEN FROM BASHKORTOSTAN

Malignant neoplasms occupy the second place in mortality, second only to cardiovascular diseases. To a greater number of deaths per year than any other cancer of the reproductive system, leads to ovarian cancer (OC). In Russia, more than 14,000 new cases are diagnosed annually, half of which are fatal[1]. No more than 15% of all cases of OC can be attributed to disorders in BRCA1 / 2 genes, most of the pathology is caused by changes in other genes[2]. The search and identification of new candidate genes for OC will contribute to the early diagnosis of the disease and the creation of personalized therapy[3]. The most important genome candidate is MYH14 gene. The violation of C.C4366T (p.Q1456X) in the MYH14 gene was first detected in exomial sequencing; a high level of this protein was detected in various malignant neoplasms, including in ovarian carcinoma[4,5]. We searched for a previously unknown variant of the gene MYH14 c.C4366T for women from the Republic of Bashkortostan. As a result, it was found that the variant p.Q1456X in the MYH14 gene meets with a low frequency (0.4%) only in patients with ovarian cancer.

Текст научной работы на тему «АНАЛИЗ ВКЛАДА ИЗМЕНЕНИЯ НУКЛЕОТИДНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ДНК C.C4366T ГЕНА MYH14 РАЗВИТИИ РАКА ЯИЧНИКОВ В РЕСПУБЛИКЕ БАШКОРТОСТАН»

Наукова Думка; 2005. 792 с.

УДК 61.618.11

Шаяхметова А.К. студент магистратуры биологический факультет Прокофьева Д.С., к.биол.н.

доцент

кафедра «Генетики и фундаментальной медицины»

Мингажева Э. Т. аспирант

кафедра «Генетики и фундаментальной медицины» Башкирский государственный университет Хуснутдинова Э.К., доктор биологических наук

профессор

Институт биохимии и генетики Уфимский научный центр Российской академии наук Россия, Республика Башкортостан, г. Уфа АНАЛИЗ ВКЛАДА ИЗМЕНЕНИЯ НУКЛЕОТИДНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ДНК C.C4366T ГЕНА MYH14 РАЗВИТИИ РАКА ЯИЧНИКОВ В РЕСПУБЛИКЕ БАШКОРТОСТАН Аннотация: Злокачественные новообразования занимают второе место по смертности, уступая только сердечнососудистым заболеваниям. К большему числу смертей в год, чем любой другой рак репродуктивной системы, приводит рак яичников (РЯ). В России ежегодно диагностируют более 14000 новых случаев заболевания, половина из которых имеют смертельный исходом[1]. Не более 15% всех случаев РЯ можно объяснить нарушениями в генах BRCA1/2, большая часть патологии вызвана изменениями в других генах[2]. Поиск и идентификация новых генов-кандидатов РЯ будет способствовать ранней диагностики заболевания и созданию персонифицированной терапии[3]. Важнейшим геном-кандидатом выступает ген MYH14. Нарушение C.C4366T (p.Q1456X) в гене MYH14 было впервые выявлено при экзомном секвенировании; высокий уровень этого белка был обнаружен при различных злокачественных новообразованиях, в том числе при карциноме яичников[4,5]. Нами был проведен поиск ранее неизвестного варианта c.C4366T гена MYH14 у женщин из Республики Башкортостан. В результате было установлено, что вариант p.Q1456X в гене MYH14 встречается с низкой частотой (0,4%) только у больных раком яичников.

Ключевые слова: рак яичников, секвенирование нового поколения, ген MYH14, риск развития рака яичников, частота встречаемости.

Shayakhmetova A.K. graduate student of the Faculty of Biology

Bashkir State University

Russia, the Republic of Bashkortostan, Ufa Prokofieva DS Candidate of Biological Sciences, Associate Professor Associate Professor of the Department of Genetics and Fundamental

Medicine Bashkir State University Russia, the Republic of Bashkortostan, Ufa Mingajeva E. T. Post-graduate student of the Department of Genetics and

Fundamental Medicine Bashkir State University Russia, the Republic of Bashkortostan, Ufa Khusnutdinova E. K. doctor of biological sciences, professor Institute of Biochemistry and Genetics of the Ufa Science Center of the

Russian Federation Academy of Sciences Russia, the Republic of Bashkortostan, Ufa ANALYSIS OF THE CONTRIBUTION OF CHANGES IN THE NUCLEOTIDE SEQUENCE OF DNA C.C4366T MYH14 GENE IN OVARIAN CANCER PATHOGENESIS IN WOMEN FROM

BASHKORTOSTAN

Abstract: Malignant neoplasms occupy the second place in mortality, second only to cardiovascular diseases. To a greater number of deaths per year than any other cancer of the reproductive system, leads to ovarian cancer (OC). In Russia, more than 14,000 new cases are diagnosed annually, half of which are fatal[1]. No more than 15% of all cases of OC can be attributed to disorders in BRCA1 / 2 genes, most of the pathology is caused by changes in other genes[2]. The search and identification of new candidate genes for OC will contribute to the early diagnosis of the disease and the creation of personalized therapy[3]. The most important genome candidate is MYH14 gene. The violation of C.C4366T (p.Q1456X) in the MYH14 gene was first detected in exomial sequencing; a high level of this protein was detected in various malignant neoplasms, including in ovarian carcinoma[4,5]. We searched for a previously unknown variant of the gene MYH14 c.C4366T for women from the Republic of Bashkortostan. As a result, it was found that the variant p.Q1456X in the MYH14 gene meets with a low frequency (0.4%) only in patients with ovarian cancer.

Key words: ovarian cancer, new generation sequencing, MYH14 gene, risk of ovarian cancer, frequency of occurrence.

Карцинома яичника — злокачественное новообразование поражающее яичники. Ежегодно в мире регистрируются более 225 тысяч новых случаев рака яичников, из них почти 2/3 заканчиваются смертью. Несмотря на значительные успехи в диагностике данного заболевания, около 75% выявляется на 3-4 стадиях. При этом в течение пяти лет при третьей стадии выживает около 24%, а при 4-й — лишь 4,6%[6].

Около 15% большинства семейных форм заболевания, а также всех

спорадических случаев рака яичников вызваны мутациями в генах репарации BRCA1 и BRCA2[2]. Вместе с тем мало данных о других генах, мутации в которых могут быть опосредованы с риском развития злокачественной патологии яичников.

В настоящий момент одним из самых актуальных направлений становится поиск потенциальных генов-кандидатов, вовлеченных в канцерогенез различной этиологии, включая рак яичников, с помощью технологий секвенирования нового поколения (Next Generation Sequensing). Подобный подход позволяет проводить полномасштабный анализ всего генома и выявлять даже самые редкие изменения нуклеотидной последовательности ДНК, которые, тем не менее, могут иметь решающее значение в возникновении заболевания[3].

Целью исследования было Изучить роль изменений нуклеотидной последовательности ДНК C.C4366T гена MYH14 в патогенезе рака яичников Республики Башкортостан.

Материалами для исследования послужили образцы ДНК, выделенные из венозной крови 262 женщин с установленным диагнозом «рак яичников» и 284 здоровых доноров. Выделение осуществляли методом фенольно-хлороформной экстракции. Генотипирование образцов ДНК гена MYH14 проводили с помощью аллель-специфичной ПЦР.

Скрининг варианта C.C4366T в гене MYH14 выполнен с помощью аллель-специфической ПЦР, в результате которой синтезируется фрагмент ДНК, несущий нормальный аллель C или мутантный аллель T, размером 208 п.н. В качестве внутреннего контроля ПЦР амплифицировали участок гена MDC1, размером 351 п.н.

Рис. 1 Электрофореграмма детекции варианта р^1456Х в гене МТН14. Дорожки 1-2 и 3-4 - образцы без варианта р^1456Х; Дорожки 5-6 -образец с вариантом р^1456Х.

В проведенном нами исследовании среди больных РЯ (п=263) и здоровых доноров (п=284) была обнаружена лишь 1 (0,4%) носительница изучаемого варианта в гетерозиготном состоянии в группе пациенток.

Других носителей данного изменения не обнаружено.

Носительница варианта C.C4366T в гене MYH14 русского этнического происхождения. У пациентки с данным изменением установлен диагноз «серозный рак яичников с высокой степенью злокачественности» с метастазами в сальник. Заболевание возникло в пременопаузе. У носительницы изменения нуклеотидной последовательности ДНК C.C4366T в гене MYH14 не идентифицировано мутаций в генах BRCA1 и BRCA2.

Таким образом, полученные нами данные свидетельствуют о низкой частоте встречаемости (0,4%) нового варианта p.Q1456X, приводящего к синтезу усеченного белка, среди больных РЯ из Республики Башкортостан.

Полученные нами результаты гласят, что новый вариант p.Q1456X в гене MYH14, встречается с низкой частотой (0,4%) у женщин больных раком яичников из Республики Башкортостан.

Использованные источники:

1. Каприн А.Д., Старинский В.В., Петрова Г.В. Злокачественные новообразования в России в 2016 году (заболеваемость и смертность) □ М.: МНИОИ им. П.А. Герцена □ филиал ФГБУ «НМИЦ радиологии» Минздрава России, □ 2018. □ 250 с.

2. Любченко Л.Н., Батенева Е.И. Медико-генетическое консультирование и ДНК-диагностика при наследственной предрасположенности к раку молочной железы и раку яичников. Пособие для врачей. М.: ИГ РОНЦ, 2014. 64 с.

3. Новикова Е.И. Снигирева Г.П. Секвенирование «нового поколения» (NGS): применение для молекулярно-генетических исследований в онкологии. Журнал Вестник Российского научного центра рентгенорадиологии Минздрава России 2016

4. Прокофьева Д. С. и др. Поиск новых генов-кандидатов, участвующих в патогенезе рака яичников, с помощью полного экзомного секвенирования //Генетика. - 2016. - Т. 52. - №. 10. - С. 1215-1221

5. https: //www.proteinatlas .org/ENSG00000105357-MYH14/pathology

6. Маринюк А. С. Роль маркеров экстрацеллюлярных везикул в диагностике рака яичников //Sciences of Europe. - 2017. - №. 14-1. - С. 64-69.

УДК 342.5

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.